BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-133L16
Chromosome7 (Build37)
Map Location 87,099,512 - 87,216,863
singlet/doubletdoublet
Overlap geneZfp710
Upstream geneAcan, Hapln3, Mfge8, Abhd2, Rlbp1, BC025462, Polg, AI854517, Rhcg, 5730590G19Rik, Plin, Pex11a, EG626359, EG665900, Mesp1, Mesp2, Anpep, Ap3s2, 2610034B18Rik
Downstream geneIdh2, Sema4b, Cib1, D330012F22Rik, LOC100042374, LOC100042379, Ttll13, Ngrn, Vps33b, Prc1, Rccd1, Unc45a, Hddc3, Man2a2, Fes, Furin, LOC384647, Blm, Crtc3, Iqgap1, LOC100042402, Zscan2, Wdr73, Nmb, Sec11a, Zfp592, Alpk3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-133L16.bB6Ng01-133L16.g
ACCDH934202DH934203
length1,1051,048
definitionDH934202|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-133L16, 5' end.DH934203|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-133L16, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(87,215,764 - 87,216,863)(87,099,512 - 87,100,546)
sequence
gaattcactgttctcagggaagccctagcccaatcatccaacagccctga
gggcctgtccccagcgcactctgacttaagaactgggtcctcaatggtct
cagcgctcttccctacaaacaggtgacaaagaggtggaaatcaccaattc
ttcaagatccacttgttttagggatgtggcctagtagtggagcgctggcc
tggcatgcgagacgccttgggttcttttcctgggaggaaggcagggtcaa
gggcttcttcccagggtccttccagctcccacagaccgagctggggtttt
ccttacagatagacaaactgagggcacacaggcttgggcctattaactag
accccgttccctgcactctaggacacagcagccccagcctagcctcctcc
aggacactgcactgctgtgtttaatctacagtgatcagaagcaagtccag
gaacagatttaccacagaaaagcaagcaagccgattatgccgccggcccc
agggtctcagagcgacacagcatagagaggtcagtagacatggtatcaag
ccccctggagctgggcgtggtggcacaggcctttaatcccagcactcaga
aggcagaggcaggcggatttctgagttcgaggccaccccggtctacagag
tgagttccaggacagccagggctatacagagaaaccctgtcttgaacacc
ccccccccccccaaaaagtcccctggtgtcgtggagtagaatgaaggggc
ccaaaggctatgagagacctggcagtagctgaggaacactgtgtggtggg
gaggtggcaggatttcagcctctggttcctgggctcccaagtgttctgtc
cctgccagtgtagctgacaaggttctcttccaggatgcacaaagtgacag
gggcccaagaggaagccagggcttccctctgctaggtaaacagagagctg
gagtgtgcatcttctggcaagaggctcaagcttctgtgggtggagtcctc
gtctgtaaccagaatggtgcagggaaggaagctaccacagaacggagcca
gaatgtttactttctgaagatcatggatgtagagaatggtactctgatac
aaaac
gaattcactctatagaccaggctggccttgaactcagaaatccgcctgcc
tctgcctccagagtgctgggattaaaggtgtgcaccaccatgcccggcta
atatattcaatttttacttgtcaattatgagaagaaagcagataaacaaa
taaatggcctacatttaagcactgtacactgatagttcatattaaaaaca
ggactctggagcatgacagtgactcagtgtttgcatgcgcccaccaataa
gcctcaaaacctaagtatggtccctggaccttccttagagagaactgatc
cctaaaggtagtcactgctctgacctctacacctgtgtgcatgtgtgggc
atgtgtgtgcatgtgtgagcatgtgtgtgcatgtgtgtgcatgtgtgagc
atgtgtgggcatgtgtgtgggcatgtgtgtgcatgtgtgggcatgtgtga
gcatgtgtgagcatgtgtgtgcatgtgtgagcatgtgtgggcatgtgtgg
gcatgtgtgggcatgtgtgtgggcatgtgtgtgcatgtgtgtgcatgtgt
gagcatgtgtgggcatgtgtgtgcatgtgcgtgagagagatggaggaaga
gagaggaaaagagtgcccagaggtctgaccaccacaagcatccctgtgcc
catgtgcacacatacacacacaaataaatttttttttaatttaaaataga
agtctttaaaaaggaaaaacagagggctggagagattcctcagcggttaa
gagcactgtctgctcttccagaggatttgggttctattcccagcaaccac
atggcaactcagaaccatctataactccagttccagaggatctaaatctt
cacacagacatactggcaaaaacacacaggcaaaaacacaattgcatatg
aaataacaaaaggcatttaaaaaaacaaaactataactaatgaccaagcc
agctcattgagtcaacgggtcctcaaagagggatgagataaagaaagaaa
agacgacaacttataacttggcccagctagcgcgtaaaaggttttctt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_87215764_87216863
seq2: B6Ng01-133L16.b_49_1153 (reverse)

seq1  GTTTTGTCACCAGAGTCCCATTCTCTACATCCATGATC-TCAGAAGGTAA  49
      ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||
seq2  GTTTTGT-ATCAGAGTACCATTCTCTACATCCATGATCTTCAGAAAGTAA  49

seq1  ACA-TCTGGCCTCTGTCTGTGGTAGCTTCCTTCCCTGGCACCATCCTGGT  98
      ||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||
seq2  ACATTCTGGCTCCGTTCTGTGGTAGCTTCCTTCCCT-GCACCATTCTGGT  98

seq1  TACAGACGAGGACT-CACCCACAGGAGCTTGAGCCTCTTGCCAGAAGATG  147
      |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGACGAGGACTCCACCCACAGAAGCTTGAGCCTCTTGCCAGAAGATG  148

seq1  CACAGCTCAGCTCTCCTGTTTACCT-GCAGAGGGAGGCCCTGGCTTCCTC  196
      ||||   ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||
seq2  CACACTCCAGCTCT-CTGTTTACCTAGCAGAGGGAAGCCCTGGCTTCCTC  197

seq1  -TGGGCCCCTGTCACTTGTGGCATCCTGG-AGAGAACCTTGTCAGCTACA  244
       ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGCCCCTGTCACTTTGTGCATCCTGGAAGAGAACCTTGTCAGCTACA  247

seq1  CTGGCA-GGACAGAACACTTGGGAGCCCAGGAACCAGAGGCTGAAATCCC  293
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  CTGGCAGGGACAGAACACTTGGGAGCCCAGGAACCAGAGGCTGAAAT-CC  296

seq1  TGCCACCTCCCCACCACACAGTGTTCCTCAGCTACTGCCAGGTCTCTCAT  343
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCACCTCCCCACCACACAGTGTTCCTCAGCTACTGCCAGGTCTCTCAT  346

seq1  AGCCTTTGGGCCCCTTCATTCTACTCCACGACACCAGGGGACTTTTT--G  391
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |
seq2  AGCCTTTGGGCCCCTTCATTCTACTCCACGACACCAGGGGACTTTTTGGG  396

seq1  GGGGGGGGGGGTGTTCAAGACAGGGTTTCTCTGTATAGCCCTGGCTGTCC  441
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGGGGGGGTGTTCAAGACAGGGTTTCTCTGTATAGCCCTGGCTGTCC  446

seq1  TGGAACTCACTCTGTAGACCGGGGTGGCCTCGAACTCAGAAATCCGCCTG  491
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAACTCACTCTGTAGACCGGGGTGGCCTCGAACTCAGAAATCCGCCTG  496

seq1  CCTCTGCCTTCTGAGTGCTGGGATTAAAGGCCTGTGCCACCACGCCCAGC  541
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTGCCTTCTGAGTGCTGGGATTAAAGGCCTGTGCCACCACGCCCAGC  546

seq1  TCCAGGGGGCTTGATACCATGTCTACTGACCTCTCTATGCTGTGTCGCTC  591
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGGGGGCTTGATACCATGTCTACTGACCTCTCTATGCTGTGTCGCTC  596

seq1  TGAGACCCTGGGGCCGGCGGCATAATCGGCTTGCTTGCTTTTCTGTGGTA  641
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGACCCTGGGGCCGGCGGCATAATCGGCTTGCTTGCTTTTCTGTGGTA  646

seq1  AATCTGTTCCTGGACTTGCTTCTGATCACTGTAGATTAAACACAGCAGTG  691
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTGTTCCTGGACTTGCTTCTGATCACTGTAGATTAAACACAGCAGTG  696

seq1  CAGTGTCCTGGAGGAGGCTAGGCTGGGGCTGCTGTGTCCTAGAGTGCAGG  741
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGTCCTGGAGGAGGCTAGGCTGGGGCTGCTGTGTCCTAGAGTGCAGG  746

seq1  GAACGGGGTCTAGTTAATAGGCCCAAGCCTGTGTGCCCTCAGTTTGTCTA  791
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACGGGGTCTAGTTAATAGGCCCAAGCCTGTGTGCCCTCAGTTTGTCTA  796

seq1  TCTGTAAGGAAAACCCCAGCTCGGTCTGTGGGAGCTGGAAGGACCCTGGG  841
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTAAGGAAAACCCCAGCTCGGTCTGTGGGAGCTGGAAGGACCCTGGG  846

seq1  AAGAAGCCCTTGACCCTGCCTTCCTCCCAGGAAAAGAACCCAAGGCGTCT  891
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAGCCCTTGACCCTGCCTTCCTCCCAGGAAAAGAACCCAAGGCGTCT  896

seq1  CGCATGCCAGGCCAGCGCTCCACTACTAGGCCACATCCCTAAAACAAGTG  941
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCATGCCAGGCCAGCGCTCCACTACTAGGCCACATCCCTAAAACAAGTG  946

seq1  GATCTTGAAGAATTGGTGATTTCCACCTCTTTGTCACCTGTTTGTAGGGA  991
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTTGAAGAATTGGTGATTTCCACCTCTTTGTCACCTGTTTGTAGGGA  996

seq1  AGAGCGCTGAGACCATTGAGGACCCAGTTCTTAAGTCAGAGTGCGCTGGG  1041
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCGCTGAGACCATTGAGGACCCAGTTCTTAAGTCAGAGTGCGCTGGG  1046

seq1  GACAGGCCCTCAGGGCTGTTGGATGATTGGGCTAGGGCTTCCCTGAGAAC  1091
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGGCCCTCAGGGCTGTTGGATGATTGGGCTAGGGCTTCCCTGAGAAC  1096

seq1  AGTGAATTC  1100
      |||||||||
seq2  AGTGAATTC  1105

seq1: chr7_87099512_87100546
seq2: B6Ng01-133L16.g_69_1092

seq1  GAATTCACTCTATAGACCAGGCTGGCCTTGAACTCAGAAATCCGCCTGCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTCTATAGACCAGGCTGGCCTTGAACTCAGAAATCCGCCTGCC  50

seq1  TCTGCCTCCAGAGTGCTGGGATTAAAGGTGTGCACCACCATGCCCGGCTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCCTCCAGAGTGCTGGGATTAAAGGTGTGCACCACCATGCCCGGCTA  100

seq1  ATATATTCAATTTTTACTTGTCAATTATGAGAAGAAAGCAGATAAACAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATTCAATTTTTACTTGTCAATTATGAGAAGAAAGCAGATAAACAAA  150

seq1  TAAATGGCCTACATTTAAGCACTGTACACTGATAGTTCATATTAAAAACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATGGCCTACATTTAAGCACTGTACACTGATAGTTCATATTAAAAACA  200

seq1  GGACTCTGGAGCATGACAGTGACTCAGTGTTTGCATGCGCCCACCAATAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTCTGGAGCATGACAGTGACTCAGTGTTTGCATGCGCCCACCAATAA  250

seq1  GCCTCAAAACCTAAGTATGGTCCCTGGACCTTCCTTAGAGAGAACTGATC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCAAAACCTAAGTATGGTCCCTGGACCTTCCTTAGAGAGAACTGATC  300

seq1  CCTAAAGGTAGTCACTGCTCTGACCTCTACACCTGTGTGCATGTGTGGGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAAAGGTAGTCACTGCTCTGACCTCTACACCTGTGTGCATGTGTGGGC  350

seq1  ATGTGTGTGCATGTGTGAGCATGTGTGTGCATGTGTGTGCATGTGTGAGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGTGTGCATGTGTGAGCATGTGTGTGCATGTGTGTGCATGTGTGAGC  400

seq1  ATGTGTGGGCATGTGTGTGGGCATGTGTGTGCATGTGTGGGCATGTGTGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGTGGGCATGTGTGTGGGCATGTGTGTGCATGTGTGGGCATGTGTGA  450

seq1  GCATGTGTGAGCATGTGTGTGCATGTGTGAGCATGTGTGGGCATGTGTGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGTGTGAGCATGTGTGTGCATGTGTGAGCATGTGTGGGCATGTGTGG  500

seq1  GCATGTGTGGGCATGTGTGTGGGCATGTGTGTGCATGTGTGTGCATGTGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGTGTGGGCATGTGTGTGGGCATGTGTGTGCATGTGTGTGCATGTGT  550

seq1  GAGCATGTGTGGGCATGTGTGTGCATGTGCGTGAGAGAGATGGAGGAAGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCATGTGTGGGCATGTGTGTGCATGTGCGTGAGAGAGATGGAGGAAGA  600

seq1  GAGAGGAAAAGAGTGCCCAGAGGTCTGACCACCACAAGCATCCCTGTGCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGGAAAAGAGTGCCCAGAGGTCTGACCACCACAAGCATCCCTGTGCC  650

seq1  CATGTGCACACATACACACACAAATAAATTTTTTTTTAATTTAAAATAGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTGCACACATACACACACAAATAAATTTTTTTTTAATTTAAAATAGA  700

seq1  AGTCTTTAAAAAGGAAAAACAGAGGGCTGGAGAGATTCCTCAGCGGTTAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTTTAAAAAGGAAAAACAGAGGGCTGGAGAGATTCCTCAGCGGTTAA  750

seq1  GAGCACTGTCTGCTCTTCCAGAGGATTTGGGTTCTATTCCCAGCAACCAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCACTGTCTGCTCTTCCAGAGGATTTGGGTTCTATTCCCAGCAACCAC  800

seq1  ATGGCAACTCAGAACCATCTATAACTCCAGTTCCAGAGGATCTAAAACCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||
seq2  ATGGCAACTCAGAACCATCTATAACTCCAGTTCCAGAGGATCT-AAATCT  849

seq1  TCACACAGACATACTGGCAAAAAACACACAAGCAAAAACACAATTGCATA  900
      |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  TCACACAGACATACTGGC-AAAAACACACAGGCAAAAACACAATTGCATA  898

seq1  TGAAATAACAAAAAGCAAATTAAAAAAACAAAAACAAAAACTAAATGACC  950
      ||||||||||||| || | |||||||||| ||||| | |||| |||||||
seq2  TGAAATAACAAAAGGC-ATTTAAAAAAAC-AAAACTATAACT-AATGACC  945

seq1  AAGCCAGCTCAGTGAGTCAACAGGGTCTCAAAAGAGGGAGTGAGGATTAA  1000
      ||||||||||| ||||||||| |||||   ||||||||| ||||   |||
seq2  AAGCCAGCTCATTGAGTCAAC-GGGTCCTCAAAGAGGGA-TGAG--ATAA  991

seq1  AGAAAGAAAAGACAGACAACTTTATAACATGGCCC  1035
      ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||
seq2  AGAAAGAAAAGAC-GACAAC-TTATAACTTGGCCC  1024