BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-108C09
Chromosome7 (Build37)
Map Location 59,220,546 - 59,413,552
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGas2, 1700015G11Rik, EG668783
Upstream geneEG638046, EG668770, EG668774, LOC668776, LOC434186, LOC546971, LOC668779, Tmem16e, Slc17a6, EG620599, LOC654473, LOC100040608
Downstream geneEG620782, LOC100040692, Gm1865
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-108C09.bB6Ng01-108C09.g
ACCDH915409DH915410
length1,1121,009
definitionDH915409|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-108C09, 5' end.DH915410|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-108C09, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(59,220,546 - 59,221,677)(59,412,543 - 59,413,552)
sequence
gaattctctgagctgttgtgtatcccacaaagaaccgagatctacatctg
gtgtccctcaggaacattctcccctcatttgcttcctttgtttttgaaca
ggagacagcaggacttcagaaaatggatcatcctaacatttgccattcaa
aacaccaagaatcagcactgtaattcccagagggtgtgagcctctttctt
ctcaaccactatggatcccagtgtgataaaaaacatctctccactgcagg
atttaaacagatagtcttcttactgtacctaaccaaaagctttcttttct
cttgtcacaaaggagtagtttgtatttttaggtgctgtccattcgtttgc
catctgcagtggagacggcgagtgttttatgaaccttgtatcttcttgtt
tcagtagggtcttcatagttgtgcctatgtctcaacagccaaagcaaagc
agacactgaaggtaattgcctagatgatagagcacacctcttccctttgc
attcactgtagagcttgaccgccaatcaaactaggggagttgggcattca
gggttaagagtaatgtatcatttcaaaaaagatacaacattatttcccct
tgattttctatatttgttgaaaattttaaagatatactgtgggtatgtgg
aaagcagtacattggctatgtttttgtcttcttaataagacctccacact
cagatacttttccttatagaccttactattgaaatcacttggaaggatta
gcttggcacttgcttctgtatgctatattgtcatagtttttcctgttaaa
catttaaataacagatttgtgaaataagaattaccgtttatttggggatg
cttccactggactcttatacaaatgaccttttgtagtttagcacatgtat
gaacctgtggcacttgcaacatttctgttcagcaccattcctagttctaa
tgcacgctccccagctcacatgtgccctgctgctagcatgtgtttacagg
ttagggaagagacacattctagtttgagtcccgagtttgctagtgtgcag
aaagactgatcacttatgtatttttaagaaagatatgatctaaaagagca
gtgacttgtttc
gaattcatagccactcaaggtctcccagcctccagattaggatcactggt
gagccttccaattctggattgtagttcatttcaaatatagtcaagttgac
aaccaggaatagccactacactcagccatcacatttcctactatccaacc
atcaaaacagatgttatctttccttgtggtgaatattcatatccttaagt
acccacactctggtgtctttgttacttggaataggttctcttctgacttc
tgcttactacacatcttcccagcctccagatatgttcatatgtctaggaa
ctcattcctaccttcttttccattgagatcttcagaataggctttgatta
agctgtctatggagccattctaattaaagccattctgtagcaaggtcact
ccactccattcatatgccagggagaatgccagaatgatgctgtttgattt
ctgtatttctgcagcataatgtgaaatccaagatgatgacaacctcagaa
atggttttgaattattcatttagttcaagttaggttttactatcctcagt
cttcggtttctttatgagttttgattttttaaaagatttctatgaagaat
cgtgttggaattttgatggaaattgcattgattctgtacactgcttttac
catgttcagaatattcattttacaatccaggagcagaagccaagaggaca
agagggtgtgttgtggtagtttatgaggctggaccacctggggctaagtc
actagactttgcagcagtctaggatgaagattctaacaacacaacaacaa
caaatcagggtctggaacattgtaggcagccttggagctgtctgctgttg
acttgaagtctgctgtgacagaagtaaagttaaggagcttacaggaaatt
tttatcttgggatatatgtgaaatttcaacacccatggtcataggagttg
tagcagggagtcacaagatcagtgggatgcacacacactggggtgggggg
tggagggaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_59220546_59221677
seq2: B6Ng01-108C09.b_48_1159

seq1  GAATTCTCTGAGCTGTTGTGTATCCCACAAAGAACCGAGATCTACATCTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTGAGCTGTTGTGTATCCCACAAAGAACCGAGATCTACATCTG  50

seq1  GTGTCCCTCAGGAACATTCTCCCCTCATTTGCTTCCTTTGTTTTTGAACA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCCCTCAGGAACATTCTCCCCTCATTTGCTTCCTTTGTTTTTGAACA  100

seq1  GGAGACAGCAGGACTTCAGAAAATGGATCATCCTAACATTTGCCATTCAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGACAGCAGGACTTCAGAAAATGGATCATCCTAACATTTGCCATTCAA  150

seq1  AACACCAAGAATCAGCACTGTAATTCCCAGAGGGTGTGAGCCTCTTTCTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACCAAGAATCAGCACTGTAATTCCCAGAGGGTGTGAGCCTCTTTCTT  200

seq1  CTCAACCACTATGGATCCCAGTGTGATAAAAAACATCTCTCCACTGCAGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAACCACTATGGATCCCAGTGTGATAAAAAACATCTCTCCACTGCAGG  250

seq1  ATTTAAACAGATAGTCTTCTTACTGTACCTAACCAAAAGCTTTCTTTTCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAAACAGATAGTCTTCTTACTGTACCTAACCAAAAGCTTTCTTTTCT  300

seq1  CTTGTCACAAAGGAGTAGTTTGTATTTTTAGGTGCTGTCCATTCGTTTGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTCACAAAGGAGTAGTTTGTATTTTTAGGTGCTGTCCATTCGTTTGC  350

seq1  CATCTGCAGTGGAGACGGCGAGTGTTTTATGAACCTTGTATCTTCTTGTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTGCAGTGGAGACGGCGAGTGTTTTATGAACCTTGTATCTTCTTGTT  400

seq1  TCAGTAGGGTCTTCATAGTTGTGCCTATGTCTCAACAGCCAAAGCAAAGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTAGGGTCTTCATAGTTGTGCCTATGTCTCAACAGCCAAAGCAAAGC  450

seq1  AGACACTGAAGGTAATTGCCTAGATGATAGAGCACACCTCTTCCCTTTGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACACTGAAGGTAATTGCCTAGATGATAGAGCACACCTCTTCCCTTTGC  500

seq1  ATTCACTGTAGAGCTTGACCGCCAATCAAACTAGGGGAGTTGGGCATTCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCACTGTAGAGCTTGACCGCCAATCAAACTAGGGGAGTTGGGCATTCA  550

seq1  GGGTTAAGAGTAATGTATCATTTCAAAAAAGATACAACATTATTTCCCCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTAAGAGTAATGTATCATTTCAAAAAAGATACAACATTATTTCCCCT  600

seq1  TGATTTTCTATATTTGTTGAAAATTTTAAAGATATACTGTGGGTATGTGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTTTCTATATTTGTTGAAAATTTTAAAGATATACTGTGGGTATGTGG  650

seq1  AAAGCAGTACATTGGCTATGTTTTTGTCTTCTTAATAAGACCTCCACACT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCAGTACATTGGCTATGTTTTTGTCTTCTTAATAAGACCTCCACACT  700

seq1  CAGATACTTTTCCTTATAGACCTTACTATTGAAATCACTTGGAAGGATTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATACTTTTCCTTATAGACCTTACTATTGAAATCACTTGGAAGGATTA  750

seq1  GCTTGGCACTTGCTTCTGTATGCTATATTGTCATAGTTTTTCCTGTTAAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGGCACTTGCTTCTGTATGCTATATTGTCATAGTTTTTCCTGTTAAA  800

seq1  CATTTAAATAACAGATTTGTGAAATAAGAATTACCGTTTATTTGGGGATG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTAAATAACAGATTTGTGAAATAAGAATTACCGTTTATTTGGGGATG  850

seq1  CTTCCACTGGACTCTTATACAAATGACCTTTTGTAGTTTAGCACATGTAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCACTGGACTCTTATACAAATGACCTTTTGTAGTTTAGCACATGTAT  900

seq1  GAACCTGTGGCACTTGCAACATTTCTGTTCCAGCACCATTCCTAGTTCTA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  GAACCTGTGGCACTTGCAACATTTCTGTT-CAGCACCATTCCTAGTTCTA  949

seq1  ATGCACGCTCCCCCAGCTCACATGTGCCCTGGCCTGCCTAGCATGTTGTT  1000
      ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||
seq2  ATGCACGCT-CCCCAGCTCACATGTGCCCTG--CTG-CTAGCATG-TGTT  994

seq1  TACAGGGTTAGGGAAGAGACACATTCTAGTTTGAGGTCCCGAGTTTGCTA  1050
      |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  TACA-GGTTAGGGAAGAGACACATTCTAGTTTGA-GTCCCGAGTTTGCTA  1042

seq1  GTGTGCAGAAAAGAACTGAATCACTTTATGTATATTTTAAAGAAAAGAAT  1100
      |||||||||||   |||| ||||| |||||  |||||| ||||||   ||
seq2  GTGTGCAGAAA--GACTG-ATCAC-TTATG--TATTTTTAAGAAA--GAT  1084

seq1  ATGATCTAAAAAGAGCAGTAGACCTTTGTTTC  1132
      ||||||| ||||||||||| |||  |||||||
seq2  ATGATCT-AAAAGAGCAGT-GAC--TTGTTTC  1112

seq1: chr7_59412543_59413552
seq2: B6Ng01-108C09.g_69_1076 (reverse)

seq1  TCCCTC--ACCCCCACCCCAGTGTGTGTGCATCCCACTGATCTTGTGACT  48
      ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTCCACCCCCCACCCCAGTGTGTGTGCATCCCACTGATCTTGTGACT  50

seq1  CCCCTGCTACAACTCCTATGACCATGGGTGTTGAAATTTCACATATATTC  98
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  -CCCTGCTACAACTCCTATGACCATGGGTGTTGAAATTTCACATATA-TC  98

seq1  CCAAGATAAAAATTTCCTGTAAGCTCCTTAACTTTACCTTCTGTCACAGC  148
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  CCAAGATAAAAATTTCCTGTAAGCTCCTTAACTTTA-CTTCTGTCACAGC  147

seq1  AGACTTCAAGTCAACAGCAGACAGCTCCAAGGCTGCCTACAATGTTCCAG  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTTCAAGTCAACAGCAGACAGCTCCAAGGCTGCCTACAATGTTCCAG  197

seq1  ACCCTGATTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTAGAATCTTCATCCTAGACTGCT  248
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTGATTTGTTGTTGTTG-TGTTGTTAGAATCTTCATCCTAGACTGCT  246

seq1  GCAAAGTCTAGTGACTTAGCCCCAGGTGGTCCAGCCTCATAAACTACCAC  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAAGTCTAGTGACTTAGCCCCAGGTGGTCCAGCCTCATAAACTACCAC  296

seq1  AACACACCCTCTTGTCCTCTTGGCTTCTGCTCCTGGATTGTAAAATGAAT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACACCCTCTTGTCCTCTTGGCTTCTGCTCCTGGATTGTAAAATGAAT  346

seq1  ATTCTGAACATGGTAAAAGCAGTGTACAGAATCAATGCAATTTCCATCAA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTGAACATGGTAAAAGCAGTGTACAGAATCAATGCAATTTCCATCAA  396

seq1  AATTCCAACACGATTCTTCATAGAAATCTTTTAAAAAATCAAAACTCATA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCCAACACGATTCTTCATAGAAATCTTTTAAAAAATCAAAACTCATA  446

seq1  AAGAAACCGAAGACTGAGGATAGTAAAACCTAACTTGAACTAAATGAATA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAACCGAAGACTGAGGATAGTAAAACCTAACTTGAACTAAATGAATA  496

seq1  ATTCAAAACCATTTCTGAGGTTGTCATCATCTTGGATTTCACATTATGCT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCAAAACCATTTCTGAGGTTGTCATCATCTTGGATTTCACATTATGCT  546

seq1  GCAGAAATACAGAAATCAAACAGCATCATTCTGGCATTCTCCCTGGCATA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAAATACAGAAATCAAACAGCATCATTCTGGCATTCTCCCTGGCATA  596

seq1  TGAATGGAGTGGAGTGACCTTGCTACAGAATGGCTTTAATTAGAATGGCT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATGGAGTGGAGTGACCTTGCTACAGAATGGCTTTAATTAGAATGGCT  646

seq1  CCATAGACAGCTTAATCAAAGCCTATTCTGAAGATCTCAATGGAAAAGAA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATAGACAGCTTAATCAAAGCCTATTCTGAAGATCTCAATGGAAAAGAA  696

seq1  GGTAGGAATGAGTTCCTAGACATATGAACATATCTGGAGGCTGGGAAGAT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAGGAATGAGTTCCTAGACATATGAACATATCTGGAGGCTGGGAAGAT  746

seq1  GTGTAGTAAGCAGAAGTCAGAAGAGAACCTATTCCAAGTAACAAAGACAC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTAGTAAGCAGAAGTCAGAAGAGAACCTATTCCAAGTAACAAAGACAC  796

seq1  CAGAGTGTGGGTACTTAAGGATATGAATATTCACCACAAGGAAAGATAAC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGTGTGGGTACTTAAGGATATGAATATTCACCACAAGGAAAGATAAC  846

seq1  ATCTGTTTTGATGGTTGGATAGTAGGAAATGTGATGGCTGAGTGTAGTGG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGTTTTGATGGTTGGATAGTAGGAAATGTGATGGCTGAGTGTAGTGG  896

seq1  CTATTCCTGGTTGTCAACTTGACTATATTTGAAATGAACTACAATCCAGA  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTCCTGGTTGTCAACTTGACTATATTTGAAATGAACTACAATCCAGA  946

seq1  ATTGGAAGGCTCACCAGTGATCCTAATCTGGAGGCTGGGAGACCTTGAGT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGGAAGGCTCACCAGTGATCCTAATCTGGAGGCTGGGAGACCTTGAGT  996

seq1  GGCTATGAATTC  1010
      ||||||||||||
seq2  GGCTATGAATTC  1008