BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-119J02
Chromosome7 (Build37)
Map Location 122,064,271 - 122,219,169
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG627967
Upstream geneSpon1, Rras2, LOC668451, Copb1, Psma1, 4933406I18Rik, Pde3b, Cyp2r1, Calca, LOC100043295, Calcb, Insc
Downstream geneLOC668472, Sox6, LOC100042779, 1110006G14Rik, EG668479
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-119J02.bB6Ng01-119J02.g
ACCDH923746DH923747
length1,0391,127
definitionDH923746|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-119J02, 5' end.DH923747|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-119J02, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(122,218,134 - 122,219,169)(122,064,271 - 122,065,377)
sequence
gaattcaaggaggatgccatacagtcaagcagggaacaccacataaagaa
agctgccattttccaagagttggcacaatgagatctggagagacactgga
gtgcttcagcttggggagagaggaggcttgcgactgttctgagtccttga
aagagaagactgagaaagagtagggtttgatgggaaagagcatagcttga
agataccagaaacaaaaataccctagccatattgagggagtgaaaagaaa
ataagaaggatataattctccagggttgactcatggactggactgcagct
ttggttgaatggcataatccttccactctgtacatgtgtatcaaaacaga
taatactttaagttctggagtggagagataacggaactgcttagatttga
gtcttggagatctactctttaagctccaactctttctgccatagtctcct
tacgagtctcttgttcttccaaggccctccatcagccttagttcttatct
ggaggaaagggtggtttttgtttcacataagctgggctatggacaaggaa
gaattcctaaaccttccagccagtgaatagacactgggaaccctcaggtg
aaaggtctgtagtaacacagcagtcaattacagcttatggttggcatgag
atcatcaaggtggcacatttgcctggcgttcttcagtccacagtcaagat
ttcccatgatgactattgattgatgggctaaatgggcagaagagtcagcc
aaggaatgaacaaggacataaattgtgtgatttgacattaaaacctgtgc
tgtgagttccttattcatctctgtatggttgtctaacttgactcaaggat
gccatgctggcagaaaagagcctgagactatgtgtctgatactttagctc
ttagatttagcttttttttctttctcatcccccatcctaccccttttctt
cttgacttgtagcctgtatcccaggtcagtctagtccttgcctcatttct
taccccagggatcatgattctatgcttttctttctccca
gaattctccttcccttcactctcccccttctccctttcttccattcatct
atacctccggctacccacccaatattgatatgtacatgatagaactaagc
ctttattaatttgcatgctagaattaaatcatcattgtgctagaattaag
actttataagaaagtaaaggtgttttctgtcttcaaggacagttatactt
gggctgggaaactggaaaggaatgggaatgtgaaaagatgacttagaatt
gattgatgcagacctccatcactgtctgatttcacaaggatggtgatgaa
gaggaaagggagaaagtgatcctggaaagggcagtgtgaactctgcaccc
agttattttacaggctacattgtatggtgctataccataacatatgctgg
ccatgtgatcttggatcaatcttcttacctaggtctcttacttatccaca
cactttggactgggtgatttttttctggtatttcacatactatgattcta
ttattctattcctatgcattaatcaaaataagcaaagatcaggagctagt
gaattgtgggctgtttggagcttgggaagtaggactctgtgaggatgcag
gtggagaagcagttgagtagggacaaaggttggagttgggctgtggagag
aggctggagatgtcagaatggcaggacataccgagtttctctgcacttga
agtgcctctctgctcctggctctcacctgtgacacaaacagagtcctttg
aaaccaattaccacagttttttttcactctttccttgactgtgtttgggc
tcacattggggcagtcctagattagaagaatgtggactgaagagtctttg
ctcaagcacattgggctgctctcctctatgtgctggctgcctttccactc
taggctagggcttcatttttaccattttgtaattaacatacaacttgaca
aagaagaagcctctaagttatatatttagagacttctggaagaaacaaca
ctcattgactctgaagcttagaaagctatttaaagtcatacttggtgccc
cttctgaattctttctacttgattctatcattaacattccagagaatgat
tgaatggatggatgaatgagtgagtga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_122218134_122219169
seq2: B6Ng01-119J02.b_49_1082 (reverse)

seq1  GAAAGAAAAAGCATAGAATCATGATCCCTGGGGTAAGAAATGGAGGCAAG  50
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  GAAAG-AAAAGCATAGAATCATGATCCCTGGGGTAAGAAAT-GAGGCAAG  48

seq1  GACTAGACTGACCTGGGATACAGGCTACAAGTCAAGAAGAAAAGGGGTAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTAGACTGACCTGGGATACAGGCTACAAGTCAAGAAGAAAAGGGGTAG  98

seq1  GATGGGGGATGAGAAAGAAAAAAAAGCTAAATCTAAGAGCTAAAGTATCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGGGGATGAGAAAGAAAAAAAAGCTAAATCTAAGAGCTAAAGTATCA  148

seq1  GACACATAGTCTCAGGCTCTTTTCTGCCAGCATGGCATCCCTGAGTCAAG  200
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  GACACATAGTCTCAGGCTCTTTTCTGCCAGCATGGCATCCTTGAGTCAAG  198

seq1  TTAGACAACCATACAGAGATGAATAAGGAACTCACAGCACAGGTTTTAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGACAACCATACAGAGATGAATAAGGAACTCACAGCACAGGTTTTAAT  248

seq1  GTCAAATCACACAATTTATGTCCTTGTTCATTCCTTGGCTGACTCTTCTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAAATCACACAATTTATGTCCTTGTTCATTCCTTGGCTGACTCTTCTG  298

seq1  CCCATTTAGCCCATCAATCAATAGTCATCATGGGAAATCTTGACTGTGGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCATTTAGCCCATCAATCAATAGTCATCATGGGAAATCTTGACTGTGGA  348

seq1  CTGAAGAACGCCAGGCAAATGTGCCACCTTGATGATCTCATGCCAACCAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAGAACGCCAGGCAAATGTGCCACCTTGATGATCTCATGCCAACCAT  398

seq1  AAGCTGTAATTGACTGCTGTGTTACTACAGACCTTTCACCTGAGGGTTCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTGTAATTGACTGCTGTGTTACTACAGACCTTTCACCTGAGGGTTCC  448

seq1  CAGTGTCTATTCACTGGCTGGAAGGTTTAGGAATTCTTCCTTGTCCATAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGTCTATTCACTGGCTGGAAGGTTTAGGAATTCTTCCTTGTCCATAG  498

seq1  CCCAGCTTATGTGAAACAAAAACCACCCTTTCCTCCAGATAAGAACTAAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGCTTATGTGAAACAAAAACCACCCTTTCCTCCAGATAAGAACTAAG  548

seq1  GCTGATGGAGGGCCTTGGAAGAACAAGAGACTCGTAAGGAGACTATGGCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGATGGAGGGCCTTGGAAGAACAAGAGACTCGTAAGGAGACTATGGCA  598

seq1  GAAAGAGTTGGAGCTTAAAGAGTAGATCTCCAAGACTCAAATCTAAGCAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGAGTTGGAGCTTAAAGAGTAGATCTCCAAGACTCAAATCTAAGCAG  648

seq1  TTCCGTTATCTCTCCACTCCAGAACTTAAAGTATTATCTGTTTTGATACA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCGTTATCTCTCCACTCCAGAACTTAAAGTATTATCTGTTTTGATACA  698

seq1  CATGTACAGAGTGGAAGGATTATGCCATTCAACCAAAGCTGCAGTCCAGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTACAGAGTGGAAGGATTATGCCATTCAACCAAAGCTGCAGTCCAGT  748

seq1  CCATGAGTCAACCCTGGAGAATTATATCCTTCTTATTTTCTTTTCACTCC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGAGTCAACCCTGGAGAATTATATCCTTCTTATTTTCTTTTCACTCC  798

seq1  CTCAATATGGCTAGGGTATTTTTGTTTCTGGTATCTTCAAGCTATGCTCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAATATGGCTAGGGTATTTTTGTTTCTGGTATCTTCAAGCTATGCTCT  848

seq1  TTCCCATCAAACCCTACTCTTTCTCAGTCTTCTCTTTCAAGGACTCAGAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCATCAAACCCTACTCTTTCTCAGTCTTCTCTTTCAAGGACTCAGAA  898

seq1  CAGTCGCAAGCCTCCTCTCTCCCCAAGCTGAAGCACTCCAGTGTCTCTCC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCGCAAGCCTCCTCTCTCCCCAAGCTGAAGCACTCCAGTGTCTCTCC  948

seq1  AGATCTCATTGTGCCAACTCTTGGAAAATGGCAGCTTTCTTTATGTGGTG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATCTCATTGTGCCAACTCTTGGAAAATGGCAGCTTTCTTTATGTGGTG  998

seq1  TTCCCTGCTTGACTGTATGGCATCCTCCTTGAATTC  1036
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCTGCTTGACTGTATGGCATCCTCCTTGAATTC  1034

seq1: chr7_122064271_122065377
seq2: B6Ng01-119J02.g_69_1195

seq1  GAATTCTCCTTCCCTTCACTCTCCCCCTTCTCCCTTTCTTCCATTCATCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCTTCCCTTCACTCTCCCCCTTCTCCCTTTCTTCCATTCATCT  50

seq1  ATACCTCCGGCTACCCACCCAATATTGATATGTACATGATAGAACTAAGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACCTCCGGCTACCCACCCAATATTGATATGTACATGATAGAACTAAGC  100

seq1  CTTTATTAATTTGCATGCTAGAATTAAATCATCATTGTGCTAGAATTAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTATTAATTTGCATGCTAGAATTAAATCATCATTGTGCTAGAATTAAG  150

seq1  ACTTTATAAGAAAGTAAAGGTGTTTTCTGTCTTCAAGGACAGTTATACTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTATAAGAAAGTAAAGGTGTTTTCTGTCTTCAAGGACAGTTATACTT  200

seq1  GGGCTGGGAAACTGGAAAGGAATGGGAATGTGAAAAGATGACTTAGAATT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTGGGAAACTGGAAAGGAATGGGAATGTGAAAAGATGACTTAGAATT  250

seq1  GATTGATGCAGACCTCCATCACTGTCTGATTTCACAAGGATGGTGATGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTGATGCAGACCTCCATCACTGTCTGATTTCACAAGGATGGTGATGAA  300

seq1  GAGGAAAGGGAGAAAGTGATCCTGGAAAGGGCAGTGTGAACTCTGCACCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGAAAGGGAGAAAGTGATCCTGGAAAGGGCAGTGTGAACTCTGCACCC  350

seq1  AGTTATTTTACAGGCTACATTGTATGGTGCTATACCATAACATATGCTGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTATTTTACAGGCTACATTGTATGGTGCTATACCATAACATATGCTGG  400

seq1  CCATGTGATCTTGGATCAATCTTCTTACCTAGGTCTCTTACTTATCCACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGTGATCTTGGATCAATCTTCTTACCTAGGTCTCTTACTTATCCACA  450

seq1  CACTTTGGACTGGGTGATTTTTTTCTGGTATTTCACATACTATGATTCTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTTGGACTGGGTGATTTTTTTCTGGTATTTCACATACTATGATTCTA  500

seq1  TTATTCTATTCCTATGCATTAATCAAAATAAGCAAAGATCAGGAGCTAGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTCTATTCCTATGCATTAATCAAAATAAGCAAAGATCAGGAGCTAGT  550

seq1  GAATTGTGGGCTGTTTGGAGCTTGGGAAGTAGGACTCTGTGAGGATGCAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTGTGGGCTGTTTGGAGCTTGGGAAGTAGGACTCTGTGAGGATGCAG  600

seq1  GTGGAGAAGCAGTTGAGTAGGGACAAAGGTTGGAGTTGGGCTGTGGAGAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGAGAAGCAGTTGAGTAGGGACAAAGGTTGGAGTTGGGCTGTGGAGAG  650

seq1  AGGCTGGAGATGTCAGAATGGCAGGACATACCGAGTTTCTCTGCACTTGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTGGAGATGTCAGAATGGCAGGACATACCGAGTTTCTCTGCACTTGA  700

seq1  AGTGCCTCTCTGCTCCTGGCTCTCACCTGTGACACAAACAGAGTCCTTTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCCTCTCTGCTCCTGGCTCTCACCTGTGACACAAACAGAGTCCTTTG  750

seq1  AAACCAATTACCACAGTTTTTTTTCACTCTTTCCTTGACTGTGTTTGGGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCAATTACCACAGTTTTTTTTCACTCTTTCCTTGACTGTGTTTGGGC  800

seq1  TCACATTGGGGCAGTCCTAGATTAGAAGAATGTGGACTGAAGAGTCTTTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACATTGGGGCAGTCCTAGATTAGAAGAATGTGGACTGAAGAGTCTTTG  850

seq1  CTCAAGCACATT-GGCTGCTCTCCTCTATGTGCTGGCTGCC-TTCCACTC  898
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  CTCAAGCACATTGGGCTGCTCTCCTCTATGTGCTGGCTGCCTTTCCACTC  900

seq1  TAGGCTAGGGCTTCATTTTTACCA-TTTGTACTT-ACATACAACTTGACA  946
      |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||
seq2  TAGGCTAGGGCTTCATTTTTACCATTTTGTAATTAACATACAACTTGACA  950

seq1  AAGAAG-AGCCTCTAAGGTTATATATTTAAGGAC-TCTGGAAGACACAAC  994
      |||||| ||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||| |||||
seq2  AAGAAGAAGCCTCTAA-GTTATATATTTAGAGACTTCTGGAAGAAACAAC  999

seq1  ACTCATTGACTCTTGAAGCCTAG-AAGCTATTTAAAGTCATACCTTGGTG  1043
      |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||
seq2  ACTCATTGACTC-TGAAGCTTAGAAAGCTATTTAAAGTCATA-CTTGGTG  1047

seq1  CCCC-TCTGAATTCTTTCTAACATGGATCCTATCCATAACATTC---ACA  1089
      |||| |||||||||||||||   | ||| |||||  ||||||||   | |
seq2  CCCCTTCTGAATTCTTTCTA--CTTGATTCTATCATTAACATTCCAGAGA  1095

seq1  --------------GGAAGAATGAGTGAGTGA  1107
                    ||| ||||||||||||||
seq2  ATGATTGAATGGATGGATGAATGAGTGAGTGA  1127