BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-106K08
Chromosome7 (Build37)
Map Location 91,586,095 - 91,751,806
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100039239, Fah
Upstream geneEG666160, Tmc3, Stard5, Il16, Phgdh-ps1, LOC666170, 1700026D08Rik, Mesdc1, Mesdc2, 9930013L23Rik, 2210412D01Rik, Arnt2
Downstream geneZfand6, 2610206C17Rik, EG620480, Olfr291, LOC666276, Olfr290, ENSMUSG00000070600, F830104D24Rik, LOC620641, EG620672, Vmn2r-ps68, EG620697, Vmn2r-ps69, LOC330581, LOC100039339, Vmn2r70, Vmn2r-ps72
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-106K08.bB6Ng01-106K08.g
ACCDH914327DH914328
length1,215460
definitionDH914327|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-106K08, 5' end.DH914328|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-106K08, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(91,586,095 - 91,587,335)(91,751,341 - 91,751,806)
sequence
gaattctactatgaatttgttaagggccctcctgtaatagaaagcagctc
tgtgatttcatttaaaatctttgatgtcagaggacaagttcagagcagag
caaagtcaagcaggagggatgaggccttcatgtgtgctgcgtatatgtgt
gctacatgtgatcagcccctactcctaggagcccatgagaacctctgggg
ccacccccacatgactttaagtagttccttatttatagttctttttttat
agttactcaaacactacatagttgtgctcttcataatccacagtaacaaa
gatgtaagaatcctccactgataaactagctgccttcccagaagacatcc
acagttccaaccattgtctctatcccatgttcatctacacacatgggcac
cctcccccctccccccacaaggtgttggctcatactacatccttctgata
tccaggatatccagtttgatgaagatctgggcacttgtatcaggtctcca
acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacactgttgt
ctcctgattctcaatggctttgcctcaggctatgctctccttatctccct
agaagtcattgttggcaccatcaagtattcttgtttctgaggagaggagt
tcttgaacatgtctttttttttttttcctagccaagtttctattcattac
ccactgagtgttgccagtgagccccaggattcaggactgagcaagctccc
ctagaagaggcctcctctgtgccatttatgctacataaccagtctatggc
acaataaaaatgggggtacatgcaacagtcattccttattacatgggcat
tcctctattcttctgctacccctaattattctttactggtaccccattct
tctttaaaaacacccccaccccccaagacacaatcaatttgacactcttt
ccaggatctcgctgagatgaatttccttccactctcacccatcttgaatc
tgttcacaataaaatgcattttgaagctcacagctgtgattagtgaagtg
atcctctgttgttaagtctttgatcactggagggagaacacagagctggg
tctggaaaatgagccttgtgctagctgacagctccgagagtcaaggaact
gggtctcctgccttccatctgtactgcatggatgggtctagcgtggcact
ctcaatggggctatg
cacctctcaactctcgtggatctcctagaatatggcaaaactgctgcttc
aggtgccagggaagcctggcttaggacagttccaggaggtgaaatcttct
aacatgctcggtgctgtgaggtcagagaccagctttgacaagatatttgg
gcctctgtaattatctgaacccatgcagagctcttacagggcataaaaga
aatccatcattcatgtgatctgagcactgtgacttctgcagttccctaca
acctgagctgcattcaagctaccacagagctgatcctccatgttactaca
tgtggaacactcactgctctgcttcataagagaatggccctgagcaaagc
cctgggcccagcatgaaaagagagagattcaggtggtgggcgtggtggcg
tacgcctttaatcccagcacttgggaggcagaggcatgtggatttctgat
tttgatgcca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_91586095_91587335
seq2: B6Ng01-106K08.b_46_1260

seq1  GAATTCTACTATGAATTTGTTAAGGGCCCTCCTGTAATAGAAAGCAGCTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTACTATGAATTTGTTAAGGGCCCTCCTGTAATAGAAAGCAGCTC  50

seq1  TGTGATTTCATTTAAAATCTTTGATGTCAGAGGACAAGTTCAGAGCAGAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGATTTCATTTAAAATCTTTGATGTCAGAGGACAAGTTCAGAGCAGAG  100

seq1  CAAAGTCAAGCAGGAGGGATGAGGCCTTCATGTGTGCTGCGTATATGTGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGTCAAGCAGGAGGGATGAGGCCTTCATGTGTGCTGCGTATATGTGT  150

seq1  GCTACATGTGATCAGCCCCTACTCCTAGGAGCCCATGAGAACCTCTGGGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTACATGTGATCAGCCCCTACTCCTAGGAGCCCATGAGAACCTCTGGGG  200

seq1  CCACCCCCACATGACTTTAAGTAGTTCCTTATTTATAGTTCTTTTTTTAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCCCCACATGACTTTAAGTAGTTCCTTATTTATAGTTCTTTTTTTAT  250

seq1  AGTTACTCAAACACTACATAGTTGTGCTCTTCATAATCCACAGTAACAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTACTCAAACACTACATAGTTGTGCTCTTCATAATCCACAGTAACAAA  300

seq1  GATGTAAGAATCCTCCACTGATAAACTAGCTGCCTTCCCAGAAGACATCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTAAGAATCCTCCACTGATAAACTAGCTGCCTTCCCAGAAGACATCC  350

seq1  ACAGTTCCAACCATTGTCTCTATCCCATGTTCATCTACACACATGGGCAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTTCCAACCATTGTCTCTATCCCATGTTCATCTACACACATGGGCAC  400

seq1  CCTCCCCCCTCCCCCCACAAGGTGTTGGCTCATACTACATCCTTCTGATA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCCCCCTCCCCCCACAAGGTGTTGGCTCATACTACATCCTTCTGATA  450

seq1  TCCAGGATATCCAGTTTGATGAAGATCTGGGCACTTGTATCAGGTCTCCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGGATATCCAGTTTGATGAAGATCTGGGCACTTGTATCAGGTCTCCA  500

seq1  ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACTGTTGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACTGTTGT  550

seq1  CTCCTGATTCTCAATGGCTTTGCCTCAGGCTATGCTCTCCTTATCTCCCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTGATTCTCAATGGCTTTGCCTCAGGCTATGCTCTCCTTATCTCCCT  600

seq1  AGAAGTCATTGTTGGCACCATCAAGTATTCTTGTTTCTGAGGAGAGGAGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGTCATTGTTGGCACCATCAAGTATTCTTGTTTCTGAGGAGAGGAGT  650

seq1  TCTTGAACATGTCTTTTTTTTTTTTTCCTAGCCAAGTTTCTATTCATTAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGAACATGTCTTTTTTTTTTTTTCCTAGCCAAGTTTCTATTCATTAC  700

seq1  CCACTGAGTGTTGCCAGTGAGCCCCAGGATTCAGGACTGAGCAAGCTCCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTGAGTGTTGCCAGTGAGCCCCAGGATTCAGGACTGAGCAAGCTCCC  750

seq1  CTAGAAGAGGCCTCCTCTGTGCCATTTATGCTACATAACCAGTCTATGGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGAAGAGGCCTCCTCTGTGCCATTTATGCTACATAACCAGTCTATGGC  800

seq1  ACAATAAAAATGGGGGTACATGCAACAGTCATTCCTTATTACATGGGCAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATAAAAATGGGGGTACATGCAACAGTCATTCCTTATTACATGGGCAT  850

seq1  TCCTCTATTCTTCTGCTACCCCTAATTATTCTTTACTGGTACCCCATTCT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCTATTCTTCTGCTACCCCTAATTATTCTTTACTGGTACCCCATTCT  900

seq1  TCTTTAAAAACACCCCCA-CCCCCAAGACACATTCAATTTGACACTCTTC  949
      |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| 
seq2  TCTTTAAAAACACCCCCACCCCCCAAGACACAATCAATTTGACACTCTTT  950

seq1  CCAGGATCTCGCCTGAGATGAATTTCCTTCCACTCTCCACCCATC-TGAA  998
      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||
seq2  CCAGGATCTCG-CTGAGATGAATTTCCTTCCACTCT-CACCCATCTTGAA  998

seq1  TCTGTTCACAATAAAATGCATTTTGAAAGCTCACAGCTGTGATTAAGTGA  1048
      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||
seq2  TCTGTTCACAATAAAATGCATTTTG-AAGCTCACAGCTGTGATT-AGTGA  1046

seq1  AGGTGAACCCTCTGTTGTTAAGTCTTTGATCACTGGAGGGAGACCACAGA  1098
      | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  A-GTG-ATCCTCTGTTGTTAAGTCTTTGATCACTGGAGGGAGAACACAGA  1094

seq1  GCTGGGTCCTGGAGAAATGAGGCTGTGTGCTATGCTGAGCAGGTCTCGAG  1148
      ||||||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||| || ||||
seq2  GCTGGGT-CTGGA-AAATGAGCCT-TGTGCTA-GCTGA-CAGCTC-CGAG  1138

seq1  AGTCAAGGTAAGACTTGTGTGCTCTCTGCCCTTCCATCTGGTCACTGCAA  1198
      |||||||    ||  || || ||| ||| |||||||||||   ||||| |
seq2  AGTCAAG----GAACTGGGT-CTC-CTG-CCTTCCATCTG--TACTGC-A  1178

seq1  TGGAAATGGTGCTGCGGCTGTGGCATCTCTCAATGGGGCTATG  1241
      |||  ||||  ||   || |||||| |||||||||||||||||
seq2  TGG--ATGGGTCT--AGC-GTGGCA-CTCTCAATGGGGCTATG  1215

seq1: chr7_91751341_91751806
seq2: B6Ng01-106K08.g_70_535 (reverse)

seq1  TGGCCTCAAACTCAGAAATCCACCTGCCTCTGCCTCCCAAGTGCTGGGAT  50
      |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCATCAAAATCAGAAATCCACATGCCTCTGCCTCCCAAGTGCTGGGAT  50

seq1  TAAAGGCGTACGCCACCACGCCCACCACCTGAATCTCTCTCTTTTCATGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGGCGTACGCCACCACGCCCACCACCTGAATCTCTCTCTTTTCATGC  100

seq1  TGGGCCCAGGGCTTTGCTCAGGGCCATTCTCTTATGAAGCAGAGCAGTGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCCCAGGGCTTTGCTCAGGGCCATTCTCTTATGAAGCAGAGCAGTGA  150

seq1  GTGTTCCACATGTAGTAACATGGAGGATCAGCTCTGTGGTAGCTTGAATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTCCACATGTAGTAACATGGAGGATCAGCTCTGTGGTAGCTTGAATG  200

seq1  CAGCTCAGGTTGTAGGGAACTGCAGAAGTCACAGTGCTCAGATCACATGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTCAGGTTGTAGGGAACTGCAGAAGTCACAGTGCTCAGATCACATGA  250

seq1  ATGATGGATTTCTTTTATGCCCTGTAAGAGCTCTGCATGGGTTCAGATAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATGGATTTCTTTTATGCCCTGTAAGAGCTCTGCATGGGTTCAGATAA  300

seq1  TTACAGAGGCCCAAATATCTTGTCAAAGCTGGTCTCTGACCTCACAGCAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAGAGGCCCAAATATCTTGTCAAAGCTGGTCTCTGACCTCACAGCAC  350

seq1  CGAGCATGTTAGAAGATTTCACCTCCTGGAACTGTCCTAAGCCAGGCTTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAGCATGTTAGAAGATTTCACCTCCTGGAACTGTCCTAAGCCAGGCTTC  400

seq1  CCTGGCACCTGAAGCAGCAGTTTTGCCATATTCTAGGAGATCCACGAGAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGCACCTGAAGCAGCAGTTTTGCCATATTCTAGGAGATCCACGAGAG  450

seq1  TTGAGAGGTGGAATTC  466
      ||||||||||||||||
seq2  TTGAGAGGTGGAATTC  466