BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-128A15
Chromosome7 (Build37)
Map Location 70,735,028 - 70,878,393
singlet/doubletdoublet
Overlap geneOtud7a, LOC100041386
Upstream geneEG665038, LOC669222, LOC384631, LOC622243, EG622251, Chrna7, LOC545971
Downstream geneLOC665083, Klf13, E030018B13Rik, Trpm1, BB128963, Mtmr15, LOC100041582, Mphosph10, Mcee, Apba2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-128A15.bB6Ng01-128A15.g
ACCDH929995DH929996
length1,0331,076
definitionDH929995|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-128A15, 5' end.DH929996|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-128A15, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(70,735,028 - 70,736,066)(70,877,307 - 70,878,393)
sequence
gaattcactacagagatcttgggatcagagaggactcttcagtaaatatg
atgtgtgtcatggaatcttatagctgcccctgtacctttccctatgccaa
gtaccccaggcctgcctggctgaatctgtccacagcccagatactgctgg
tacctctgtggatgtctgtacctctcagaattgctaccctcttctctagt
acacttagggcttggtatccaagtttgttcactagctctctgctttctga
gccccaattctggtcctccagtccttgggcctttatcctatggtccctga
ctatagaatgcccttgacctgagcagtggagctggaaagcctggcttagt
gagccctctgcaggaacatgtggggactttcaggtcctcggtggttttgg
cacatcttaggatgtgttctctgtgtcctctgtttctcctccttcctctt
cccccgctcattctctttctctcttcctttcttttttctgcctcttttct
ttgtccttctcttccctactttcctcttttctgtcctgcttcctctcatt
tttcctggtggactcctttcctctcctttctttttcccttgttctcagtt
tgtgtttataccctatccctgattctcctacatgggcttaaactcttacc
agtctctgccatagtcccggagaggccttttcactctcctgcccatgggt
tttcccttatcctcggacatttctcagcactgggaacatcttacaggcat
ccatgtgtcactgtttccatcctctgccagtgtctcctaaagcagctggt
tttctcaccaccatgcctaccctgtccttggtagacacaagcatctctga
ccttgtctatgctgcagatccccatgaagggccctgagaacataacggag
ccattggaacgattaagctgcaaacttactttctctctctctcagtcagc
ctggattgctagcctatattctactagcacactaaaaggtcagctcagac
tgagacccagatcttatcagctcctgtttgata
gaattctgccctgggggtagaaggaatttgaatgtacagcctcactctca
caccctccccagccagagtccaagctcctgcctggcctcagggatagagt
tgtcattcaggctgtgagacactaggacagaagactgtgacctagatgtc
cctcatcaacagggacaccctccaagggaagagagtcagagctcttagat
gacaggatcttgtgtaagtctctgcactatgacagtgtacagcgggaggt
agtaaattcttggctttccataccctggggctccaggaatgagttccttg
aagacttcaagggaacaagggtggcccttggggctgggatgactgggaaa
gagctccaggctgtaaatcctaagaaatgcacctttggggggagatccaa
tgttgcattatgtttttctttcttctttttctttcttcctattttgcctt
tttctttggtggccaatggactttagagtccaaattgtggcagcagtcag
aagtcacaaaacctcatatagagccacctaaaagttattctccagcctgc
cacctctttaccttgagaggggtcagaatatttacagagccgcatttgac
accccaggacacagccaccaaaacgaagagctaacatctgcccaccaggt
ttgctcacagtggtcccaccaacaccttcaggatccaggatccatcaggg
ccatgagctttctgctgaggactccctcagcctgcaacgctgctctgtgt
ttcctcaactgcaacacttctgagatgcaaccgcaggcctgggaggtgtc
ttgtggaactttctgagtctgaatctctccattgcctgaccgtgacgtta
gaagacagtctgggcttgtcctctcagtggcgtggtatgcaggttgtcct
acagtggcatggccttggtcactggcttcttccagccacaccttttgagc
tgctcaggccacctacgccatcacattttgtcccacaggagcttgaactc
tgcacgtctccatccttcccaagcctgtggcagcactgggattccggttt
atgtttcattaaatggttataatcca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_70735028_70736066
seq2: B6Ng01-128A15.b_50_1082

seq1  GAATTCACTACAGAGATCTTGGGATCAGAGAGGACTCTTCAGTAAATATG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTACAGAGATCTTGGGATCAGAGAGGACTCTTCAGTAAATATG  50

seq1  ATGTGTGTCATGGAATCTTATAGCTGCCCCTGTACCTTTCCCTATGCCAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGTGTCATGGAATCTTATAGCTGCCCCTGTACCTTTCCCTATGCCAA  100

seq1  GTACCCCAGGCCTGCCTGGCTGAATCTGTCCACAGCCCAGATACTGCTGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACCCCAGGCCTGCCTGGCTGAATCTGTCCACAGCCCAGATACTGCTGG  150

seq1  TACCTCTGTGGATGTCTGTACCTCTCAGAATTGCTACCCTCTTCTCTAGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTCTGTGGATGTCTGTACCTCTCAGAATTGCTACCCTCTTCTCTAGT  200

seq1  ACACTTAGGGCTTGGTATCCAAGTTTGTTCACTAGCTCTCTGCTTTCTGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTTAGGGCTTGGTATCCAAGTTTGTTCACTAGCTCTCTGCTTTCTGA  250

seq1  GCCCCAATTCTGGTCCTCCAGTCCTTGGGCCTTTATCCTATGGTCCCTGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCAATTCTGGTCCTCCAGTCCTTGGGCCTTTATCCTATGGTCCCTGA  300

seq1  CTATAGAATGCCCTTGACCTGAGCAGTGGAGCTGGAAAGCCTGGCTTAGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATAGAATGCCCTTGACCTGAGCAGTGGAGCTGGAAAGCCTGGCTTAGT  350

seq1  GAGCCCTCTGCAGGAACATGTGGGGACTTTCAGGTCCTCGGTGGTTTTGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCCTCTGCAGGAACATGTGGGGACTTTCAGGTCCTCGGTGGTTTTGG  400

seq1  CACATCTTAGGATGTGTTCTCTGTGTCCTCTGTTTCTCCTCCTTCCTCTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATCTTAGGATGTGTTCTCTGTGTCCTCTGTTTCTCCTCCTTCCTCTT  450

seq1  CCCCCGCTCATTCTCTTTCTCTCTTCCTTTCTTTTTTCTGCCTCTTTTCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCGCTCATTCTCTTTCTCTCTTCCTTTCTTTTTTCTGCCTCTTTTCT  500

seq1  TTGTCCTTCTCTTCCCTACTTTCCTCTTTTCTGTCCTGCTTCCTCTCATT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCCTTCTCTTCCCTACTTTCCTCTTTTCTGTCCTGCTTCCTCTCATT  550

seq1  TTTCCTGGTGGACTCCTTTCCTCTCCTTTCTTTTTCCCTTGTTCTCAGTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCTGGTGGACTCCTTTCCTCTCCTTTCTTTTTCCCTTGTTCTCAGTT  600

seq1  TGTGTTTATACCCTATCCCTGATTCTCCTACATGGGCTTAAACTCTTACC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTTTATACCCTATCCCTGATTCTCCTACATGGGCTTAAACTCTTACC  650

seq1  AGTCTCTGCCATAGTCCCGGAGAGGCCTTTTCACTCTCCTGCCCATGGGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTCTGCCATAGTCCCGGAGAGGCCTTTTCACTCTCCTGCCCATGGGT  700

seq1  TTTCCCTTATCCTCGGACATTTCTCAGCACTGGGAACATCTTACAGGCAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCCTTATCCTCGGACATTTCTCAGCACTGGGAACATCTTACAGGCAT  750

seq1  CCATGTGTCACTGTTTCCATCCTCTGCCAGTGTCTCCTAAAGCAGCTGGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGTGTCACTGTTTCCATCCTCTGCCAGTGTCTCCTAAAGCAGCTGGT  800

seq1  TTTCTCACCACCATGCCTACCCTGTCCTTGGTAGACACAAGCATCTCTGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTCACCACCATGCCTACCCTGTCCTTGGTAGACACAAGCATCTCTGA  850

seq1  CCTTGTCTATGCTGCAGATCCCCATGAAGGGCCCTGAGAACATAACGGAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGTCTATGCTGCAGATCCCCATGAAGGGCCCTGAGAACATAACGGAG  900

seq1  CCATTGGAACGATTAAGGCTGCAAACTTACTTTCTCTCTCTCTCCAGTCA  950
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  CCATTGGAACGATTAA-GCTGCAAACTTACTTTCTCTCTCTCT-CAGTCA  948

seq1  GCCTGGATTGCTAGCCTATATTCTTACTAAGCACACTAAAAGGTCAGCTC  1000
      ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGGATTGCTAGCCTATATTC-TACT-AGCACACTAAAAGGTCAGCTC  996

seq1  AGAACTGAGACCCAGATCTTATCAGCTCCCTGTTTGATA  1039
      || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  AG-ACTGAGACCCAGATCTTATCAGCT-CCTGTTTGATA  1033

seq1: chr7_70877307_70878393
seq2: B6Ng01-128A15.g_69_1144 (reverse)

seq1  TGGATTATAAACCATTTAATGAAAACATAAAACCAGAAATCCACAGTGCT  50
      |||||||| |||||||||||| |||||||||  | | ||||| |||||||
seq2  TGGATTAT-AACCATTTAATG-AAACATAAA--CCGGAATCC-CAGTGCT  45

seq1  GCCAACAGGCTTGGGAAGGATTGGAGACGTGCAGAGGTTCCAAGCTCCTG  100
      ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||
seq2  GCC-ACAGGCTTGGGAAGGA-TGGAGACGTGCAGAG--TTCAAGCTCCTG  91

seq1  TGGGACACATGGTGATGGCGTAGGTGGCCTGAGCAGCTCAAAAGGTTGTG  150
      ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  TGGGACAAAATGTGATGGCGTAGGTGGCCTGAGCAGCTCAAAAGG-TGTG  140

seq1  GCTGGAAGAAGCCAGTGACCAAGGCCATGCCACTGTAGGACAACCTGCAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGAAGAAGCCAGTGACCAAGGCCATGCCACTGTAGGACAACCTGCAT  190

seq1  ACCACGCCACCTGAGAGGACAAGCCCAGACTGTCTTCTAACGTCACGGTC  250
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCACGCCA-CTGAGAGGACAAGCCCAGACTGTCTTCTAACGTCACGGTC  239

seq1  AGGCAATGGAGAGATTCAGACTCAGAAAGTTCCACAAGACACCTCCCAGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAATGGAGAGATTCAGACTCAGAAAGTTCCACAAGACACCTCCCAGG  289

seq1  CCTGCGGTTGCATCTCAGAAGTGTTGCAGTTGAGGAAACACAGAGCAGCG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCGGTTGCATCTCAGAAGTGTTGCAGTTGAGGAAACACAGAGCAGCG  339

seq1  TTGCAGGCTGAGGGAGTCCTCAGCAGAAAGCTCATGGCCCTGATGGATCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCAGGCTGAGGGAGTCCTCAGCAGAAAGCTCATGGCCCTGATGGATCC  389

seq1  TGGATCCTGAAGGTGTTGGTGGGACCACTGTGAGCAAACCTGGTGGGCAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATCCTGAAGGTGTTGGTGGGACCACTGTGAGCAAACCTGGTGGGCAG  439

seq1  ATGTTAGCTCTTCGTTTTGGTGGCTGTGTCCTGGGGTGTCAAATGCGGCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTAGCTCTTCGTTTTGGTGGCTGTGTCCTGGGGTGTCAAATGCGGCT  489

seq1  CTGTAAATATTCTGACCCCTCTCAAGGTAAAGAGGTGGCAGGCTGGAGAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTAAATATTCTGACCCCTCTCAAGGTAAAGAGGTGGCAGGCTGGAGAA  539

seq1  TAACTTTTAGGTGGCTCTATATGAGGTTTTGTGACTTCTGACTGCTGCCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTTTTAGGTGGCTCTATATGAGGTTTTGTGACTTCTGACTGCTGCCA  589

seq1  CAATTTGGACTCTAAAGTCCATTGGCCACCAAAGAAAAAGGCAAAATAGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTTGGACTCTAAAGTCCATTGGCCACCAAAGAAAAAGGCAAAATAGG  639

seq1  AAGAAAGAAAAAGAAGAAAGAAAAACATAATGCAACATTGGATCTCCCCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAAGAAAAAGAAGAAAGAAAAACATAATGCAACATTGGATCTCCCCC  689

seq1  CAAAGGTGCATTTCTTAGGATTTACAGCCTGGAGCTCTTTCCCAGTCATC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGGTGCATTTCTTAGGATTTACAGCCTGGAGCTCTTTCCCAGTCATC  739

seq1  CCAGCCCCAAGGGCCACCCTTGTTCCCTTGAAGTCTTCAAGGAACTCATT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCCCCAAGGGCCACCCTTGTTCCCTTGAAGTCTTCAAGGAACTCATT  789

seq1  CCTGGAGCCCCAGGGTATGGAAAGCCAAGAATTTACTACCTCCCGCTGTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGAGCCCCAGGGTATGGAAAGCCAAGAATTTACTACCTCCCGCTGTA  839

seq1  CACTGTCATAGTGCAGAGACTTACACAAGATCCTGTCATCTAAGAGCTCT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGTCATAGTGCAGAGACTTACACAAGATCCTGTCATCTAAGAGCTCT  889

seq1  GACTCTCTTCCCTTGGAGGGTGTCCCTGTTGATGAGGGACATCTAGGTCA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTCTCTTCCCTTGGAGGGTGTCCCTGTTGATGAGGGACATCTAGGTCA  939

seq1  CAGTCTTCTGTCCTAGTGTCTCACAGCCTGAATGACAACTCTATCCCTGA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCTTCTGTCCTAGTGTCTCACAGCCTGAATGACAACTCTATCCCTGA  989

seq1  GGCCAGGCAGGAGCTTGGACTCTGGCTGGGGAGGGTGTGAGAGTGAGGCT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCAGGCAGGAGCTTGGACTCTGGCTGGGGAGGGTGTGAGAGTGAGGCT  1039

seq1  GTACATTCAAATTCCTTCTACCCCCAGGGCAGAATTC  1087
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACATTCAAATTCCTTCTACCCCCAGGGCAGAATTC  1076