BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-128F21
Chromosome7 (Build37)
Map Location 125,862,813 - 125,979,388
singlet/doubletdoublet
Overlap gene6330503K22Rik, 9030624J02Rik
Upstream geneLOC669758, Rps15a, Arl6ip1, 2610207I05Rik, LOC100043339, Syt17, LOC100042845, E030018N11Rik, Coq7, Tmc7, B230311B06Rik, Tmc5, Mir16
Downstream gene2310008H09Rik, Iqck, Gprc5b, Gpr139, LOC100042871, Gp2, Umod, 1700007B13Rik, C730027J19Rik, Acsm2, Acsm1, BC048390, Thumpd1, EG434233, Acsm3, Exod1, 2610020H08Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-128F21.bB6Ng01-128F21.g
ACCDH930237DH930238
length9071,055
definitionDH930237|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-128F21, 5' end.DH930238|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-128F21, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(125,978,481 - 125,979,388)(125,862,813 - 125,863,866)
sequence
gaattccaggctaacctggtcttcatattaagttcctgcctaaacagaaa
gaggagccccctttaggatctgagacaatgactcaattaattcagtgtca
gttacacaagaatgaaacccacatttggacctccaagtgagaaagccagg
tgttggttgtccatgtctataaccgtagtaaaggacaaagggggcagaaa
taggtggatcaccagagctctctggccggcagccagccaagacaactggt
gagctccaggctcagagagagcctctgtcacaaaaacaactggacagtag
aaagacacttgacatcaatttctgtcctccacacacatatgtacacactc
agacacagacagacagacagacagacagacagacacacatgtatcaaaag
tacactgagtggagcccctccctacacacagcagggtcatgtagctatgg
gaagctcctaatttatagtctcccaggaactaacttttaaaactatactc
ctttgttctccatactactgtaatttgcactgactctggtagagcaaatg
ggtagatctgtgcataattaaatgaaggaaagaaccatcggggatgcttt
gtgttcccctctggctgctgctttcaagacaagagagtcccatattctct
ccaggttttgcttgaaaagcaaaaacaaaacatcagaggtacagaagact
tgaacacgggttgtgtttgttttaagatgggatttatgtagcccaggctg
gacctcagacacttatttcagctgagggcaacgtacatacattctatcct
cctggctatctggaatcagtcgagattgtgtgaccaacttgaggccctgt
gggtttaatcaactagagaaagtaagaaaaggagccgtggtggaggaggg
ggtgaga
gaattccttatatagacagggatttcatggactacagatatttggagggc
ctctttcctctaagaaacttgtgattcagttatagatttaagtttttaaa
tttagtttgtctaacctaaggcacattttactggtatactaaaaacatag
ctgttgagtattaaagatatgaactatgcaaggttctatggcagaatagt
ccatgtcacttaaacctgggagcatgtccgtggaccccaggaatatgcac
ttctttaggtttattttcatcctgaggttgtcaccatgtacacttgtatt
gtttatcacccagtacctggagatcattatgtgtcttgggacttagaagg
tgaaactcaagtgccatatagtctagcaaaacaaaacaaaacaaaacaaa
agcccataaaaacaacccctccagatttttagtattcaggatgtaatgag
ctctcactttttcctacttggtctctgaggcccacatcatgagttgttct
catcctactgtgtctgtcggctgctgacctacttgtctgaaaacatacag
cttgctgtcttcactggctgtcactgatctgattaaagttggctttgtat
gctgagttctaagttgaaaatttctaattgttagaaacataaacaacatg
gatgaactatcatttactccagaaacaccccatcttatggagagggttgt
ttttaagccaacacgttttttccagctggtatccacagaggggtcacaga
gagaaagatcctcagcaaggtagaggcagggtgcttgtctcggaaccaaa
gctcctcagagtgttttttgttttgtttttgagtcagggtcttactaggt
cgccttgtatagacatgtacctgctgcctcctgcctctgcttcagtgagt
tctggaattaaaggggtgtctactattcccagctaaaacttttttaaaag
tctcatttttaaattttgtttgtatgtatatttgtgcatcatgtgtgtgt
ctggggcctgtgcaggccagaagaaagctttaggtcctcctaaaactgaa
gttag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_125978481_125979388
seq2: B6Ng01-128F21.b_48_954 (reverse)

seq1  TCTCACCCCCTCCTCCACCACGGCTCCTTTTCTTTACTTTCTCTAGTTGA  50
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TCTCACCCCCTCCTCCACCACGGCTCCTTTTC-TTACTTTCTCTAGTTGA  49

seq1  TTAAACCCACAGGGCCTCAAGTTGGTCACACAATCTCGACTGATTCCAGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAACCCACAGGGCCTCAAGTTGGTCACACAATCTCGACTGATTCCAGA  99

seq1  TAGCCAGGAGGATAGAATGTATGTACGTTGCCCTCAGCTGAAATAAGTGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCCAGGAGGATAGAATGTATGTACGTTGCCCTCAGCTGAAATAAGTGT  149

seq1  CTGAGGTCCAGCCTGGGCTACATAAATCCCATCTTAAAACAAACACAACC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGGTCCAGCCTGGGCTACATAAATCCCATCTTAAAACAAACACAACC  199

seq1  CGTGTTCAAGTCTTCTGTACCTCTGATGTTTTGTTTTTGCTTTTCAAGCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGTTCAAGTCTTCTGTACCTCTGATGTTTTGTTTTTGCTTTTCAAGCA  249

seq1  AAACCTGGAGAGAATATGGGACTCTCTTGTCTTGAAAGCAGCAGCCAGAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCTGGAGAGAATATGGGACTCTCTTGTCTTGAAAGCAGCAGCCAGAG  299

seq1  GGGAACACAAAGCATCCCCGATGGTTCTTTCCTTCATTTAATTATGCACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAACACAAAGCATCCCCGATGGTTCTTTCCTTCATTTAATTATGCACA  349

seq1  GATCTACCCATTTGCTCTACCAGAGTCAGTGCAAATTACAGTAGTATGGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTACCCATTTGCTCTACCAGAGTCAGTGCAAATTACAGTAGTATGGA  399

seq1  GAACAAAGGAGTATAGTTTTAAAAGTTAGTTCCTGGGAGACTATAAATTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACAAAGGAGTATAGTTTTAAAAGTTAGTTCCTGGGAGACTATAAATTA  449

seq1  GGAGCTTCCCATAGCTACATGACCCTGCTGTGTGTAGGGAGGGGCTCCAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCTTCCCATAGCTACATGACCCTGCTGTGTGTAGGGAGGGGCTCCAC  499

seq1  TCAGTGTACTTTTGATACATGTGTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTGTACTTTTGATACATGTGTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGT  549

seq1  CTGTGTCTGAGTGTGTACATATGTGTGTGGAGGACAGAAATTGATGTCAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGTCTGAGTGTGTACATATGTGTGTGGAGGACAGAAATTGATGTCAA  599

seq1  GTGTCTTTCTACTGTCCAGTTGTTTTTGTGACAGAGGCTCTCTCTGAGCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCTTTCTACTGTCCAGTTGTTTTTGTGACAGAGGCTCTCTCTGAGCC  649

seq1  TGGAGCTCACCAGTTGTCTTGGCTGGCTGCCGGCCAGAGAGCTCTGGTGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGCTCACCAGTTGTCTTGGCTGGCTGCCGGCCAGAGAGCTCTGGTGA  699

seq1  TCCACCTATTTCTGCCCCCTTTGTCCTTTACTACGGTTATAGACATGGAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACCTATTTCTGCCCCCTTTGTCCTTTACTACGGTTATAGACATGGAC  749

seq1  AACCAACACCTGGCTTTCTCACTTGGAGGTCCAAATGTGGGTTTCATTCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCAACACCTGGCTTTCTCACTTGGAGGTCCAAATGTGGGTTTCATTCT  799

seq1  TGTGTAACTGACACTGAATTAATTGAGTCATTGTCTCAGATCCTAAAGGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTAACTGACACTGAATTAATTGAGTCATTGTCTCAGATCCTAAAGGG  849

seq1  GGCTCCTCTTTCTGTTTAGGCAGGAACTTAATATGAAGACCAGGTTAGCC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTCCTCTTTCTGTTTAGGCAGGAACTTAATATGAAGACCAGGTTAGCC  899

seq1  TGGAATTC  908
      ||||||||
seq2  TGGAATTC  907

seq1: chr7_125862813_125863866
seq2: B6Ng01-128F21.g_65_1119

seq1  GAATTCCTTATATAGACAGGGATTTCATGGACTACAGATATTTGGAGGGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTATATAGACAGGGATTTCATGGACTACAGATATTTGGAGGGC  50

seq1  CTCTTTCCTCTAAGAAACTTGTGATTCAGTTATAGATTTAAGTTTTTAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTTCCTCTAAGAAACTTGTGATTCAGTTATAGATTTAAGTTTTTAAA  100

seq1  TTTAGTTTGTCTAACCTAAGGCACATTTTACTGGTATACTAAAAACATAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGTTTGTCTAACCTAAGGCACATTTTACTGGTATACTAAAAACATAG  150

seq1  CTGTTGAGTATTAAAGATATGAACTATGCAAGGTTCTATGGCAGAATAGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTGAGTATTAAAGATATGAACTATGCAAGGTTCTATGGCAGAATAGT  200

seq1  CCATGTCACTTAAACCTGGGAGCATGTCCGTGGACCCCAGGAATATGCAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGTCACTTAAACCTGGGAGCATGTCCGTGGACCCCAGGAATATGCAC  250

seq1  TTCTTTAGGTTTATTTTCATCCTGAGGTTGTCACCATGTACACTTGTATT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTTAGGTTTATTTTCATCCTGAGGTTGTCACCATGTACACTTGTATT  300

seq1  GTTTATCACCCAGTACCTGGAGATCATTATGTGTCTTGGGACTTAGAAGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTATCACCCAGTACCTGGAGATCATTATGTGTCTTGGGACTTAGAAGG  350

seq1  TGAAACTCAAGTGCCATATAGTCTAGCAAAACAAAACAAAACAAAACAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAACTCAAGTGCCATATAGTCTAGCAAAACAAAACAAAACAAAACAAA  400

seq1  AGCCCATAAAAACAACCCCTCCAGATTTTTAGTATTCAGGATGTAATGAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCATAAAAACAACCCCTCCAGATTTTTAGTATTCAGGATGTAATGAG  450

seq1  CTCTCACTTTTTCCTACTTGGTCTCTGAGGCCCACATCATGAGTTGTTCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCACTTTTTCCTACTTGGTCTCTGAGGCCCACATCATGAGTTGTTCT  500

seq1  CATCCTACTGTGTCTGTCGGCTGCTGACCTACTTGTCTGAAAACATACAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCTACTGTGTCTGTCGGCTGCTGACCTACTTGTCTGAAAACATACAG  550

seq1  CTTGCTGTCTTCACTGGCTGTCACTGATCTGATTAAAGTTGGCTTTGTAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCTGTCTTCACTGGCTGTCACTGATCTGATTAAAGTTGGCTTTGTAT  600

seq1  GCTGAGTTCTAAGTTGAAAATTTCTAATTGTTAGAAACATAAACAACATG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGAGTTCTAAGTTGAAAATTTCTAATTGTTAGAAACATAAACAACATG  650

seq1  GATGAACTATCATTTACTCCAGAAACACCCCATCTTATGGAGAGGGTTGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGAACTATCATTTACTCCAGAAACACCCCATCTTATGGAGAGGGTTGT  700

seq1  TTTTAAGCCAACACGTTTTTTCCAGCTGGTATCCACAGAGGGGTCACAGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAAGCCAACACGTTTTTTCCAGCTGGTATCCACAGAGGGGTCACAGA  750

seq1  GAGAAAGATCCTCAGCAAGGTAGAGGCAGGGTGCTTGTCTCGGAACCAAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAAGATCCTCAGCAAGGTAGAGGCAGGGTGCTTGTCTCGGAACCAAA  800

seq1  GCTCCTCAGAGTGTTTTTTGTTTTGTTTTTGAGTCAGGGTCTTACTAGGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCTCAGAGTGTTTTTTGTTTTGTTTTTGAGTCAGGGTCTTACTAGGT  850

seq1  CGCCTTGTATAGACATGTACCTGCTGCCTCCTGCCTCTGCTTCAGTGAGT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCCTTGTATAGACATGTACCTGCTGCCTCCTGCCTCTGCTTCAGTGAGT  900

seq1  TCTGGAATTAAAGGGGTGTCTACTATTCCCAGCTAAAACTTTTTTAAAAG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGAATTAAAGGGGTGTCTACTATTCCCAGCTAAAACTTTTTTAAAAG  950

seq1  TCTCATTTTTATATTTTGTTTGTATGTATATTTGTGCATCATGTGTGTGT  1000
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCATTTTTAAATTTTGTTTGTATGTATATTTGTGCATCATGTGTGTGT  1000

seq1  CTGGTGCCTGTGCAGGCCAGAAGAGAGCTTTAGGT-CTCCTAGAACTGAA  1049
      |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||
seq2  CTGGGGCCTGTGCAGGCCAGAAGAAAGCTTTAGGTCCTCCTAAAACTGAA  1050

seq1  GTTAG  1054
      |||||
seq2  GTTAG  1055