BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-122H04
Chromosome7 (Build37)
Map Location 123,166,383 - 123,332,388
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSox6, 1110006G14Rik, EG668479, LOC100043313, 1110004F10Rik, Plekha7
Upstream geneLOC668472, LOC100042779
Downstream geneRps13, Pik3c2a, LOC100042798, Nucb2, LOC100043320, EG668484, LOC668485, LOC546993, LOC100043330
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-122H04.bB6Ng01-122H04.g
ACCDH925867DH925868
length1,135664
definitionDH925867|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-122H04, 5' end.DH925868|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-122H04, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(123,331,253 - 123,332,388)(123,166,383 - 123,167,046)
sequence
gaattcctaggttcttgccctgaacaacggatctggacagagatagtgga
taataacagaattgtttacgaagggagaaaagcttttccacgggtagaaa
tagaccagagctggaaaaagatccaaggcgcaatggcagagattctaaac
agaggatcgggactgtatagtctagtatggtgggctttggatctttgtac
agtccacagttttctttgctcttttacaagtcaaccttccattctttcac
atgctaattttgacttaatttccatcctactctcttgctacaattgtaca
catacacataacctctaggggcatcaagtaggagcccaaagctggggtct
cgaggagaggaaacagaaccctgcttatctcagtggtcttcagagagaaa
accctagtcacaggctgtgctcagtgtgttgagtggaccacggttgctat
tgcatagaggttctaactggctgatctgcagtaaccttaggcttgcttca
aagacaccaggcctccgctcctgtctcttctgtaggacccttctccagca
ctgttacagggccgccctgctcatgactgggtcactgtgctgctcttctg
aagcttcttcctggttttctgcagttatccgcatgggtctggcctttggt
ggctgtcctagttttatttctggagctgtggtcaagcatcgtgacaaaaa
agcaactggtgagggaaagggtttgtttcagcctacagttccaggttacc
gtctgttaccacgggcgagtcacagctccgtttctccagtcttaacagag
ttcagaccttctctgcctagaggatggtgctgcccacagtgggctgggtt
ttcctgaatcagttgacttaattaagagagtccccagtagatatgcccac
aggctaacccaatgtaaacaactcctcacctagactctccttgtgagtct
gggctgtgtcaagtggacagaactaattatcacagtagctaacagggcta
cctgcatacaggggcttgggcttggaaggtcaggatggtgatttcaatat
cagatcctcagcacaagcacatgctgtcttctccttcggtgctaagggtg
tctctatagcttagggaagaggaacagaaacattc
gaattcctatttctatactctgaggaagaatttactttcatgctcccctt
cgatttaaagttataaagagtcttgggagatagctcagttgataaagtta
ttgccatacagcaagcatgaaaatctgagatcaatttctagaacccacat
acataaaaagtttggcatggtggtgtgcacttgcaatcactaaacccaac
tgggaagacagaggcaggcagatcactggagctctctggccagccatccc
agccaactgagcaagcaagctccaggctagtgagagaccctctctcaaaa
cataaggttgatagcatctgagaaagacactaaggttaacctctggccaa
cacacactaagacacacacacctgaatacaagttcaggcatacatccata
aacacaacaaaattatgaactatgctaacttgatgcctattaaaattaaa
actattaatatgtaacaccagaaacaaataggagaaattcaaattaatac
tcagatcagaaacttttcagatagcattttctctgccactatgcttgtca
aatgaatgaaaggagcacataagcataacatacaagattatactaattca
taatcttgaatcagtagcttatctgacagtattgtgtgtgtgtgtgtgtg
tgtgtgtgtgtgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_123331253_123332388
seq2: B6Ng01-122H04.b_47_1181 (reverse)

seq1  GAATGTTTCTG-TCCTCTTCCCTAAAGCTATAGAGACACCC-TAGCACTG  48
      ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
seq2  GAATGTTTCTGTTCCTCTTCCCT-AAGCTATAGAGACACCCTTAGCACCG  49

seq1  -AGGAGAAGACAGCATGTGCCTGTGCTTGAGGATCTGATATGGAAATCAC  97
       ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||
seq2  AAGGAGAAGACAGCATGTGCTTGTGC-TGAGGATCTGATATTGAAATCAC  98

seq1  ATTCCTGAACCTTCCAAGCCCAAGCCCCTTGTATGCAGGTAGCCCTGTTA  147
        ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  CATCCTG-ACCTTCCAAGCCCAAGCCCC-TGTATGCAGGTAGCCCTGTTA  146

seq1  GCTACTGTGATAATTAGTTCTGTCCACTTGACACAGCCCAGACTCACAAG  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTACTGTGATAATTAGTTCTGTCCACTTGACACAGCCCAGACTCACAAG  196

seq1  GAGAGTCTAGGTGAGGAGTTGTTTACATTGGGTTAGCCTGTGGGCATATC  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGTCTAGGTGAGGAGTTGTTTACATTGGGTTAGCCTGTGGGCATATC  246

seq1  TACTGGGGACTCTCTTAATTAAGTCAACTGATTCAGGAAAACCCAGCCCA  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGGGGACTCTCTTAATTAAGTCAACTGATTCAGGAAAACCCAGCCCA  296

seq1  CTGTGGGCAGCACCATCCTCTAGGCAGAGAAGGTCCTGAACTCTGTTAAG  347
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  CTGTGGGCAGCACCATCCTCTAGGCAGAGAAGGT-CTGAACTCTGTTAAG  345

seq1  ACTGGAGAAACGGAGCTGTGACTCGCCCGTGGTAACAGACGGTAACCTGG  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGAGAAACGGAGCTGTGACTCGCCCGTGGTAACAGACGGTAACCTGG  395

seq1  AACTGTAGGCTGAAACAAACCCTTTCCCTCACCAGTTGCTTTTTTGTCAC  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGTAGGCTGAAACAAACCCTTTCCCTCACCAGTTGCTTTTTTGTCAC  445

seq1  GATGCTTGACCACAGCTCCAGAAATAAAACTAGGACAGCCACCAAAGGCC  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCTTGACCACAGCTCCAGAAATAAAACTAGGACAGCCACCAAAGGCC  495

seq1  AGACCCATGCGGATAACTGCAGAAAACCAGGAAGAAGCTTCAGAAGAGCA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCCATGCGGATAACTGCAGAAAACCAGGAAGAAGCTTCAGAAGAGCA  545

seq1  GCACAGTGACCCAGTCATGAGCAGGGCGGCCCTGTAACAGTGCTGGAGAA  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACAGTGACCCAGTCATGAGCAGGGCGGCCCTGTAACAGTGCTGGAGAA  595

seq1  GGGTCCTACAGAAGAGACAGGAGCGGAGGCCTGGTGTCTTTGAAGCAAGC  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTCCTACAGAAGAGACAGGAGCGGAGGCCTGGTGTCTTTGAAGCAAGC  645

seq1  CTAAGGTTACTGCAGATCAGCCAGTTAGAACCTCTATGCAATAGCAACCG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGGTTACTGCAGATCAGCCAGTTAGAACCTCTATGCAATAGCAACCG  695

seq1  TGGTCCACTCAACACACTGAGCACAGCCTGTGACTAGGGTTTTCTCTCTG  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCCACTCAACACACTGAGCACAGCCTGTGACTAGGGTTTTCTCTCTG  745

seq1  AAGACCACTGAGATAAGCAGGGTTCTGTTTCCTCTCCTCGAGACCCCAGC  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACCACTGAGATAAGCAGGGTTCTGTTTCCTCTCCTCGAGACCCCAGC  795

seq1  TTTGGGCTCCTACTTGATGCCCCTAGAGGTTATGTGTATGTGTACAATTG  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGGCTCCTACTTGATGCCCCTAGAGGTTATGTGTATGTGTACAATTG  845

seq1  TAGCAAGAGAGTAGGATGGAAATTAAGTCAAAATTAGCATGTGAAAGAAT  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCAAGAGAGTAGGATGGAAATTAAGTCAAAATTAGCATGTGAAAGAAT  895

seq1  GGAAGGTTGACTTGTAAAAGAGCAAAGAAAACTGTGGACTGTACAAAGAT  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGGTTGACTTGTAAAAGAGCAAAGAAAACTGTGGACTGTACAAAGAT  945

seq1  CCAAAGCCCACCATACTAGACTATACAGTCCCGATCCTCTGTTTAGAATC  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAAGCCCACCATACTAGACTATACAGTCCCGATCCTCTGTTTAGAATC  995

seq1  TCTGCCATTGCGCCTTGGATCTTTTTCCAGCTCTGGTCTATTTCTACCCG  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCCATTGCGCCTTGGATCTTTTTCCAGCTCTGGTCTATTTCTACCCG  1045

seq1  TGGAAAAGCTTTTCTCCCTTCGTAAACAATTCTGTTATTATCCACTATCT  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAAAGCTTTTCTCCCTTCGTAAACAATTCTGTTATTATCCACTATCT  1095

seq1  CTGTCCAGATCC-TTGTTCAGGGCAAGAACCTAGGAATTC  1136
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCCAGATCCGTTGTTCAGGGCAAGAACCTAGGAATTC  1135

seq1: chr7_123166383_123167046
seq2: B6Ng01-122H04.g_68_731

seq1  GAATTCCTATTTCTATACTCTGAGGAAGAATTTACTTTCATGCTCCCCTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTATTTCTATACTCTGAGGAAGAATTTACTTTCATGCTCCCCTT  50

seq1  CGATTTAAAGTTATAAAGAGTCTTGGGAGATAGCTCAGTTGATAAAGTTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGATTTAAAGTTATAAAGAGTCTTGGGAGATAGCTCAGTTGATAAAGTTA  100

seq1  TTGCCATACAGCAAGCATGAAAATCTGAGATCAATTTCTAGAACCCACAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCATACAGCAAGCATGAAAATCTGAGATCAATTTCTAGAACCCACAT  150

seq1  ACATAAAAAGTTTGGCATGGTGGTGTGCACTTGCAATCACTAAACCCAAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATAAAAAGTTTGGCATGGTGGTGTGCACTTGCAATCACTAAACCCAAC  200

seq1  TGGGAAGACAGAGGCAGGCAGATCACTGGAGCTCTCTGGCCAGCCATCCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAAGACAGAGGCAGGCAGATCACTGGAGCTCTCTGGCCAGCCATCCC  250

seq1  AGCCAACTGAGCAAGCAAGCTCCAGGCTAGTGAGAGACCCTCTCTCAAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCAACTGAGCAAGCAAGCTCCAGGCTAGTGAGAGACCCTCTCTCAAAA  300

seq1  CATAAGGTTGATAGCATCTGAGAAAGACACTAAGGTTAACCTCTGGCCAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAAGGTTGATAGCATCTGAGAAAGACACTAAGGTTAACCTCTGGCCAA  350

seq1  CACACACTAAGACACACACACCTGAATACAAGTTCAGGCATACATCCATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACTAAGACACACACACCTGAATACAAGTTCAGGCATACATCCATA  400

seq1  AACACAACAAAATTATGAACTATGCTAACTTGATGCCTATTAAAATTAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACAACAAAATTATGAACTATGCTAACTTGATGCCTATTAAAATTAAA  450

seq1  ACTATTAATATGTAACACCAGAAACAAATAGGAGAAATTCAAATTAATAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATTAATATGTAACACCAGAAACAAATAGGAGAAATTCAAATTAATAC  500

seq1  TCAGATCAGAAACTTTTCAGATAGCATTTTCTCTGCCACTATGCTTGTCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGATCAGAAACTTTTCAGATAGCATTTTCTCTGCCACTATGCTTGTCA  550

seq1  AATGAATGAAAGGAGCACATAAGCATAACATACAAGATTATACTAATTCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGAATGAAAGGAGCACATAAGCATAACATACAAGATTATACTAATTCA  600

seq1  TAATCTTGAATCAGTAGCTTATCTGACAGTATTGTGTGTGTGTGTGTGTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATCTTGAATCAGTAGCTTATCTGACAGTATTGTGTGTGTGTGTGTGTG  650

seq1  TGTGTGTGTGTGTG  664
      ||||||||||||||
seq2  TGTGTGTGTGTGTG  664