BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-118I01
Chromosome7 (Build37)
Map Location 98,606,382 - 98,750,319
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDlg2
Upstream geneTmem126b, B230218P12Rik, LOC666689, LOC621816, LOC100039943
Downstream geneCcdc90b
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-118I01.bB6Ng01-118I01.g
ACCDH922964DH922965
length9001,128
definitionDH922964|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-118I01, 5' end.DH922965|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-118I01, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(98,749,420 - 98,750,319)(98,606,382 - 98,607,514)
sequence
gaattctgtagggcaggagtaggaaggactcatatactgaattgggtggc
ctttgtgagctttctaaaaattggacaatatctcgtgacaggctaaagaa
ttatatccaatggcatgctggccacatattgtctagaggactaaaaagat
aatacctagacatcatatatgtggacctagcaattatacttctttaagta
aggtaaatgtacataatctaatccacacagtcccagtgaaaattaatgac
ctaggtctgcttttactgctgtatgaatagtagtgatgctcatagccacc
aggtggcagagttttggtacagtgactgactcaaagaatttcaaacacca
gctcaagatgcattcaaaaatcatctttaagtaagattccaaattctccc
atctgtttccatgtaccaggtgcagaggttagatagggaaagtgaaatgt
atatttggaggctcttggaaggtagataacaggatagaacatcacatata
tttaaagaacaactattcaaagatgcaactttttgccttcaacctcaaaa
ttatcacagtgtagcctaagcatgatttcctctaatcatctgtgtaacat
ccatcctatcacatttaaactgggggaagtcacggacacctgactcttat
ttgaatccccaagtcatagaaagcagtcaaaacatatgtcatctctttat
gtggttttatcactcaaagatatatatatttctgaccttattccgatgtg
tcaccataggtcacagccaaaaggagtattattttagtaacatgaatagg
gacaaggactctgttttcattcattaaactcagacattagagatatgtac
gtttgtatgtatatatgtatgcatgtatgtatgtatgttagggtgtgtgt

gaattctctctagggtttagagagatggctcatgcttacagcacttgcct
gtaaacaggagagcatgaattccatcagccatcagcgtgaaccttcctaa
ttgacagggtctaaaacagtgtgagaccctgtctaagtagagcttcatgg
cagtcctgaagttgcctggcttccacatacatgtcaatagaatgaagccc
acaatgggttttttatggcttttgaaaaatgggttagaagatagtactca
aacttcctatttctttcatctacataaaagtaataacaatggttttatag
atacactaaattgctttacttatatgtatgtatatatcaaaggcacacca
atttttaaaacaaaaatttcttataataatctctaatgagtattaatagt
gatcatttatgcaaatattcctaaagagttaactccgttattattataac
ttctctaaaaactaaactctcactactgccaaggcttctgttataattag
aaaaaaaaattactaaagcccacagaagctcttttgtcaatgtgagatat
ctcttgttgttgctagtggtgctggtggcattaatgcctttaaattaccc
acaattcctaatacatcttccttttaaacaataaactagttgtatgcttt
gagtaagagtgctgtccactatttctcctttccaaaggtctatataaatt
atttgaaactaacacattaaacaattaatatacatcaagattaatttgag
ttgaggaaactttttttttttcagttttctgctagctagtccaaataatg
taccacaggtataatttagagaagtaaaggagtttaacattttctgggtt
tcaagaatgcctctgttactgactagtatgacctattataaaacatacta
acatattccctaaagtatacaatagggcaagactcaatctgtaataaaga
ttactacatatccaatacgagaattatttcgaatagtccttcacacctaa
cagtgcccagtaattataattatttttcattaaataaccacaaaagaaac
atgtagaacaatctaaattaacatataaattctggactaaaaatagatgc
tagatcttaatcattccctatctttctg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_98749420_98750319
seq2: B6Ng01-118I01.b_47_946 (reverse)

seq1  ACACACACCCTAACATACATACATACATGCATACATATATACATACAAAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACCCTAACATACATACATACATGCATACATATATACATACAAAC  50

seq1  GTACATATCTCTAATGTCTGAGTTTAATGAATGAAAACAGAGTCCTTGTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACATATCTCTAATGTCTGAGTTTAATGAATGAAAACAGAGTCCTTGTC  100

seq1  CCTATTCATGTTACTAAAATAATACTCCTTTTGGCTGTGACCTATGGTGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTATTCATGTTACTAAAATAATACTCCTTTTGGCTGTGACCTATGGTGA  150

seq1  CACATCGGAATAAGGTCAGAAATATATATATCTTTGAGTGATAAAACCAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATCGGAATAAGGTCAGAAATATATATATCTTTGAGTGATAAAACCAC  200

seq1  ATAAAGAGATGACATATGTTTTGACTGCTTTCTATGACTTGGGGATTCAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAGAGATGACATATGTTTTGACTGCTTTCTATGACTTGGGGATTCAA  250

seq1  ATAAGAGTCAGGTGTCCGTGACTTCCCCCAGTTTAAATGTGATAGGATGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGAGTCAGGTGTCCGTGACTTCCCCCAGTTTAAATGTGATAGGATGG  300

seq1  ATGTTACACAGATGATTAGAGGAAATCATGCTTAGGCTACACTGTGATAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTACACAGATGATTAGAGGAAATCATGCTTAGGCTACACTGTGATAA  350

seq1  TTTTGAGGTTGAAGGCAAAAAGTTGCATCTTTGAATAGTTGTTCTTTAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGAGGTTGAAGGCAAAAAGTTGCATCTTTGAATAGTTGTTCTTTAAA  400

seq1  TATATGTGATGTTCTATCCTGTTATCTACCTTCCAAGAGCCTCCAAATAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATGTGATGTTCTATCCTGTTATCTACCTTCCAAGAGCCTCCAAATAT  450

seq1  ACATTTCACTTTCCCTATCTAACCTCTGCACCTGGTACATGGAAACAGAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTTCACTTTCCCTATCTAACCTCTGCACCTGGTACATGGAAACAGAT  500

seq1  GGGAGAATTTGGAATCTTACTTAAAGATGATTTTTGAATGCATCTTGAGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGAATTTGGAATCTTACTTAAAGATGATTTTTGAATGCATCTTGAGC  550

seq1  TGGTGTTTGAAATTCTTTGAGTCAGTCACTGTACCAAAACTCTGCCACCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGTTTGAAATTCTTTGAGTCAGTCACTGTACCAAAACTCTGCCACCT  600

seq1  GGTGGCTATGAGCATCACTACTATTCATACAGCAGTAAAAGCAGACCTAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGCTATGAGCATCACTACTATTCATACAGCAGTAAAAGCAGACCTAG  650

seq1  GTCATTAATTTTCACTGGGACTGTGTGGATTAGATTATGTACATTTACCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATTAATTTTCACTGGGACTGTGTGGATTAGATTATGTACATTTACCT  700

seq1  TACTTAAAGAAGTATAATTGCTAGGTCCACATATATGATGTCTAGGTATT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTAAAGAAGTATAATTGCTAGGTCCACATATATGATGTCTAGGTATT  750

seq1  ATCTTTTTAGTCCTCTAGACAATATGTGGCCAGCATGCCATTGGATATAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTTTTAGTCCTCTAGACAATATGTGGCCAGCATGCCATTGGATATAA  800

seq1  TTCTTTAGCCTGTCACGAGATATTGTCCAATTTTTAGAAAGCTCACAAAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTTAGCCTGTCACGAGATATTGTCCAATTTTTAGAAAGCTCACAAAG  850

seq1  GCCACCCAATTCAGTATATGAGTCCTTCCTACTCCTGCCCTACAGAATTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCACCCAATTCAGTATATGAGTCCTTCCTACTCCTGCCCTACAGAATTC  900

seq1: chr7_98606382_98607514
seq2: B6Ng01-118I01.g_67_1194

seq1  GAATTCTCTCTAGGGTTTAGAGAGATGGCTCATGCTTACAGCACTTGCCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTCTAGGGTTTAGAGAGATGGCTCATGCTTACAGCACTTGCCT  50

seq1  GTAAACAGGAGAGCATGAATTCCATCAGCCATCAGCGTGAACCTTCCTAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAACAGGAGAGCATGAATTCCATCAGCCATCAGCGTGAACCTTCCTAA  100

seq1  TTGACAGGGTCTAAAACAGTGTGAGACCCTGTCTAAGTAGAGCTTCATGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGACAGGGTCTAAAACAGTGTGAGACCCTGTCTAAGTAGAGCTTCATGG  150

seq1  CAGTCCTGAAGTTGCCTGGCTTCCACATACATGTCAATAGAATGAAGCCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCCTGAAGTTGCCTGGCTTCCACATACATGTCAATAGAATGAAGCCC  200

seq1  ACAATGGGTTTTTTATGGCTTTTGAAAAATGGGTTAGAAGATAGTACTCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATGGGTTTTTTATGGCTTTTGAAAAATGGGTTAGAAGATAGTACTCA  250

seq1  AACTTCCTATTTCTTTCATCTACATAAAAGTAATAACAATGGTTTTATAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTCCTATTTCTTTCATCTACATAAAAGTAATAACAATGGTTTTATAG  300

seq1  ATACACTAAATTGCTTTACTTATATGTATGTATATATCAAAGGCACACCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACACTAAATTGCTTTACTTATATGTATGTATATATCAAAGGCACACCA  350

seq1  ATTTTTAAAACAAAAATTTCTTATAATAATCTCTAATGAGTATTAATAGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTTAAAACAAAAATTTCTTATAATAATCTCTAATGAGTATTAATAGT  400

seq1  GATCATTTATGCAAATATTCCTAAAGAGTTAACTCCGTTATTATTATAAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCATTTATGCAAATATTCCTAAAGAGTTAACTCCGTTATTATTATAAC  450

seq1  TTCTCTAAAAACTAAACTCTCACTACTGCCAAGGCTTCTGTTATAATTAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCTAAAAACTAAACTCTCACTACTGCCAAGGCTTCTGTTATAATTAG  500

seq1  AAAAAAAAATTACTAAAGCCCACAGAAGCTCTTTTGTCAATGTGAGATAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAAATTACTAAAGCCCACAGAAGCTCTTTTGTCAATGTGAGATAT  550

seq1  CTCTTGTTGTTGCTAGTGGTGCTGGTGGCATTAATGCCTTTAAATTACCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTGTTGTTGCTAGTGGTGCTGGTGGCATTAATGCCTTTAAATTACCC  600

seq1  ACAATTCCTAATACATCTTCCTTTTAAACAATAAACTAGTTGTATGCTTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATTCCTAATACATCTTCCTTTTAAACAATAAACTAGTTGTATGCTTT  650

seq1  GAGTAAGAGTGCTGTCCACTATTTCTCCTTTCCAAAGGTCTATATAAATT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTAAGAGTGCTGTCCACTATTTCTCCTTTCCAAAGGTCTATATAAATT  700

seq1  ATTTGAAACTAACACATTAAACAATTAATATACATCAAGATTAATTTGAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGAAACTAACACATTAAACAATTAATATACATCAAGATTAATTTGAG  750

seq1  TTGAGGAAAC-TTTTTTTTTTCAGTTTTCTGCTAGCTAGTCCAAATAATG  799
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGGAAACTTTTTTTTTTTCAGTTTTCTGCTAGCTAGTCCAAATAATG  800

seq1  TACCACAGGTATAATTTAGAGAAGTAAAGGAGTTTAACATTTTCTGGGTT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCACAGGTATAATTTAGAGAAGTAAAGGAGTTTAACATTTTCTGGGTT  850

seq1  TCAAGAATGCCTCTGTTACTGACTAGTATGACCTATTATAAAACATACTA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGAATGCCTCTGTTACTGACTAGTATGACCTATTATAAAACATACTA  900

seq1  ACATATTCCCTAAAGTATACAATAGGGCAAGACTCAATCTGTAATAAAGA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATATTCCCTAAAGTATACAATAGGGCAAGACTCAATCTGTAATAAAGA  950

seq1  TTACTACATATCCAATACGAGAATTATTTCGAATAGTCCTTCACACCTAA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTACATATCCAATACGAGAATTATTTCGAATAGTCCTTCACACCTAA  1000

seq1  CAGGTGCCCAGTAATTTATAATTATTTTTCCATTAAATAAACACAAAAGA  1049
      || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||
seq2  CA-GTGCCCAGTAA-TTATAATTATTTTT-CATTAAATAACCACAAAAGA  1047

seq1  CACATGTAAGAACAATCTAAATTTAACATTATAAATTCTGGACTAAAAAT  1099
       |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||
seq2  AACATGT-AGAACAATCTAAA-TTAACA-TATAAATTCTGGACTAAAAAT  1094

seq1  AGATGCTAGATCTT-ATCATTTCCCTATCTTTCTG  1133
      |||||||||||||| |||| |||||||||||||||
seq2  AGATGCTAGATCTTAATCA-TTCCCTATCTTTCTG  1128