BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-132L19
Chromosome7 (Build37)
Map Location 144,490,227 - 144,595,311
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEbf3, 9430038I01Rik
Upstream geneLOC546009, EG621677, EG668771, Mgmt, EG621804
Downstream geneTxnl2, LOC435235, Tcerg1l
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-132L19.bB6Ng01-132L19.g
ACCDH933463DH933464
length1,102950
definitionDH933463|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-132L19, 5' end.DH933464|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-132L19, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(144,594,204 - 144,595,311)(144,490,227 - 144,491,178)
sequence
gaattcttcttttagtccatatttccttcgggatgtttcgggtcagggct
tgttttgcatgtttgtgttggtgattggaccctcacatccttgaatgggt
gattgtatccttggtactctaatactgagcagaaatatggaatccatttc
ctcctgattatctttttgtctgtgttaggaaatcaaacactaggtcttgt
acctgttagacaagaactctacactgactttcatccctggattactttga
aaacttctagaggacagttgatagggaccatataccaggcctcatgggtg
gcagacaaaagttctactgctaagctacatcgccagctttctttttgaga
cagggcctcactactttacccagactgacctttaatctgtctgtagccaa
agcaggctttgaacttgtaatgttcctgcatagcttcccaagtagctagg
gttagaggcccataccataccatcaggcatagcttggtgtctcaaacttg
atggcatctataaccctagaggccagcgaatctcaataattccaagcatg
gacatcatgaagaaaaatggtggcagagacagctagtgaggaaattgctc
aaaggtactgatagaaaaatgtagaagtagccagagacaaaaagacacac
tgtgtactgagacacaaacgtacagctgcagcttcacactggaaatgctc
ctgcaggacagtagagtctcatcaatgacagaaaaaaaaaatcctgctat
ttagaattctgtacccaggggaagttatcttttgtgttcagtttctgaac
ttctattgctgtttttaaagctcaccaaccttttctttgaaagtgtctaa
tttgtcactaattgcacatagtgcatttttcatcccaggaattatacttt
tgattcggatcatgtacacacacataactcatgtctaacgttttgagcat
tatgcagctataggaccctttgagtgttctctgtgggtagagaggaggga
ctgaggtgagatgaagctttaggcatacctcatgacttactggtcagcca
tggcatcctgttagctccatcaggcggattccctgatgaggttaataccc
tc
gaattcatcctgcttttatgccatggggcagcgtggttgcctttccaaca
atttaatcattcgccttttatgggcctccgtgatttaaatattccaaaca
gtattatttaggaaataaaaccctaataagtgaaattgagctgtgccact
tcaataaatgtttaatataaagttaaaatgctttaattttttgtaaagga
gccaagaacttgaaaggggcgggggttaggggggggagcaagtgggacac
gcagcttgcacaagctacagagccctacaaacaactctccaacctgatgg
gcagcacacgggctcaggaatgaaagagctgcacagggaagcatcaggac
tggaaagaaaggaacaaacttttagaagtgacaaaaaagaatcacaaggt
gttagcagtaatgtgaggagaggaggaaaactccagggcaggccactcct
ggaaacagctggcctgcaaagcctgcatatttagtatgaccctaactgtg
tgtccctgaagggcagggatccagggacaaatggacaagtgccatgggtt
tgggaagggagagggacagagagtaggatactggggacagaggccagggc
aagatacaggatgagagatatatgccaccagacatttgtcaaactccatg
gaaggtacaacacccagggaactctccagtcatttgtggacttttagtta
attcatatcaacgttagctggatattaaccagctttccccccatccccat
acctagtgtaaaatctccacacagggagcacaggtcctaatggtaaggga
aattatgctttcagttttggtttctgttagcctaaaactgctctggaaac
agtctggatgcacagacaggcagcacacatacattagctccaactctctg
ccttggtctctgctgccctggcacacctggatgcccacccttcccctcct

quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_144594204_144595311
seq2: B6Ng01-132L19.b_49_1150 (reverse)

seq1  GAGGGTATTAACCTCATCAGTGGAATCACGGCCTGAT-GAGCTAACAGGA  49
      |||||||||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||||||||
seq2  GAGGGTATTAACCTCATCAG-GGAAT--CCGCCTGATGGAGCTAACAGGA  47

seq1  TGCATGGGCTGA-CAGTAAGTCATGAGGTATGCCTTAAAGCCTTCATCTC  98
      |||   |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||
seq2  TGCCATGGCTGACCAGTAAGTCATGAGGTATGCC-TAAAG-CTTCATCTC  95

seq1  ACCCTCAGTCCCCTCCTCTCTACCCACAGAGAACACTCAAAGGGTTCCTA  148
      | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  A-CCTCAGT-CCCTCCTCTCTACCCACAGAGAACACTCAAAGGG-TCCTA  142

seq1  TAGCTGCAT-ATGCTCAAAACGTTAGACATGAGTTATGTGTGTGTACATG  197
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTGCATAATGCTCAAAACGTTAGACATGAGTTATGTGTGTGTACATG  192

seq1  ATCCGAATCAAAAGTTATAATTCCTGGGATGAAAAATGCACTATGTGCAA  247
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCGAATCAAAAG-TATAATTCCTGGGATGAAAAATGCACTATGTGCAA  241

seq1  TTAGTGACAAATTAGACACTTTCAAAGAAAAGGTTGGTGAGCTTTAAAAA  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTGACAAATTAGACACTTTCAAAGAAAAGGTTGGTGAGCTTTAAAAA  291

seq1  CAGCAATAGAAGTTCAGAAACTGAACACAAAAGATAACTTCCCCTGGGTA  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAATAGAAGTTCAGAAACTGAACACAAAAGATAACTTCCCCTGGGTA  341

seq1  CAGAATTCTAAATAGCAGGATTTTTTTTTTCTGTCATTGATGAGACTCTA  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAATTCTAAATAGCAGGATTTTTTTTTTCTGTCATTGATGAGACTCTA  391

seq1  CTGTCCTGCAGGAGCATTTCCAGTGTGAAGCTGCAGCTGTACGTTTGTGT  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCCTGCAGGAGCATTTCCAGTGTGAAGCTGCAGCTGTACGTTTGTGT  441

seq1  CTCAGTACACAGTGTGTCTTTTTGTCTCTGGCTACTTCTACATTTTTCTA  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGTACACAGTGTGTCTTTTTGTCTCTGGCTACTTCTACATTTTTCTA  491

seq1  TCAGTACCTTTGAGCAATTTCCTCACTAGCTGTCTCTGCCACCATTTTTC  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTACCTTTGAGCAATTTCCTCACTAGCTGTCTCTGCCACCATTTTTC  541

seq1  TTCATGATGTCCATGCTTGGAATTATTGAGATTCGCTGGCCTCTAGGGTT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATGATGTCCATGCTTGGAATTATTGAGATTCGCTGGCCTCTAGGGTT  591

seq1  ATAGATGCCATCAAGTTTGAGACACCAAGCTATGCCTGATGGTATGGTAT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGATGCCATCAAGTTTGAGACACCAAGCTATGCCTGATGGTATGGTAT  641

seq1  GGGCCTCTAACCCTAGCTACTTGGGAAGCTATGCAGGAACATTACAAGTT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCCTCTAACCCTAGCTACTTGGGAAGCTATGCAGGAACATTACAAGTT  691

seq1  CAAAGCCTGCTTTGGCTACAGACAGATTAAAGGTCAGTCTGGGTAAAGTA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGCCTGCTTTGGCTACAGACAGATTAAAGGTCAGTCTGGGTAAAGTA  741

seq1  GTGAGGCCCTGTCTCAAAAAGAAAGCTGGCGATGTAGCTTAGCAGTAGAA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGGCCCTGTCTCAAAAAGAAAGCTGGCGATGTAGCTTAGCAGTAGAA  791

seq1  CTTTTGTCTGCCACCCATGAGGCCTGGTATATGGTCCCTATCAACTGTCC  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTGTCTGCCACCCATGAGGCCTGGTATATGGTCCCTATCAACTGTCC  841

seq1  TCTAGAAGTTTTCAAAGTAATCCAGGGATGAAAGTCAGTGTAGAGTTCTT  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGAAGTTTTCAAAGTAATCCAGGGATGAAAGTCAGTGTAGAGTTCTT  891

seq1  GTCTAACAGGTACAAGACCTAGTGTTTGATTTCCTAACACAGACAAAAAG  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTAACAGGTACAAGACCTAGTGTTTGATTTCCTAACACAGACAAAAAG  941

seq1  ATAATCAGGAGGAAATGGATTCCATATTTCTGCTCAGTATTAGAGTACCA  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATCAGGAGGAAATGGATTCCATATTTCTGCTCAGTATTAGAGTACCA  991

seq1  AGGATACAATCACCCATTCAAGGATGTGAGGGTCCAATCACCAACACAAA  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATACAATCACCCATTCAAGGATGTGAGGGTCCAATCACCAACACAAA  1041

seq1  CATGCAAAACAAGCCCTGACCCGAAACATCCCGAAGGAAATATGGACTAA  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCAAAACAAGCCCTGACCCGAAACATCCCGAAGGAAATATGGACTAA  1091

seq1  AAGAAGAATTC  1108
      |||||||||||
seq2  AAGAAGAATTC  1102

seq1: chr7_144490227_144491178
seq2: B6Ng01-132L19.g_68_1017

seq1  GAATTCATCCTGCTTTTATGCCATGGGGCAGCGTGGTTGCCTTTCCAACA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATCCTGCTTTTATGCCATGGGGCAGCGTGGTTGCCTTTCCAACA  50

seq1  ATTTAATCATTCGCCTTTTATGGGCCTCCGTGATTTAAATATTCCAAACA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAATCATTCGCCTTTTATGGGCCTCCGTGATTTAAATATTCCAAACA  100

seq1  GTATTATTTAGGAAATAAAACCCTAATAAGTGAAATTGAGCTGTGCCACT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTATTTAGGAAATAAAACCCTAATAAGTGAAATTGAGCTGTGCCACT  150

seq1  TCAATAAATGTTTAATATAAAGTTAAAATGCTTTAATTTTTTGTAAAGGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATAAATGTTTAATATAAAGTTAAAATGCTTTAATTTTTTGTAAAGGA  200

seq1  GCCAAGAACTTGAAAGGGGCGGGGGTTAGGGGGGGGAGCAAGTGGGACAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAAGAACTTGAAAGGGGCGGGGGTTAGGGGGGGGAGCAAGTGGGACAC  250

seq1  GCAGCTTGCACAAGCTACAGAGCCCTACAAACAACTCTCCAACCTGATGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCTTGCACAAGCTACAGAGCCCTACAAACAACTCTCCAACCTGATGG  300

seq1  GCAGCACACGGGCTCAGGAATGAAAGAGCTGCACAGGGAAGCATCAGGAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCACACGGGCTCAGGAATGAAAGAGCTGCACAGGGAAGCATCAGGAC  350

seq1  TGGAAAGAAAGGAACAAACTTTTAGAAGTGACAAAAAAGAATCACAAGGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAAGAAAGGAACAAACTTTTAGAAGTGACAAAAAAGAATCACAAGGT  400

seq1  GTTAGCAGTAATGTGAGGAGAGGAGGAAAACTCCAGGGCAGGCCACTCCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAGCAGTAATGTGAGGAGAGGAGGAAAACTCCAGGGCAGGCCACTCCT  450

seq1  GGAAACAGCTGGCCTGCAAAGCCTGCATATTTAGTATGACCCTAACTGTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAACAGCTGGCCTGCAAAGCCTGCATATTTAGTATGACCCTAACTGTG  500

seq1  TGTCCCTGAAGGGCAGGGATCCAGGGACAAATGGACAAGTGCCATGGGTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCCTGAAGGGCAGGGATCCAGGGACAAATGGACAAGTGCCATGGGTT  550

seq1  TGGGAAGGGAGAGGGACAGAGAGTAGGATACTGGGGACAGAGGCCAGGGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAAGGGAGAGGGACAGAGAGTAGGATACTGGGGACAGAGGCCAGGGC  600

seq1  AAGATACAGGATGAGAGATATATGCCACCAGACATTTGTCAAACTCCATG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATACAGGATGAGAGATATATGCCACCAGACATTTGTCAAACTCCATG  650

seq1  GAAGGTACAACACCCAGGGAACTCTCCAGTCATTTGTGGAC-TTTAGTTA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  GAAGGTACAACACCCAGGGAACTCTCCAGTCATTTGTGGACTTTTAGTTA  700

seq1  ATTCATATCAACGTTAGCTGGATATTAACCAGCTTTCCCCCCATCCCCAT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCATATCAACGTTAGCTGGATATTAACCAGCTTTCCCCCCATCCCCAT  750

seq1  ACCTAGTGTAAAATCTCCACACAGGGAGCACAGGTCCAAATGGTAAGGGA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  ACCTAGTGTAAAATCTCCACACAGGGAGCACAGGTCCTAATGGTAAGGGA  800

seq1  AATTATGCTTTCAGTTTGGTTTTCTGTTAGCCTAAAACTGCTCTGGAAAC  849
      ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTATGCTTTCAGTTTTGGTTTCTGTTAGCCTAAAACTGCTCTGGAAAC  850

seq1  AGTCTGGATGCACAGACAGGCAGCACACATTACA-TAGCTCCAAACTCTC  898
      ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||
seq2  AGTCTGGATGCACAGACAGGCAGCACACA-TACATTAGCTCC-AACTCTC  898

seq1  TGCCTATGGTCTCTGCTGCCCTGGGCACACCTGGGATGCCCACCC-TCCC  947
      ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||
seq2  TGCCT-TGGTCTCTGCTGCCCT-GGCACACCT-GGATGCCCACCCTTCCC  945

seq1  CTCCT  952
      |||||
seq2  CTCCT  950