BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-097L13
Chromosome7 (Build37)
Map Location 128,976,250 - 129,150,068
singlet/doubletdoublet
Overlap geneScnn1b, Cog7, Gga2
Upstream geneLOC100043426, Eef2k, Polr3e, Cdr2, 4933427G17Rik, EG668548, Mettl9, LOC668456, Igsf6, Otoa, LOC668556, Hs3st2, Usp31, Scnn1g
Downstream geneEars2, Ubfd1, Ndufab1, Palb2, Dctn5, Plk1, Ern2, 2010110P09Rik, Prkcb1, LOC668486, Cacng3, 4930413G21Rik, Rbbp6
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-097L13.bB6Ng01-097L13.g
ACCDH908015DH908016
length1,025696
definitionDH908015|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-097L13, 5' end.DH908016|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-097L13, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(128,976,250 - 128,977,273)(129,149,376 - 129,150,068)
sequence
gaattcatcaacttttaagtgttttcagatgctataattgtgcaacaata
tttgtctttcacaattggaaaatgcaaatgccatttaaacaaatatggaa
tttctgggctggtatcaggatgtggcgacttgcatgtggattttggccaa
tctaaactcctcccagtttagaatcccggagaatccaaggaagcccatgt
gatcatgatgtctgagcatggaatgtggtgagcatcttgtacctgcttag
tccctggacctatagctagggatgaatccaccaatgcagaggagaaaccg
aggcacagctgacctgtccatgatgaccagagggcggaactcctggagtt
gattgtttccatgacaatgaatcctgacaaaaggacaaacctgaccctgg
atccctggatccacatggcacttgctgtaacaatacaacatagcggttgg
tagttagtagttatccagcattgtgctaagcactatgtgctcctgaccct
catacgaggccctgagcttgattatctgattttataacaagaatctgagg
ctcagagaggtctagggttcatcccacattcccacagctagtgtactaag
tggatttaacctctttgtatacttggccagatttcctatatcagaggctt
tcactggcggccagcttgggccacaaagaactaaagaaccagtagagatt
aagatgaaagtctgtatgtgtgagctaagtcaagcaagagtggggagagg
agacagctgagaggtgagaccttcaggggagacagaggtgaggtgggttc
atgtggagagatcctgactctggaagtcccagacttgtgaccaaaaaaga
gattactttgtgtagagtattttcattagtatagaaacagagatggcttg
acagagtggctctggtggtggttggctttcgtcatcatttgaatggatta
gagtccactgtggaaactcacctgtgggcgccgtctatgaggtgtgaaag
acccatctggatgtggagtggtgca
gaattcctgaggtgatataaagccttaatcagagcccgtgtatgtactgt
tctgtgtgatgttttctatctgtagaagtattttattttaggtggtactt
gcataagctctctaccagaaagttacatctcgagtgtgtttcttgaaggc
tgttgatgttcagtgatgtcgttactggggaatcagggtctcatttgcaa
gttctttctcgtagataaaatagacttcaaagggaagacagttttattgg
agttggagagaaaaaaaaaaacaacagagctgagggcaagctatgaatcc
cagcagctgcagggaaggaggaacatggaaagaaggaagacagaaagtca
tgtcttcctagttccaagtcaaggaagcagcaggcacgccccacagcagt
ggaggttagggggaggggcttatgatgatgtctgaagtctgaaaggtggc
ttgatgagtaacaatgtttgtgtgcaagcatgaagatgtgagtttgaatc
cccagagcccaagttaaatgctgggtttgacgcatgtgttgtcctatgga
ggagagagataaggagaattgctaaggattgctggtggtcagcatagctc
aagttcagttacagactccataagagaataacagccagttgtggtggtgc
tcaccttatgattttgctttatatggggtagaggcaggagggtcac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_128976250_128977273
seq2: B6Ng01-097L13.b_50_1074

seq1  GAATTCATCAACTTTTAAGTGTTTTCAGATGCTATAATTGTGCAACAATA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATCAACTTTTAAGTGTTTTCAGATGCTATAATTGTGCAACAATA  50

seq1  TTTGTCTTTCACAATTGGAAAATGCAAATGCCATTTAAACAAATATGGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTCTTTCACAATTGGAAAATGCAAATGCCATTTAAACAAATATGGAA  100

seq1  TTTCTGGGCTGGTATCAGGATGTGGCGACTTGCATGTGGATTTTGGCCAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTGGGCTGGTATCAGGATGTGGCGACTTGCATGTGGATTTTGGCCAA  150

seq1  TCTAAACTCCTCCCAGTTTAGAATCCCGGAGAATCCAAGGAAGCCCATGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAACTCCTCCCAGTTTAGAATCCCGGAGAATCCAAGGAAGCCCATGT  200

seq1  GATCATGATGTCTGAGCATGGAATGTGGTGAGCATCTTGTACCTGCTTAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCATGATGTCTGAGCATGGAATGTGGTGAGCATCTTGTACCTGCTTAG  250

seq1  TCCCTGGACCTATAGCTAGGGATGAATCCACCAATGCAGAGGAGAAACCG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTGGACCTATAGCTAGGGATGAATCCACCAATGCAGAGGAGAAACCG  300

seq1  AGGCACAGCTGACCTGTCCATGATGACCAGAGGGCGGAACTCCTGGAGTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCACAGCTGACCTGTCCATGATGACCAGAGGGCGGAACTCCTGGAGTT  350

seq1  GATTGTTTCCATGACAATGAATCCTGACAAAAGGACAAACCTGACCCTGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTGTTTCCATGACAATGAATCCTGACAAAAGGACAAACCTGACCCTGG  400

seq1  ATCCCTGGATCCACATGGCACTTGCTGTAACAATACAACATAGCGGTTGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCCTGGATCCACATGGCACTTGCTGTAACAATACAACATAGCGGTTGG  450

seq1  TAGTTAGTAGTTATCCAGCATTGTGCTAAGCACTATGTGCTCCTGACCCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTAGTAGTTATCCAGCATTGTGCTAAGCACTATGTGCTCCTGACCCT  500

seq1  CATACGAGGCCCTGAGCTTGATTATCTGATTTTATAACAAGAATCTGAGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACGAGGCCCTGAGCTTGATTATCTGATTTTATAACAAGAATCTGAGG  550

seq1  CTCAGAGAGGTCTAGGGTTCATCCCACATTCCCACAGCTAGTGTACTAAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGAGAGGTCTAGGGTTCATCCCACATTCCCACAGCTAGTGTACTAAG  600

seq1  TGGATTTAACCTCTTTGTATACTTGGCCAGATTTCCTATATCAGAGGCTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATTTAACCTCTTTGTATACTTGGCCAGATTTCCTATATCAGAGGCTT  650

seq1  TCACTGGCGGCCAGCTTGGGCCACAAAGAACTAAAGAACCAGTAGAGATT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTGGCGGCCAGCTTGGGCCACAAAGAACTAAAGAACCAGTAGAGATT  700

seq1  AAGATGAAAGTCTGTATGTGTGAGCTAAGTCAAGCAAGAGTGGGGAGAGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATGAAAGTCTGTATGTGTGAGCTAAGTCAAGCAAGAGTGGGGAGAGG  750

seq1  AGACAGCTGAGAGGTGAGACCTTCAGGGGAGACAGAGGTGAGGTGGGTTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAGCTGAGAGGTGAGACCTTCAGGGGAGACAGAGGTGAGGTGGGTTC  800

seq1  ATGTGGAGAGATCCTGACTCTGGAAGTCCCAGACTTGTGACCAAAAAAGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGGAGAGATCCTGACTCTGGAAGTCCCAGACTTGTGACCAAAAAAGA  850

seq1  GATTACTTTGTGTAGAGTATTTTCATCAGTATAGAAACAGAGATGGCATG  900
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||
seq2  GATTACTTTGTGTAGAGTATTTTCATTAGTATAGAAACAGAGATGGCTTG  900

seq1  ACAGAGTGGCTCT-GTGGTGGTTGGCTTTCGTCATCAATTTGAATGGATT  949
      ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
seq2  ACAGAGTGGCTCTGGTGGTGGTTGGCTTTCGTCATC-ATTTGAATGGA-T  948

seq1  TAGAGT-CACTGTGGAAACTCACCTGTGGGCG-CGTCTATGAGGGTGTG-  996
      |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| 
seq2  TAGAGTCCACTGTGGAAACTCACCTGTGGGCGCCGTCTATGA-GGTGTGA  997

seq1  AAGACCCATTCTGAATGT-GAGTGGTGCA  1024
      |||||||| |||| |||| ||||||||||
seq2  AAGACCCA-TCTGGATGTGGAGTGGTGCA  1025

seq1: chr7_129149376_129150068
seq2: B6Ng01-097L13.g_68_763 (reverse)

seq1  GTGACCCTCCTGCCTCTA-CCCAT-TTCAGC-AAATCCTTTGGTGTGCAC  47
      |||||||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| |  |||| ||||
seq2  GTGACCCTCCTGCCTCTACCCCATATAAAGCAAAATCATAAGGTGAGCAC  50

seq1  CACCACAACTGGCTGTTATTCTCTTATGGAGTCTGTAACTGAACTTGAGC  97
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCACAACTGGCTGTTATTCTCTTATGGAGTCTGTAACTGAACTTGAGC  100

seq1  TATGCTGACCACCAGCAATCCTTAGCAATTCTCCTTATCTCTCTCCTCCA  147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCTGACCACCAGCAATCCTTAGCAATTCTCCTTATCTCTCTCCTCCA  150

seq1  TAGGACAACACATGCGTCAAACCCAGCATTTAACTTGGGCTCTGGGGATT  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGACAACACATGCGTCAAACCCAGCATTTAACTTGGGCTCTGGGGATT  200

seq1  CAAACTCACATCTTCATGCTTGCACACAAACATTGTTACTCATCAAGCCA  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACTCACATCTTCATGCTTGCACACAAACATTGTTACTCATCAAGCCA  250

seq1  CCTTTCAGACTTCAGACATCATCATAAGCCCCTCCCCCTAACCTCCACTG  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTCAGACTTCAGACATCATCATAAGCCCCTCCCCCTAACCTCCACTG  300

seq1  CTGTGGGGCGTGCCTGCTGCTTCCTTGACTTGGAACTAGGAAGACATGAC  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGGGGCGTGCCTGCTGCTTCCTTGACTTGGAACTAGGAAGACATGAC  350

seq1  TTTCTGTCTTCCTTCTTTCCATGTTCCTCCTTCCCTGCAGCTGCTGGGAT  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTGTCTTCCTTCTTTCCATGTTCCTCCTTCCCTGCAGCTGCTGGGAT  400

seq1  TCATAGCTTGCCCTCAGCTCTGTTGTTTTTTTTTTTCTCTCCAACTCCAA  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATAGCTTGCCCTCAGCTCTGTTGTTTTTTTTTTTCTCTCCAACTCCAA  450

seq1  TAAAACTGTCTTCCCTTTGAAGTCTATTTTATCTACGAGAAAGAACTTGC  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAACTGTCTTCCCTTTGAAGTCTATTTTATCTACGAGAAAGAACTTGC  500

seq1  AAATGAGACCCTGATTCCCCAGTAACGACATCACTGAACATCAACAGCCT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGAGACCCTGATTCCCCAGTAACGACATCACTGAACATCAACAGCCT  550

seq1  TCAAGAAACACACTCGAGATGTAACTTTCTGGTAGAGAGCTTATGCAAGT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGAAACACACTCGAGATGTAACTTTCTGGTAGAGAGCTTATGCAAGT  600

seq1  ACCACCTAAAATAAAATACTTCTACAGATAGAAAACATCACACAGAACAG  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCACCTAAAATAAAATACTTCTACAGATAGAAAACATCACACAGAACAG  650

seq1  TACATACACGGGCTCTGATTAAGGCTTTATATCACCTCAGGAATTC  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATACACGGGCTCTGATTAAGGCTTTATATCACCTCAGGAATTC  696