BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-119K19
Chromosome7 (Build37)
Map Location 117,107,816 - 117,249,563
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTmem41b, Ipo7, AA474408, Zfp143
Upstream geneTub, Ric3, Lmo1, Stk33, EG668320, 1700095J03Rik, Trim66, Rpl27a, St5, LOC100042582, D930014E17Rik, BC051019, Ascl3, Tmem9b, 4930431P19Rik, Nrip3, Scube2, Phxr5, Rab6ip1
Downstream geneWee1, Swap70, EG668368, Sbf2, LOC668246, Adm, B430319F04Rik, Ampd3, Rnf141, Xlkd1, Mrvi1, Ctr9, Eif4g2, LOC100043221
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-119K19.bB6Ng01-119K19.g
ACCDH923825DH923826
length1,0581,100
definitionDH923825|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-119K19, 5' end.DH923826|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-119K19, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(117,107,816 - 117,108,867)(117,248,437 - 117,249,563)
sequence
gaattcaaagcaggtaaatttctgagtttgaggccagcctggtctacaaa
gtgagttccaggacaggcagggctatacagaggaaccctgtctcaaacaa
acgaacaaacaaaaaaaaagaattcaaagtcatccttagctacatatgga
gtttcaggaattataccagacccctcctctctatatctatctatctatct
atctatctatctatctatctatctatatctatctatctatgtgatttgaa
tctagatagatacatacatattatacatacattgataatacatacgcaga
tatatagatatgtagaacatagatacatagatatctgtctaacatgcttg
caagcatgcccacacatatacacagcaaggtatatagagtaccatgacac
acgcctataatctgaaacagaaaggcagaatgccagctccggcagttagc
ttgtagcaagatgctaccccaaagcaaagggttgaggtagttcaatggta
gaggatttgcctagcacatgcaaagtcctggatttaaaaaacagaagtgt
aaaaaaaagtacacaatagctgaagcacaaaagcaatccaagtgtccact
ggcagattaatggatgatggattagcaaaatgtggcatatcctacaatag
aatcttcaagcctttaaaaagaaggaaactagccaggaggtggtacatgc
ctttaataccagcacttgggagatagaggagcgctgtgggttcataacca
gactggtctacagagtggtttccaaataagcctgccaaggctacacagag
aaacactgtttcaaaaacaaaactaggaagatagatagatagatagatag
atagatagatagatagatagatagatagatagatagagggaaaccagacg
ggtatagtttcactttggtagaaagccctgcactcggtcctccccgtggc
aagaatgcaggtgttatgtaatcccagtactcaaggaggtagatgcacgc
ctttaatcccagcactttgggaggcagaggcagccggaatttctgagttt
cggggcca
gaattcaggacctctagaagagcagtcagtgctcttacccactgagccat
ctctccagtcccgcaaaaagctcctaattgataacctagttaatgggggc
aatgtataaggctgaagagaaggctcaactgttaaagactgtgtattcct
tctactggggacctggctcacaggcatctacagagccaggtctaaggcat
ctaacaccctcttctggcctccaggagcacccatacacccaggatgttta
gttccccggacaaacacgcacgtacatggtgttaaaaataaatctgtaaa
gagaataatataaaaaagtggtaatgagtttcatagtattaaaaccttct
gaaggtacccaggcttggtaccagtgcttgagagtcagaagcagacaaac
ctgtttccttgaggccagcagagagagacagtgagaccctgtttcaaaaa
caaaacaaaaattcttaaaagttgtgagctgggcgtggtggcgcacgcct
ttaatcccagcacttgggaggcagaggcaggcggatttctgagttcgagg
ccagcctggtctacaaagtgagttccaggatagctagggctatacagaga
aaccctgtctcgaaaaaacaacaacaaaaaaagttgtgataggggtggag
aattccgggattcaaaaaagaaagatgaatctgtaggtctgagatgccag
ctaccaggctgggcttcaataatagcaggaagaattaattcttttggagg
ataaccttagccacactttagcaaactggagtccaggagaggtgatcaag
gcaaagtccatcctgagaactaggccaaagggcaaaacagcaaaggagac
atttattctagattcctgtccgagatggaaagagaggatgaagaggcact
catctgtgatctccgaactcagagctgaggcaggagatgagagtggagca
gctggggatatctagcagacgtgtctgtcagctctgacatgacctgtggg
taatgcgtctgctactaagcctgatgactgatcgatcccaagagactaag
gcaatgatgcagttgatagtgaccatgagctttgtctctcacatatgcac

quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_117107816_117108867
seq2: B6Ng01-119K19.b_45_1102

seq1  GAATTCAAAGCAGGTAAATTTCTGAGTTTGAGGCCAGCCTGGTCTACAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAAGCAGGTAAATTTCTGAGTTTGAGGCCAGCCTGGTCTACAAA  50

seq1  GTGAGTTCCAGGACAGGCAGGGCTATACAGAGGAACCCTGTCTCAAACAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGTTCCAGGACAGGCAGGGCTATACAGAGGAACCCTGTCTCAAACAA  100

seq1  ACGAACAAACAAAAAAAAAGAATTCAAAGTCATCCTTAGCTACATATGGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGAACAAACAAAAAAAAAGAATTCAAAGTCATCCTTAGCTACATATGGA  150

seq1  GTTTCAGGAATTATACCAGACCCCTCCTCTCTATATCTATCTATCTATCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCAGGAATTATACCAGACCCCTCCTCTCTATATCTATCTATCTATCT  200

seq1  ATCTATCTATCTATCTATCTATCTATATCTATCTATCTATGTGATTTGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTATCTATCTATCTATCTATCTATATCTATCTATCTATGTGATTTGAA  250

seq1  TCTAGATAGATACATACATATTATACATACATTGATAATACATACGCAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGATAGATACATACATATTATACATACATTGATAATACATACGCAGA  300

seq1  TATATAGATATGTAGAACATAGATACATAGATATCTGTCTAACATGCTTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATAGATATGTAGAACATAGATACATAGATATCTGTCTAACATGCTTG  350

seq1  CAAGCATGCCCACACATATACACAGCAAGGTATATAGAGTACCATGACAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCATGCCCACACATATACACAGCAAGGTATATAGAGTACCATGACAC  400

seq1  ACGCCTATAATCTGAAACAGAAAGGCAGAATGCCAGCTCCGGCAGTTAGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGCCTATAATCTGAAACAGAAAGGCAGAATGCCAGCTCCGGCAGTTAGC  450

seq1  TTGTAGCAAGATGCTACCCCAAAGCAAAGGGTTGAGGTAGTTCAATGGTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTAGCAAGATGCTACCCCAAAGCAAAGGGTTGAGGTAGTTCAATGGTA  500

seq1  GAGGATTTGCCTAGCACATGCAAAGTCCTGGATTTAAAAAACAGAAGTGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGATTTGCCTAGCACATGCAAAGTCCTGGATTTAAAAAACAGAAGTGT  550

seq1  AAAAAAAAGTACACAATAGCTGAAGCACAAAAGCAATCCAAGTGTCCACT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAAGTACACAATAGCTGAAGCACAAAAGCAATCCAAGTGTCCACT  600

seq1  GGCAGATTAATGGATGATGGATTAGCAAAATGTGGCATATCCTACAATAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGATTAATGGATGATGGATTAGCAAAATGTGGCATATCCTACAATAG  650

seq1  AATCTTCAAGCCTTTAAAAAGAAGGAAACTAGCCAGGAGGTGGTACATGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTTCAAGCCTTTAAAAAGAAGGAAACTAGCCAGGAGGTGGTACATGC  700

seq1  CTTTAATACCAGCACTTGGGAGATAGAGGAGCGCTGTGGGTTCATAACCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTAATACCAGCACTTGGGAGATAGAGGAGCGCTGTGGGTTCATAACCA  750

seq1  GACTGGTCTACAGAGTGGTTTCCAAATAAGCCTGCCAAGGCTACACAGAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGGTCTACAGAGTGGTTTCCAAATAAGCCTGCCAAGGCTACACAGAG  800

seq1  AAACACTGTTTCAAAAACAAAACTAGGAAGATAGATAGATAGATAGATAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACACTGTTTCAAAAACAAAACTAGGAAGATAGATAGATAGATAGATAG  850

seq1  ATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGAGGGAAACCAGACG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGAGGGAAACCAGACG  900

seq1  GGTATAG-TTCAC-TTGGTAGAAAGCCCTGCACTCGGTCCTCCCCGTGGC  948
      ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTATAGTTTCACTTTGGTAGAAAGCCCTGCACTCGGTCCTCCCCGTGGC  950

seq1  AGGAATGCAGGTGTTATGTAATCCCAGTACTCAA-GAGGTAGATGCACGC  997
      | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  AAGAATGCAGGTGTTATGTAATCCCAGTACTCAAGGAGGTAGATGCACGC  1000

seq1  CTTTAATCCCAGCAC-TTGGGAGGCAGAGGCAGGCGG-ATTTCTGAG-TT  1044
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||
seq2  CTTTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCAGAGGCAGCCGGAATTTCTGAGTTT  1050

seq1  CTGGGCCA  1052
      | ||||||
seq2  CGGGGCCA  1058

seq1: chr7_117248437_117249563
seq2: B6Ng01-119K19.g_69_1168 (reverse)

seq1  GTGCATATGTGAGGCAC-AAGCTCCATGGTGCACTTCATCCACCTTGCAT  49
      |||||||||||||  || ||||| |||||| ||||  ||| ||  |||||
seq2  GTGCATATGTGAGAGACAAAGCT-CATGGT-CACT--ATCAAC--TGCAT  44

seq1  CCATTGGCCCTGTGTCTCCTGGGGATCGGATTCAGTCATCAGGCTTAGTA  99
       |||||  |||  |||| || |||||||   |||||||||||||||||||
seq2  -CATTG--CCTTAGTCT-CTTGGGATCG--ATCAGTCATCAGGCTTAGTA  88

seq1  GCAGACGCATTACCCACTAGGTCATGTCAAGAGCTGACAAGACACGGTCT  149
      ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| 
seq2  GCAGACGCATTACCCAC-AGGTCATGTC-AGAGCTGAC-AGACAC-GTC-  133

seq1  TGCTAGATATCCCCCAGCTGCCTCCAACTCTCAATCCTCCTGCCTCAGCT  199
      |||||||||| ||||||||| |||| |||||||   ||||||||||||||
seq2  TGCTAGATAT-CCCCAGCTG-CTCC-ACTCTCA--TCTCCTGCCTCAGCT  178

seq1  TCTTGAGTTCGGAGATCACAGATGAGTGCCTCTTCATCCTTCTCTATTCC  249
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||
seq2  --CTGAGTTCGGAGATCACAGATGAGTGCCTCTTCATCC-TCTCT-TTCC  224

seq1  ATTCTCGGACAGGAATCTAGAATAAATGTCTCCTTTGCTGTTTTGCCCTT  299
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  A-TCTCGGACAGGAATCTAGAATAAATGTCTCCTTTGCTGTTTTGCCCTT  273

seq1  TGGCCTAGTTCCTCAGGATGGACTTTGCCTTGATCACCTCTCCTGGACTC  349
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCTAGTT-CTCAGGATGGACTTTGCCTTGATCACCTCTCCTGGACTC  322

seq1  CAGTTTGCTAAAGTGTGGCTAAGGTTATCCTCCAAAAGAATTAATTCTTC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTTGCTAAAGTGTGGCTAAGGTTATCCTCCAAAAGAATTAATTCTTC  372

seq1  CTGCTATTATTGAAGCCCAGCCTGGTAGCTGGCATCTCAGACCTACAGAT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTATTATTGAAGCCCAGCCTGGTAGCTGGCATCTCAGACCTACAGAT  422

seq1  TCATCTTTCTTTTTTGAATCCCGGAATTCTCCACCCCTATCACAACTTTT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCTTTCTTTTTTGAATCCCGGAATTCTCCACCCCTATCACAACTTTT  472

seq1  TTTGTTGTTGTTTTTTCGAGACAGGGTTTCTCTGTATAGCCCTAGCTATC  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTTGTTGTTTTTTCGAGACAGGGTTTCTCTGTATAGCCCTAGCTATC  522

seq1  CTGGAACTCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAAATCCGCCT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAACTCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAAATCCGCCT  572

seq1  GCCTCTGCCTCCCAAGTGCTGGGATTAAAGGCGTGCGCCACCACGCCCAG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCTGCCTCCCAAGTGCTGGGATTAAAGGCGTGCGCCACCACGCCCAG  622

seq1  CTCACAACTTTTAAGAATTTTTGTTTTGTTTTTGAAACAGGGTCTCACTG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACAACTTTTAAGAATTTTTGTTTTGTTTTTGAAACAGGGTCTCACTG  672

seq1  TCTCTCTCTGCTGGCCTCAAGGAAACAGGTTTGTCTGCTTCTGACTCTCA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCTCTGCTGGCCTCAAGGAAACAGGTTTGTCTGCTTCTGACTCTCA  722

seq1  AGCACTGGTACCAAGCCTGGGTACCTTCAGAAGGTTTTAATACTATGAAA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACTGGTACCAAGCCTGGGTACCTTCAGAAGGTTTTAATACTATGAAA  772

seq1  CTCATTACCACTTTTTTATATTATTCTCTTTACAGATTTATTTTTAACAC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATTACCACTTTTTTATATTATTCTCTTTACAGATTTATTTTTAACAC  822

seq1  CATGTACGTGCGTGTTTGTCCGGGGAACTAAACATCCTGGGTGTATGGGT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTACGTGCGTGTTTGTCCGGGGAACTAAACATCCTGGGTGTATGGGT  872

seq1  GCTCCTGGAGGCCAGAAGAGGGTGTTAGATGCCTTAGACCTGGCTCTGTA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCTGGAGGCCAGAAGAGGGTGTTAGATGCCTTAGACCTGGCTCTGTA  922

seq1  GATGCCTGTGAGCCAGGTCCCCAGTAGAAGGAATACACAGTCTTTAACAG  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCCTGTGAGCCAGGTCCCCAGTAGAAGGAATACACAGTCTTTAACAG  972

seq1  TTGAGCCTTCTCTTCAGCCTTATACATTGCCCCCATTAACTAGGTTATCA  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGCCTTCTCTTCAGCCTTATACATTGCCCCCATTAACTAGGTTATCA  1022

seq1  ATTAGGAGCTTTTTGCGGGACTGGAGAGATGGCTCAGTGGGTAAGAGCAC  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGGAGCTTTTTGCGGGACTGGAGAGATGGCTCAGTGGGTAAGAGCAC  1072

seq1  TGACTGCTCTTCTAGAGGTCCTGAATTC  1127
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTGCTCTTCTAGAGGTCCTGAATTC  1100