BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-104H10
Chromosome7 (Build37)
Map Location 128,473,624 - 128,615,709
singlet/doubletdoublet
Overlap geneHs3st2
Upstream geneAbca15, Abca16, LOC668429, LOC546994, LOC100042914, E130201H02Rik, LOC637957, Uqcrc2, 4930408O21Rik, BC030336, E030013G06Rik, EG436008, LOC100043426, Eef2k, Polr3e, Cdr2, 4933427G17Rik, EG668548, Mettl9, LOC668456, Igsf6, Otoa, LOC668556
Downstream geneUsp31, Scnn1g, Scnn1b, Cog7, Gga2, Ears2, Ubfd1, Ndufab1, Palb2, Dctn5, Plk1, Ern2, 2010110P09Rik, Prkcb1, LOC668486
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-104H10.bB6Ng01-104H10.g
ACCDH912755DH912756
length8021,042
definitionDH912755|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-104H10, 5' end.DH912756|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-104H10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(128,614,911 - 128,615,709)(128,473,624 - 128,474,665)
sequence
gaattcacagggacacatgctgaggaaatgtggatttgagagcagtagtt
ctaagttcaaatgttatgttcttgggaagggattgtcttgactcctttca
acctcatctctaaagactatggcttcaaatagtggctgggctgtcctcag
gtattggaggttggagagggtgtaggaggggaagccttcttctgtccacc
cttaaggaatcctttgctctatttgtacaggagttcgggatgtcagaggt
gtgtagtccaagagcgaaaaccgcaatggtttggggcaaatgatgcttga
gataggcatctacattggatcagaacctgcctagcttcataggggataaa
aatgatggtaagtatactttccttccttttgcagatggaaaaactgatga
taagaaaggtacccagcgttacccaacttaaaaatggccaagcataggta
caaacccaggagcctatttctgtagcacctgcattggaatatgacacccc
gaaatgatggccaggacctggggagattcatggtgtgacaatccttcaac
catacagtcctggacagcaggatgtaaggatcagtgtgagcacttgcaca
cgctctgaacactactgaggctgaagcactgctgtcccttctctcccatc
cggaggcaaaggaatctagacttgaggatctgttcatcctcttaccagta
tgctcttaggcgagctgatgaagcctccattccttgggtctctttgtcta
taagatggtgatatgaagcctattagagtgagtcagacggtgcttccccg
at
gaattcttgactaagacacttgttaaggggggctgattttgtttttcttt
ttaagtgatggcaggtgtccctaaatatggaaacccaacatacaacaggc
tcatggagacacattagtgtcacatgccacccaaggactcaatttgcaac
cttgatctcagcttcttcgtcaagtgtacatgaggaaaggatgcctagag
cgggtatgcagcaagcatgaggactgagtttagatccccagcgctcacat
gaaacatggcatggcagttcacagctgcagccccagggctggggtcagag
gaacagagatcagcagacgtcggggagctgctggcctgaccgtctagccc
aaagagtgagttccaggttcagtgagacaccatgtctcaaaaaagtggtg
attaaggaacacatcttccccctactcgccaatacatcctcccagagact
cagagagagaagctgcgagtcagggtctgctcataagacagacggtgtat
ttaaataagcacaagtaagaaggctttgtattaaagaaggggatcgccca
gcaatacctctcctgggcatatatccagaagatgccccaacaggtaagaa
ggacacatgctccactatgttcatagcagccttatttataatagccagaa
gctggaaagaacctagatgcccctcaaaaagaggaatggatacagaaaat
gtggtacatctacacaatggagtactactcagctattaaaaagaatgaat
ttatgaaattcctagccaaatggatggacctggagggcatcatcctgagt
gagggtaacacattcacaaagaaactcacacattatgtattcactgataa
gtggatattagccccaaacctagatacccaagatataagatataatttgc
taaacacatgaaaactcaaggagaatgaagactgaagtgtgacactatgc
ccctccttagatttgggaacaaaacacccatggaaggagttacagagacg
gagtttggagctgagatgaaagatggaccatgtagagactgc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_128614911_128615709
seq2: B6Ng01-104H10.b_46_847 (reverse)

seq1  ATCGGGG-AGCACCGTCTGACTCACTCT-ATAGGCTTCATATCACCATCT  48
      ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  ATCGGGGAAGCACCGTCTGACTCACTCTAATAGGCTTCATATCACCATCT  50

seq1  TATAGAC-AAGAGACCCAAGGAATGGAGGCTTCATCAGCTCGCCTAAGAG  97
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGACAAAGAGACCCAAGGAATGGAGGCTTCATCAGCTCGCCTAAGAG  100

seq1  CATACTGGTAAGAGGATGAACAGATCCTCAAGTCTAGATTCCTTTGCCTC  147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACTGGTAAGAGGATGAACAGATCCTCAAGTCTAGATTCCTTTGCCTC  150

seq1  CGGATGGGAGAGAAGGGACAGCAGTGCTTCAGCCTCAGTAGTGTTCAGAG  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGATGGGAGAGAAGGGACAGCAGTGCTTCAGCCTCAGTAGTGTTCAGAG  200

seq1  CGTGTGCAAGTGCTCACACTGATCCTTACATCCTGCTGTCCAGGACTGTA  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGTGCAAGTGCTCACACTGATCCTTACATCCTGCTGTCCAGGACTGTA  250

seq1  TGGTTGAAGGATTGTCACACCATGAATCTCCCCAGGTCCTGGCCATCATT  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTGAAGGATTGTCACACCATGAATCTCCCCAGGTCCTGGCCATCATT  300

seq1  TCGGGGTGTCATATTCCAATGCAGGTGCTACAGAAATAGGCTCCTGGGTT  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGGGGTGTCATATTCCAATGCAGGTGCTACAGAAATAGGCTCCTGGGTT  350

seq1  TGTACCTATGCTTGGCCATTTTTAAGTTGGGTAACGCTGGGTACCTTTCT  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTACCTATGCTTGGCCATTTTTAAGTTGGGTAACGCTGGGTACCTTTCT  400

seq1  TATCATCAGTTTTTCCATCTGCAAAAGGAAGGAAAGTATACTTACCATCA  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCATCAGTTTTTCCATCTGCAAAAGGAAGGAAAGTATACTTACCATCA  450

seq1  TTTTTATCCCCTATGAAGCTAGGCAGGTTCTGATCCAATGTAGATGCCTA  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTATCCCCTATGAAGCTAGGCAGGTTCTGATCCAATGTAGATGCCTA  500

seq1  TCTCAAGCATCATTTGCCCCAAACCATTGCGGTTTTCGCTCTTGGACTAC  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCAAGCATCATTTGCCCCAAACCATTGCGGTTTTCGCTCTTGGACTAC  550

seq1  ACACCTCTGACATCCCGAACTCCTGTACAAATAGAGCAAAGGATTCCTTA  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCTCTGACATCCCGAACTCCTGTACAAATAGAGCAAAGGATTCCTTA  600

seq1  AGGGTGGACAGAAGAAGGCTTCCCCTCCTACACCCTCTCCAACCTCCAAT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTGGACAGAAGAAGGCTTCCCCTCCTACACCCTCTCCAACCTCCAAT  650

seq1  ACCTGAGGACAGCCCAGCCACTATTTGAAGCCATAGTCTTTAGAGATGAG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGAGGACAGCCCAGCCACTATTTGAAGCCATAGTCTTTAGAGATGAG  700

seq1  GTTGAAAGGAGTCAAGACAATCCCTTCCCAAGAACATAACATTTGAACTT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGAAAGGAGTCAAGACAATCCCTTCCCAAGAACATAACATTTGAACTT  750

seq1  AGAACTACTGCTCTCAAATCCACATTTCCTCAGCATGTGTCCCTGTGAAT  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACTACTGCTCTCAAATCCACATTTCCTCAGCATGTGTCCCTGTGAAT  800

seq1  TC  799
      ||
seq2  TC  802

seq1: chr7_128473624_128474665
seq2: B6Ng01-104H10.g_69_1110

seq1  GAATTCTTGACTAAGACACTTGTTAAGGGGGGCTGATTTTGTTTTTCTTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTGACTAAGACACTTGTTAAGGGGGGCTGATTTTGTTTTTCTTT  50

seq1  TTAAGTGATGGCAGGTGTCCCTAAATATGGAAACCCAACATACAACAGGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGTGATGGCAGGTGTCCCTAAATATGGAAACCCAACATACAACAGGC  100

seq1  TCATGGAGACACATTAGTGTCACATGCCACCCAAGGACTCAATTTGCAAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGGAGACACATTAGTGTCACATGCCACCCAAGGACTCAATTTGCAAC  150

seq1  CTTGATCTCAGCTTCTTCGTCAAGTGTACATGAGGAAAGGATGCCTAGAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGATCTCAGCTTCTTCGTCAAGTGTACATGAGGAAAGGATGCCTAGAG  200

seq1  CGGGTATGCAGCAAGCATGAGGACTGAGTTTAGATCCCCAGCGCTCACAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGGTATGCAGCAAGCATGAGGACTGAGTTTAGATCCCCAGCGCTCACAT  250

seq1  GAAACATGGCATGGCAGTTCACAGCTGCAGCCCCAGGGCTGGGGTCAGAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACATGGCATGGCAGTTCACAGCTGCAGCCCCAGGGCTGGGGTCAGAG  300

seq1  GAACAGAGATCAGCAGACGTCGGGGAGCTGCTGGCCTGACCGTCTAGCCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACAGAGATCAGCAGACGTCGGGGAGCTGCTGGCCTGACCGTCTAGCCC  350

seq1  AAAGAGTGAGTTCCAGGTTCAGTGAGACACCATGTCTCAAAAAAGTGGTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAGTGAGTTCCAGGTTCAGTGAGACACCATGTCTCAAAAAAGTGGTG  400

seq1  ATTAAGGAACACATCTTCCCCCTACTCGCCAATACATCCTCCCAGAGACT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAGGAACACATCTTCCCCCTACTCGCCAATACATCCTCCCAGAGACT  450

seq1  CAGAGAGAGAAGCTGCGAGTCAGGGTCTGCTCATAAGACAGACGGTGTAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGAGAGAAGCTGCGAGTCAGGGTCTGCTCATAAGACAGACGGTGTAT  500

seq1  TTAAATAAGCACAAGTAAGAAGGCTTTGTATTAAAGAAGGGGATCGCCCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAATAAGCACAAGTAAGAAGGCTTTGTATTAAAGAAGGGGATCGCCCA  550

seq1  GCAATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGATGCCCCAACAGGTAAGAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGATGCCCCAACAGGTAAGAA  600

seq1  GGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAA  650

seq1  GCTGGAAAGAACCTAGATGCCCCTC-AAAAGAGGAATGGATACAGAAAAT  699
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGAAAGAACCTAGATGCCCCTCAAAAAGAGGAATGGATACAGAAAAT  700

seq1  GTGGTACATCTACACAATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGAATGAAT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTACATCTACACAATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGAATGAAT  750

seq1  TTATGAAATTCCTAGCCAAATGGATGGACCTGGAGGGCATCATCCTGAGT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGAAATTCCTAGCCAAATGGATGGACCTGGAGGGCATCATCCTGAGT  800

seq1  GA-GGTAACACATTCACAAAGAAACTCACACAATATGTATTCACTGATAA  848
      || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  GAGGGTAACACATTCACAAAGAAACTCACACATTATGTATTCACTGATAA  850

seq1  GTGGATATTAGCCCCAAACCTAGGATACCCAAGATATAAGATATAATTTG  898
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGATATTAGCCCCAAACCTA-GATACCCAAGATATAAGATATAATTTG  899

seq1  CTAAACACATG-AAACTCAAGGAGAATGAAGACTGAAGTGTGGACACTAT  947
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  CTAAACACATGAAAACTCAAGGAGAATGAAGACTGAAGTGT-GACACTAT  948

seq1  GCCCCTCCTTAGATTTGGGAACAAAACACCCATGGAAGGAGTTACAGAGA  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCTCCTTAGATTTGGGAACAAAACACCCATGGAAGGAGTTACAGAGA  998

seq1  CGGAGTTTGGAGCTGAGATGAAAGGATGGACCATGTAGAGACTGC  1042
      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  CGGAGTTTGGAGCTGAGATGAAA-GATGGACCATGTAGAGACTGC  1042