BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-119J10
Chromosome7 (Build37)
Map Location 64,584,718 - 64,717,104
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGabrg3, Gabra5
Upstream genep, LOC100040839
Downstream geneGabrb3, EG668807, LOC434189
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-119J10.bB6Ng01-119J10.g
ACCDH923762DH923763
length1,0911,083
definitionDH923762|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-119J10, 5' end.DH923763|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-119J10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(64,715,999 - 64,717,104)(64,584,718 - 64,585,808)
sequence
gaattctacacctgtacaaatgaaagcgtgagttatttaacataatgtta
ttgggagaatttcaaattttgcataacaatttaaaatattttgcttttcc
ctgaattcagtaagtttctagtgtgtgtaaagtaggtttctgtgcctatc
acttttccagctctgaacccctaccctagcaaccctactgatcttctaca
ttatgtcaggcccttctgtgggtgtgaataaaacataggttgttctgaat
ccgagtaataaggatatgacaatggccggcctctggaaggaagtctatct
gcagttctgtaccagtcagaaaacacctaccatggatctacaatagtcac
cgtatgggaacaattcatattataaaagctgtgacatatgggcaattgat
ccagctggcaatgactttcaggctccagcacacactcctgactcaccagt
cttcatatgcactatagttcaattctgtattgctattgaggatctgaaga
catctgctttcagcacactattataaactataattatataaccaggaata
tttgcataaccaatatctatagaacagtgttttggtgcttgttcagggca
ctttcctctccttgagtgaattttgggaccaggacacagcaggacagaca
gagaaacactcacaggcattctcatttgacaagccagagaaaagaaagca
ctctccccagccctccctaaccctagccttggaaaaatcatctggaattt
gaagccatgccctttgttgtaaacttttggtctctgagcattactattct
attccaatcattctgggactcttgacaaagggtgtccaatcacaactttg
gtctttagcttgtacactcctggtaatgtatatactaattatagcagaga
caagctgtaaagtgtcatgccatcaaatgtagcttcactgttagtaattt
tccctccatcttgattctccttgtgattatatcaaagtaaattaagcaac
tttttccacttgagtactcaatttcatcacggattcacattctgtgatgc
tctatacgacacacaaattagatactaccaatatagcattc
gaattccaacaaacagcatggctcatatggacccatctgaagctcttctt
acagaggtggaggaagcgcatgaatctacccagaaggcatgaggctacag
atttgaacagaacccctaccatgtctaagtgacaagtctaaacacacaag
aagctcagatatcttactttcattgacctgagccttttgataagtgcctt
tctaggagaactggttccctggtatctgtggctcttgaaggaaaatatgt
tttacatgaagtaactgtgaagcaagacccttctctgaacctacatgtta
tatggccactctctgtttcagaccgagaattcatgttccccaaacaagat
ctggtatctggacagcaaagatgtatgaatcaccctgtccctcctgcaac
atcacacacggaaaagagtcattgtgatactgttgtctaataacagctct
agaaagtggggctatacaactattataattagttggtttgtgcatgttaa
atgtacagctaagcttgaaaactataacatgatgaagaactttaaatgtc
ctcaagaacatgacaactatgagttgatccaagaagtaaagtggacaaag
ctctgatagattaggacagtcctggcagtaagcatctgttctgatggaaa
tgattctatctcctgggcagaaagaggctgaaagggatactgagactgaa
actaaaggggcttgcattcattcataaataggcaggaaattggtaatgac
agaaacacagattaaagtagatggatactggatataacaagtggaaatac
aatacattataatataacataacataatataataataaaatatcatacct
gttataatgagagctcacgggatacacactgcttttgggggtgggcattt
gaaggctatgcagggagataccctttagctatctatagatgtacagttag
gaaaggaattgcaacccttagcgaggaagcatggtcatggatcatcccag
tcgactcaaccagctctgaatgttggcgttttccagtttctctgtcttag
tacctcatcccggatggctgccaacaaagccag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_64715999_64717104
seq2: B6Ng01-119J10.b_42_1132 (reverse)

seq1  GAATGCCCTTATATTGTGTTAAGTATCTAAATTTGTGGTGTCGTATTAGA  50
      ||||||   ||||||| ||  ||||||| ||||||| |||||||| ||||
seq2  GAATGC---TATATTG-GT--AGTATCT-AATTTGT-GTGTCGTA-TAGA  41

seq1  GCAATCACAGAATGTGAATACCGTGATGAAATTGAGTACTCAAGTGGAAA  100
      || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GC-ATCACAGAATGTGAAT-CCGTGATGAAATTGAGTACTCAAGTGGAAA  89

seq1  AAGTTGCTTAATTTTACTTTTGATATTAAATCACAAGGAGAATCAAGATG  150
      ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTGCTTAA-TTTAC-TTTGATAT--AATCACAAGGAGAATCAAGATG  135

seq1  GAGGGAAAATTACTAACAGTGAAGCTACATTTGATGGCATGACACTTTAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGAAAATTACTAACAGTGAAGCTACATTTGATGGCATGACACTTTAC  185

seq1  AGCTTGTCTCTGCTATAATTAGTATATACATTACCAGGAGTGTACAAGCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTGTCTCTGCTATAATTAGTATATACATTACCAGGAGTGTACAAGCT  235

seq1  AAAGACCAAAGTTGTGATTGGACACCCTTTGTCAAGAGTCCCAGAATGAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGACCAAAGTTGTGATTGGACACCCTTTGTCAAGAGTCCCAGAATGAT  285

seq1  TGGAATAGAATAGTAATGCTCAGAGACCAAAAGTTTACAACAAAGGGCAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAATAGAATAGTAATGCTCAGAGACCAAAAGTTTACAACAAAGGGCAT  335

seq1  GGCTTCAAATTCCAGATGATTTTTCCAAGGCTAGGGTTAGGGAGGGCTGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTCAAATTCCAGATGATTTTTCCAAGGCTAGGGTTAGGGAGGGCTGG  385

seq1  GGAGAGTGCTTTCTTTTCTCTGGCTTGTCAAATGAGAATGCCTGTGAGTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGAGTGCTTTCTTTTCTCTGGCTTGTCAAATGAGAATGCCTGTGAGTG  435

seq1  TTTCTCTGTCTGTCCTGCTGTGTCCTGGTCCCAAAATTCACTCAAGGAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTCTGTCTGTCCTGCTGTGTCCTGGTCCCAAAATTCACTCAAGGAGA  485

seq1  GGAAAGTGCCCTGAACAAGCACCAAAACACTGTTCTATAGATATTGGTTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAGTGCCCTGAACAAGCACCAAAACACTGTTCTATAGATATTGGTTA  535

seq1  TGCAAATATTCCTGGTTATATAATTATAGTTTATAATAGTGTGCTGAAAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAAATATTCCTGGTTATATAATTATAGTTTATAATAGTGTGCTGAAAG  585

seq1  CAGATGTCTTCAGATCCTCAATAGCAATACAGAATTGAACTATAGTGCAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATGTCTTCAGATCCTCAATAGCAATACAGAATTGAACTATAGTGCAT  635

seq1  ATGAAGACTGGTGAGTCAGGAGTGTGTGCTGGAGCCTGAAAGTCATTGCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAGACTGGTGAGTCAGGAGTGTGTGCTGGAGCCTGAAAGTCATTGCC  685

seq1  AGCTGGATCAATTGCCCATATGTCACAGCTTTTATAATATGAATTGTTCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGGATCAATTGCCCATATGTCACAGCTTTTATAATATGAATTGTTCC  735

seq1  CATACGGTGACTATTGTAGATCCATGGTAGGTGTTTTCTGACTGGTACAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACGGTGACTATTGTAGATCCATGGTAGGTGTTTTCTGACTGGTACAG  785

seq1  AACTGCAGATAGACTTCCTTCCAGAGGCCGGCCATTGTCATATCCTTATT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGCAGATAGACTTCCTTCCAGAGGCCGGCCATTGTCATATCCTTATT  835

seq1  ACTCGGATTCAGAACAACCTATGTTTTATTCACACCCACAGAAGGGCCTG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCGGATTCAGAACAACCTATGTTTTATTCACACCCACAGAAGGGCCTG  885

seq1  ACATAATGTAGAAGATCAGTAGGGTTGCTAGGGTAGGGGTTCAGAGCTGG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATAATGTAGAAGATCAGTAGGGTTGCTAGGGTAGGGGTTCAGAGCTGG  935

seq1  AAAAGTGATAGGCACAGAAACCTACTTTACACACACTAGAAACTTACTGA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGTGATAGGCACAGAAACCTACTTTACACACACTAGAAACTTACTGA  985

seq1  ATTCAGGGAAAAGCAAAATATTTTAAATTGTTATGCAAAATTTGAAATTC  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCAGGGAAAAGCAAAATATTTTAAATTGTTATGCAAAATTTGAAATTC  1035

seq1  TCCCAATAACATTATGTTAAATAACTCACGCTTTCATTTGTACAGGTGTA  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCAATAACATTATGTTAAATAACTCACGCTTTCATTTGTACAGGTGTA  1085

seq1  GAATTC  1106
      ||||||
seq2  GAATTC  1091

seq1: chr7_64584718_64585808
seq2: B6Ng01-119J10.g_67_1149

seq1  GAATTCCAACAAACAGCATGGCTCATATGGACCCATCTGAAGCTCTTCTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAACAAACAGCATGGCTCATATGGACCCATCTGAAGCTCTTCTT  50

seq1  ACAGAGGTGGAGGAAGCGCATGAATCTACCCAGAAGGCATGAGGCTACAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAGGTGGAGGAAGCGCATGAATCTACCCAGAAGGCATGAGGCTACAG  100

seq1  ATTTGAACAGAACCCCTACCATGTCTAAGTGACAAGTCTAAACACACAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGAACAGAACCCCTACCATGTCTAAGTGACAAGTCTAAACACACAAG  150

seq1  AAGCTCAGATATCTTACTTTCATTGACCTGAGCCTTTTGATAAGTGCCTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTCAGATATCTTACTTTCATTGACCTGAGCCTTTTGATAAGTGCCTT  200

seq1  TCTAGGAGAACTGGTTCCCTGGTATCTGTGGCTCTTGAAGGAAAATATGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGGAGAACTGGTTCCCTGGTATCTGTGGCTCTTGAAGGAAAATATGT  250

seq1  TTTACATGAAGTAACTGTGAAGCAAGACCCTTCTCTGAACCTACATGTTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACATGAAGTAACTGTGAAGCAAGACCCTTCTCTGAACCTACATGTTA  300

seq1  TATGGCCACTCTCTGTTTCAGACCGAGAATTCATGTTCCCCAAACAAGAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGCCACTCTCTGTTTCAGACCGAGAATTCATGTTCCCCAAACAAGAT  350

seq1  CTGGTATCTGGACAGCAAAGATGTATGAATCACCCTGTCCCTCCTGCAAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTATCTGGACAGCAAAGATGTATGAATCACCCTGTCCCTCCTGCAAC  400

seq1  ATCACACACGGAAAAGAGTCATTGTGATACTGTTGTCTAATAACAGCTCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACACACGGAAAAGAGTCATTGTGATACTGTTGTCTAATAACAGCTCT  450

seq1  AGAAAGTGGGGCTATACAACTATTATAATTAGTTGGTTTGTGCATGTTAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGTGGGGCTATACAACTATTATAATTAGTTGGTTTGTGCATGTTAA  500

seq1  ATGTACAGCTAAGCTTGAAAACTATAACATGATGAAGAACTTTAAATGTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTACAGCTAAGCTTGAAAACTATAACATGATGAAGAACTTTAAATGTC  550

seq1  CTCAAGAACATGACAACTATGAGTTGATCCAAGAAGTAAAGTGGACAAAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAAGAACATGACAACTATGAGTTGATCCAAGAAGTAAAGTGGACAAAG  600

seq1  CTCTGATAGATTAGGACAGTCCTGGCAGTAAGCATCTGTTCTGATGGAAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGATAGATTAGGACAGTCCTGGCAGTAAGCATCTGTTCTGATGGAAA  650

seq1  TGATTCTATCTCCTGGGCAGAAAGAGGCTGAAAGGGATACTGAGACTGAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTCTATCTCCTGGGCAGAAAGAGGCTGAAAGGGATACTGAGACTGAA  700

seq1  ACTAAAGGGGCTTGCATTCATTCATAAATAGGCAGGAAATTGGTAATGAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAAAGGGGCTTGCATTCATTCATAAATAGGCAGGAAATTGGTAATGAC  750

seq1  AGAAACACAGATTAAAGTAGATGGATACTGGATATAACAAGTGGAAATAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAACACAGATTAAAGTAGATGGATACTGGATATAACAAGTGGAAATAC  800

seq1  AATACATTATAATATAACATAACATAATATAATAATAAAATATCATACCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACATTATAATATAACATAACATAATATAATAATAAAATATCATACCT  850

seq1  GTTATAATGAGAGCTCACAGGGATACACACTGC-TTTGGGGTTGGGCAAT  899
      |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |
seq2  GTTATAATGAGAGCTCAC-GGGATACACACTGCTTTTGGGGGTGGGCATT  899

seq1  TTGAGGCTATGCATGGGAGATAACCCTTAAGCTATCCCATAGATGTACCA  949
      |  |||||||||| ||||||| |||||| |||||| | ||||||||||  
seq2  TGAAGGCTATGCA-GGGAGAT-ACCCTTTAGCTAT-CTATAGATGTACAG  946

seq1  GTAGGAAAGGAATGCAAACCCCTAGCGAGGAAGCATGGTCAGTGGATCAT  999
       ||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  TTAGGAAAGGAATTGCAACCCTTAGCGAGGAAGCATGGTCA-TGGATCAT  995

seq1  CCCAGTCGACTCCAACCAGACTCTGAAATGTGGCGTTTTCACAGTATCTC  1049
      ||||||||||| ||||||| |||||||   |||||||||| |||| ||||
seq2  CCCAGTCGACT-CAACCAG-CTCTGAATGTTGGCGTTTTC-CAGTTTCTC  1042

seq1  TGTCTTAGTACCTCAACACCAGATGGCTGCAAACAAAGCCAG  1091
      ||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||
seq2  TGTCTTAGTACCTCATC-CCGGATGGCTGCCAACAAAGCCAG  1083