BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-099L14
Chromosome7 (Build37)
Map Location 39,235,102 - 39,241,465
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG625594
Upstream geneZfp536, LOC100043453, EG627844, C80913, Ccne1, 1600014C10Rik, Plekhf1, Pop4, LOC668519, LOC100043464, 1700010N08Rik, EG627975
Downstream geneEG627983, EG434171, LOC100043467
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-099L14.bB6Ng01-099L14.g
ACCDH909440DH909441
length5301,059
definitionDH909440|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-099L14, 5' end.DH909441|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-099L14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(39,240,937 - 39,241,465)(39,235,102 - 39,236,161)
sequence
gaattcaaataaagaagttccaaaattctttaggggatctcatataactg
aaattcttctataatgtagggaacatgtcaactggacaaagataaagact
acagaatgcaaaaagtgttttcctctctccatatcctgtaatatggttac
caaagcaaggagtaaatttcgaaatatatataaacaagtcaagaaactgc
atttcgaatggtcaaatcatccagtttcaaaattgcatacatatctgaac
aaaatactcagtagaggaaattcaaaggctgagaaacacttatagaaatg
ttgcacatcattggttgtcagggaaatgcaaatcaaaaccaccttgagtt
accatcttcaacatgttagaatgcctaagaccagtaacacagcatatcgt
gctggtgaggatgtagagcagaggaaacacttcctttctagttagtatgc
aatcttgtacagccactattgaaattaaaatggcagttccacagtaagtt
aaagatgatctacctgcaggtccatgcatc
gaattcctggagtgcatcttcccttccatgagtgcttccagtgcaatccc
acttgagagcacctggataggagggtgccgaggtggaaatctggccctgc
tctgttagcactgtcagcatggttgaggaagcatgtgggttaagataggc
attacccatgagcggctggagagaagtgctggatgctgatggtagaagcc
atgctgaactcacatctggggtggagaccctggaaaagttgcacaccgat
cctgcaggctgtatggagttgctcagcaaaggcagagaagggtgcagagt
gctttctgtcccaaagaaaggtgaactttgggaattttctgtagagagga
agaggacagtgggaaaatggtgaggttgatgttttctaggttactgtggg
gagcagtgctatatccagtgtgtactagctgtgactgactaagactgaag
tttcttccagcatcccaattgcaagtgctcaggttgattcttggatctag
ccataatgacactcctttgatgagctacctgatccttctctgtgggcatg
gaattcctggttgatctggctcaacctttgctccaacttagacattttcc
ttctttgccctgctttgtcttgctctcatacctgctgtaacattgcctcc
aaactctgtcctacagtagctgtgtttagaggtaggagagcctttagata
gcttctcaagctactgccttttccctgtcctgtgcacatctatgtagaga
gacatggactctttacttaagagtaggctggacttgaaatcacaaaaacc
aaccttgcctctggatctgacatgctgctattatagttgagtaccaggac
caccgagcttatctatactctgtgggtatttttgttttttaaaaattaca
tgtcagggagtttatatatgaatatctatttacttaatttacttggctac
ctgctccttgtccctctcactcctgaactgagatacttaaataactctta
aacacctgtgcgtttatgactttataataaacaactactggtcacaattt
caggggtgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_39240937_39241465
seq2: B6Ng01-099L14.b_50_579 (reverse)

seq1  GATGCGTGGACCTGCAGGTAGATCATC-TTAACTTACTGTGGAACTGCCA  49
      ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCATGGACCTGCAGGTAGATCATCTTTAACTTACTGTGGAACTGCCA  50

seq1  TTTTAATTTCAATAGTGGCTGTAGAAGATTGCATACTAACTAGAAAGGGA  99
      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
seq2  TTTTAATTTCAATAGTGGCTGTACAAGATTGCATACTAACTAGAAAGGAA  100

seq1  GTGTTTCCTCTGCTCTACATCCTCACCAGCATGATATGCTGTGTTACTGG  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  GTGTTTCCTCTGCTCTACATCCTCACCAGCACGATATGCTGTGTTACTGG  150

seq1  TCTTAGGCATTCTAACATGTTGAAGATGGTAACTCAAGGTGGTTTTGATT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTAGGCATTCTAACATGTTGAAGATGGTAACTCAAGGTGGTTTTGATT  200

seq1  TGCATTTCCCTGACAACCAATGATGTGCAACATTTCTATAAGTGTTTCTC  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATTTCCCTGACAACCAATGATGTGCAACATTTCTATAAGTGTTTCTC  250

seq1  AGCCTTTGAATTTCCTCTACTGAGTATTTTGTTCAGATATGTATGCAATT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTTTGAATTTCCTCTACTGAGTATTTTGTTCAGATATGTATGCAATT  300

seq1  TTGAAACTGGATGATTTGACCATTCGAAATGCAGTTTCTTGACTTGTTTA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAACTGGATGATTTGACCATTCGAAATGCAGTTTCTTGACTTGTTTA  350

seq1  TATATATTTCGAAATTTACTCCTTGCTTTGGTAACCATATTACAGGATAT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATATTTCGAAATTTACTCCTTGCTTTGGTAACCATATTACAGGATAT  400

seq1  GGAGAGAGGAAAACACTTTTTGCATTCTGTAGTCTTTATCTTTGTCCAGT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGAGAGGAAAACACTTTTTGCATTCTGTAGTCTTTATCTTTGTCCAGT  450

seq1  TGACATGTTCCCTACATTATAGAAGAAATTCAGTTATATGAGATCCCCTA  499
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  TGACATGTTCCCTACATTATAGAAGAATTTCAGTTATATGAGATCCCCTA  500

seq1  AAGAATTTTGGAACTTCTTTATTTGAATTC  529
      ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAATTTTGGAACTTCTTTATTTGAATTC  530

seq1: chr7_39235102_39236161
seq2: B6Ng01-099L14.g_67_1125

seq1  GAATTCCTGGAGTGCATCTTCCCTTCCATGAGTGCTTCCAGTGCAATCCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTGGAGTGCATCTTCCCTTCCATGAGTGCTTCCAGTGCAATCCC  50

seq1  ACTTGAGAGCACCTGGATAGGAGGGTGCCGAGGTGGAAATCTGGCCCTGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGAGAGCACCTGGATAGGAGGGTGCCGAGGTGGAAATCTGGCCCTGC  100

seq1  TCTGTTAGCACTGTCAGCATGGTTGAGGAAGCATGTGGGTTAAGATAGGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTTAGCACTGTCAGCATGGTTGAGGAAGCATGTGGGTTAAGATAGGC  150

seq1  ATTACCCATGAGCGGCTGGAGAGAAGTGCTGGATGCTGATGGTAGAAGCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTACCCATGAGCGGCTGGAGAGAAGTGCTGGATGCTGATGGTAGAAGCC  200

seq1  ATGCTGAACTCACATCTGGGGTGGAGACCCTGGAAAAGTTGCACACCGAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTGAACTCACATCTGGGGTGGAGACCCTGGAAAAGTTGCACACCGAT  250

seq1  CCTGCAGGCTGTATGGAGTTGCTCAGCAAAGGCAGAGAAGGGTGCAGAGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCAGGCTGTATGGAGTTGCTCAGCAAAGGCAGAGAAGGGTGCAGAGT  300

seq1  GCTTTCTGTCCCAAAGAAAGGTGAACTTTGGGAATTTTCTGTAGAGAGGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTCTGTCCCAAAGAAAGGTGAACTTTGGGAATTTTCTGTAGAGAGGA  350

seq1  AGAGGACAGTGGGAAAATGGTGAGGTTGATGTTTTCTAGGTTACTGTGGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGACAGTGGGAAAATGGTGAGGTTGATGTTTTCTAGGTTACTGTGGG  400

seq1  GAGCAGTGCTATATCCAGTGTGTACTAGCTGTGACTGACTAAGACTGAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAGTGCTATATCCAGTGTGTACTAGCTGTGACTGACTAAGACTGAAG  450

seq1  TTTCTTCCAGCATCCCAATTGCAAGTGCTCAGGTTGATTCTTGGATCTAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTCCAGCATCCCAATTGCAAGTGCTCAGGTTGATTCTTGGATCTAG  500

seq1  CCATAATGACACTCCTTTGATGAGCTACCTGATCCTTCTCTGTGGGCATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATAATGACACTCCTTTGATGAGCTACCTGATCCTTCTCTGTGGGCATG  550

seq1  GAATTCCTGGTTGATCTGGCTCAACCTTTGCTCCAACTTAGACATTTTCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTGGTTGATCTGGCTCAACCTTTGCTCCAACTTAGACATTTTCC  600

seq1  TTCTTTGCCCTGCTTTGTCTTGCTCTCATACCTGCTGTAACATTGCCTCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTTGCCCTGCTTTGTCTTGCTCTCATACCTGCTGTAACATTGCCTCC  650

seq1  AAACTCTGTCCTACAGTAGCTGTGTTTAGAGGTAGGAGAGCC-TTAGATA  699
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  AAACTCTGTCCTACAGTAGCTGTGTTTAGAGGTAGGAGAGCCTTTAGATA  700

seq1  GCTTCTCAAGCTACTGCCTTTTCCCTGTCCTGTGCACATCTATGTAGAGA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCTCAAGCTACTGCCTTTTCCCTGTCCTGTGCACATCTATGTAGAGA  750

seq1  GACATGGACTCTTTACTTAAGAGTAGGCTGGACTTGAAATCACAAAAACC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATGGACTCTTTACTTAAGAGTAGGCTGGACTTGAAATCACAAAAACC  800

seq1  AACC-TGCCTCTGGATCTGACATGCTGCTATTATAGTTGAGTACCAGGAC  848
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTTGCCTCTGGATCTGACATGCTGCTATTATAGTTGAGTACCAGGAC  850

seq1  CACCGAGCTTATCTATACTCTGTGGGTATTTTTGTTTTTTAAAAATTACA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCGAGCTTATCTATACTCTGTGGGTATTTTTGTTTTTTAAAAATTACA  900

seq1  TGTCAGGGAGTTTATATATGAATATTCTATTTACTTAATTTACTTTGCTA  948
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||
seq2  TGTCAGGGAGTTTATATATGAATA-TCTATTTACTTAATTTACTTGGCTA  949

seq1  CCTCCTCCTTTGTCCCTCTCACTCCTGTAACTGATGATATCTTATATAAC  998
      ||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||
seq2  CCTGCTCC-TTGTCCCTCTCACTCCTG-AACTGA-GATA-CTTAAATAAC  995

seq1  TCTTAAACACCTGTGCGTTTATGACTTTAT-ATATACAACCTACTGGTCA  1047
      |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||
seq2  TCTTAAACACCTGTGCGTTTATGACTTTATAATAAACAA-CTACTGGTCA  1044

seq1  C-ATTTCA-TGGTGT  1060
      | ||||||  |||||
seq2  CAATTTCAGGGGTGT  1059