BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-099P11
Chromosome7 (Build37)
Map Location 92,678,364 - 92,809,570
singlet/doubletdoublet
Overlap geneVmn2r70, Vmn2r-ps72, EG233445
Upstream geneLOC100039239, Fah, Zfand6, 2610206C17Rik, EG620480, Olfr291, LOC666276, Olfr290, ENSMUSG00000070600, F830104D24Rik, LOC620641, EG620672, Vmn2r-ps68, EG620697, Vmn2r-ps69, LOC330581, LOC100039339
Downstream geneVmn2r-ps74, EG244114, EG620928, EG546980, LOC666382, LOC637652, LOC637667, EG666418, LOC100039471, EG546981, Vmn2r-ps86, Vmn2r76, Olfr310, Olfr309, Olfr308, Olfr307, Olfr306-ps1, Olfr305, Olfr304, Olfr303, Olfr301, Olfr1531-ps1, Olfr300-ps1, Olfr299, Olfr298, Olfr297, Olfr296-ps1, Olfr295, Olfr294
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-099P11.bB6Ng01-099P11.g
ACCDH909608DH909609
length1,0741,147
definitionDH909608|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-099P11, 5' end.DH909609|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-099P11, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(92,808,498 - 92,809,570)(92,678,364 - 92,679,507)
sequence
gaattcccctatactggggcatagaatcttcacaggaccaagggcctctg
ctcccattgatgacctactaggcctctgctacatatgcagctatagccat
gtgtcccaccatgtgttttctttggttggcggtttagtcccaggaagctc
tgggggaacttgttagttcatattgttgttccccctatgaggttgcaaac
cctttcagctccttggggaaattctctagctcctatattgctgaccatgt
gctaagtccaatggatgacagtgagcatccactactgtatttttcagaca
ctggcagagcctctcaggagacagctatatcatactattgtcagcaagct
cttattggcatccagaatagtatctgggtttggtggtggtttaagggatg
gctccccatgtggagcagtctctggacagtcataggccatggaatagatc
ctcagtcctctgtacaccttcactgccagaggagagcttgcctccaggga
gtgctctgactccaggcaacattcttaagactggagatgacaagtaggat
ggagatgaaaaataaggaagggtaatcccagactttaccttttggtgctt
gagggaaaggaagagaacaccaatccagaggtcatgttcccagatgttct
tcagaaatattgagagggccaaaagagcatcttctctaatttggtctatg
aatcaccagaatggtgttcagtgaccaaatctgggtttcctttaatggtg
aaggggagcaaacctataatgatgaaaagcccaaaggaaacaaatgagga
acaaatagatatgacagatgatgtgtcaaaggcttgtacttaaacagagg
actccctctgttgttactccaagaccatagcatcaaactgaatttgaaaa
tggaaagtgcaccaaggatgagagtacaaagaaacaaaggatattaggtc
catgcatgctctaccatcacaggacctacaacataaacaactatgggtcc
aacctcgacttaccagcaaccaagtgagcacatagcatgtgtccccagga
gaaagaaccgaatcatgtttaatt
gaattcactcccagtcactgcccatctcgggcatagtagtaggttgatgg
gtgagcaacttatcaggtgctgtcacgccacatcaggtgctgaaacgtca
tgctgcgggctatataagcagcaccattttctgggttcagggtcttcctg
agaagtaagcaataaaaactttgccgtagaaggatccggttgtcagagtg
aattcttgccagcgagatactagctcgggcgagaggtgggcagctgccat
cacccctttcctctcccacatttggttcaaacccctaattattcagttag
ggaagcaaccaaccattagcaatcggtggaacgtgccagacaagactgac
attcagtctgccagaggttagggtgtggaagggtgacatatgattgccac
gaggtataactggggttagggtggtatcttaactctcttggcctctcaat
tctgcaagcagagaacattctagagggaggcagggagccgctcacagtgg
gctctctgctttgctctaatagtcaatattaataaaacattgcattaaac
ccaattatcagaggagataattgaagccattttttcacatctccagggac
agagagcattgactcctgggtatagtggctggtgcctaggtaatttgagg
tagcctgaggacatgttggggctaaggatctacagaggaacaagttccta
agaaaagggagtaaggctcaagctggagactctaaccctccccttcccca
acacaggacagcaaggtcctctcttctgcttcaaccagtacccaagaggg
catgctaaactgccaacaggatagctggagtgctggtctcattacttggg
tagctcagtacgtcccttttctgaggcttagttttcttatctgctcagtg
ggaccacgatcctatagagagatgttggcaaaatcatctaatgcattagg
ggtgcccagtgaccagggaacactctttctaactgctgttaagagttgtc
tatggacattgtggtggaacatagactctccagcacctattcaaaggtag
atcataatgattaaattcttaagaacgtgggtgctggaccagagggcttc
agagacggggaacacttctggctctctaagagagaccagcacccaca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_92808498_92809570
seq2: B6Ng01-099P11.b_50_1123 (reverse)

seq1  AATTAAACATGATCTGGTTTCTTTCTCCTGGGGACAC-TGCTGTTGTGCT  49
      ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||  ||||||
seq2  AATTAAACATGAT-TCGGTTCTTTCTCCTGGGGACACATGCT-ATGTGCT  48

seq1  CCCTTTGGTTGCTTGTTAGCTGA-GTTGGACCCATAGTGTTTTATGTTGT  98
      | | ||||||||| || ||  || ||||||||||||||  ||||||||||
seq2  CAC-TTGGTTGCTGGTAAGTCGAGGTTGGACCCATAGTTGTTTATGTTGT  97

seq1  AGGTCCTGTGATGGT-GAGCATGCATGGACCT-ATATCCTTTGTCTCTTT  146
      ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || ||
seq2  AGGTCCTGTGATGGTAGAGCATGCATGGACCTAATATCCTTTGTTTC-TT  146

seq1  TGTACTCTCATCC-TGGTGCACTTTCCATTTTCAATTTCAGTTTTGATGC  195
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
seq2  TGTACTCTCATCCTTGGTGCACTTTCCATTTTCAAATTCAG-TTTGATGC  195

seq1  TATGGTCTTGGAGTAACAACAGAGGGAGTCCTCTGTTT-AGTACAAGCCT  244
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| 
seq2  TATGGTCTTGGAGTAACAACAGAGGGAGTCCTCTGTTTAAGTACAAGCC-  244

seq1  TTTGACACATCATCTGTCATATCTATTTGTTCCTCATTTGTTTCCTTTGG  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGACACATCATCTGTCATATCTATTTGTTCCTCATTTGTTTCCTTTGG  294

seq1  GCTTTTCATCATTATAGGTTTGCTCCCCTTCACCATT-AAGGAAACCCAG  343
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  GCTTTTCATCATTATAGGTTTGCTCCCCTTCACCATTAAAGGAAACCCAG  344

seq1  ATTTGGTCACTGAACACCATTCTGGTGATTCATAGACCAAATTAGGGAAG  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  ATTTGGTCACTGAACACCATTCTGGTGATTCATAGACCAAATTAGAGAAG  394

seq1  ATGCTCTTTTGGCCCTCTCAATATTTCTGAAGAACATCTGGGAACATGAC  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTCTTTTGGCCCTCTCAATATTTCTGAAGAACATCTGGGAACATGAC  444

seq1  CTCTGGATTGGTGTTCTCTTCCTTTCCCTCAAGCACCAAAAGGTAAAGTC  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGGATTGGTGTTCTCTTCCTTTCCCTCAAGCACCAAAAGGTAAAGTC  494

seq1  TGGGATTACCCTTCCTTATTTTTCATCTCCATCCTACTTGTCATCTCCAG  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGATTACCCTTCCTTATTTTTCATCTCCATCCTACTTGTCATCTCCAG  544

seq1  TCTTAAGAATGTTGCCTGGAGTCAGAGCACTCCCTGGAGGCAAGCTCTCC  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTAAGAATGTTGCCTGGAGTCAGAGCACTCCCTGGAGGCAAGCTCTCC  594

seq1  TCTGGCAGTGAAGGTGTACAGAGGACTGAGGATCTATTCCATGGCCTATG  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGCAGTGAAGGTGTACAGAGGACTGAGGATCTATTCCATGGCCTATG  644

seq1  ACTGTCCAGAGACTGCTCCACATGGGGAGCCATCCCTTAAACCACCACCA  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTCCAGAGACTGCTCCACATGGGGAGCCATCCCTTAAACCACCACCA  694

seq1  AACCCAGATACTATTCTGGATGCCAATAAGAGCTTGCTGACAATAGTATG  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCAGATACTATTCTGGATGCCAATAAGAGCTTGCTGACAATAGTATG  744

seq1  ATATAGCTGTCTCCTGAGAGGCTCTGCCAGTGTCTGAAAAATACAGTAGT  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAGCTGTCTCCTGAGAGGCTCTGCCAGTGTCTGAAAAATACAGTAGT  794

seq1  GGATGCTCACTGTCATCCATTGGACTTAGCACATGGTCAGCAATATAGGA  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGCTCACTGTCATCCATTGGACTTAGCACATGGTCAGCAATATAGGA  844

seq1  GCTAGAGAATTTCCCCAAGGAGCTGAAAGGGTTTGCAACCTCATAGGGGG  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAGAGAATTTCCCCAAGGAGCTGAAAGGGTTTGCAACCTCATAGGGGG  894

seq1  AACAACAATATGAACTAACAAGTTCCCCCAGAGCTTCCTGGGACTAAACC  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAACAATATGAACTAACAAGTTCCCCCAGAGCTTCCTGGGACTAAACC  944

seq1  GCCAACCAAAGAAAACACATGGTGGGACACATGGCTATAGCTGCATATGT  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAACCAAAGAAAACACATGGTGGGACACATGGCTATAGCTGCATATGT  994

seq1  AGCAGAGGCCTAGTAGGTCATCAATGGGAGCAGAGGCCCTTGGTCCTGTG  1043
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGAGGCCTAGTAGGTCATCAATGGGAGCAGAGGCCCTTGGTCCTGTG  1044

seq1  AAGATTCTATGCCCCAGTATAGGGGAATTC  1073
      ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATTCTATGCCCCAGTATAGGGGAATTC  1074

seq1: chr7_92678364_92679507
seq2: B6Ng01-099P11.g_69_1215

seq1  GAATTCACTCCCAGTCACTGCCCATCTCGGGCATAGTAGTAGGTTGATGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTCCCAGTCACTGCCCATCTCGGGCATAGTAGTAGGTTGATGG  50

seq1  GTGAGCAACTTATCAGGTGCTGTCACGCCACATCAGGTGCTGAAACGTCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGCAACTTATCAGGTGCTGTCACGCCACATCAGGTGCTGAAACGTCA  100

seq1  TGCTGCGGGCTATATAAGCAGCACCATTTTCTGGGTTCAGGGTCTTCCTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGCGGGCTATATAAGCAGCACCATTTTCTGGGTTCAGGGTCTTCCTG  150

seq1  AGAAGTAAGCAATAAAAACTTTGCCGTAGAAGGATCCGGTTGTCAGAGTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGTAAGCAATAAAAACTTTGCCGTAGAAGGATCCGGTTGTCAGAGTG  200

seq1  AATTCTTGCCAGCGAGATACTAGCTCGGGCGAGAGGTGGGCAGCTGCCAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCTTGCCAGCGAGATACTAGCTCGGGCGAGAGGTGGGCAGCTGCCAT  250

seq1  CACCCCTTTCCTCTCCCACATTTGGTTCAAACCCCTAATTATTCAGTTAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCCTTTCCTCTCCCACATTTGGTTCAAACCCCTAATTATTCAGTTAG  300

seq1  GGAAGCAACCAACCATTAGCAATCGGTGGAACGTGCCAGACAAGACTGAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGCAACCAACCATTAGCAATCGGTGGAACGTGCCAGACAAGACTGAC  350

seq1  ATTCAGTCTGCCAGAGGTTAGGGTGTGGAAGGGTGACATATGATTGCCAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCAGTCTGCCAGAGGTTAGGGTGTGGAAGGGTGACATATGATTGCCAC  400

seq1  GAGGTATAACTGGGGTTAGGGTGGTATCTTAACTCTCTTGGCCTCTCAAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTATAACTGGGGTTAGGGTGGTATCTTAACTCTCTTGGCCTCTCAAT  450

seq1  TCTGCAAGCAGAGAACATTCTAGAGGGAGGCAGGGAGCCGCTCACAGTGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCAAGCAGAGAACATTCTAGAGGGAGGCAGGGAGCCGCTCACAGTGG  500

seq1  GCTCTCTGCTTTGCTCTAATAGTCAATATTAATAAAACATTGCATTAAAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTCTGCTTTGCTCTAATAGTCAATATTAATAAAACATTGCATTAAAC  550

seq1  CCAATTATCAGAGGAGATAATTGAAGCCATTTTTTCACATCTCCAGGGAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATTATCAGAGGAGATAATTGAAGCCATTTTTTCACATCTCCAGGGAC  600

seq1  AGAGAGCATTGACTCCTGGGTATAGTGGCTGGTGCCTAGGTAATTTGAGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGCATTGACTCCTGGGTATAGTGGCTGGTGCCTAGGTAATTTGAGG  650

seq1  TAGCCTGAGGACATGTTGGGGCTAAGGATCTACAGAGGAACAAGTTCCTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCCTGAGGACATGTTGGGGCTAAGGATCTACAGAGGAACAAGTTCCTA  700

seq1  AGAAAAGGGAGTAAGGCTCAAGCTGGAGACTCTAACCCTCCCCTTCCCCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAAGGGAGTAAGGCTCAAGCTGGAGACTCTAACCCTCCCCTTCCCCA  750

seq1  ACACAGGACAGCAAGGTCCTCTCTTCTGCTTCAACCAGTACCCAAGAGGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAGGACAGCAAGGTCCTCTCTTCTGCTTCAACCAGTACCCAAGAGGG  800

seq1  CATGCTAAACTGCCAACAGGATAGCTGGAGTGCTGGTCTCATTACTT-GG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  CATGCTAAACTGCCAACAGGATAGCTGGAGTGCTGGTCTCATTACTTGGG  850

seq1  TAGCTCAGTACGTCCCTTTTCTGAGGCTTAGTTTTCTTATCTGCTCAGTG  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTCAGTACGTCCCTTTTCTGAGGCTTAGTTTTCTTATCTGCTCAGTG  900

seq1  G--ACACGATCCTATAGAGAGATGTTGGCAAAATCATCTAATGCATTA-G  946
      |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  GGACCACGATCCTATAGAGAGATGTTGGCAAAATCATCTAATGCATTAGG  950

seq1  GGTGCCCAGTGACCAGGGAACACTCTTTCTTAACTGCTGTTAAGAGTTTG  996
      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||
seq2  GGTGCCCAGTGACCAGGGAACACTCTTTC-TAACTGCTGTTAAGAG-TTG  998

seq1  TCTGTCTGACATTGT-GTGGACCATAGACTCTGCAGCACCTATTCAAAGG  1045
      ||| |  |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TCTAT-GGACATTGTGGTGGAACATAGACTCTCCAGCACCTATTCAAAGG  1047

seq1  GTAAGATCATAATGA-TAAAATCTAAAGAACAGTGGTGCTGGA-CAGATG  1093
         |||||||||||| |||| ||| ||||||   ||||||||| |||| |
seq2  --TAGATCATAATGATTAAATTCTTAAGAACGTGGGTGCTGGACCAGAGG  1095

seq1  GC-TCAGTAGACGGGGAGCACTTTCTGCTCTTCAAGA-AGACCAGCACCC  1141
      || |||| ||||||||| |||||   |||||  |||| ||||||||||||
seq2  GCTTCAG-AGACGGGGAACACTTCTGGCTCTCTAAGAGAGACCAGCACCC  1144

seq1  ACA  1144
      |||
seq2  ACA  1147