BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-132F11
Chromosome7 (Build37)
Map Location 72,091,635 - 72,244,058
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneTrpm1, BB128963, Mtmr15, LOC100041582, Mphosph10, Mcee, Apba2, 5730507A09Rik, Ndnl2
Downstream geneTjp1, Gm1693, EG665234, Tarsl2, Tm2d3, LOC665241, Pcsk6, Snrpa1, H47
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-132F11.bB6Ng01-132F11.g
ACCDH933168DH933169
length893917
definitionDH933168|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-132F11, 5' end.DH933169|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-132F11, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(72,091,635 - 72,092,527)(72,243,142 - 72,244,058)
sequence
gaattctcagggaggaaaaaaacaaacagttttttgttgttgttgcttat
tgacagacggcagcaaacccagtccctcacacacgtttggcaagcgctcc
acgacgacctgcaccctggcccttagaatacacatgtactagtcctgtgt
catatctgcattatatttaaaatatataggatatgcaagaatcctggttt
ctcctaaagacataaactttattcctactcctgaccccaagccagacaca
catagtgtgtgtctatggatttctcacagggccactgctggcctgagaga
ctccagaaactggggaccacttcctcaagaactgtacacatgtgcatcca
tacgcaaggatccaggcggtccaaggcgttccgagtgtgggtggttacta
tgtagttccacctggcctgcaactgctatgtaggccaggctagccctgta
ctcacagagatctgcctgcctctgcctcctggatgactgctgagctgtac
aaccccaaggaggacagttctacaagctactgcctcaggcaacagagcta
gctagtccaccaaggctggagagcagaggttcttccgataagctgagaat
tctgagcccacgagaggatacacagtggccatacaaacagcctgctctca
agcggccgcacacattgtccacagagcagcctagtgcttgtggataatgg
gagtctgcacaaaagcatgtgctaaaaggataatccatctactaagaaca
cactggaaagaaactacattagtggcctctgagagcccgggaggtcacac
ggagaatactgtggtcaattaaacagagacatcctatgtcttagtttgct
ctctattgctgtgataaacagcatgccaaaagcaactggggaa
gaattcaggtcctcacatgtctctgttccatttctgttgctgggataaaa
tacctccggtttaaaaaaaaataactttaagggaaggtattaacttggtt
gtgattccagccaccagtgtatcattgcagcgaagggcagaacttgaact
ctctagacacacccagagacaagagcagagagagagcctcaagtgtatgg
agagtctccctcctctattctctgctgtccagaacccaaagcagggacta
gtgctgcctcctgtcaggctttgccatcccacatcaactaagacaattaa
gacacatacacactcgcacactcacgtgcacacccagacatacttacaga
tgaatatattctggatagtttctcactgagaatcttcaaagctcaccgtc
aaagcttgcttgggagaccagggccctccagacaactgtcttcccagccc
tgatgaatgctgtctcatacagggccaccttaccagactcgaaacgccct
tgtgctagatgacagttgttcatcacgggtgatataaataagtctgagag
ggtccaggtggatggtggactcgtagctcatgcatcacgggctgactgga
tctttgatggctaatttgctgtgtaattatcccaacaaatgtcggccgaa
acgtgttgaagtctatgtgcttctgctgtcttttgtgtacgttgggagtg
atttttattcttaatgtctcagataaagccagaatggttattcagtgtat
aggctgtaggttagccgtttaaaaagctactcattttaagggtgggcttg
agtcccctttgagttggcttggaggggagttcctggctactgtgagtgtg
gagggtctgagagagattggtgggggtatgccttgtatgagatatcaaga
gaggggtgcttgccttt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_72091635_72092527
seq2: B6Ng01-132F11.b_45_936

seq1  GAATTCTCAGGGAGGAAAAAAACAAACAGTTTTTTGTTGTTGTTGCTTAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCAGGGAGGAAAAAAACAAACAGTTTTTTGTTGTTGTTGCTTAT  50

seq1  TGACAGACGGCAGCAAACCCAGTCCCTCACACACGTTTGGCAAGCGCTCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAGACGGCAGCAAACCCAGTCCCTCACACACGTTTGGCAAGCGCTCC  100

seq1  ACGACGACCTGCACCCTGGCCCTTAGAATACACATGTACTAGTCCTGTGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGACGACCTGCACCCTGGCCCTTAGAATACACATGTACTAGTCCTGTGT  150

seq1  CATATCTGCATTATATTTAAAATATATAGGATATGCAAGAATCCTGGTTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATCTGCATTATATTTAAAATATATAGGATATGCAAGAATCCTGGTTT  200

seq1  CTCCTAAAGACATAAACTTTATTCCTACTCCTGACCCCAAGCCAGACACA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTAAAGACATAAACTTTATTCCTACTCCTGACCCCAAGCCAGACACA  250

seq1  CATAGTGTGTGTCTATGGATTTCTCACAGGGCCACTGCTGGCCTGAGAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGTGTGTGTCTATGGATTTCTCACAGGGCCACTGCTGGCCTGAGAGA  300

seq1  CTCCAGAAACTGGGGACCACTTCCTCAAGAACTGTACACATGTGCATCCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCAGAAACTGGGGACCACTTCCTCAAGAACTGTACACATGTGCATCCA  350

seq1  TACGCAAGGATCCAGGCGGTCCAAGGCGTTCCGAGTGTGGGTGGTTACTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACGCAAGGATCCAGGCGGTCCAAGGCGTTCCGAGTGTGGGTGGTTACTA  400

seq1  TGTAGTTCCACCTGGCCTGCAACTGCTATGTAGGCCAGGCTAGCCCTGTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGTTCCACCTGGCCTGCAACTGCTATGTAGGCCAGGCTAGCCCTGTA  450

seq1  CTCACAGAGATCTGCCTGCCTCTGCCTCCTGGATGACTGCTGAGCTGTAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACAGAGATCTGCCTGCCTCTGCCTCCTGGATGACTGCTGAGCTGTAC  500

seq1  AACCCCAAGGAGGACAGTTCTACAAGCTACTGCCTCAGGCAACAGAGCTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCCAAGGAGGACAGTTCTACAAGCTACTGCCTCAGGCAACAGAGCTA  550

seq1  GCTAGTCCACCAAGGCTGGAGAGCAGAGGTTCTTCCGATAAGCTGAGAAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAGTCCACCAAGGCTGGAGAGCAGAGGTTCTTCCGATAAGCTGAGAAT  600

seq1  TCTGAGCCCACGAGAGGATACACAGTGGCCATACAAACAGCCTGCTCTCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAGCCCACGAGAGGATACACAGTGGCCATACAAACAGCCTGCTCTCA  650

seq1  AGCGGCCGCACACATTGTCCACAGAGCAGCCTAGTGCTTGTGGATAATGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCGGCCGCACACATTGTCCACAGAGCAGCCTAGTGCTTGTGGATAATGG  700

seq1  GAGTCTGCACAAAAGCATGTGCTAAAAGGATAATCCATCTACTAAGAACA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCTGCACAAAAGCATGTGCTAAAAGGATAATCCATCTACTAAGAACA  750

seq1  CACTGGAAAGAAACTACATTAGTGGCCTCTGAGAGCCCGGGAGGTCACAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGGAAAGAAACTACATTAGTGGCCTCTGAGAGCCCGGGAGGTCACAC  800

seq1  GGAGAATACTGTGGTCAATTAAACAGAGACATCCTATGTCTTAGTTTGCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGAATACTGTGGTCAATTAAACAGAGACATCCTATGTCTTAGTTTGCT  850

seq1  CTCTATTGCTGTGATAAACAGCATGCCAAAAGCAACTTGGGGA  893
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  CTCTATTGCTGTGATAAACAGCATGCCAAAAGCAAC-TGGGGA  892

seq1: chr7_72243142_72244058
seq2: B6Ng01-132F11.g_66_982 (reverse)

seq1  AAAGGC-AGCACCCCTCTCTTGATATTCTCAAACAAGGCATACCACCACC  49
      |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||
seq2  AAAGGCAAGCACCCCTCTCTTGATA-TCTCATACAAGGCATACCCCCACC  49

seq1  AATCTCTCTCAGACCCTCCACACTCACAGTAGCCAGGAACTCCCCTCCAA  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTCTCTCAGACCCTCCACACTCACAGTAGCCAGGAACTCCCCTCCAA  99

seq1  GCCAACTCAAAGGGGACTCAAGCCCACCCTTAAAATGAGTAGCTTTTTAA  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAACTCAAAGGGGACTCAAGCCCACCCTTAAAATGAGTAGCTTTTTAA  149

seq1  ACGGCTAACCTACAGCCTATACACTGAATAACCATTCTGGCTTTATCTGA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGGCTAACCTACAGCCTATACACTGAATAACCATTCTGGCTTTATCTGA  199

seq1  GACATTAAGAATAAAAATCACTCCCAACGTACACAAAAGACAGCAGAAGC  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATTAAGAATAAAAATCACTCCCAACGTACACAAAAGACAGCAGAAGC  249

seq1  ACATAGACTTCAACACGTTTCGGCCGACATTTGTTGGGATAATTACACAG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATAGACTTCAACACGTTTCGGCCGACATTTGTTGGGATAATTACACAG  299

seq1  CAAATTAGCCATCAAAGATCCAGTCAGCCCGTGATGCATGAGCTACGAGT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATTAGCCATCAAAGATCCAGTCAGCCCGTGATGCATGAGCTACGAGT  349

seq1  CCACCATCCACCTGGACCCTCTCAGACTTATTTATATCACCCGTGATGAA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCATCCACCTGGACCCTCTCAGACTTATTTATATCACCCGTGATGAA  399

seq1  CAACTGTCATCTAGCACAAGGGCGTTTCGAGTCTGGTAAGGTGGCCCTGT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTGTCATCTAGCACAAGGGCGTTTCGAGTCTGGTAAGGTGGCCCTGT  449

seq1  ATGAGACAGCATTCATCAGGGCTGGGAAGACAGTTGTCTGGAGGGCCCTG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGACAGCATTCATCAGGGCTGGGAAGACAGTTGTCTGGAGGGCCCTG  499

seq1  GTCTCCCAAGCAAGCTTTGACGGTGAGCTTTGAAGATTCTCAGTGAGAAA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCCCAAGCAAGCTTTGACGGTGAGCTTTGAAGATTCTCAGTGAGAAA  549

seq1  CTATCCAGAATATATTCATCTGTAAGTATGTCTGGGTGTGCACGTGAGTG  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATCCAGAATATATTCATCTGTAAGTATGTCTGGGTGTGCACGTGAGTG  599

seq1  TGCGAGTGTGTATGTGTCTTAATTGTCTTAGTTGATGTGGGATGGCAAAG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCGAGTGTGTATGTGTCTTAATTGTCTTAGTTGATGTGGGATGGCAAAG  649

seq1  CCTGACAGGAGGCAGCACTAGTCCCTGCTTTGGGTTCTGGACAGCAGAGA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGACAGGAGGCAGCACTAGTCCCTGCTTTGGGTTCTGGACAGCAGAGA  699

seq1  ATAGAGGAGGGAGACTCTCCATACACTTGAGGCTCTCTCTCTGCTCTTGT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGAGGAGGGAGACTCTCCATACACTTGAGGCTCTCTCTCTGCTCTTGT  749

seq1  CTCTGGGTGTGTCTAGAGAGTTCAAGTTCTGCCCTTCGCTGCAATGATAC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGGGTGTGTCTAGAGAGTTCAAGTTCTGCCCTTCGCTGCAATGATAC  799

seq1  ACTGGTGGCTGGAATCACAACCAAGTTAATACCTTCCCTTAAAGTTATTT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGTGGCTGGAATCACAACCAAGTTAATACCTTCCCTTAAAGTTATTT  849

seq1  TTTTTTAAACCGGAGGTATTTTATCCCAGCAACAGAAATGGAACAGAGAC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTAAACCGGAGGTATTTTATCCCAGCAACAGAAATGGAACAGAGAC  899

seq1  ATGTGAGGACCTGAATTC  917
      ||||||||||||||||||
seq2  ATGTGAGGACCTGAATTC  917