BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-133H23
Chromosome7 (Build37)
Map Location 103,322,598 - 103,419,440
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG666836, Odz4
Upstream geneLOC666823, Frda-ps
Downstream geneLOC670727, LOC666858, Nars2, Gab2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-133H23.bB6Ng01-133H23.g
ACCDH934028DH934029
length1,098963
definitionDH934028|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-133H23, 5' end.DH934029|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-133H23, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(103,418,336 - 103,419,440)(103,322,598 - 103,323,563)
sequence
gaattccatgagaaaagcagaaaaggaatgatggagggggatttcaaata
tcccctttgtctatcccttaataaggattattctagatcttttgtccagc
atttataagataccatggcagttaatgagtaagttaattggttaaatcat
tctagtaggggctgccaattcatccgggcgtgcctgtgatgtgtatggag
aagattaaggctgagtttgagaaaggaccaagacaccagatggcttgaag
tatccccagtaatagtttaaatttttttaagttattaatgtcacgtactt
tttatcagagaaaactgaagagcatgaaggggcatgggagaacaaaaaca
aaagcagttattctacagcactactacccagaactaatattttgatagat
tttaaaatgaatttgtatgaaccttataaagttgaggttagactgcatgc
aacattttctcctgtgtctcccattcagcattttaggtttattctttcaa
aacatatttattggctaaagaatatttttcataatggctctatcatggat
attaagagttgacatatgaaatttcctttggtgtttgttattacctgctc
atgtattaaggacctgggtcaatgaaattatctcctctctctcaggaaga
aagatttgaagcagattgtatgtacatatacttaatcaaagctatgtatg
tgcaataaactaaggggcccctcagctgacagctgaaagctggaggagat
ggtgaggtcagaatgggcagaaggagtcagatggcagaggaaaatgcatt
tgcaaacacgcctggacaagagctagttgggcagattgcacatggcttct
tttatggttggactttgcagtgagcagggatgaggactgctccaggtcac
tctagcctaaacacattgaaaagccgttcacactgtgataaatgcaagtg
cattttaacgttttgaaggaagttgtgttaacgctgaagacacagtggcc
tggattcttcaaacctgacaagcctctaattagcagcagttggcatcgat
tcacggcttgtcagtctgtcttttgccacacgtgggacccacatgtac
gaattcattatttgaaagcagaaatatcaaagacgctacaaagcacacat
ctggttttagcatgacttccttactacacggggactgatttttcccaggc
tgcttttccttatgtgtcttcttttatttgtatgtatgcattatgtgtat
acatttatatgatagttccttattttctaagcaatgaggtggagatggct
agaaatagtatctgtattttactcaagtattagaagtttctcaggcattc
agctgtggtgcagccacagcccaggcattacaggttgtgttagtaacaga
atttccttgctgtagagctttggaatttaggagagaaatgtatttggttg
acaagacgttactggccgtgactgtggccaattgtagtcatagacccaaa
gaattcttgcacagtattttcaggcatgaaaggaaaaacacatgtccctt
aaaaatagagacatgattcagggatagagaatgtcatactcctttaaaac
cagcacttgagccacagatgtaggtggacctctgtgggttcaaggccagc
ctgatctatgtagtcagggctacacctttagtgagatcctatctagaaat
gaacagtaagtaaacaaacggtcaaacattctcagcttcactcacgtttc
tatgggtaggaaggagtgtcataagatgcctgtattctttgctctgcccg
ggagcctgagaatgaggatttgttagtgtaaagttaagcctcagtttcaa
aaagagtcttgaaagttcctaagtctcttagagtatacagaacaaagttc
agaatgaaaatataagtgtgctacatattttccagtgtacacacagctgc
atttgcttgccaagttgctctgtgactttatggctctccaaatggaccat
tcctctctgcatggccaggataactgcaagtatctatgatcatcatctat
ctatctatctatc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_103418336_103419440
seq2: B6Ng01-133H23.b_48_1145 (reverse)

seq1  GTACATGT-GGTCCACGGTGTGCAGACAGGCAGACTGGCCAGCCGTGAAA  49
      |||||||| |||||   |||||   | || ||||||| | ||||||||| 
seq2  GTACATGTGGGTCCCACGTGTGGCAAAAGACAGACTGACAAGCCGTGAA-  49

seq1  TCTGAATGCAAACTGGCTGCTAATTAGAGGCTTGTCAGGTTTGAAGAATC  99
        |  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  --TCGATGCCAACT-GCTGCTAATTAGAGGCTTGTCAGGTTTGAAGAATC  96

seq1  CAGGCCCACTGTGTTCTTCAGCGTTAACACACCTTCCCTTCAAAACGTTA  149
      |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||
seq2  CAGG-CCACTGTG-TCTTCAGCGTTAACACAACTT-CCTTCAAAACGTTA  143

seq1  AAATGCACCTTGCATTTATCACAGTGTGAACGGCTTTTCAATGTGTTTAG  199
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGCA-CTTGCATTTATCACAGTGTGAACGGCTTTTCAATGTGTTTAG  192

seq1  GCTAGAGTGACCTGGAGCAGTCCTCATCCCTGCTCACTGCAAAGTCCAAC  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAGAGTGACCTGGAGCAGTCCTCATCCCTGCTCACTGCAAAGTCCAAC  242

seq1  CATAAAAGAAGCCATGTGCAATCTGCCCAACTAGCTCTTGTCCAGGCGTG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAAAAGAAGCCATGTGCAATCTGCCCAACTAGCTCTTGTCCAGGCGTG  292

seq1  TTTGCAAATGCATTTTCCTCTGCCATCTGACTCCTTCTGCCCATTCTGAC  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCAAATGCATTTTCCTCTGCCATCTGACTCCTTCTGCCCATTCTGAC  342

seq1  CTCACCATCTCCTCCAGCTTTCAGCTGTCAGCTGAGGGGCCCCTTAGTTT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACCATCTCCTCCAGCTTTCAGCTGTCAGCTGAGGGGCCCCTTAGTTT  392

seq1  ATTGCACATACATAGCTTTGATTAAGTATATGTACATACAATCTGCTTCA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGCACATACATAGCTTTGATTAAGTATATGTACATACAATCTGCTTCA  442

seq1  AATCTTTCTTCCTGAGAGAGAGGAGATAATTTCATTGACCCAGGTCCTTA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTTTCTTCCTGAGAGAGAGGAGATAATTTCATTGACCCAGGTCCTTA  492

seq1  ATACATGAGCAGGTAATAACAAACACCAAAGGAAATTTCATATGTCAACT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATGAGCAGGTAATAACAAACACCAAAGGAAATTTCATATGTCAACT  542

seq1  CTTAATATCCATGATAGAGCCATTATGAAAAATATTCTTTAGCCAATAAA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAATATCCATGATAGAGCCATTATGAAAAATATTCTTTAGCCAATAAA  592

seq1  TATGTTTTGAAAGAATAAACCTAAAATGCTGAATGGGAGACACAGGAGAA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTTTTGAAAGAATAAACCTAAAATGCTGAATGGGAGACACAGGAGAA  642

seq1  AATGTTGCATGCAGTCTAACCTCAACTTTATAAGGTTCATACAAATTCAT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTTGCATGCAGTCTAACCTCAACTTTATAAGGTTCATACAAATTCAT  692

seq1  TTTAAAATCTATCAAAATATTAGTTCTGGGTAGTAGTGCTGTAGAATAAC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAAATCTATCAAAATATTAGTTCTGGGTAGTAGTGCTGTAGAATAAC  742

seq1  TGCTTTTGTTTTTGTTCTCCCATGCCCCTTCATGCTCTTCAGTTTTCTCT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTTTGTTTTTGTTCTCCCATGCCCCTTCATGCTCTTCAGTTTTCTCT  792

seq1  GATAAAAAGTACGTGACATTAATAACTTAAAAAAATTTAAACTATTACTG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAAAAAGTACGTGACATTAATAACTTAAAAAAATTTAAACTATTACTG  842

seq1  GGGATACTTCAAGCCATCTGGTGTCTTGGTCCTTTCTCAAACTCAGCCTT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATACTTCAAGCCATCTGGTGTCTTGGTCCTTTCTCAAACTCAGCCTT  892

seq1  AATCTTCTCCATACACATCACAGGCACGCCCGGATGAATTGGCAGCCCCT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTTCTCCATACACATCACAGGCACGCCCGGATGAATTGGCAGCCCCT  942

seq1  ACTAGAATGATTTAACCAATTAACTTACTCATTAACTGCCATGGTATCTT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAGAATGATTTAACCAATTAACTTACTCATTAACTGCCATGGTATCTT  992

seq1  ATAAATGCTGGACAAAAGATCTAGAATAATCCTTATTAAGGGATAGACAA  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATGCTGGACAAAAGATCTAGAATAATCCTTATTAAGGGATAGACAA  1042

seq1  AGGGGATATTTGAAATCCCCCTCCATCATTCCTTTTCTGCTTTTCTCATG  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGATATTTGAAATCCCCCTCCATCATTCCTTTTCTGCTTTTCTCATG  1092

seq1  GAATTC  1105
      ||||||
seq2  GAATTC  1098

seq1: chr7_103322598_103323563
seq2: B6Ng01-133H23.g_66_1028

seq1  GAATTCATTATTTGAAAGCAGAAATATCAAAGACGCTACAAAGCACACAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTATTTGAAAGCAGAAATATCAAAGACGCTACAAAGCACACAT  50

seq1  CTGGTTTTAGCATGACTTCCTTACTACACGGGGACTGATTTTTCCCAGGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTTTTAGCATGACTTCCTTACTACACGGGGACTGATTTTTCCCAGGC  100

seq1  TGCTTTTCCTTATGTGTCTTCTTTTATTTGTATGTATGCATTATGTGTAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTTTCCTTATGTGTCTTCTTTTATTTGTATGTATGCATTATGTGTAT  150

seq1  ACATTTATATGATAGTTCCTTATTTTCTAAGCAATGAGGTGGAGATGGCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTTATATGATAGTTCCTTATTTTCTAAGCAATGAGGTGGAGATGGCT  200

seq1  AGAAATAGTATCTGTATTTTACTCAAGTATTAGAAGTTTCTCAGGCATTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAATAGTATCTGTATTTTACTCAAGTATTAGAAGTTTCTCAGGCATTC  250

seq1  AGCTGTGGTGCAGCCACAGCCCAGGCATTACAGGTTGTGTTAGTAACAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGTGGTGCAGCCACAGCCCAGGCATTACAGGTTGTGTTAGTAACAGA  300

seq1  ATTTCCTTGCTGTAGAGCTTTGGAATTTAGGAGAGAAATGTATTTGGTTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCCTTGCTGTAGAGCTTTGGAATTTAGGAGAGAAATGTATTTGGTTG  350

seq1  ACAAGACGTTACTGGCCGTGACTGTGGCCAATTGTAGTCATAGACCCAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGACGTTACTGGCCGTGACTGTGGCCAATTGTAGTCATAGACCCAAA  400

seq1  GAATTCTTGCACAGTATTTTCAGGCATGAAAGGAAAAACACATGTCCCTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTGCACAGTATTTTCAGGCATGAAAGGAAAAACACATGTCCCTT  450

seq1  AAAAATAGAGACATGATTCAGGGATAGAGAATGTCATACTCCTTTAAAAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAATAGAGACATGATTCAGGGATAGAGAATGTCATACTCCTTTAAAAC  500

seq1  CAGCACTTGAGCCACAGATGTAGGTGGACCTCTGTGGGTTCAAGGCCAGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCACTTGAGCCACAGATGTAGGTGGACCTCTGTGGGTTCAAGGCCAGC  550

seq1  CTGATCTATGTAGTCAGGGCTACACCTTTAGTGAGATCCTATCTAGAAAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATCTATGTAGTCAGGGCTACACCTTTAGTGAGATCCTATCTAGAAAT  600

seq1  GAACAGTAAGTAAACAAACGGTCAAACATTCTCAGCTTCACTCACGTTTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACAGTAAGTAAACAAACGGTCAAACATTCTCAGCTTCACTCACGTTTC  650

seq1  TATGGGTAGGAAGGAGTGTCATAAGATGCCTGTATTCTTTGCTCTGCCCG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGGTAGGAAGGAGTGTCATAAGATGCCTGTATTCTTTGCTCTGCCCG  700

seq1  GGAGCCTGAGAATGAGGATTTGTTAGTGTAAAGTTAAGCCTCAGTTTCAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCCTGAGAATGAGGATTTGTTAGTGTAAAGTTAAGCCTCAGTTTCAA  750

seq1  AAAGAGTCTTGAAAGTTCCTAAGTCTCTTAGAGTATACAGAACAAAGTTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAGTCTTGAAAGTTCCTAAGTCTCTTAGAGTATACAGAACAAAGTTC  800

seq1  AGAATGAAAATATAAGTGTGCTACATATTTTCCAGTGTACACACAGCTGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATGAAAATATAAGTGTGCTACATATTTTCCAGTGTACACACAGCTGC  850

seq1  ATTTGCTTGCCAAGTTTGCTCTGTGACTTTATGGCTCTCCAAAATGGACC  900
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
seq2  ATTTGCTTGCCAAG-TTGCTCTGTGACTTTATGGCTCTCC-AAATGGA-C  897

seq1  CATTCCTCTCTGCATGGCCAGGAATAACTGCAAGTTATCTATGATC--TA  948
      |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||   |
seq2  CATTCCTCTCTGCATGGCCAGG-ATAACTGCAAG-TATCTATGATCATCA  945

seq1  TCTATCTATCTATCTATC  966
      ||||||||||||||||||
seq2  TCTATCTATCTATCTATC  963