BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-121C20
Chromosome7 (Build37)
Map Location 36,488,546 - 36,626,128
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDpy19l3, zfp507
Upstream geneChst8, Pepd, Cebpg, Cebpa, Slc7a10, Wdr88, Gpatch1, Rhpn2, C230052I12Rik, Ccdc123, Slc7a9, 2410004F06Rik, Nudt19, Rgs9bp, Ankrd27, Pdcd5
Downstream geneLOC100043872, EG668988, LOC668507, Tshz3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-121C20.bB6Ng01-121C20.g
ACCDH924926DH924927
length1,2021,110
definitionDH924926|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-121C20, 5' end.DH924927|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-121C20, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(36,624,916 - 36,626,128)(36,488,546 - 36,489,657)
sequence
gaattcactatgtagaccaggctggcctggcactcactatgtagatcagg
ctggtctgaaactcactttgtagaccaggctggcttgaaattcatagaga
tctacttgcctctgtctcctaggactgggattaaaggcacatgccccatg
ccaagccaaattactttttttgatatttgatatctagtaacaatctgttg
tagctatggttgttttagtatgactaaggcaaacaccattatggcattag
agatgttgaaatttgaatctataattagatctaatatggagttacctgtc
catttcttagaggtcaataacgaaataaaaactctgttcctttggtgatg
tttcctaggttgttcacccttcgtgacatctttcacttcctctttcctct
ggaaacagacacgtctgcctccaggttttacagcatactgacaggaaaca
ctcttaccaataggctagctatggattctggggccctttcacctcggcca
ggtgcacagaaccttttgtgttttatctccctttgtgttttagttcccct
actacatgcccataaattctcatgtctgtgtgcctttctctagtctggct
taatacacatattgttagccatcttccacactcacaccactgtccaggga
cactcaaggaatctgagcatacagtggaagagggaaggtacagcaattag
ggtatccataaatccattcaagaaaggggctgcaggtgtagcatcccata
cagctcagagaaggcatcctgacagagcccacaaaacagctgtgcagttg
agtgctgagcccagggtgcttcgagtccctgcctctcttccctgagacag
ccactttcctgccatgcagctatgctccttgtacaaggattctcagtggg
acaaggaacaggtaagtaccttgggtatcatcccacctaactgcagatgc
tggggatgtctgtgtcagcactggagtgccacatctgctggaagggagga
tgtaagaacagttacaccgttcccattcaatgaccctggtgtgaccagaa
atcagattcttggtgatgaaacaggtaccctggcattgtgtatcataagc
ccacccaggattttatagaaatcagcataacctggacagcttatgaaaaa
ggcctctcagtcagatcaagcaatggatgtattttcggtgcctggtactg
gt
gaattctttcagctccgagagttcatccatcactcctggccaggactgaa
aggaaaaaccagacaagaccaaacgcacccgtgtagctgtcgctaaggtt
aagtaacagaggacgagaaactgtgcatgatatactcaggaggcacacaa
acggcagctgcagccctggatggctttacctctgagccagtctgcacagg
tgagcgcgaggcccgagaacgtccaggtactcccgaagctagctcgtaca
gacaggcttttatgtgatggtgtgaatgtaaagtaagactgtatgtatgc
aacaacagcaacacctactcctggtgggtctggagagatggctcagtggc
tgctcttgtaagggggaaggacctgggttcagttcccaggacccacaatg
ttcagctcccaggacccatcaggccgaccgtaattcagtgatgtgccgct
gtcctcttctggcctctgcgggtgttgcatgcatgtggagtgcagactta
caggcactcgcacacatggatcaaggctttcaatacaggggtattatcca
agggtatcacaagacagatggtgcagctgggagcatcaccatcagatctg
ctggtggctgactaagtagcagagctgtgcctcgggacttgcttctatat
gcttctccctgcactgtcatgactattctgggcaaatggcttggtacatg
ttaatagatattctgtcacgataggaaaggatgggctggaaatcagactc
caggagcatcgaatgtattaggctttattatttcggccattgggtcagct
catgtcacttaagggttataccgactgagtataaacaaacatttcccatc
ccacctgtcatctaacgcaaattctagttcattaaccaattaaatcttag
gctcttcttgaatgatggtggatcaggcacacttcctccattaattctta
ttttgagacagataattactttgtaggccaggttagctcaactcctggct
actctactaaatactttgggaataatctgtgggggctggtcacctgaaca
tcaccaaggaattaacactttaattgaattatatgtccattgtttgggca
ttggataatt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_36624916_36626128
seq2: B6Ng01-121C20.b_45_1246 (reverse)

seq1  ACCAGTACAACCAGGCAACAGAAATACAT-CATTGCCTTGATCTTGGACT  49
      ||||||   |||||||| |  |||||||| ||||| ||||||||  ||||
seq2  ACCAGT---ACCAGGCACCGAAAATACATCCATTG-CTTGATCT--GACT  44

seq1  CTGAAGCCTCTTTCATAAGCTGTCCAGTTTATGCTGATTTTCTATAAAAT  99
        || |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||
seq2  GAGAGGCCTTTTTCATAAGCTGTCCAGGTTATGCTGA-TTTCTATAAAAT  93

seq1  CCTGGGTGGGCTTATGATACAC-ATGCCAGGGTACCTTGTTTCATCACCA  148
      |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||
seq2  CCTGGGTGGGCTTATGATACACAATGCCAGGGTACC-TGTTTCATCACCA  142

seq1  AGGATCTGATTTTCTGGTCACACCAGGGTCATTGAATGGGGAACGGTGTT  198
      || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
seq2  AGAATCTGA-TTTCTGGTCACACCAGGGTCATTGAAT-GGGAACGGTG-T  189

seq1  AACTGTTCTTACATCCTCCCTTCCAGCAGATGTGGCACTCCAGTGCTGAC  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGTTCTTACATCCTCCCTTCCAGCAGATGTGGCACTCCAGTGCTGAC  239

seq1  ACAGACATCCCCAGCATCTGCAGTTAGGTGGGATGATACCCAAGGTACTT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGACATCCCCAGCATCTGCAGTTAGGTGGGATGATACCCAAGGTACTT  289

seq1  ACCTGTTCCTTGTCCCACTGAGAATCCTTGTACAAGGAGCATAGCTGCAT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGTTCCTTGTCCCACTGAGAATCCTTGTACAAGGAGCATAGCTGCAT  339

seq1  GGCAGGAAAGTGGCTGTCTCAGGGAAGAGAGGCAGGGACTCGAAGCACCC  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGGAAAGTGGCTGTCTCAGGGAAGAGAGGCAGGGACTCGAAGCACCC  389

seq1  TGGGCTCAGCACTCAACTGCACAGCCTGTTTTGTGGGCTCTGTCAGGATG  448
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCTCAGCACTCAACTGCACAG-CTGTTTTGTGGGCTCTGTCAGGATG  438

seq1  CCTTCTCCTGAGCTGTATGGGATGCTACACCTGCAGCCCCTTTCTTGAAT  498
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCT-CTGAGCTGTATGGGATGCTACACCTGCAGCCCCTTTCTTGAAT  487

seq1  GGATTTATGGATACCCTAATTGCTGTACCTTCCCTCTTCCACTGTATGCT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTTATGGATACCCTAATTGCTGTACCTTCCCTCTTCCACTGTATGCT  537

seq1  CAGATTCCTTGAGTGTCCCTGGACAGTGGTGTGAGTGTGGAAGATGGCTA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATTCCTTGAGTGTCCCTGGACAGTGGTGTGAGTGTGGAAGATGGCTA  587

seq1  ACAATATGTGTATTAAGCCAGACTAGAGAAAGGCACACAGACATGAGAAT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATATGTGTATTAAGCCAGACTAGAGAAAGGCACACAGACATGAGAAT  637

seq1  TTATGGGCATGTAGTAGGGGAACTAAAACACAAAGGGAGATAAAACACAA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGGGCATGTAGTAGGGGAACTAAAACACAAAGGGAGATAAAACACAA  687

seq1  AAGGTTCTGTGCACCTGGCCGAGGTGAAAGGGCCCCAGAATCCATAGCTA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTTCTGTGCACCTGGCCGAGGTGAAAGGGCCCCAGAATCCATAGCTA  737

seq1  GCCTATTGGTAAGAGTGTTTCCTGTCAGTATGCTGTAAAACCTGGAGGCA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTATTGGTAAGAGTGTTTCCTGTCAGTATGCTGTAAAACCTGGAGGCA  787

seq1  GACGTGTCTGTTTCCAGAGGAAAGAGGAAGTGAAAGATGTCACGAAGGGT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACGTGTCTGTTTCCAGAGGAAAGAGGAAGTGAAAGATGTCACGAAGGGT  837

seq1  GAACAACCTAGGAAACATCACCAAAGGAACAGAGTTTTTATTTCGTTATT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACAACCTAGGAAACATCACCAAAGGAACAGAGTTTTTATTTCGTTATT  887

seq1  GACCTCTAAGAAATGGACAGGTAACTCCATATTAGATCTAATTATAGATT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCTCTAAGAAATGGACAGGTAACTCCATATTAGATCTAATTATAGATT  937

seq1  CAAATTTCAACATCTCTAATGCCATAATGGTGTTTGCCTTAGTCATACTA  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATTTCAACATCTCTAATGCCATAATGGTGTTTGCCTTAGTCATACTA  987

seq1  AAACAACCATAGCTACAACAGATTGTTACTAGATATCAAATATCAAAAAA  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAACCATAGCTACAACAGATTGTTACTAGATATCAAATATCAAAAAA  1037

seq1  AGTAATTTGGCTTGGCATGGGGCATGTGCCTTTAATCCCAGTCCTAGGAG  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAATTTGGCTTGGCATGGGGCATGTGCCTTTAATCCCAGTCCTAGGAG  1087

seq1  ACAGAGGCAAGTAGATCTCTATGAATTTCAAGCCAGCCTGGTCTACAAAG  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAGGCAAGTAGATCTCTATGAATTTCAAGCCAGCCTGGTCTACAAAG  1137

seq1  TGAGTTTCAGACCAGCCTGATCTACATAGTGAGTGCCAGGCCAGCCTGGT  1198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTTTCAGACCAGCCTGATCTACATAGTGAGTGCCAGGCCAGCCTGGT  1187

seq1  CTACATAGTGAATTC  1213
      |||||||||||||||
seq2  CTACATAGTGAATTC  1202

seq1: chr7_36488546_36489657
seq2: B6Ng01-121C20.g_66_1175

seq1  GAATTCTTTCAGCTCCGAGAGTTCATCCATCACTCCTGGCCAGGACTGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTCAGCTCCGAGAGTTCATCCATCACTCCTGGCCAGGACTGAA  50

seq1  AGGAAAAACCAGACAAGACCAAACGCACCCGTGTAGCTGTCGCTAAGGTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAAAACCAGACAAGACCAAACGCACCCGTGTAGCTGTCGCTAAGGTT  100

seq1  AAGTAACAGAGGACGAGAAACTGTGCATGATATACTCAGGAGGCACACAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTAACAGAGGACGAGAAACTGTGCATGATATACTCAGGAGGCACACAA  150

seq1  ACGGCAGCTGCAGCCCTGGATGGCTTTACCTCTGAGCCAGTCTGCACAGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGGCAGCTGCAGCCCTGGATGGCTTTACCTCTGAGCCAGTCTGCACAGG  200

seq1  TGAGCGCGAGGCCCGAGAACGTCCAGGTACTCCCGAAGCTAGCTCGTACA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCGCGAGGCCCGAGAACGTCCAGGTACTCCCGAAGCTAGCTCGTACA  250

seq1  GACAGGCTTTTATGTGATGGTGTGAATGTAAAGTAAGACTGTATGTATGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGGCTTTTATGTGATGGTGTGAATGTAAAGTAAGACTGTATGTATGC  300

seq1  AACAACAGCAACACCTACTCCTGGTGGGTCTGGAGAGATGGCTCAGTGGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAACAGCAACACCTACTCCTGGTGGGTCTGGAGAGATGGCTCAGTGGC  350

seq1  TGCTCTTGTAAGGGGGAAGGACCTGGGTTCAGTTCCCAGGACCCACAATG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCTTGTAAGGGGGAAGGACCTGGGTTCAGTTCCCAGGACCCACAATG  400

seq1  TTCAGCTCCCAGGACCCATCAGGCCGACCGTAATTCAGTGATGTGCCGCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGCTCCCAGGACCCATCAGGCCGACCGTAATTCAGTGATGTGCCGCT  450

seq1  GTCCTCTTCTGGCCTCTGCGGGTGTTGCATGCATGTGGAGTGCAGACTTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTCTTCTGGCCTCTGCGGGTGTTGCATGCATGTGGAGTGCAGACTTA  500

seq1  CAGGCACTCGCACACATGGATCAAGGCTTTCAATACAGGGGTATTATCCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCACTCGCACACATGGATCAAGGCTTTCAATACAGGGGTATTATCCA  550

seq1  AGGGTATCACAAGACAGATGGTGCAGCTGGGAGCATCACCATCAGATCTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTATCACAAGACAGATGGTGCAGCTGGGAGCATCACCATCAGATCTG  600

seq1  CTGGTGGCTGACTAAGTAGCAGAGCTGTGCCTCGGGACTTGCTTCTATAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTGGCTGACTAAGTAGCAGAGCTGTGCCTCGGGACTTGCTTCTATAT  650

seq1  GCTTCTCCCTGCACTGTCATGACTATTCTGGGCAAATGGCTTGGTACATG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCTCCCTGCACTGTCATGACTATTCTGGGCAAATGGCTTGGTACATG  700

seq1  TTAATAGATATTCTGTCACGATAGGAAAGGAT-GGCTGGAAATCAGACTC  749
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TTAATAGATATTCTGTCACGATAGGAAAGGATGGGCTGGAAATCAGACTC  750

seq1  CAGGAGCATCGAATGTATTAGGCTTTATTATTTCGGCCATT-GGTCAGCT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  CAGGAGCATCGAATGTATTAGGCTTTATTATTTCGGCCATTGGGTCAGCT  800

seq1  CATGTCACTTAA-GGTTATACCGACTGAGTATAAAACAAACA-TTCCCAT  846
      |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||
seq2  CATGTCACTTAAGGGTTATACCGACTGAGTAT-AAACAAACATTTCCCAT  849

seq1  CCCACCTGTCATCTAACGCAAATTCTAGTTCATTAACCAATTAAATCTTA  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACCTGTCATCTAACGCAAATTCTAGTTCATTAACCAATTAAATCTTA  899

seq1  -GCTCTTCTTGAATGATGGTGGATCAGGCACCACTTCCTCCATTAATTCT  945
       ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  GGCTCTTCTTGAATGATGGTGGATCAGGCA-CACTTCCTCCATTAATTCT  948

seq1  TATTTTGAGACAGATAATTACTTTGTAGCCCAGGTTAGCCTCAAACTCCT  995
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||
seq2  TATTTTGAGACAGATAATTACTTTGTAGGCCAGGTTAG-CTC-AACTCCT  996

seq1  GGCTTACTCTACTAAATACTTTGGGAATTAAATCTGTGGTGCCT-GTCAC  1044
      ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | || |||||
seq2  GGC-TACTCTACTAAATACTTTGGGAAT--AATCTGTGGGGGCTGGTCAC  1043

seq1  CTGATCATCAACAA-GATATAACACTTTATTTAATATAATGTTCCAATTA  1093
      |||| ||||| ||| ||  |||||||||| || | || || |  | ||| 
seq2  CTGAACATCACCAAGGAATTAACACTTTAATTGA-ATTATATGTCCATT-  1091

seq1  TTTTGGGCATTGGATAATT  1112
       ||||||||||||||||||
seq2  GTTTGGGCATTGGATAATT  1110