BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-128I15
Chromosome7 (Build37)
Map Location 141,468,055 - 141,604,796
singlet/doubletdoublet
Overlap gene4933400E14Rik
Upstream geneLOC668747, 4930404H21Rik, LOC100043237, 2700050L05Rik, Mmp21, Uros, Bccip, Dhx32, LOC100043695, Fank1, Adam12, A130023I24Rik
Downstream geneLOC100043248, LOC100043699, LOC668750, Dock1, B830028B13Rik, EG668693, LOC100043254, Foxi2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-128I15.bB6Ng01-128I15.g
ACCDH930363DH930364
length1,1761,158
definitionDH930363|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-128I15, 5' end.DH930364|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-128I15, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(141,468,055 - 141,469,240)(141,603,643 - 141,604,796)
sequence
gaattctagacttgaattacagctgtctgcctgcctcctttccccaaagt
ggcataagcttccaagacaaggagggtctcttttctatccatctatactg
cccaggtcagcacccctttccctccctgtccacactctacacctctaacg
ggaaaacataagatgccccaggttgatacttcctgcctagcccagcaagg
gacaaagggatcaagcaattatcattagttccctctaaaagccagaggga
ttaccaaagaggactagcctaaagagtgccaaggacacatgggtccatga
accacatttacagaaaccccattaactagtgttggcaacaacagagggtg
ccaaactaaaccagatcactatttgcattgagcctaggaggcccaaagta
aactccaaagggtgtcaacatccaaagaaaactatatgcctgttgtcccc
tggagcttctacaatgtttaggaaatagaatgaactccacttggaagatg
ggctgtttcactgggccttaaaatttaatgacctccaattcttaatgacc
taactcaacaagacagggaatcctatataaaggtaatataagcatgcata
aattaaatattatgcttttatgatgtacacagggtcatttgtttgtcttg
tgagtctgatagctaagtctaacttgtactggatccatgttactgtggca
gaaggtagtgtgaaggataagaaacaagtcaagttcacctgtgggcttca
cagcgttgagacaggaatgccagaccaaggatgctcaattgaattggcac
ttacaatgaataacaaagcccttatagacatcttagatgctgcatggaac
ctaatcattttgaggagtttactgtggttcatctgaacgccactccaaga
tagataattgtgagagttaagtatttgatccagactgcagatgcatgtga
ccagctacctccagctctaccaccattgccccacaccccgacataatggc
tgcactcctagactgatgagcctgtcttcctggagcttctttctcgttat
ttgatcacaggatggaggaagtatcagacaaatcagtattcacatttcat
tagctgatcagagctgtgctttgggtgatcatggaagctttgatgcatga
cacacagcatcaggctccatgtgaat
cttctcctaggaactctggcgtctttcttgtctaacttcttttcagcaaa
atagcttcagtgagcctgtaagacacagcacccttgagagtgatttgtaa
gagctcaaaaaacccttcctgggatttccctgagataaatctagtgaata
ttagtgcaccattcccgttttcagaaattctctaagaaccttagatagtc
tctaaattttcctaattaagttttaaagtcacttcttttattgcttaaaa
atcattgagcgctatatcatgttaccacgaagtaaaacggcactaactgg
gtcataatatattaacttcttggggtccatttaaatacattcacatcctg
aaacctaaagaagctggcccaggaagttaaaggcaagcaagactgttccc
aaggttccctctgagctgtgctgtagagaatcaggtatctctctgctgat
cagcagcaactataatgaagtgcctgccccaaggagttcctgggactgca
ggcataaagtgtgctgggcaggagaattacaaaggatgataacacagcgt
cagctgggtctactctaagtgggagagcatggttagcgtggagtgaggca
ggagggaagaaacgccagccttcctggtgagttcctggcttatttaattt
tttaaagagtttttttttttttagatgcactcagttgcctgtggttcttc
taaagactataataaatcattgactagagccatccctgcaatgtgctggt
tcccagctcaaaagaatgatcacgtttctccccctgcccctctgctcttc
tattgtatcttagttttaaagaaagcttggaggaacacatacttactttt
ccctctccctgccgagttgaggatggagcacagggccctggaagatgctt
cttggctgtgtccccggctcaatacttaacttttcttctgcctcagagtg
cctccaggagtggaggatttgtctaaattgatttcctgtgctaagggttg
gctttaatgaggatatggcctagaacaccatttcagcgtggtttttggtt
tgcagagcttcttaggagcaatctcattagattcttctgcccggagctgc
ccagcatgttgtttcggtagaataggggtaccacctctgtgaatctctct
ttaatttc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_141468055_141469240
seq2: B6Ng01-128I15.b_50_1225

seq1  GAATTCTAGACTTGAATTACAGCTGTCTGCCTGCCTCCTTTCCCCAAAGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTAGACTTGAATTACAGCTGTCTGCCTGCCTCCTTTCCCCAAAGT  50

seq1  GGCATAAGCTTCCAAGACAAGGAGGGTCTCTTTTCTATCCATCTATACTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCATAAGCTTCCAAGACAAGGAGGGTCTCTTTTCTATCCATCTATACTG  100

seq1  CCCAGGTCAGCACCCCTTTCCCTCCCTGTCCACACTCTACACCTCTAACG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGGTCAGCACCCCTTTCCCTCCCTGTCCACACTCTACACCTCTAACG  150

seq1  GGAAAACATAAGATGCCCCAGGTTGATACTTCCTGCCTAGCCCAGCAAGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAACATAAGATGCCCCAGGTTGATACTTCCTGCCTAGCCCAGCAAGG  200

seq1  GACAAAGGGATCAAGCAATTATCATTAGTTCCCTCTAAAAGCCAGAGGGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAAAGGGATCAAGCAATTATCATTAGTTCCCTCTAAAAGCCAGAGGGA  250

seq1  TTACCAAAGAGGACTAGCCTAAAGAGTGCCAAGGACACATGGGTCCATGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACCAAAGAGGACTAGCCTAAAGAGTGCCAAGGACACATGGGTCCATGA  300

seq1  ACCACATTTACAGAAACCCCATTAACTAGTGTTGGCAACAACAGAGGGTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCACATTTACAGAAACCCCATTAACTAGTGTTGGCAACAACAGAGGGTG  350

seq1  CCAAACTAAACCAGATCACTATTTGCATTGAGCCTAGGAGGCCCAAAGTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAACTAAACCAGATCACTATTTGCATTGAGCCTAGGAGGCCCAAAGTA  400

seq1  AACTCCAAAGGGTGTCAACATCCAAAGAAAACTATATGCCTGTTGTCCCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCCAAAGGGTGTCAACATCCAAAGAAAACTATATGCCTGTTGTCCCC  450

seq1  TGGAGCTTCTACAATGTTTAGGAAATAGAATGAACTCCACTTGGAAGATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGCTTCTACAATGTTTAGGAAATAGAATGAACTCCACTTGGAAGATG  500

seq1  GGCTGTTTCACTGGGCCTTAAAATTTAATGACCTCCAATTCTTAATGACC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGTTTCACTGGGCCTTAAAATTTAATGACCTCCAATTCTTAATGACC  550

seq1  TAACTCAACAAGACAGGGAATCCTATATAAAGGTAATATAAGCATGCATA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTCAACAAGACAGGGAATCCTATATAAAGGTAATATAAGCATGCATA  600

seq1  AATTAAATATTATGCTTTTATGATGTACACAGGGTCATTTGTTTGTCTTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTAAATATTATGCTTTTATGATGTACACAGGGTCATTTGTTTGTCTTG  650

seq1  TGAGTCTGATAGCTAAGTCTAACTTGTACTGGATCCATGTTACTGTGGCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTCTGATAGCTAAGTCTAACTTGTACTGGATCCATGTTACTGTGGCA  700

seq1  GAAGGTAGTGTGAAGGATAAGAAACAAGTCAAGTTCACCTGTGGGCTTCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGTAGTGTGAAGGATAAGAAACAAGTCAAGTTCACCTGTGGGCTTCA  750

seq1  CAGCGTTGAGACAGGAATGCCAGACCAAGGATGCTCAATTGAATTGGCAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCGTTGAGACAGGAATGCCAGACCAAGGATGCTCAATTGAATTGGCAC  800

seq1  TTACAATGAATAACAAAGCCCTTATAGACATCTTAGATGCTGCATGGAAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAATGAATAACAAAGCCCTTATAGACATCTTAGATGCTGCATGGAAC  850

seq1  CTAATCA-TTTGAGGAGTTTACTGTGGTTCATCTGAAACGCCACTCCAAG  899
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  CTAATCATTTTGAGGAGTTTACTGTGGTTCATCTG-AACGCCACTCCAAG  899

seq1  ATAGATAA-TGTGAGAGTTAAGTA-TTGATCCAGACTGCAGATGCAATGT  947
      |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||
seq2  ATAGATAATTGTGAGAGTTAAGTATTTGATCCAGACTGCAGATGC-ATGT  948

seq1  GACCAGCTACCTCCAGCTCTACCACCA-TGCCCCACACCCCGACATAATG  996
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  GACCAGCTACCTCCAGCTCTACCACCATTGCCCCACACCCCGACATAATG  998

seq1  GCTGCACTCCTAGACTGATGAGCCTGTCCTTCCTGGAGCTTCTTTTCTCG  1046
      ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||
seq2  GCTGCACTCCTAGACTGATGAGCCTGT-CTTCCTGGAGCTTC-TTTCTCG  1046

seq1  TGTATTTGATCACAGGAATGAGGAAAGTATCAGACACACCAGTATTCAAC  1096
      | |||||||||||||||  |||| |||||||||||| | |||||||| ||
seq2  T-TATTTGATCACAGGATGGAGG-AAGTATCAGACAAATCAGTATTC-AC  1093

seq1  ATTTCCATTAGCTGAATCAGAAGCTGTGCTTTGTGTGATCATGGAAGCTC  1146
      |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| 
seq2  ATTT-CATTAGCTG-ATCAG-AGCTGTGCTTTGGGTGATCATGGAAGCT-  1139

seq1  TTGATGCCATGACAACACAGCATCAGGGCTCCATGTGAAT  1186
      |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||
seq2  TTGATG-CATGAC-ACACAGCATCA-GGCTCCATGTGAAT  1176

seq1: chr7_141603643_141604796
seq2: B6Ng01-128I15.g_74_1231 (reverse)

seq1  GAAACTAAAAGAGAAGTTCACAGAGGTGTGACAACTTATCTCACCG-AAC  49
      |||| | |||||||  ||||||||||||  ||  ||  ||| |||| |||
seq2  GAAA-TTAAAGAGAGATTCACAGAGGTGGTACCCCTATTCT-ACCGAAAC  48

seq1  AACCTGCTGGGCAGCTCC-GGCAGACAGATCCTAATGAG-TTGCT-CTAA  96
      ||| |||||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| ||||
seq2  AACATGCTGGGCAGCTCCGGGCAGA-AGAATCTAATGAGATTGCTCCTAA  97

seq1  G-AGCTCTGCCAACC-AAAACCACGCTGAAA-GTGGTTCTAGCCCTTATC  143
      | |||||||| |||| ||||||||||||||| |  ||||||| || ||||
seq2  GAAGCTCTGCAAACCAAAAACCACGCTGAAATGGTGTTCTAGGCCATATC  147

seq1  CTCATTAAAGCCAACCCTTAGCACGAGGAAATCAATTTAGAACAAATCCT  193
      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||
seq2  CTCATTAAAGCCAACCCTTAGCAC-AGGAAATCAATTTAG-ACAAATCCT  195

seq1  ACAACTCCTGAAGCCACTCTGAGGCAGAGGAAAAGTTAAGTATGGAGCCG  243
       | ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||
seq2  -CCACTCCTGGAGGCACTCTGAGGCAGAAGAAAAGTTAAGTATTGAGCCG  244

seq1  GGGACACAGCCAAGAAGCATCTT-CAGGGCCCTGTGCTCCATCCTCAACT  292
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGACACAGCCAAGAAGCATCTTCCAGGGCCCTGTGCTCCATCCTCAACT  294

seq1  CGGCAGGGAGAGGGAAAAGTAAGTATGTGTTTCCTCCAAGCTTTCTTTAA  342
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  CGGCAGGGAGAGGGAAAAGTAAGTATGTG-TTCCTCCAAGCTTTCTTTAA  343

seq1  AACTAAGATACAATAGAAGAGCAGAGGGGCAGGGGGAGAAACGTGATCAT  392
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTAAGATACAATAGAAGAGCAGAGGGGCAGGGGGAGAAACGTGATCAT  393

seq1  TCTTTTGAGCTGGGAACCAGCACATTGCAGGGATGGCTCTAGTCAATGAT  442
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTTGAGCTGGGAACCAGCACATTGCAGGGATGGCTCTAGTCAATGAT  443

seq1  TTATTATAGTCTTTAGAAGAACCACAGGCAACTGAGTGCATCT--AAAAA  490
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||
seq2  TTATTATAGTCTTTAGAAGAACCACAGGCAACTGAGTGCATCTAAAAAAA  493

seq1  AAAAAACTCTTT-AAAAATTAAATAAGCCAGGAACTCACCAGGAAGGCTG  539
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAACTCTTTAAAAAATTAAATAAGCCAGGAACTCACCAGGAAGGCTG  543

seq1  GCGTTTCTTCCCTCCTGCCTCACTCCACGCTAACCATGCTCTCCCACTTA  589
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGTTTCTTCCCTCCTGCCTCACTCCACGCTAACCATGCTCTCCCACTTA  593

seq1  GAGTAGACCCAGCTGACGCTGTGTTATCATCCTTTGTAATTCTCCTGCCC  639
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTAGACCCAGCTGACGCTGTGTTATCATCCTTTGTAATTCTCCTGCCC  643

seq1  AGCACACTTTATGCCTGCAGTCCCAGGAACTCCTTGGGGCAGGCACTTCA  689
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACACTTTATGCCTGCAGTCCCAGGAACTCCTTGGGGCAGGCACTTCA  693

seq1  TTATAGTTGCTGCTGATCAGCAGAGAGATACCTGATTCTCTACAGCACAG  739
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATAGTTGCTGCTGATCAGCAGAGAGATACCTGATTCTCTACAGCACAG  743

seq1  CTCAGAGGGAACCTTGGGAACAGTCTTGCTTGCCTTTAACTTCCTGGGCC  789
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGAGGGAACCTTGGGAACAGTCTTGCTTGCCTTTAACTTCCTGGGCC  793

seq1  AGCTTCTTTAGGTTTCAGGATGTGAATGTATTTAAATGGACCCCAAGAAG  839
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTCTTTAGGTTTCAGGATGTGAATGTATTTAAATGGACCCCAAGAAG  843

seq1  TTAATATATTATGACCCAGTTAGTGCCGTTTTACTTCGTGGTAACATGAT  889
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATATATTATGACCCAGTTAGTGCCGTTTTACTTCGTGGTAACATGAT  893

seq1  ATAGCGCTCAATGATTTTTAAGCAATAAAAGAAGTGACTTTAAAACTTAA  939
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGCGCTCAATGATTTTTAAGCAATAAAAGAAGTGACTTTAAAACTTAA  943

seq1  TTAGGAAAATTTAGAGACTATCTAAGGTTCTTAGAGAATTTCTGAAAACG  989
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGAAAATTTAGAGACTATCTAAGGTTCTTAGAGAATTTCTGAAAACG  993

seq1  GGAATGGTGCACTAATATTCACTAGATTTATCTCAGGGAAATCCCAGGAA  1039
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATGGTGCACTAATATTCACTAGATTTATCTCAGGGAAATCCCAGGAA  1043

seq1  GGGTTTTTTGAGCTCTTACAAATCACTCTCAAGGGTGCTGTGTCTTACAG  1089
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTTTTTGAGCTCTTACAAATCACTCTCAAGGGTGCTGTGTCTTACAG  1093

seq1  GCTCACTGAAGCTATTTTGCTGAAAAGAAGTTAGACAAGAAAGACGCCAG  1139
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCACTGAAGCTATTTTGCTGAAAAGAAGTTAGACAAGAAAGACGCCAG  1143

seq1  AGTTCCTAGGAGAAG  1154
      |||||||||||||||
seq2  AGTTCCTAGGAGAAG  1158