BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-124G06
Chromosome7 (Build37)
Map Location 124,800,112 - 124,940,889
singlet/doubletdoublet
Overlap geneXylt1
Upstream geneLOC546993, LOC100043330
Downstream geneLOC669758, Rps15a, Arl6ip1, 2610207I05Rik, LOC100043339, Syt17, LOC100042845, E030018N11Rik, Coq7, Tmc7, B230311B06Rik, Tmc5, Mir16, 6330503K22Rik, 9030624J02Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-124G06.bB6Ng01-124G06.g
ACCDH927312DH927313
length1,1131,024
definitionDH927312|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-124G06, 5' end.DH927313|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-124G06, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(124,939,775 - 124,940,889)(124,800,112 - 124,801,141)
sequence
gaattcatggtataaattgcacctaaggtttgtcctaatcaaaggcaaaa
aaggaaattaggccttcaaagttctttaccagtggtcaccagtaaatgcc
attttgagggattatgagctcccaggtactctagtgacacagctgaagtc
agctgaggtcagccactaaggcaagggtagagtcaaggtttcagaagcat
actgatgctaaaggaagtgtatggaagtgatacaagagactagaggactt
agtggagtgactcacacttatgagcccagaatccaggaggcaggggtagc
ctgagctatatagtgagttcaggctagcctagactatgagatattgtctc
aaaataaaacaaagcaaaagggatctcaagatatttggatagaggatcct
ctttagtggtctataaaatttttatagacagggattgaattattttttaa
tagcgtggtatttaaaattatatatggacacaaatgcctgtctaagccct
cttcagtctcacatttgtttcacagaattatgctcagtattgtgaggaaa
ggaagctcttttagtccacacagttctgctccttctgcaaatatcataat
gaagctatatggctcttaagacctcattccagaaaatgatctgccattaa
tagcaataaatatcatggagatactgaagaaagacacagcaagtgtgagc
atgctgtgtattaatattaacgataatcatggcaggtgctagaatgacct
ataacctagagagatcggtggcattcgtgtgtgttattccataagaccct
cccagtgatcctgtgagtaggaatgaggactaggttcattttctggatga
acaaactaaggccaaaggaaccttagtaactctctccaacaggcagcaga
aggcacagcttgggctctgccgagttctgccagtaccatgttcctctgca
ttgagagatgccaagtcacgtgcttctgaccagaacatcttcgccaagga
agtctttgattctgacgcctggtggtaagctccttttttgttgcatggtg
aagctaggaatatttctcagccacgtttaccagcctcgttgagccaacat
ttttcagtttcat
gaattcacacactacaagccccctttgaatctgcctctgaggcctggggt
ctggacagtgaagattctccatcactgggtgccagtggcagagaccaaat
tccttgtggcacctttgaccttttccaacaagcagcccatcaaaccaggt
gagtgctctcagggtccctgaggaggagagggtccatcccatggagccct
gggaccccatgcccaacatgacacatgaggctgccttgcagagagcaaag
cttccccaattgggttttttccctacttgtttaccctatagagctggctc
atttcctccttgtacacagaggcagtgccatctgtgtgggtgtttatcag
ctgctggcccactggactgccacaaggctctgttcatatttaagacaagc
tgggtactaatcctagacacacactgagttttaacatggcttcttggctg
tttggaaaatgataattactgatgcaattctgctcatagaatatgtgata
ccctaagtaaaaaggacaaaccgtacactggtggaagatgtttgctcccc
aaaatatactaaaaaataatcccataaataagagtttggcaaactatgag
ccccagttaactatgggcattttctggtctttatttttaaaaaaaatctt
acagggaacatggccatgggcacttgtggacacagttacctatgtctgct
tttgggctttagtggcagactccaacagtcaggacagagactgactcaga
aatgctgtctcagaaatcaaaaccattttagcccctgaagacgatgagtg
ccattggcagctataacagagagagaaataaggaagaaaaaatgagaaca
aaataagaggaaaaaatgaatttcccactatgtataatttaagcaaaagt
aacaacaaaaaacctccccctcattaatatgagaggcattatgaaaatcc
aagcaaaagaggttcagaatggtaaaatagtgtgcctgtgatggtcagtc
agtgccccagggcaggtcatagat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_124939775_124940889
seq2: B6Ng01-124G06.b_41_1153 (reverse)

seq1  ATGAAACTGAAAAATGTTTGCTCAACGAGGCTGGTAAACGTGGCTGAGAA  50
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAACTGAAAAATGTTGGCTCAACGAGGCTGGTAAACGTGGCTGAGAA  50

seq1  ATATTCCTAGGCTCA-CATGCAAC-AAGAAGGAGCTTACCACCA-GCGTC  97
      ||||||||||  ||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||
seq2  ATATTCCTAGCTTCACCATGCAACAAAAAAGGAGCTTACCACCAGGCGTC  100

seq1  AGAATCAAAGACTTCCTTGGCGAAAGATGTTCTGGTCAGAAGCACGTGAC  147
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATCAAAGACTTCCTTGGCG-AAGATGTTCTGGTCAGAAGCACGTGAC  149

seq1  TTGGCATCTCCTCAATGCAGAGGAACATGGTACTGGGCAGAACTCGGCAG  197
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  TTGGCATCT-CTCAATGCAGAGGAACATGGTACT-GGCAGAACTCGGCAG  197

seq1  AGCCCAAGCTGTGCCTTCTGCTGCCTTGTTGGAGAGAGTTACTTAGGTTC  247
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
seq2  AGCCCAAGCTGTGCCTTCTGCTGCC-TGTTGGAGAGAGTTACTAAGGTTC  246

seq1  TTTTGGCCTTAGTTTGTTCATCCAGGAAATGAACCTAGTCCTCATTCCTA  297
       |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| 
seq2  CTTTGGCCTTAGTTTGTTCATCCAGAAAATGAACCTAGTCCTCATTCCT-  295

seq1  ACTCACAGGATCACTGGGAGGGTCTTATGGAATAACACACACGAATGCCA  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCACAGGATCACTGGGAGGGTCTTATGGAATAACACACACGAATGCCA  345

seq1  CCGATCTCTCTAGGTTATAGGTCATTCTAGCACCTGCCATGATTATCGTT  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGATCTCTCTAGGTTATAGGTCATTCTAGCACCTGCCATGATTATCGTT  395

seq1  AATATTAATACACAGCATGCTCACACTTGCTGTGTCTTTCTTCAGTATCT  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATTAATACACAGCATGCTCACACTTGCTGTGTCTTTCTTCAGTATCT  445

seq1  CCATGATATTTATTGCTATTAATGGCAGATCATTTTCTGGAATGAGGTCT  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGATATTTATTGCTATTAATGGCAGATCATTTTCTGGAATGAGGTCT  495

seq1  TAAGAGCCATATAGCTTCATTATGATATTTGCAGAAGGAGCAGAACTGTG  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGAGCCATATAGCTTCATTATGATATTTGCAGAAGGAGCAGAACTGTG  545

seq1  TGGACTAAAAGAGCTTCCTTTCCTCACAATACTGAGCATAATTCTGTGAA  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACTAAAAGAGCTTCCTTTCCTCACAATACTGAGCATAATTCTGTGAA  595

seq1  ACAAATGTGAGACTGAAGAGGGCTTAGACAGGCATTTGTGTCCATATATA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAATGTGAGACTGAAGAGGGCTTAGACAGGCATTTGTGTCCATATATA  645

seq1  ATTTTAAATACCACGCTATTAAAAAATAATTCAATCCCTGTCTATAAAAA  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTAAATACCACGCTATTAAAAAATAATTCAATCCCTGTCTATAAAAA  695

seq1  TTTTATAGACCACTAAAGAGGATCCTCTATCCAAATATCTTGAGATCCCT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTATAGACCACTAAAGAGGATCCTCTATCCAAATATCTTGAGATCCCT  745

seq1  TTTGCTTTGTTTTATTTTGAGACAATATCTCATAGTCTAGGCTAGCCTGA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCTTTGTTTTATTTTGAGACAATATCTCATAGTCTAGGCTAGCCTGA  795

seq1  ACTCACTATATAGCTCAGGCTACCCCTGCCTCCTGGATTCTGGGCTCATA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCACTATATAGCTCAGGCTACCCCTGCCTCCTGGATTCTGGGCTCATA  845

seq1  AGTGTGAGTCACTCCACTAAGTCCTCTAGTCTCTTGTATCACTTCCATAC  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTGAGTCACTCCACTAAGTCCTCTAGTCTCTTGTATCACTTCCATAC  895

seq1  ACTTCCTTTAGCATCAGTATGCTTCTGAAACCTTGACTCTACCCTTGCCT  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCCTTTAGCATCAGTATGCTTCTGAAACCTTGACTCTACCCTTGCCT  945

seq1  TAGTGGCTGACCTCAGCTGACTTCAGCTGTGTCACTAGAGTACCTGGGAG  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTGGCTGACCTCAGCTGACTTCAGCTGTGTCACTAGAGTACCTGGGAG  995

seq1  CTCATAATCCCTCAAAATGGCATTTACTGGTGACCACTGGTAAAGAACTT  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATAATCCCTCAAAATGGCATTTACTGGTGACCACTGGTAAAGAACTT  1045

seq1  TGAAGGCCTAATTTCCTTTTTTGCCTTTGATTAGGACAAACCTTAGGTGC  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGGCCTAATTTCCTTTTTTGCCTTTGATTAGGACAAACCTTAGGTGC  1095

seq1  AATTTATACCATGAATTC  1115
      ||||||||||||||||||
seq2  AATTTATACCATGAATTC  1113

seq1: chr7_124800112_124801141
seq2: B6Ng01-124G06.g_67_1090

seq1  GAATTCACACACTACAAGCCCCCTTTGAATCTGCCTCTGAGGCCTGGGGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACACACTACAAGCCCCCTTTGAATCTGCCTCTGAGGCCTGGGGT  50

seq1  CTGGACAGTGAAGATTCTCCATCACTGGGTGCCAGTGGCAGAGACCAAAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGACAGTGAAGATTCTCCATCACTGGGTGCCAGTGGCAGAGACCAAAT  100

seq1  TCCTTGTGGCACCTTTGACCTTTTCCAACAAGCAGCCCATCAAACCAGGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTGTGGCACCTTTGACCTTTTCCAACAAGCAGCCCATCAAACCAGGT  150

seq1  GAGTGCTCTCAGGGTCCCTGAGGAGGAGAGGGTCCATCCCATGGAGCCCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGCTCTCAGGGTCCCTGAGGAGGAGAGGGTCCATCCCATGGAGCCCT  200

seq1  GGGACCCCATGCCCAACATGACACATGAGGCTGCCTTGCAGAGAGCAAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGACCCCATGCCCAACATGACACATGAGGCTGCCTTGCAGAGAGCAAAG  250

seq1  CTTCCCCAATTGGGTTTTTTCCCTACTTGTTTACCCTATAGAGCTGGCTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCCCAATTGGGTTTTTTCCCTACTTGTTTACCCTATAGAGCTGGCTC  300

seq1  ATTTCCTCCTTGTACACAGAGGCAGTGCCATCTGTGTGGGTGTTTATCAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCCTCCTTGTACACAGAGGCAGTGCCATCTGTGTGGGTGTTTATCAG  350

seq1  CTGCTGGCCCACTGGACTGCCACAAGGCTCTGTTCATATTTAAGACAAGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTGGCCCACTGGACTGCCACAAGGCTCTGTTCATATTTAAGACAAGC  400

seq1  TGGGTACTAATCCTAGACACACACTGAGTTTTAACATGGCTTCTTGGCTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTACTAATCCTAGACACACACTGAGTTTTAACATGGCTTCTTGGCTG  450

seq1  TTTGGAAAATGATAATTACTGATGCAATTCTGCTCATAGAATATGTGATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGAAAATGATAATTACTGATGCAATTCTGCTCATAGAATATGTGATA  500

seq1  CCCTAAGTAAAAAGGACAAACCGTACACTGGTGGAAGATGTTTGCTCCCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTAAGTAAAAAGGACAAACCGTACACTGGTGGAAGATGTTTGCTCCCC  550

seq1  AAAATATACTAAAAAATAATCCCATAAATAAGAGTTTGGCAAACTATGAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATATACTAAAAAATAATCCCATAAATAAGAGTTTGGCAAACTATGAG  600

seq1  CCCCAGTTAACTATGGGCA-TTTCTGGTCTTTATTTTTAAAAAAAATCTT  649
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCAGTTAACTATGGGCATTTTCTGGTCTTTATTTTTAAAAAAAATCTT  650

seq1  ACAGGGAACATGGCCATGGGCACTTGTGGACACAG-TACCTATGTCTGC-  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| 
seq2  ACAGGGAACATGGCCATGGGCACTTGTGGACACAGTTACCTATGTCTGCT  700

seq1  TTTGGGCTTTAGTGGCAGACTCCAACAGTCAGGACAGAGACTGACTCAGA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGGCTTTAGTGGCAGACTCCAACAGTCAGGACAGAGACTGACTCAGA  750

seq1  AATGCTGTCTCAGAAATCAAAACCA-TTTAGCCCCTGAAGACGATGAGTG  796
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCTGTCTCAGAAATCAAAACCATTTTAGCCCCTGAAGACGATGAGTG  800

seq1  CCATTGGCAGCTATAACAGAGAGAGAAATAAGGAAGAAAAAATGAGAACA  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTGGCAGCTATAACAGAGAGAGAAATAAGGAAGAAAAAATGAGAACA  850

seq1  AAATAAAGAGGAAAAAATGAATTTCCCACATATGTATAATTTAAAGCAAA  896
      |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||
seq2  AAAT-AAGAGGAAAAAATGAATTTCCCAC-TATGTATAATTT-AAGCAAA  897

seq1  AGTAACAACAAAAAACCTCACCCTCATTAATAATGAGAGGCAATAATGAA  946
      ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||
seq2  AGTAACAACAAAAAACCTCCCCCTCATTAAT-ATGAGAGGC-ATTATGAA  945

seq1  AATTACAAGCAAAAAGAGGTTCCAGAATGGGAAATAAATGTGTGCCTGTG  996
      || | ||||| |||||||||| |||||||| ||  ||  |||||||||||
seq2  AA-TCCAAGC-AAAAGAGGTT-CAGAATGGTAA--AATAGTGTGCCTGTG  990

seq1  ATGGTCAGTCAGTGCCACAGGGCAGGTCAGAGAT  1030
      |||||||||||||||| |||||||||||| ||||
seq2  ATGGTCAGTCAGTGCCCCAGGGCAGGTCATAGAT  1024