BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-113I13
Chromosome7 (Build37)
Map Location 46,599,240 - 46,700,366
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG668618, EG330513
Upstream geneLOC100038955, LOC100038967, LOC620018, LOC100038914, EG668531, EG628058
Downstream geneEG434168, 9430025M13Rik, LOC100038985, 3000002G13Rik, EG215208, LOC100039133, LOC100039050, EG668540, 4930558N11Rik, EG628161
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-113I13.bB6Ng01-113I13.g
ACCDH919304DH919305
length1,0441,075
definitionDH919304|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-113I13, 5' end.DH919305|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-113I13, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(46,699,315 - 46,700,366)(46,599,240 - 46,600,340)
sequence
gaattcacagtgcaaaactggtttagtgtgggaaaaattagatacttttg
tattttaaaggtgcatatgtgtatatatacatatgggtgcattatataat
tataatgtgcattggatgtgtgcacgtgtgcatgcgcatatgtgtaaagg
acaacctgaaggacttgactccttccaccatgaggaccctggggatcgga
ttcaactcaggctgcaagagactttacccactgagctatgtcacagtcca
gatgacacatttattccacctgtggtcacaccttagagagatggtatgtg
cataccttatctcaagtgtttaggaacattttggatttgggaatttttcc
acatttggggagcacaatgattaaaaatatttatttattgttatatgtaa
gtacactgtagctatcttcagacataccagaagagggcatcagatcttat
tacagatggttgtgagccacatgtggttgctgggatttgaactcaggacc
tttggaaaagaactcttaactgctgagccatcttaccagccccccacagt
gatttttgtaatatctaatgagatgctgcagtgactgtcacaagtttgca
tacatttgatttctgtttgatttgccctatgcatctgtgcacattttata
ttaaatttttgtctttgaacatactatacaaaatacacagttttaaaaag
aattttgtgagtaaaattagaaaagtgattatagtgatttactaagttgt
aaaaagtttcctatgaaagctctctaagaaaaggggggaaatggggtgaa
taaaaaagggggataagggaaaaattcaactcctctctttgtcctcagta
cttttacatctttcagaatatatgatcacatggtaaaagttcatcacagg
ttcaccataaaattcaaatcataaatttaaatagaagtttacacgagaat
gttatatgcaatatccataaaaggtatatttgggctaacctcatcttctg
tccagcaccagattcctgagatttaaaaaactaactaagtatta
gaattcttaagactggtgatgactgtaagaaggatggggacaaagaacaa
aggagggataatcccagactgtacctcatgcttacaggcaaggaagagaa
cccgaatccaggaaaccagggttccacatgttctccagagatatccaagc
ggacaatatggcagcctcctcccaaaattggtccaggttgtaagtcttta
ccttgagaccacaagtaaccagaagagttttcagagccccaatcaggggt
tccttggtggtagagggggagaacccatgatgaaaagcacaaaagaaaca
aatgatgaacatatgtgacaaatatgacagaagtgatgaaagccatggta
tagtaagcaggggactctctccggtgtagctcacaggtcttatgcctaga
tggtgtacccaaggaaggaaaaggcatttgggagccaatccctggtacca
aaacatggaaaaccagttcctatatcagataccaggacaaatccagacca
aaagtgaaaaacattcaaagacaaagaagacagaaaagatggcaccgcag
taagaccacgcaaagacaaagaaggaaaataatggccactgcacactcat
tgcatgctggctacatgcttgccacagcatgctcactcaaaaatgaagaa
aaacaaaaagatggctactgcaaagcttactgcacgctcacctcacgtgt
acctcatgctcctctcatgctcacctcactcttgtgtcacactagttgca
tgcttacctcatgctcactcttgaacagaactgagaacaaaggcaagata
cttgggtggacagaaaagacaaagaagtcagaaatgagtccaagctctca
ccttcacagaacccagaacataaacactaaagggtacaactcacgaagca
gcaactgaaggagcacaacacagcacagcgagagagcagatcagtcaacc
agagcacatccttgcagcaacaggcaaaacgagcaccaaaaatgaggttg
cagcagcacaatgagaataatgagtagtcatcgaccacgttggcgccgaa
atgtctgtgccctgaagctctctga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_46699315_46700366
seq2: B6Ng01-113I13.b_49_1092 (reverse)

seq1  TAATAACTTAGTTATGTTTTTTTAACTCTCAGTGAATCTGGTGCTGTGAC  50
      |||| |||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||| |||
seq2  TAAT-ACTTAGTTA--GTTTTTTAAATCTCAG-GAATCTGGTGCTG-GAC  45

seq1  AGATGATGAGTTTAGCCCAATAATTACTTCTAATGGATA-TGCATATAAA  99
      ||| |||||| ||||||||| |  ||| | | ||||||| ||||||| ||
seq2  AGAAGATGAGGTTAGCCCAA-ATATACCTTTTATGGATATTGCATAT-AA  93

seq1  CATTCTCTGTGTAAACTTCTATTTCAATTTATGATTTGAATTTTATGTGT  149
      ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||
seq2  CATTCTC-GTGTAAACTTCTATTTAAATTTATGATTTGAATTTTATG-GT  141

seq1  GAACCTGTGATGAACTTTTACCATGTGATCATATATTCTGAAAGATGTAA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACCTGTGATGAACTTTTACCATGTGATCATATATTCTGAAAGATGTAA  191

seq1  AAGTACTGAGGACAAAGAGAGGAGTTGAATTTTTCCCTTATCCCCCTTTT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTACTGAGGACAAAGAGAGGAGTTGAATTTTTCCCTTATCCCCCTTTT  241

seq1  TTATTCACCCCATTTCCCCCCTTTTCTTAGAGAGCTTTCATAGGAAACTT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTCACCCCATTTCCCCCCTTTTCTTAGAGAGCTTTCATAGGAAACTT  291

seq1  TTTACAACTTAGTAAATCACTATAATCACTTTTCTAATTTTACTCACAAA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACAACTTAGTAAATCACTATAATCACTTTTCTAATTTTACTCACAAA  341

seq1  ATTCTTTTTAAAACTGTGTATTTTGTATAGTATGTTCAAAGACAAAAATT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTTTTTAAAACTGTGTATTTTGTATAGTATGTTCAAAGACAAAAATT  391

seq1  TAATATAAAATGTGCACAGATGCATAGGGCAAATCAAACAGAAATCAAAT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATATAAAATGTGCACAGATGCATAGGGCAAATCAAACAGAAATCAAAT  441

seq1  GTATGCAAACTTGTGACAGTCACTGCAGCATCTCATTAGATATTACAAAA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATGCAAACTTGTGACAGTCACTGCAGCATCTCATTAGATATTACAAAA  491

seq1  ATCACTGTGGGGGGCTGGTAAGATGGCTCAGCAGTTAAGAGTTCTTTTCC  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACTGTGGGGGGCTGGTAAGATGGCTCAGCAGTTAAGAGTTCTTTTCC  541

seq1  AAAGGTCCTGAGTTCAAATCCCAGCAACCACATGTGGCTCACAACCATCT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGTCCTGAGTTCAAATCCCAGCAACCACATGTGGCTCACAACCATCT  591

seq1  GTAATAAGATCTGATGCCCTCTTCTGGTATGTCTGAAGATAGCTACAGTG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATAAGATCTGATGCCCTCTTCTGGTATGTCTGAAGATAGCTACAGTG  641

seq1  TACTTACATATAACAATAAATAAATATTTTTAATCATTGTGCTCCCCAAA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTACATATAACAATAAATAAATATTTTTAATCATTGTGCTCCCCAAA  691

seq1  TGTGGAAAAATTCCCAAATCCAAAATGTTCCTAAACACTTGAGATAAGGT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGAAAAATTCCCAAATCCAAAATGTTCCTAAACACTTGAGATAAGGT  741

seq1  ATGCACATACCATCTCTCTAAGGTGTGACCACAGGTGGAATAAATGTGTC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCACATACCATCTCTCTAAGGTGTGACCACAGGTGGAATAAATGTGTC  791

seq1  ATCTGGACTGTGACATAGCTCAGTGGGTAAAGTCTCTTGCAGCCTGAGTT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGGACTGTGACATAGCTCAGTGGGTAAAGTCTCTTGCAGCCTGAGTT  841

seq1  GAATCCGATCCCCAGGGTCCTCATGGTGGAAGGAGTCAAGTCCTTCAGGT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATCCGATCCCCAGGGTCCTCATGGTGGAAGGAGTCAAGTCCTTCAGGT  891

seq1  TGTCCTTTACACATATGCGCATGCACACGTGCACACATCCAATGCACATT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCTTTACACATATGCGCATGCACACGTGCACACATCCAATGCACATT  941

seq1  ATAATTATATAATGCACCCATATGTATATATACACATATGCACCTTTAAA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATTATATAATGCACCCATATGTATATATACACATATGCACCTTTAAA  991

seq1  ATACAAAAGTATCTAATTTTTCCCACACTAAACCAGTTTTGCACTGTGAA  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACAAAAGTATCTAATTTTTCCCACACTAAACCAGTTTTGCACTGTGAA  1041

seq1  TTC  1052
      |||
seq2  TTC  1044

seq1: chr7_46599240_46600340
seq2: B6Ng01-113I13.g_70_1144

seq1  GAATTCTTAAGACTGGTGATGACTGTAAGAAGGATGGGGACAAAGAACAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTAAGACTGGTGATGACTGTAAGAAGGATGGGGACAAAGAACAA  50

seq1  AGGAGGGATAATCCCAGACTGTACCTCATGCTTACAGGCAAGGAAGAGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGGGATAATCCCAGACTGTACCTCATGCTTACAGGCAAGGAAGAGAA  100

seq1  CCCGAATCCAGGAAACCAGGGTTCCACATGTTCTCCAGAGATATCCAAGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCGAATCCAGGAAACCAGGGTTCCACATGTTCTCCAGAGATATCCAAGC  150

seq1  GGACAATATGGCAGCCTCCTCCCAAAATTGGTCCAGGTTGTAAGTCTTTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACAATATGGCAGCCTCCTCCCAAAATTGGTCCAGGTTGTAAGTCTTTA  200

seq1  CCTTGAGACCACAAGTAACCAGAAGAGTTTTCAGAGCCCCAATCAGGGGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGAGACCACAAGTAACCAGAAGAGTTTTCAGAGCCCCAATCAGGGGT  250

seq1  TCCTTGGTGGTAGAGGGGGAGAACCCATGATGAAAAGCACAAAAGAAACA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTGGTGGTAGAGGGGGAGAACCCATGATGAAAAGCACAAAAGAAACA  300

seq1  AATGATGAACATATGTGACAAATATGACAGAAGTGATGAAAGCCATGGTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGATGAACATATGTGACAAATATGACAGAAGTGATGAAAGCCATGGTA  350

seq1  TAGTAAGCAGGGGACTCTCTCCGGTGTAGCTCACAGGTCTTATGCCTAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTAAGCAGGGGACTCTCTCCGGTGTAGCTCACAGGTCTTATGCCTAGA  400

seq1  TGGTGTACCCAAGGAAGGAAAAGGCATTTGGGAGCCAATCCCTGGTACCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGTACCCAAGGAAGGAAAAGGCATTTGGGAGCCAATCCCTGGTACCA  450

seq1  AAACATGGAAAACCAGTTCCTATATCAGATACCAGGACAAATCCAGACCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACATGGAAAACCAGTTCCTATATCAGATACCAGGACAAATCCAGACCA  500

seq1  AAAGTGAAAAACATTCAAAGACAAAGAAGACAGAAAAGATGGCACCGCAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTGAAAAACATTCAAAGACAAAGAAGACAGAAAAGATGGCACCGCAG  550

seq1  TAAGACCACGCAAAGACAAAGAAGGAAAATAATGGCCACTGCACACTCAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGACCACGCAAAGACAAAGAAGGAAAATAATGGCCACTGCACACTCAT  600

seq1  TGCATGCTGGCTACATGCTTGCCACAGCATGCTCACTCAAAAATGAAGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATGCTGGCTACATGCTTGCCACAGCATGCTCACTCAAAAATGAAGAA  650

seq1  AAACAAAAAGATGGCTACTGCAAAGCTTACTGCACGCTCACCTCACGTGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  AAACAAAAAGATGGCTACTGCAAAGCTTACTGCACGCTCACCTCACGTGT  700

seq1  ACCTCATGCTCCTCTCATGCTCACCTCACTCTTGTGTCACACTAGTTGCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCATGCTCCTCTCATGCTCACCTCACTCTTGTGTCACACTAGTTGCA  750

seq1  TGCTTACCTCATGCTCACTCTTGAACAGAACTGAGAACAAAGGCAAGATT  800
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  TGCTTACCTCATGCTCACTCTTGAACAGAACTGAGAACAAAGGCAAGA-T  799

seq1  ACTTGGGTGGACAGAAAAGACAAAGAAGTCAGAAATGAGGTCCAAGCTCT  850
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  ACTTGGGTGGACAGAAAAGACAAAGAAGTCAGAAATGA-GTCCAAGCTCT  848

seq1  CACCTTCACAGAACCCAGAACATAAAACACT-AAGGGTACAACTCACGGA  899
      ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||
seq2  CACCTTCACAGAACCCAGAACAT-AAACACTAAAGGGTACAACTCAC-GA  896

seq1  AGCAGCAACTGAAGGGAGCACAACACCAGCACAGCGAGAAGAGCAGATCA  949
      ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||
seq2  AGCAGCAACTGAA-GGAGCACAACA-CAGCACAGCGAG-AGAGCAGATCA  943

seq1  GGCCAAACCAAGAGCACAATCCTTGCAGCAACAGGCAAAAACGAGCCACC  999
      | |  |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||
seq2  GTC--AACC-AGAGCAC-ATCCTTGCAGCAACAGGC-AAAACGAG-CACC  987

seq1  AGAAAAAGGAGGTTTGCAGGCAGCCACAAAATGAGAATAATGAAGTAGTC  1049
        ||||| ||||||     |||||  || ||||||||||||| |||||| 
seq2  --AAAAATGAGGTT-----GCAGCAGCACAATGAGAATAATG-AGTAGT-  1028

seq1  CATCGACCACGTTGGGCGCCAGATATGGCCTGTGCTCTGGACAGCTCTCT  1099
      ||||||||||||| |||||| || || | |||||| |||   ||||||||
seq2  CATCGACCACGTT-GGCGCC-GAAAT-GTCTGTGCCCTG--AAGCTCTCT  1073

seq1  GA  1101
      ||
seq2  GA  1075