BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-128G05
Chromosome7 (Build37)
Map Location 129,335,428 - 129,485,731
singlet/doubletdoublet
Overlap gene2010110P09Rik, Prkcb1
Upstream geneLOC668556, Hs3st2, Usp31, Scnn1g, Scnn1b, Cog7, Gga2, Ears2, Ubfd1, Ndufab1, Palb2, Dctn5, Plk1, Ern2
Downstream geneLOC668486, Cacng3, 4930413G21Rik, Rbbp6, LOC628696, LOC100042977, LOC100042981, Tnrc6a, Slc5a11, Arhgap17
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-128G05.bB6Ng01-128G05.g
ACCDH930251DH930252
length1,101826
definitionDH930251|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-128G05, 5' end.DH930252|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-128G05, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(129,335,428 - 129,336,534)(129,484,905 - 129,485,731)
sequence
gaattccttccacttgacaaaaggagcttaaaataacagttaagcttgta
tccagtctatgcatttctatgatgttgtaaagacacgcttttaagggctg
gggtggtgctcagtggttcttgtagaacacatatgaggtgctagcccggg
caccatcccagccctacaacaaacaaacaaagctaacaaatgtcatgccc
ctctctgcagcagagcatatgtcctaaagtgttcctaatactcacctcgc
caaatgtctgcaccacagagtcaaatggctgtggaaaagagagcggtcag
gtccttaggagctgaagacacaggagggtgtgagctccctgatgctgaac
tcaagtcctccggaagagtagcaagtgcctttaaccactggccgtctctc
cagatccctgaaaatacatctctgctgagcatgctcagacagttttcttg
tcattcctgaaacaacacagtaaaataggtgttcacatatcacttacacg
gtattttggtatttggtattatggacaaagtagaggtgatttaaggtgcc
tatgtataggttatatgcaagacctaaaccaattttattattagcttgag
ctcctgtagatgtcattatccctgtcgatcttggagtcaatgttgtggac
actgagggatggctgtacacacatccgtggcttttaaaatggaaataata
ttagaatcctaagtgctataaagagaaatactcaggaatcaatttaatta
gaaaggcacaggatttacatgaagaagattttaaacatttatgaaggatt
ttaaactatgaacaagtgggaagatgacttcctggtgtagggaggcaaca
taactaaagcctcaattctcaccaagttagaagagcagtgtaatgaaatt
cttagggaattacattttttagagctaagatccccagaaacagtaatgat
ttcttgggtgtggtggtgtatgccgttagtcatagcactaggaagccaag
tgagtttcagccaagactggtctacattagtgagcgagatcagaggcctg
tcttgtagttatccacgctatgatggagccccaatttaatttaattttag
c
gaattcaaacaaaactcccaggagcgaagccttctgatgggcctggaaaa
gtctctgtgaccacaagagacttgagagcaaggatcctcacaagctcagg
caactgtctgtggctccaggaagcaactcagatctcccttggcatctcca
aggcacaggcagcagaaatctggcttgccctgcctgtctctctcccacag
cttcctcctcttctaattccctcttctctccatctattcactctcctctt
ctgctctcggagctgcttcctgcagacaaaaacaccccacaacttccagt
ctgcatagagattgcagccagcaggctccaaaagctgataattctcccaa
tcaagcagcaggtgcccccgttgagttaatgaatttttctaagcaagaga
actcatgccttctacttaatctcaggagaaagcccattgggaaagatggt
gggtgcagcccatcgtgaaagatcggtggcagagaagggggcccttgcta
tgctctatgaaacacgagcaatttgggaagatgatactgcaaaccctcag
agccttgggatgatagacgcaattaatattttcatactacccttaggaat
tatgctttgattaggaaagaaattaatcctgtagattaaagaaagaagtt
gcaatatggggaagaaataggtgactctttcagtgcaggtgactcacggg
gaaaggaggggtgcccacaaggaccaaaactggagcagtaaggaatgcac
agtgagtagatccagagtgggtaggtgtacttgtgcacatgctctgtgtg
tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_129335428_129336534
seq2: B6Ng01-128G05.b_49_1149

seq1  GAATTCCTTCCACTTGACAAAAGGAGCTTAAAATAACAGTTAAGCTTGTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTCCACTTGACAAAAGGAGCTTAAAATAACAGTTAAGCTTGTA  50

seq1  TCCAGTCTATGCATTTCTATGATGTTGTAAAGACACGCTTTTAAGGGCTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGTCTATGCATTTCTATGATGTTGTAAAGACACGCTTTTAAGGGCTG  100

seq1  GGGTGGTGCTCAGTGGTTCTTGTAGAACACATATGAGGTGCTAGCCCGGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTGGTGCTCAGTGGTTCTTGTAGAACACATATGAGGTGCTAGCCCGGG  150

seq1  CACCATCCCAGCCCTACAACAAACAAACAAAGCTAACAAATGTCATGCCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCATCCCAGCCCTACAACAAACAAACAAAGCTAACAAATGTCATGCCC  200

seq1  CTCTCTGCAGCAGAGCATATGTCCTAAAGTGTTCCTAATACTCACCTCGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTGCAGCAGAGCATATGTCCTAAAGTGTTCCTAATACTCACCTCGC  250

seq1  CAAATGTCTGCACCACAGAGTCAAATGGCTGTGGAAAAGAGAGCGGTCAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATGTCTGCACCACAGAGTCAAATGGCTGTGGAAAAGAGAGCGGTCAG  300

seq1  GTCCTTAGGAGCTGAAGACACAGGAGGGTGTGAGCTCCCTGATGCTGAAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTTAGGAGCTGAAGACACAGGAGGGTGTGAGCTCCCTGATGCTGAAC  350

seq1  TCAAGTCCTCCGGAAGAGTAGCAAGTGCCTTTAACCACTGGCCGTCTCTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGTCCTCCGGAAGAGTAGCAAGTGCCTTTAACCACTGGCCGTCTCTC  400

seq1  CAGATCCCTGAAAATACATCTCTGCTGAGCATGCTCAGACAGTTTTCTTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATCCCTGAAAATACATCTCTGCTGAGCATGCTCAGACAGTTTTCTTG  450

seq1  TCATTCCTGAAACAACACAGTAAAATAGGTGTTCACATATCACTTACACG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTCCTGAAACAACACAGTAAAATAGGTGTTCACATATCACTTACACG  500

seq1  GTATTTTGGTATTTGGTATTATGGACAAAGTAGAGGTGATTTAAGGTGCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTTTGGTATTTGGTATTATGGACAAAGTAGAGGTGATTTAAGGTGCC  550

seq1  TATGTATAGGTTATATGCAAGACCTAAACCAATTTTATTATTAGCTTGAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTATAGGTTATATGCAAGACCTAAACCAATTTTATTATTAGCTTGAG  600

seq1  CTCCTGTAGATGTCATTATCCCTGTCGATCTTGGAGTCAATGTTGTGGAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTGTAGATGTCATTATCCCTGTCGATCTTGGAGTCAATGTTGTGGAC  650

seq1  ACTGAGGGATGGCTGTACACACATCCGTGGCTTTTAAAATGGAAATAATA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAGGGATGGCTGTACACACATCCGTGGCTTTTAAAATGGAAATAATA  700

seq1  TTAGAATCCTAAGTGCTATAAAGAGAAATACTCAGGAATCAATTTAATTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGAATCCTAAGTGCTATAAAGAGAAATACTCAGGAATCAATTTAATTA  750

seq1  GAAAGGCACAGGATTTACATGAAGAAGATTTTAAACATTTATGAAGGATT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGGCACAGGATTTACATGAAGAAGATTTTAAACATTTATGAAGGATT  800

seq1  TTAAACTATGAACAAGTGGGAAGATGACTTCCTGGTGTAGGGAGGCAACA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAACTATGAACAAGTGGGAAGATGACTTCCTGGTGTAGGGAGGCAACA  850

seq1  TAACTAAAGCCTCAATTCTCACCAAGTTAGAAGAGCAGTGTAATGAAATT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTAAAGCCTCAATTCTCACCAAGTTAGAAGAGCAGTGTAATGAAATT  900

seq1  CTTAGGGAATTACATTTTTTAGAGCTAAAGATCCCCAGAAACAGTAATGA  950
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGGGAATTACATTTTTTAGAGCT-AAGATCCCCAGAAACAGTAATGA  949

seq1  TTTC-TGGGTGTGGTGGTGTATGCCGTTAGTCATAGCACTAGGGAAGCCA  999
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  TTTCTTGGGTGTGGTGGTGTATGCCGTTAGTCATAGCACTA-GGAAGCCA  998

seq1  AGTGAGTTTCAGGCAAGACTGGTCTACA-TAGTGAGCGCAGATCAGAGGG  1048
      |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| 
seq2  AGTGAGTTTCAGCCAAGACTGGTCTACATTAGTGAGCG-AGATCAGAGG-  1046

seq1  CCTTGTCTTGTTAGCTATCACAGCATAGAGTGAAGCCACAATATTAATTT  1098
       | ||||||| ||| |||| ||   ||   || |||| |||| |||||||
seq2  -CCTGTCTTG-TAGTTATC-CACGCTATGATGGAGCCCCAAT-TTAATTT  1092

seq1  AATTTTAGC  1107
      |||||||||
seq2  AATTTTAGC  1101

seq1: chr7_129484905_129485731
seq2: B6Ng01-128G05.g_68_893 (reverse)

seq1  CACACACACACACACACACACACACACACACAGAGCATGTGCACAAGTAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACACACACACACACACACACACACACAGAGCATGTGCACAAGTAC  50

seq1  ACCTACCCACTCTGGATCTACTCACTGTGCATTCCTTACCTGCTCCAGTT  100
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  ACCTACCCACTCTGGATCTACTCACTGTGCATTCCTTA-CTGCTCCAGTT  99

seq1  TTGGTCCTTGTGGGCACCCCTCCTTTCCCCGTGAGTCACCTGCACTGAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTCCTTGTGGGCACCCCTCCTTTCCCCGTGAGTCACCTGCACTGAAA  149

seq1  GAGTCACCTATTTCTTCCCCATATTGCAACTTCTTTCTTTAATCTACAGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCACCTATTTCTTCCCCATATTGCAACTTCTTTCTTTAATCTACAGG  199

seq1  ATTAATTTCTTTCCTAATCAAAGCATAATTCCTAAGGGTAGTATGAAAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAATTTCTTTCCTAATCAAAGCATAATTCCTAAGGGTAGTATGAAAAT  249

seq1  ATTAATTGCGTCTATCATCCCAAGGCTCTGAGGGTTTGCAGTATCATCTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAATTGCGTCTATCATCCCAAGGCTCTGAGGGTTTGCAGTATCATCTT  299

seq1  CCCAAATTGCTCGTGTTTCATAGAGCATAGCAAGGGCCCCCTTCTCTGCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAAATTGCTCGTGTTTCATAGAGCATAGCAAGGGCCCCCTTCTCTGCC  349

seq1  ACCGATCTTTCACGATGGGCTGCACCCACCATCTTTCCCAATGGGCTTTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCGATCTTTCACGATGGGCTGCACCCACCATCTTTCCCAATGGGCTTTC  399

seq1  TCCTGAGATTAAGTAGAAGGCATGAGTTCTCTTGCTTAGAAAAATTCATT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGAGATTAAGTAGAAGGCATGAGTTCTCTTGCTTAGAAAAATTCATT  449

seq1  AACTCAACGGGGGCACCTGCTGCTTGATTGGGAGAATTATCAGCTTTTGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCAACGGGGGCACCTGCTGCTTGATTGGGAGAATTATCAGCTTTTGG  499

seq1  AGCCTGCTGGCTGCAATCTCTATGCAGACTGGAAGTTGTGGGGTGTTTTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTGCTGGCTGCAATCTCTATGCAGACTGGAAGTTGTGGGGTGTTTTT  549

seq1  GTCTGCAGGAAGCAGCTCCGAGAGCAGAAGAGGAGAGTGAATAGATGGAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGCAGGAAGCAGCTCCGAGAGCAGAAGAGGAGAGTGAATAGATGGAG  599

seq1  AGAAGAGGGAATTAGAAGAGGAGGAAGCTGTGGGAGAGAGACAGGCAGGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGAGGGAATTAGAAGAGGAGGAAGCTGTGGGAGAGAGACAGGCAGGG  649

seq1  CAAGCCAGATTTCTGCTGCCTGTGCCTTGGAGATGCCAAGGGAGATCTGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCCAGATTTCTGCTGCCTGTGCCTTGGAGATGCCAAGGGAGATCTGA  699

seq1  GTTGCTTCCTGGAGCCACAGACAGTTGCCTGAGCTTGTGAGGATCCTTGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGCTTCCTGGAGCCACAGACAGTTGCCTGAGCTTGTGAGGATCCTTGC  749

seq1  TCTCAAGTCTCTTGTGGTCACAGAGACTTTTCCAGGCCCATCAGAAGGCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCAAGTCTCTTGTGGTCACAGAGACTTTTCCAGGCCCATCAGAAGGCT  799

seq1  TCGCTCCTGGGAGTTTTGTTTGAATTC  827
      |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGCTCCTGGGAGTTTTGTTTGAATTC  826