BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-126K11
Chromosome7 (Build37)
Map Location 138,034,468 - 138,235,287
singlet/doubletdoublet
Overlap genePlekha1, Htra1, Dmbt1
Upstream geneLOC100043150, Fgfr2, LOC546005, Ate1, LOC100043163, Nsmce4a, Tacc2, LOC619876, Btbd16, EG434249
Downstream gene4933402N03Rik, 5430419D17Rik, LOC546006, LOC100043173, Cuzd1, 1700007K09Rik, 1700063I17Rik, 2310057M21Rik, Pstk, Ikzf5, Acadsb, Hmx3, Hmx2, Bub3, LOC677073, LOC100043679, Gpr26, Cpxm2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-126K11.bB6Ng01-126K11.g
ACCDH928964DH928965
length1,094782
definitionDH928964|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-126K11, 5' end.DH928965|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-126K11, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(138,034,468 - 138,035,578)(138,234,508 - 138,235,287)
sequence
gaattcctgacagactggggcgagtgcttgtgataaagcagtcgttacta
gaaaagctcctgcagatcaggaaattccagctgagcagctccagagaagt
aagtcagcacaggaaatgcagaactcatggagcaatggcaggtggtggag
acacaaaacaaattcagattcaaaggaggtctgcttatttactgattggc
aactaattaggtcactaatagagtgctgtatcagtgagggtctgttgaat
agaaacaccatttaaggcatttctctgtcccaaggtaattattacaggtg
gttagatgtttcagtgactcaaactttgctgactctgtggctaggagaca
ggaggacagaggtaagacaaagccttagatctggaggggctgctgccagg
aagctatgaaatagaggtttagactcagcccttaagcttcaggactttaa
agcaaggctgtatatttagcacaaatgctaataacaatacagatgagagt
tattagaaacctcgtggacacaattggcaattgggaagacgcttttgtat
agggattcagctttttgtttgttttgttttgttttgttttgttttgtttt
actgagacagggtttctctgtgtatcagccctggctgccctggaacttgc
tttgtagaccaagttgtcctcaaagtcacagagatctacctgcctctgct
tcctgagtgctgggattaaaagtaggagccaccataaagtgcaagaggat
agtggatcccctggagcaggaggttcagacagttgtgagctgtcatgtgg
gtgctgggaattaaagccaggtcctctggaagtatagccagtgctgtaac
tactgagtcatctttctatcccctcaaacaaatttttaatgtaattctct
gtgactcataagtctatatgaagaaaattattccacagaaatactggctg
agtgtgaagaatctcccaagtgatactttattgtgatggactggttactg
agtatgcatcattgagactgactcactatttagcagtatcctcttttatg
gaggctggcagacaagagtctgactgtgttacttagcgatgaaa
gaattccacctactctggagctaatggccatgactgtggtgataataggt
gtggagaggatagagaggagttgaaggaggttctgactcaccagctactg
ttgggattggcactggaggagctgtgagaaaaaaatccttgacagaacct
tgaagagaagttgtctgtcatggtcctttgtgcatgatgctgagcacgcc
agagtgagttgtactcacctgctgcctcattgcaagtgtgtaaccatata
caatacaagaggatccttctgatggagtcattaagaatcagtagtctatt
ctgactgcatgtagacatttgtatctgcatttgttgagaggtaagatcct
gtactttgtgtctccccagggatttatgggtgaatgactacaacaagcaa
agagcaagtcctcacatttgaccattaaggcctctaaggacatcttcagc
tactcttgccatgaggcacagatgtagatggatttccagccatgagcaca
gactctacctcagtacctgaaaggctatgcagaggcacacatggacatca
aggcccaaagaatgaacttgtgctaagttcttctctgatggggaatggga
gacaggaattgaccaaagcaaaatattttcatagttatcattttcacgtg
cagtaaagcaactccacagccaagagtagcagcagcatccagtcaggtct
ttagctcaggacaaagtccacccttattgcttccttgcttgaacaaaaga
cctggaacatcagcctcagtccttctccataa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_138034468_138035578
seq2: B6Ng01-126K11.b_47_1140

seq1  GAATTCCTGACAGACTGGGGCGAGTGCTTGTGATAAAGCAGTCGTTACTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTGACAGACTGGGGCGAGTGCTTGTGATAAAGCAGTCGTTACTA  50

seq1  GAAAAGCTCCTGCAGATCAGGAAATTCCAGCTGAGCAGCTCCAGAGAAGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAGCTCCTGCAGATCAGGAAATTCCAGCTGAGCAGCTCCAGAGAAGT  100

seq1  AAGTCAGCACAGGAAATGCAGAACTCATGGAGCAATGGCAGGTGGTGGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCAGCACAGGAAATGCAGAACTCATGGAGCAATGGCAGGTGGTGGAG  150

seq1  ACACAAAACAAATTCAGATTCAAAGGAGGTCTGCTTATTTACTGATTGGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAAAACAAATTCAGATTCAAAGGAGGTCTGCTTATTTACTGATTGGC  200

seq1  AACTAATTAGGTCACTAATAGAGTGCTGTATCAGTGAGGGTCTGTTGAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTAATTAGGTCACTAATAGAGTGCTGTATCAGTGAGGGTCTGTTGAAT  250

seq1  AGAAACACCATTTAAGGCATTTCTCTGTCCCAAGGTAATTATTACAGGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAACACCATTTAAGGCATTTCTCTGTCCCAAGGTAATTATTACAGGTG  300

seq1  GTTAGATGTTTCAGTGACTCAAACTTTGCTGACTCTGTGGCTAGGAGACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAGATGTTTCAGTGACTCAAACTTTGCTGACTCTGTGGCTAGGAGACA  350

seq1  GGAGGACAGAGGTAAGACAAAGCCTTAGATCTGGAGGGGCTGCTGCCAGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGACAGAGGTAAGACAAAGCCTTAGATCTGGAGGGGCTGCTGCCAGG  400

seq1  AAGCTATGAAATAGAGGTTTAGACTCAGCCCTTAAGCTTCAGGACTTTAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTATGAAATAGAGGTTTAGACTCAGCCCTTAAGCTTCAGGACTTTAA  450

seq1  AGCAAGGCTGTATATTTAGCACAAATGCTAATAACAATACAGATGAGAGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAAGGCTGTATATTTAGCACAAATGCTAATAACAATACAGATGAGAGT  500

seq1  TATTAGAAACCTCGTGGACACAATTGGCAATTGGGAAGACGCTTTTGTAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTAGAAACCTCGTGGACACAATTGGCAATTGGGAAGACGCTTTTGTAT  550

seq1  AGGGATTCAGCTTTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGATTCAGCTTTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTT  600

seq1  ACTGAGACAGGGTTTCTCTGTGTATCAGCCCTGGCTGCCCTGGAACTTGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAGACAGGGTTTCTCTGTGTATCAGCCCTGGCTGCCCTGGAACTTGC  650

seq1  TTTGTAGACCAAGTTGTCCTCAAAGTCACAGAGATCTACCTGCCTCTGCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTAGACCAAGTTGTCCTCAAAGTCACAGAGATCTACCTGCCTCTGCT  700

seq1  TCCTGAGTGCTGGGATTAAAAGTAGGAGCCACCATAAAGTGCAAGAGGAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGAGTGCTGGGATTAAAAGTAGGAGCCACCATAAAGTGCAAGAGGAT  750

seq1  AGTGGATCCCCTGGAGCAGGAGGTTCAGACAGTTGTGAGCTGTCAGGTGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  AGTGGATCCCCTGGAGCAGGAGGTTCAGACAGTTGTGAGCTGTCATGTGG  800

seq1  GTGCTGGGAATTAAAGCCAGGTCCTCTGGAAGTATAGCCAGTGCTGTTAA  850
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  GTGCTGGGAATTAAAGCCAGGTCCTCTGGAAGTATAGCCAGTGCTG-TAA  849

seq1  CTACTGAGTCATCTTTCTAATCCCCTCAAACAAAATTTTTAAATGTTAAT  900
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||| ||||
seq2  CTACTGAGTCATCTTTCT-ATCCCCTCAAACAAA--TTTTTAATG-TAAT  895

seq1  TCTCTGTGACTCAATAAGTCTATATGAAGAAAATTATTCCACAGAAATAC  950
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTGTGACTC-ATAAGTCTATATGAAGAAAATTATTCCACAGAAATAC  944

seq1  TGGCTGAAGTGTGAAGGAATCTCCCCAAGTGATACTTTATTGTGATGGCC  1000
      |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |
seq2  TGGCTG-AGTGTGAA-GAATCT-CCCAAGTGATACTTTATTGTGATGGAC  991

seq1  TGTGTTAACTGAAGTATGCATCATTGGAGGACTGACTCACTATTTAGCAG  1050
      || ||| |||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||
seq2  TG-GTT-ACTG-AGTATGCATCATTG--AGACTGACTCACTATTTAGCAG  1036

seq1  TATCCTCATTTAGTGAAGGCTGGCCAGAAAAGAGTTCTGCCTGTGTAACT  1100
      ||||||| |||| || ||||||| |||| ||||| |||| |||||| |||
seq2  TATCCTCTTTTA-TGGAGGCTGG-CAGACAAGAG-TCTGACTGTGTTACT  1083

seq1  TAGCGATGAAA  1111
      |||||||||||
seq2  TAGCGATGAAA  1094

seq1: chr7_138234508_138235287
seq2: B6Ng01-126K11.g_68_849 (reverse)

seq1  TAATGGAGAAGGACTGAGGACTGATGTCCAAGGTCTTTTGTTC-AGCAAG  49
      | ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||
seq2  TTATGGAGAAGGACTGAGG-CTGATGTTCCAGGTCTTTTGTTCAAGCAAG  49

seq1  G-AGC-ATAAGGGTGGACTTTGTCCTGAGCTAAAGACCTGACTGGATGCT  97
      | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCAATAAGGGTGGACTTTGTCCTGAGCTAAAGACCTGACTGGATGCT  99

seq1  GCTGCTACTCTTGGCTGTGGAGTTGCTTTACTGCACGTGAAAATGATTAC  147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  GCTGCTACTCTTGGCTGTGGAGTTGCTTTACTGCACGTGAAAATGATAAC  149

seq1  TATGAAAATATTTTGCTTTGGTCAATTCCTGTCTCCCATTCCCCATCAGA  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGAAAATATTTTGCTTTGGTCAATTCCTGTCTCCCATTCCCCATCAGA  199

seq1  GAAGAACTTAGCACAAGTTCATTCTTTGGGCCTTGATGTCCATGTGTGCC  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAACTTAGCACAAGTTCATTCTTTGGGCCTTGATGTCCATGTGTGCC  249

seq1  TCTGCATAGCCTTTCAGGTACTGAGGTAGAGTCTGTGCTCATGGCTGGAA  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCATAGCCTTTCAGGTACTGAGGTAGAGTCTGTGCTCATGGCTGGAA  299

seq1  ATCCATCTACATCTGTGCCTCATGGCAAGAGTAGCTGAAGATGTCCTTAG  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCATCTACATCTGTGCCTCATGGCAAGAGTAGCTGAAGATGTCCTTAG  349

seq1  AGGCCTTAATGGTCAAATGTGAGGACTTGCTCTTTGCTTGTTGTAGTCAT  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCTTAATGGTCAAATGTGAGGACTTGCTCTTTGCTTGTTGTAGTCAT  399

seq1  TCACCCATAAATCCCTGGGGAGACACAAAGTACAGGATCTTACCTCTCAA  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCCATAAATCCCTGGGGAGACACAAAGTACAGGATCTTACCTCTCAA  449

seq1  CAAATGCAGATACAAATGTCTACATGCAGTCAGAATAGACTACTGATTCT  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATGCAGATACAAATGTCTACATGCAGTCAGAATAGACTACTGATTCT  499

seq1  TAATGACTCCATCAGAAGGATCCTCTTGTATTGTATATGGTTACACACTT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGACTCCATCAGAAGGATCCTCTTGTATTGTATATGGTTACACACTT  549

seq1  GCAATGAGGCAGCAGGTGAGTACAACTCACTCTGGCGTGCTCAGCATCAT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAATGAGGCAGCAGGTGAGTACAACTCACTCTGGCGTGCTCAGCATCAT  599

seq1  GCACAAAGGACCATGACAGACAACTTCTCTTCAAGGTTCTGTCAAGGATT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACAAAGGACCATGACAGACAACTTCTCTTCAAGGTTCTGTCAAGGATT  649

seq1  TTTTTCTCACAGCTCCTCCAGTGCCAATCCCAACCGTAGCTGGTGAGTCA  697
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  TTTTTCTCACAGCTCCTCCAGTGCCAATCCCAACAGTAGCTGGTGAGTCA  699

seq1  GAACCTCCTTCAACTCCTCTCTATCCTCTCCACACCTATTATCACCACAG  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACCTCCTTCAACTCCTCTCTATCCTCTCCACACCTATTATCACCACAG  749

seq1  TCATGGCCATTAGCTCCAGAGTAGGTGGAATTC  780
      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGGCCATTAGCTCCAGAGTAGGTGGAATTC  782