BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-113J07
Chromosome7 (Build37)
Map Location 123,909,136 - 124,055,027
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC546993, LOC100043330
Upstream geneSox6, LOC100042779, 1110006G14Rik, EG668479, LOC100043313, 1110004F10Rik, Plekha7, Rps13, Pik3c2a, LOC100042798, Nucb2, LOC100043320, EG668484, LOC668485
Downstream geneXylt1, LOC669758
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-113J07.bB6Ng01-113J07.g
ACCDH919338DH919339
length1,0491,063
definitionDH919338|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-113J07, 5' end.DH919339|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-113J07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(124,053,970 - 124,055,027)(123,909,136 - 123,910,197)
sequence
gaattctccatatttggaaagatagagcctgtggagcaggagcactttgt
aattcacagacacatttcttatgttgtagcttggggacacatggctgggg
tcagggagctttctgggatgccctttctaaagacactaactcaattcata
agtccatctcctcatcactgaaaacctctcaaaggcctcaccttgaggtt
gggattccagctatggattggaagagaaggaacacagtgagtcgacaaca
ttgacttacagaagactgagtagctgatggctatgatctcgggggagggc
acctcagcagacattcctctctgtcaaagaatattaattatatggaaata
aggactgtgacacagtaactctgctgaaacgaaaagaagaaaataagttt
actagttaaagcaaaggatgcatccttacctgctggctctgctggctctc
ccgcaggcttgctatgatggagaacaagatgagggagagggccaagggaa
gaccctgaccaccagccagcaaggcactgtgcctgacatctcaggaggaa
cctagtcccaccgtgagtgagtatgagggggaagactccccagccaagtt
ccaagatgagcactgccaagcagcacctccactgcggcctatgagaggcc
aagcacagacttaagctaagcccttctcagacccctacaccaagcaggct
actggtacattggggactcatcttttacataaaaagatactggaaaatac
ccaggcacataattttgagaactcaaactcttcccttctccatattctaa
aatgctatttgtctccttctgcttttgagatggtttgagctttttccctt
taattttgtttgggtttttattttttcctttctttctttcttttacccaa
gcagatgcttactgaatctgggcatttcttatgttcactgggacagtctg
acaaccattttactgctacaataattataatcagagtcatgtgacaacca
caactctgagcattaaagtgtcatctatttccgcttcatgacaacccaa
gaattccaaatgagacatggcctgagtgagaagctcttggaaactggatt
taggaacatgcagtatgaacgtgcatcaccagtcagtacatggctcttac
ctcactcctcatttgcttcacttgggggggggctgttattaagggaggac
tgagcaaggggtagaccacctctctgcttctgttagtgcatggaagtact
gacttcctgcctgcctgataactacttatgtgttctcagtaaagactgga
aacaatcaaaactataggttttatgatcctcctgaaggtcatccaaggaa
gaacatgatggcaaggggatgggacttgtccttaatgagaggagaaatgt
tgatgaagggccttaaacacagatgggcatgtataggcagactgcccctc
agacttctagcaaagtaacatttatttagcagtgtctgtgggacctgttt
accataagccactggctggactggcacatagtaggtgtttcatcagcact
ttaataggcagaccctcatctctctgctggataattttgaggagtaagga
gaggcttgctgcccctgttcatcttatttatttattccggcattacagat
cagcccaaactttgttcaatcatcttttttatatgcttgtatttctatga
gtcagcattctgggctgagtccagttggttgtgtcttctgctgttacttc
tggggctcctcgcattttgtgcctctctgctgatttcaccataattgtta
ggttatgtagagaggcttaccttctcattcctcagagagtcaacacggga
tgctccccatatgtcattcttgggggaaattctttttgagacagcctttg
gcagactgttgcacatgtatgttgactctattttatgtatggtgcggttg
agtatgtgtatgttgcacgtgcacatgggagtgcagaaaaaatcttgcct
ttcattccttagagtcacccaccttgtttttaacacagccctcctcatga
ctagaaattgctaggctaactgtaaaaagccctcaaaatcctttgcccct
gcccccccgtgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_124053970_124055027
seq2: B6Ng01-113J07.b_49_1097 (reverse)

seq1  TTGGGTTGTCATGAGGCGTAAATGAGATGACACTTATAATGCTCAGAGTT  50
      |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||
seq2  TTGGGTTGTCATGAAGCGGAAAT-AGATGACACTT-TAATGCTCAGAGTT  48

seq1  GTGGTTGTCACATGACTCCTGATTAATAATTAATTGTTAGCAGTAACAAT  100
      ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||| |||
seq2  GTGGTTGTCACATGACT-CTGATT-ATAATT-ATTG-TAGCAGTAA-AAT  93

seq1  GGTTGTCAAGACTGTCCCAGTGAACATAAGAAATGCCCAGATTCAGTAAG  150
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTGTC-AGACTGTCCCAGTGAACATAAGAAATGCCCAGATTCAGTAAG  142

seq1  CATCTGCTTGGGTAAAAAGAAAGAAAGAAAGGAAAAAATAAAAACCCAAA  200
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTGCTTGGGT-AAAAGAAAGAAAGAAAGGAAAAAATAAAAACCCAAA  191

seq1  CAAAATTAAAGGGAAAAAGCTCAAACCATCTCAAAAGCAGAAGGAGACAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAATTAAAGGGAAAAAGCTCAAACCATCTCAAAAGCAGAAGGAGACAA  241

seq1  ATAGCATTTTAGAATATGGAGAAGGGAAGAGTTTGAGTTCTCAAAATTAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGCATTTTAGAATATGGAGAAGGGAAGAGTTTGAGTTCTCAAAATTAT  291

seq1  GTGCCTGGGTATTTTCCAGTATCTTTTTATGTAAAAGATGAGTCCCCAAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCTGGGTATTTTCCAGTATCTTTTTATGTAAAAGATGAGTCCCCAAT  341

seq1  GTACCAGTAGCCTGCTTGGTGTAGGGGTCTGAGAAGGGCTTAGCTTAAGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACCAGTAGCCTGCTTGGTGTAGGGGTCTGAGAAGGGCTTAGCTTAAGT  391

seq1  CTGTGCTTGGCCTCTCATAGGCCGCAGTGGAGGTGCTGCTTGGCAGTGCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGCTTGGCCTCTCATAGGCCGCAGTGGAGGTGCTGCTTGGCAGTGCT  441

seq1  CATCTTGGAACTTGGCTGGGGAGTCTTCCCCCTCATACTCACTCACGGTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTTGGAACTTGGCTGGGGAGTCTTCCCCCTCATACTCACTCACGGTG  491

seq1  GGACTAGGTTCCTCCTGAGATGTCAGGCACAGTGCCTTGCTGGCTGGTGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTAGGTTCCTCCTGAGATGTCAGGCACAGTGCCTTGCTGGCTGGTGG  541

seq1  TCAGGGTCTTCCCTTGGCCCTCTCCCTCATCTTGTTCTCCATCATAGCAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGGTCTTCCCTTGGCCCTCTCCCTCATCTTGTTCTCCATCATAGCAA  591

seq1  GCCTGCGGGAGAGCCAGCAGAGCCAGCAGGTAAGGATGCATCCTTTGCTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGCGGGAGAGCCAGCAGAGCCAGCAGGTAAGGATGCATCCTTTGCTT  641

seq1  TAACTAGTAAACTTATTTTCTTCTTTTCGTTTCAGCAGAGTTACTGTGTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTAGTAAACTTATTTTCTTCTTTTCGTTTCAGCAGAGTTACTGTGTC  691

seq1  ACAGTCCTTATTTCCATATAATTAATATTCTTTGACAGAGAGGAATGTCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTCCTTATTTCCATATAATTAATATTCTTTGACAGAGAGGAATGTCT  741

seq1  GCTGAGGTGCCCTCCCCCGAGATCATAGCCATCAGCTACTCAGTCTTCTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGAGGTGCCCTCCCCCGAGATCATAGCCATCAGCTACTCAGTCTTCTG  791

seq1  TAAGTCAATGTTGTCGACTCACTGTGTTCCTTCTCTTCCAATCCATAGCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTCAATGTTGTCGACTCACTGTGTTCCTTCTCTTCCAATCCATAGCT  841

seq1  GGAATCCCAACCTCAAGGTGAGGCCTTTGAGAGGTTTTCAGTGATGAGGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATCCCAACCTCAAGGTGAGGCCTTTGAGAGGTTTTCAGTGATGAGGA  891

seq1  GATGGACTTATGAATTGAGTTAGTGTCTTTAGAAAGGGCATCCCAGAAAG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGACTTATGAATTGAGTTAGTGTCTTTAGAAAGGGCATCCCAGAAAG  941

seq1  CTCCCTGACCCCAGCCATGTGTCCCCAAGCTACAACATAAGAAATGTGTC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCTGACCCCAGCCATGTGTCCCCAAGCTACAACATAAGAAATGTGTC  991

seq1  TGTGAATTACAAAGTGCTCCTGCTCCACAGGCTCTATCTTTCCAAATATG  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAATTACAAAGTGCTCCTGCTCCACAGGCTCTATCTTTCCAAATATG  1041

seq1  GAGAATTC  1058
      ||||||||
seq2  GAGAATTC  1049

seq1: chr7_123909136_123910197
seq2: B6Ng01-113J07.g_71_1133

seq1  GAATTCCAAATGAGACATGGCCTGAGTGAGAAGCTCTTGGAAACTGGATT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAAATGAGACATGGCCTGAGTGAGAAGCTCTTGGAAACTGGATT  50

seq1  TAGGAACATGCAGTATGAACGTGCATCACCAGTCAGTACATGGCTCTTAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGAACATGCAGTATGAACGTGCATCACCAGTCAGTACATGGCTCTTAC  100

seq1  CTCACTCCTCATTTGCTTCACTTGGGGGGGGGCTGTTATTAAGGGAGGAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACTCCTCATTTGCTTCACTTGGGGGGGGGCTGTTATTAAGGGAGGAC  150

seq1  TGAGCAAGGGGTAGACCACCTCTCTGCTTCTGTTAGTGCATGGAAGTACT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCAAGGGGTAGACCACCTCTCTGCTTCTGTTAGTGCATGGAAGTACT  200

seq1  GACTTCCTGCCTGCCTGATAACTACTTATGTGTTCTCAGTAAAGACTGGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTCCTGCCTGCCTGATAACTACTTATGTGTTCTCAGTAAAGACTGGA  250

seq1  AACAATCAAAACTATAGGTTTTATGATCCTCCTGAAGGTCATCCAAGGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAATCAAAACTATAGGTTTTATGATCCTCCTGAAGGTCATCCAAGGAA  300

seq1  GAACATGATGGCAAGGGGATGGGACTTGTCCTTAATGAGAGGAGAAATGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACATGATGGCAAGGGGATGGGACTTGTCCTTAATGAGAGGAGAAATGT  350

seq1  TGATGAAGGGCCTTAAACACAGATGGGCATGTATAGGCAGACTGCCCCTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGAAGGGCCTTAAACACAGATGGGCATGTATAGGCAGACTGCCCCTC  400

seq1  AGACTTCTAGCAAAGTAACATTTATTTAGCAGTGTCTGTGGGACCTGTTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTTCTAGCAAAGTAACATTTATTTAGCAGTGTCTGTGGGACCTGTTT  450

seq1  ACCATAAGCCACTGGCTGGACTGGCACATAGTAGGTGTTTCATCAGCACT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATAAGCCACTGGCTGGACTGGCACATAGTAGGTGTTTCATCAGCACT  500

seq1  TTAATAGGCAGACCCTCATCTCTCTGCTGGATAATTTTGAGGAGTAAGGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATAGGCAGACCCTCATCTCTCTGCTGGATAATTTTGAGGAGTAAGGA  550

seq1  GAGGCTTGCTGCCCCTGTTCATCTTATTTATTTATTCCGGCATTACAGAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGCTTGCTGCCCCTGTTCATCTTATTTATTTATTCCGGCATTACAGAT  600

seq1  CAGCCCAAACTTTGTTCAATCATCTTTTTTATATGCTTGTATTTCTATGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCCAAACTTTGTTCAATCATCTTTTTTATATGCTTGTATTTCTATGA  650

seq1  GTCAGCATTCTGGGCTGAGTCCAGTTGGTTGTGTCTTCTGCTGTTACTTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGCATTCTGGGCTGAGTCCAGTTGGTTGTGTCTTCTGCTGTTACTTC  700

seq1  TGGGGCTCCTCGCATTTTGTGCCTCTCTGCTGATTTCACCATAATTGTTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGCTCCTCGCATTTTGTGCCTCTCTGCTGATTTCACCATAATTGTTA  750

seq1  GGTTATGTAGAGAGGCTTACCTTCTCA-TCCTCAGAGAGTCAACACGGGA  799
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTATGTAGAGAGGCTTACCTTCTCATTCCTCAGAGAGTCAACACGGGA  800

seq1  TGCTCCCCATATGTCATTCTT-GGGGAAAT--CTTTTGAGACAGCCTTTG  846
      ||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||
seq2  TGCTCCCCATATGTCATTCTTGGGGGAAATTCTTTTTGAGACAGCCTTTG  850

seq1  GCAGACTG-TGCACATGTATG-TGACTCTATTTTTATGTAT-GTGCGGTT  893
      |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||
seq2  GCAGACTGTTGCACATGTATGTTGACTCTA-TTTTATGTATGGTGCGGTT  899

seq1  GAGTATGTGTATG-TGCACGTGCACAT-GGAGGCCAGAGAAGAACCTTGC  941
      ||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||| || || |||||
seq2  GAGTATGTGTATGTTGCACGTGCACATGGGAGTGCAGA-AAAAATCTTGC  948

seq1  CTTTCATTCCTTAGGAGTCACCCACCTTGTTTTTAAACACAGGCACTCTC  991
      ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |   |||
seq2  CTTTCATTCCTTA-GAGTCACCCACCTTGTTTTT-AACACAGCCCTCCTC  996

seq1  ATTGACTTAGAAATTGCTAGGCTAACTGGTAAGATAGCCTCAGAGATCCA  1041
      | |||| |||||||||||||||||||| |||| |   ||||| | |||| 
seq2  A-TGAC-TAGAAATTGCTAGGCTAACT-GTAAAAAGCCCTCA-AAATCC-  1041

seq1  TTTGCCCCTG-CCTCCCGTGTG  1062
      |||||||||| || ||||||||
seq2  TTTGCCCCTGCCCCCCCGTGTG  1063