BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-115B16
Chromosome7 (Build37)
Map Location 136,289,753 - 136,498,873
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100043144, Ppapdc1a
Upstream geneItgax, Itgad, Cox6a2, LOC100043133, Armc5, Tgfb1i1, Slc5a2, BC017158, EG628781, Rgs10, LOC100043643, Tial1, Bag3, EG639030, Inpp5f, LOC100043651, 1110007A13Rik, Sec23ip, LOC210714
Downstream geneBrwd2, LOC100043150, Fgfr2, LOC546005
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-115B16.bB6Ng01-115B16.g
ACCDH920454DH920455
length1,2191,179
definitionDH920454|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-115B16, 5' end.DH920455|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-115B16, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(136,497,648 - 136,498,873)(136,289,753 - 136,290,960)
sequence
gaattcttatgttatattaactttcttcttatacagtccaggatcccaac
acagggaatggtgccactcatcgggatgagtcttacctcctcaattaacc
taataacccctcataggcatgcccagaggatggtctcccagataattcta
gatctcaagttgacaaatgagactaaccaccatacctctataccaactac
caaccacaatccaccataacctataggcagcaaaacactgagattagaga
aaaatgtttttcctttgagccctcaggtgatgcaagattgtcagtgtcga
ggaatacagcctgctaggatttatatggacttcataaaacacacaaacaa
cacatacccttcaattagcacagttacagaaccaacatctagaactatag
ggtaagaattttgttatgaggtcactaagtcaacaagtgtttagatcttc
tagattcttgcctagtatgcttggttctaggaaacaaatatcagacttgg
ttggaattccagaagatttagagacagaaatcattattaacattgtcaag
agtatcaattaaaaaactaaacagactcttagaagaaagaatgctgggtg
gaaacagaagagacctatccatcttatatacataatgaacaaggaaaggc
tatgtacaaagtactagaaagagtggacagggatcagtatggatctgtga
agaggaaatactgaatgtagtttaggtaccaccatatgctgctgcagatt
tgtgcacagagcttagagatgtagtgatgcatggcatatgtgaagccctc
cattcagtccccagagccaaaaggaaaaggctgctaatgtagctggaagg
gagtacagaatgaaacgaagcctcaggaataagctagaataagcagggct
agaattttccttaataagtcatagaaagtcattcaagttttattctaaat
cggtcatttccaaggaaatttaaagggtagcagatatgaattggatatat
atgaatggctgggaagatgacaaaggtagacccaggaggactagatagga
gtcattgagcttcatatcacctgggtcctttggagcttaaatggccctgt
ttggtgccataatgcctggtccaagggacaggatatcaggtcaggttcag
cttagggtcttggacctttgtctggagggtatggtggactcagaataggg
aagagatgggaatatctcc
gaattcatgtggagcagaacaggggcctgagagagggctcagtgggaact
gtttgcatacaggcctgatgactggggtatgatcccagatccacatggtg
gcatgagggaaccaactctaaaaagttatcttctggcctcaatataccag
tatctcaaagccctctctcaagcacatgcacaaacaaacccacacaaaac
aaaaacaaaaacaaaaacaaaaagagggagaaattgagtttaactccagc
gtcttcctctgcttcctgattatggttgccacgtgaccagctcctctcac
tcttacctccatggcacctccaccgtgatgggccacaccctcagtaaggc
caaataaacccttcttttcttaacttgctttctcagacattaaacagaaa
caatgaccacagtaactagcatgagtttttaccagggtttgcttcctggg
ctttcaatctctgatttttgtggcaatcatgctaagattaggtttttatc
tcctttttttaaatttaaaattctaaaaatcagttttgagaatttcatac
atgaatactgtatgaagttctacactcccctcctccttgcaactcctcct
atgtccctcttccactctcatgacttcttcaattattgttatttatataa
acatatgtatgtataaatacaacccattgggtccatttactgttgccttc
atgaatatttgtttagggaattaccatttgggcctgggtagcctctcagg
agagcccatccccagagaagactgaaatgtaggcaattgatggctcctga
gagagggagaacagtgtccccaggcattaacatctttttggtggattagt
ctctctgtcactctaaatgactttcttgatatatggcatcaccctttgct
ctaaatctactttggcattaatatgccagtctattggttagctttagcct
gctatgcatttgtactattctttgatttttacggatagttaaacatttgt
tttaaaatcagcttgtagcctgatcttttccttggatgttaggccattta
tctttatggtgatcactggactggctggggttgaactgtattgggagctg
tctcattttccaactgcttcgtcctttgttcctcaattcgactttactag
gaatcctaaagaagtgcctgttttcctgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_136497648_136498873
seq2: B6Ng01-115B16.b_44_1262 (reverse)

seq1  GGAG-TATTCCCTATTCTTCCCTATTCTTGAAGTCACCATACACTTCAGA  49
      |||| |||||||   |||||||||||| |||   |||||||| || ||||
seq2  GGAGATATTCCCATCTCTTCCCTATTC-TGAGTCCACCATACCCTCCAGA  49

seq1  CAAAGGGTCCAGAGACCTTAAAGCTGGAACTGACCTGAATATCCTGTCCC  99
      |||| |||||| ||||| | |||||| | |||||||| ||||||||||||
seq2  CAAA-GGTCCA-AGACCCT-AAGCTGAACCTGACCTG-ATATCCTGTCCC  95

seq1  TGTGGACTAGCATTTATGGCACCAAACAGTGCCATGTAAGCTTCCAAAGG  149
      | ||||| ||   |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||
seq2  T-TGGACCAGGCATTATGGCACCAAACAGGGCCATTTAAGC-TCCAAAGG  143

seq1  AACCA-GTGATATGAAGCTCAATGACTCCTATCTAGTCCTCTTGGGTCTA  198
      | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  ACCCAGGTGATATGAAGCTCAATGACTCCTATCTAGTCCTCCTGGGTCTA  193

seq1  CCTTTGTTCATCTTCCCAGCCATTCATATATATTCAATTCATATTCTGCT  248
      |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||
seq2  CCTTTG-TCATCTTCCCAGCCATTCATATATATCCAATTCATA-TCTGCT  241

seq1  ACCCTTTAAATTTCTTTGGATATGACCGATTTAGAATAAAACTTGAATGA  298
      |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTTTAAATTTCCTTGGAAATGACCGATTTAGAATAAAACTTGAATGA  291

seq1  CTTTCTATGACTTATTAAGGAAAATTCTAGCCCTGCTTATTCTAGCTTAT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCTATGACTTATTAAGGAAAATTCTAGCCCTGCTTATTCTAGCTTAT  341

seq1  TCCTGAGGCTTCGTTTCATTCTGTACTCCCTTCCAGCTACATTAGCAGCC  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGAGGCTTCGTTTCATTCTGTACTCCCTTCCAGCTACATTAGCAGCC  391

seq1  TTTTCCTTTTGGCTCTGGGGACTGAATGGAGGGCTTCACATATGCCATGC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCCTTTTGGCTCTGGGGACTGAATGGAGGGCTTCACATATGCCATGC  441

seq1  ATCACTACATCTCTAAGCTCTGTGCACAAATCTGCAGCAGCATATGGTGG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACTACATCTCTAAGCTCTGTGCACAAATCTGCAGCAGCATATGGTGG  491

seq1  TACCTAAACTACATTCAGTATTTCCTCTTCACAGATCCATACTGATCCCT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTAAACTACATTCAGTATTTCCTCTTCACAGATCCATACTGATCCCT  541

seq1  GTCCACTCTTTCTAGTACTTTGTACATAGCCTTTCCTTGTTCATTATGTA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCACTCTTTCTAGTACTTTGTACATAGCCTTTCCTTGTTCATTATGTA  591

seq1  TATAAGATGGATAGGTCTCTTCTGTTTCCACCCAGCATTCTTTCTTCTAA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAAGATGGATAGGTCTCTTCTGTTTCCACCCAGCATTCTTTCTTCTAA  641

seq1  GAGTCTGTTTAGTTTTTTAATTGATACTCTTGACAATGTTAATAATGATT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCTGTTTAGTTTTTTAATTGATACTCTTGACAATGTTAATAATGATT  691

seq1  TCTGTCTCTAAATCTTCTGGAATTCCAACCAAGTCTGATATTTGTTTCCT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTCTCTAAATCTTCTGGAATTCCAACCAAGTCTGATATTTGTTTCCT  741

seq1  AGAACCAAGCATACTAGGCAAGAATCTAGAAGATCTAAACACTTGTTGAC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACCAAGCATACTAGGCAAGAATCTAGAAGATCTAAACACTTGTTGAC  791

seq1  TTAGTGACCTCATAACAAAATTCTTACCCTATAGTTCTAGATGTTGGTTC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTGACCTCATAACAAAATTCTTACCCTATAGTTCTAGATGTTGGTTC  841

seq1  TGTAACTGTGCTAATTGAAGGGTATGTGTTGTTTGTGTGTTTTATGAAGT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAACTGTGCTAATTGAAGGGTATGTGTTGTTTGTGTGTTTTATGAAGT  891

seq1  CCATATAAATCCTAGCAGGCTGTATTCCTCGACACTGACAATCTTGCATC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATATAAATCCTAGCAGGCTGTATTCCTCGACACTGACAATCTTGCATC  941

seq1  ACCTGAGGGCTCAAAGGAAAAACATTTTTCTCTAATCTCAGTGTTTTGCT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGAGGGCTCAAAGGAAAAACATTTTTCTCTAATCTCAGTGTTTTGCT  991

seq1  GCCTATAGGTTATGGTGGATTGTGGTTGGTAGTTGGTATAGAGGTATGGT  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTATAGGTTATGGTGGATTGTGGTTGGTAGTTGGTATAGAGGTATGGT  1041

seq1  GGTTAGTCTCATTTGTCAACTTGAGATCTAGAATTATCTGGGAGACCATC  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTAGTCTCATTTGTCAACTTGAGATCTAGAATTATCTGGGAGACCATC  1091

seq1  CTCTGGGCATGCCTATGAGGGGTTATTAGGTTAATTGAGGAGGTAAGACT  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGGGCATGCCTATGAGGGGTTATTAGGTTAATTGAGGAGGTAAGACT  1141

seq1  CATCCCGATGAGTGGCACCATTCCCTGTGTTGGGATCCTGGACTGTATAA  1198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCCGATGAGTGGCACCATTCCCTGTGTTGGGATCCTGGACTGTATAA  1191

seq1  GAAGAAAGTTAATATAACATAAGAATTC  1226
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAAAGTTAATATAACATAAGAATTC  1219

seq1: chr7_136289753_136290960
seq2: B6Ng01-115B16.g_70_1248

seq1  GAATTCATGTGGAGCAGAACAGGGGCCTGAGAGAGGGCTCAGTGGGAACT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATGTGGAGCAGAACAGGGGCCTGAGAGAGGGCTCAGTGGGAACT  50

seq1  GTTTGCATACAGGCCTGATGACTGGGGTATGATCCCAGATCCACATGGTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGCATACAGGCCTGATGACTGGGGTATGATCCCAGATCCACATGGTG  100

seq1  GCATGAGGGAACCAACTCTAAAAAGTTATCTTCTGGCCTCAATATACCAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGAGGGAACCAACTCTAAAAAGTTATCTTCTGGCCTCAATATACCAG  150

seq1  TATCTCAAAGCCCTCTCTCAAGCACATGCACAAACAAACCCACACAAAAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTCAAAGCCCTCTCTCAAGCACATGCACAAACAAACCCACACAAAAC  200

seq1  AAAAACAAAAACAAAAACAAAAAGAGGGAGAAATTGAGTTTAACTCCAGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAACAAAAACAAAAACAAAAAGAGGGAGAAATTGAGTTTAACTCCAGC  250

seq1  GTCTTCCTCTGCTTCCTGATTATGGTTGCCACGTGACCAGCTCCTCTCAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTCCTCTGCTTCCTGATTATGGTTGCCACGTGACCAGCTCCTCTCAC  300

seq1  TCTTACCTCCATGGCACCTCCACCGTGATGGGCCACACCCTCAGTAAGGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTACCTCCATGGCACCTCCACCGTGATGGGCCACACCCTCAGTAAGGC  350

seq1  CAAATAAACCCTTCTTTTCTTAACTTGCTTTCTCAGACATTAAACAGAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATAAACCCTTCTTTTCTTAACTTGCTTTCTCAGACATTAAACAGAAA  400

seq1  CAATGACCACAGTAACTAGCATGAGTTTTTACCAGGGTTTGCTTCCTGGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGACCACAGTAACTAGCATGAGTTTTTACCAGGGTTTGCTTCCTGGG  450

seq1  CTTTCAATCTCTGATTTTTGTGGCAATCATGCTAAGATTAGGTTTTTATC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCAATCTCTGATTTTTGTGGCAATCATGCTAAGATTAGGTTTTTATC  500

seq1  TCCTTTTTTTAAATTTAAAATTCTAAAAATCAGTTTTGAGAATTTCATAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTTTTTTAAATTTAAAATTCTAAAAATCAGTTTTGAGAATTTCATAC  550

seq1  ATGAATACTGTATGAAGTTCTACACTCCCCTCCTCCTTGCAACTCCTCCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAATACTGTATGAAGTTCTACACTCCCCTCCTCCTTGCAACTCCTCCT  600

seq1  ATGTCCCTCTTCCACTCTCATGACTTCTTCAATTATTGTTATTTATATAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCCCTCTTCCACTCTCATGACTTCTTCAATTATTGTTATTTATATAA  650

seq1  ACATATGTATGTATAAATACAACCCATTGGGTCCATTTACTGTTGCCTTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATATGTATGTATAAATACAACCCATTGGGTCCATTTACTGTTGCCTTC  700

seq1  ATGAATATTTGTTTAGGGAATTACCATTTGGGCCTGGGTAGCCTCTCAGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAATATTTGTTTAGGGAATTACCATTTGGGCCTGGGTAGCCTCTCAGG  750

seq1  AGAGCCCATCCCCAGAGAAGACTGAAATGTAGGCAATTGATGGCTCCTGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCCCATCCCCAGAGAAGACTGAAATGTAGGCAATTGATGGCTCCTGA  800

seq1  GAGAGGGAGAACAGTGTCCCCAGGCATTTAACATCTTTTTGGTGGATTAG  850
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGGGAGAACAGTGTCCCCAGGCA-TTAACATCTTTTTGGTGGATTAG  849

seq1  TCTCTCTGTCACTCTAAAATGACTTTCTTGATATATGGCATCACCCTTTG  900
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCTGTCACTCT-AAATGACTTTCTTGATATATGGCATCACCCTTTG  898

seq1  CTCTAAATCTACTTTGGCATTAATAATGCCAGTCTATTGGTTAGCTTTAG  950
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTAAATCTACTTTGGCATTAAT-ATGCCAGTCTATTGGTTAGCTTTAG  947

seq1  CCTGCTATGCATTTGTACTATTCTTTGATTTTTAACGGATAGTTAAAACA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||
seq2  CCTGCTATGCATTTGTACTATTCTTTGATTTTT-ACGGATAGTT-AAACA  995

seq1  TTGTTTTAAAAATCAAGCTTGTTAGCCTGTATCTTTTCCTTGAATGTTTA  1050
      ||  ||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||
seq2  TTTGTTTTAAAATC-AGCTTG-TAGCCTG-ATCTTTTCCTTGGATG-TTA  1041

seq1  GGCCATTTATCTTTAATGTGATCACTGGACTGGCTGGGTTTGAACTTGTT  1100
      |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||| 
seq2  GGCCATTTATCTTTATGGTGATCACTGGACTGGCTGGGGTTGAAC-TGT-  1089

seq1  ATTTTGTAGTCTTTGTCTATTTTTCCAACTGCCTTCTGTCCCTTTGTTCC  1150
        || | ||    |||||  ||||||||||| |||| || ||||||||||
seq2  -ATTGGGAG---CTGTCTCATTTTCCAACTG-CTTC-GT-CCTTTGTTCC  1132

seq1  TTCATTTTCTGACCTTTATCTACTGTGATATCTTAATAGAATTGTTCTGT  1200
      |  |||    |||     | ||||  || ||| ||| |||| ||  ||||
seq2  TCAATT---CGAC-----TTTACTAGGA-ATCCTAA-AGAAGTG-CCTGT  1171

seq1  TTTCCTGG  1208
      ||||||||
seq2  TTTCCTGG  1179