BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-137E20
Chromosome7 (Build37)
Map Location 120,135,666 - 120,285,607
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100042678, Usp47, Dkk3, Mical2, Micalcl, Parva, LOC627808, Tead1, 4632411J06Rik, LOC434227
Downstream geneArntl, A630005I04Rik, Btbd10, Pth, LOC100042736, Mlstd2, EG434228, Spon1, Rras2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-137E20.bB6Ng01-137E20.g
ACCDH936853DH936854
length1,138934
definitionDH936853|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-137E20, 5' end.DH936854|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-137E20, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(120,135,666 - 120,136,808)(120,285,036 - 120,285,607)
sequence
gaattcttatccctcaggtggtggtgctacttagagaggctatgaaatgt
ggacaaaagtgggccactaggggttgtacccagcccttggttcctgccat
tcacactgcttcctggtttactgtgatgtggactgtctctgccataggct
gccacagccatgaactgagccttccagccatgcatgcctttctcaccacc
aggaacccaagccctcagaaaccatgagcccttcctctcttaagctcttt
ctagcaggtagtttggtcaaagcaaacataactaatacatacgtatttta
gaggctagagagatggctcagtggttaagagcagttattgctcttgcaga
ggatctcgagttccctttccaacatccacatagtggctcacaacaatctg
taactccagttttagggaatctgaaccccctttcgtgcctccattgacac
cagacactcctgtggtatagatacatacatacatgtaaacaaacactgat
acacataaaaccagtctagaaaagtttttttttaatttaaatcctttcat
atattcttttacttgtatttctaatgatcctaagaagcagctaccattgt
tattccaattttatagataagagagttaagacttgaccaagttaagaaac
ttgtgtctggtccaagagctgtgaaacttagccacaggtgctgcagactc
cctcggggacaaacaaagtggagagcggacagaggacagttgctaagttc
agaagggttgtgacctgtcaccaggtgagcatggggtctaacccaagagc
ttggctgctgttggcagctggcagctgggagatctgaggccgggctttgc
cttgtaagcttaaggccgccctgtggaagcgaggagcccggctactggtg
aagaagcccatggcccagaagctgcagacagtggcttctgctgcagccaa
ggggacggatagaccagtttttcttgtccttggaagttggttcaggcata
gggcaaacttagagatcagacgagatccaccccaacacacaccaactttg
caggagttgtgagtgttgagagggtgttgagattggggttcagaagggta
ggggtcctgtaaatatgaaggcttacgtgaactcctca
gaattcatcctactactctgttgccaggcaacctttcttgcttttgactc
ttgtaccaatgctacttgttgccatggcagtgctgggacaaggagcagta
agttgtaattaagcggcaagctaggagaaaggggcttttatgtccttgtg
tgggggtggacaggagaaaaagctcctggcactgcagtcaaggtgcaaag
agggacacgggaaagagcaggttggtggctggggcaggtgctcgtcataa
ccatcactgaaaactgtgtgtgctggtgagtttttgtcaccttgacacgc
actagcatcacctgagaagagggaacttcagttgagggattgcctctatc
acattgacatgtctgtgggtattttcatgattaactattgatgtgggagg
gcccagcccactgtgggcagtaccacctcttggcaaatggtcctaggttg
tgtaagaaaggaaacagagaaagacgcagggaaaccagtaggcagcgttt
ctctgtcttctttgctttacctcctgcctccaggttcctaccttgagttc
ctgccctgacttccctcagtgatgaactgtgacccataagccaaataatc
cctttcccctccctacgttgcttttagtcagtgttttgtcacagccacaa
accagaaaggagaataccgtgttttcccagggatgctgtccttgcccaca
tcttgtcttgtcaaggatgggtgttcaaggctgggaggtggctcagtgag
gagagtgtgacacacatgcagagaacctggattcagatcccagaatccat
ctcaaagctgcgtgtggtacatatctacaatcccagcactggggggttaa
gggtggaatcagtaatttcagagtaattgggccagccaatctagctggat
ctgtgagtgtcaattaatagagacttgttttaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_120135666_120136808
seq2: B6Ng01-137E20.b_60_1186

seq1  CCTCAGGTGGTGGTGCTACTTAGAGAGGCTATGAAATGTGGACAAAAGTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCAGGTGGTGGTGCTACTTAGAGAGGCTATGAAATGTGGACAAAAGTG  50

seq1  GGCCACTAGGGGTTGTACCCAGCCCTTGGTTCCTGCCATTCACACTGCTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCACTAGGGGTTGTACCCAGCCCTTGGTTCCTGCCATTCACACTGCTT  100

seq1  CCTGGTTTACTGTGATGTGGACTGTCTCTGCCATAGGCTGCCACAGCCAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGTTTACTGTGATGTGGACTGTCTCTGCCATAGGCTGCCACAGCCAT  150

seq1  GAACTGAGCCTTCCAGCCATGCATGCCTTTCTCACCACCAGGAACCCAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTGAGCCTTCCAGCCATGCATGCCTTTCTCACCACCAGGAACCCAAG  200

seq1  CCCTCAGAAACCATGAGCCCTTCCTCTCTTAAGCTCTTTCTAGCAGGTAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCAGAAACCATGAGCCCTTCCTCTCTTAAGCTCTTTCTAGCAGGTAG  250

seq1  TTTGGTCAAAGCAAACATAACTAATACATACGTATTTTAGAGGCTAGAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGTCAAAGCAAACATAACTAATACATACGTATTTTAGAGGCTAGAGA  300

seq1  GATGGCTCAGTGGTTAAGAGCAGTTATTGCTCTTGCAGAGGATCTCGAGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGCTCAGTGGTTAAGAGCAGTTATTGCTCTTGCAGAGGATCTCGAGT  350

seq1  TCCCTTTCCAACATCCACATAGTGGCTCACAACAATCTGTAACTCCAGTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTTTCCAACATCCACATAGTGGCTCACAACAATCTGTAACTCCAGTT  400

seq1  TTAGGGAATCTGAACCCCCTTTCGTGCCTCCATTGACACCAGACACTCCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGGAATCTGAACCCCCTTTCGTGCCTCCATTGACACCAGACACTCCT  450

seq1  GTGGTATAGATACATACATACATGTAAACAAACACTGATACACATAAAAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTATAGATACATACATACATGTAAACAAACACTGATACACATAAAAC  500

seq1  CAGTCTAGAAAAGTTTTTTTTTAATTTAAATCCTTTCATATATTCTTTTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCTAGAAAAGTTTTTTTTTAATTTAAATCCTTTCATATATTCTTTTA  550

seq1  CTTGTATTTCTAATGATCCTAAGAAGCAGCTACCATTGTTATTCCAATTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTATTTCTAATGATCCTAAGAAGCAGCTACCATTGTTATTCCAATTT  600

seq1  TATAGATAAGAGAGTTAAGACTTGACCAAGTTAAGAAACTTGTGTCTGGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGATAAGAGAGTTAAGACTTGACCAAGTTAAGAAACTTGTGTCTGGT  650

seq1  CCAAGAGCTGTGAAACTTAGCCACAGGTGCTGCAGACTCCCTCGGGGACA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGAGCTGTGAAACTTAGCCACAGGTGCTGCAGACTCCCTCGGGGACA  700

seq1  AACAAAGTGGAGAGCGGACAGAGGACAGTTGCTAAGTTCAGAAGGGTTGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAAGTGGAGAGCGGACAGAGGACAGTTGCTAAGTTCAGAAGGGTTGT  750

seq1  GACCTGTCACCAGGTGAGCATGGGGTCTAACCCAAGAGCTTGGCTGCTGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCTGTCACCAGGTGAGCATGGGGTCTAACCCAAGAGCTTGGCTGCTGT  800

seq1  TGGCAGCTGGCAGCTGGGAGATCTGAGGCCGGGCTTTGCCTTGTAAGCTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCAGCTGGCAGCTGGGAGATCTGAGGCCGGGCTTTGCCTTGTAAGCTT  850

seq1  AAGGCCGCCCTGTGGAAGCGAGGAGCCCGGCTACTGGTGAAGAAGCCCAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCCGCCCTGTGGAAGCGAGGAGCCCGGCTACTGGTGAAGAAGCCCAT  900

seq1  GGCCCAGAAGCTGCAGACAGTGGCTTCTGCTGCAGCCAAGGGGAACCGGA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||
seq2  GGCCCAGAAGCTGCAGACAGTGGCTTCTGCTGCAGCCAAGGGGA--CGGA  948

seq1  TAGACCAGTTTTTCTTGTCCTTGGAAAAGTTGGTTCAGGCATAAGGGCAA  1000
      ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |
seq2  TAGACCAGTTTTTCTTGTCCTTGG--AAGTTGGTTCAGGCAT-AGGGC-A  994

seq1  AACTTAAGAGATCAGACAGAGATCCACCCCCAACACACACACACCTTTGC  1050
      ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||
seq2  AACTT-AGAGATCAGAC-GAGATCCA-CCCCAACACACAC-CAACTTTGC  1040

seq1  AGGAAGTTGTGAGTGTTGAAGAGGGTG-TGAGATTGGGGTGCAAGAGGGT  1099
      ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||  |||||
seq2  AGG-AGTTGTGAGTGTTG-AGAGGGTGTTGAGATTGGGGTTCAGAAGGGT  1088

seq1  AGGGGTGCCTTGTAAAAAGAGAAGGCTTAAGTGGAGACTCCTCA  1143
      ||||||  | |||||| |  ||||||||| |||   ||||||||
seq2  AGGGGT--CCTGTAAATA-TGAAGGCTTACGTG--AACTCCTCA  1127

seq1: chr7_120285036_120285607
seq2: B6Ng01-137E20.g_68_639 (reverse)

seq1  TCACTGAGGGAAGTCAGGGCAGGAACTCAAGGTAGGAACCTGGAGGCAGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTGAGGGAAGTCAGGGCAGGAACTCAAGGTAGGAACCTGGAGGCAGG  50

seq1  AGGTAAAGCAAAGAAGACAGAGAAACGCTGCCTACTGGTTTCCCTGCGTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTAAAGCAAAGAAGACAGAGAAACGCTGCCTACTGGTTTCCCTGCGTC  100

seq1  TTTCTCTGTTTCCTTTCTTACACAACCTAGGACCATTTGCCAAGAGGTGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTCTGTTTCCTTTCTTACACAACCTAGGACCATTTGCCAAGAGGTGG  150

seq1  TACTGCCCACAGTGGGCTGGGCCCTCCCACATCAATAGTTAATCATGAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGCCCACAGTGGGCTGGGCCCTCCCACATCAATAGTTAATCATGAAA  200

seq1  ATACCCACAGACATGTCAATGTGATAGAGGCAATCCCTCAACTGAAGTTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACCCACAGACATGTCAATGTGATAGAGGCAATCCCTCAACTGAAGTTC  250

seq1  CCTCTTCTCAGGTGATGCTAGTGCGTGTCAAGGTGACAAAAACTCACCAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTTCTCAGGTGATGCTAGTGCGTGTCAAGGTGACAAAAACTCACCAG  300

seq1  CACACACAGTTTTCAGTGATGGTTATGACGAGCACCTGCCCCAGCCACCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACAGTTTTCAGTGATGGTTATGACGAGCACCTGCCCCAGCCACCA  350

seq1  ACCTGCTCTTTCCCGTGTCCCTCTTTGCACCTTGACTGCAGTGCCAGGAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGCTCTTTCCCGTGTCCCTCTTTGCACCTTGACTGCAGTGCCAGGAG  400

seq1  CTTTTTCTCCTGTCCACCCCCACACAAGGACATAAAAGCCCCTTTCTCCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTTCTCCTGTCCACCCCCACACAAGGACATAAAAGCCCCTTTCTCCT  450

seq1  AGCTTGCCGCTTAATTACAACTTACTGCTCCTTGTCCCAGCACTGCCATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTGCCGCTTAATTACAACTTACTGCTCCTTGTCCCAGCACTGCCATG  500

seq1  GCAACAAGTAGCATTGGTACAAGAGTCAAAAGCAAGAAAGGTTGCCTGGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAACAAGTAGCATTGGTACAAGAGTCAAAAGCAAGAAAGGTTGCCTGGC  550

seq1  AACAGAGTAGTAGGATGAATTC  572
      ||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGAGTAGTAGGATGAATTC  572