BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-140E24
Chromosome7 (Build37)
Map Location 61,134,584 - 61,246,508
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100040692, Gm1865, LOC100040718, LOC668789
Downstream geneMrps33p, LOC622146, Luzp2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-140E24.bB6Ng01-140E24.g
ACCDH939078DH939079
length1,1031,084
definitionDH939078|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-140E24, 5' end.DH939079|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-140E24, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(61,134,584 - 61,135,689)(61,245,418 - 61,246,508)
sequence
gaattctctgacttaaccctgctgggactgagactacctggtttacagat
gggagcagtattctccataaaggtcagagacaagcaggtgctgctgtatt
gtatggcacaaatgtcatctgggctgaaactctacaccctgacatgtctg
cacagaaagaggagctaattacccttaccagagccttggaacttgaggca
ggcaagaaaattaacatctacagggatagcaggtatgcttttgccacaga
tcacatctacggggataaataccaagagaaagtactgctcacatcagagg
aaaaataaaaattaaaaaaaaacaaaacaaaacaggacttcttggatcag
atgaagccagtaattatgagtattattcattgcccaagacatcagaaggg
aagagactcagtgacgggggcaatcatcaggcatatcaagcagcttgaga
tgtggctatgcaggaacctatcccagttattggcctacaagagtcaccca
ctggggaatgggattggactaagagctcgtctcacttaaaatatacagaa
gaaagaacttagattgctagccaaccttccaactattacctagagaaggg
gatgggggaaatgccacacaaaagaatgaaaaactatactctccagaaag
caagcaatagacctactaggcaaatgcacagatggactcctttaggggat
aaaaagcttgtctaagcagttaagggatctaaagtatatataatagacct
caggttttcggccagagagatagtagtacagggtaaggaattccagcaag
tgaatgcttatgagaccaagagtaaacagggcaaaacacctaggggagaa
cagcctggagtttattggcaggtcaattttatggatgttaagccagaaaa
aaatatgtttagaaatacttctactgtctgtggatgatttctctcaatgt
gttgaggctttcccacaaagcaggaaacagctaccattatagcggagata
tagaagaaatctgggagtttgagtgcctaggctaatggatgggataacag
tcctgcctttgtttctaagataagtcaaggaattggacggagatattggg
gat
gaattcagtcctaatttctgcctctgtaaaattatatacattattgacat
ctaataaattagccaaccaattacactatgtatgcttgaaagatttcctt
tgtttgagttttaataacttaattttacatgtataagataacccaggaga
cacagaaacatatgtagtgtgtgctcatctttaaaggtacaggtttatgt
atttgtataagtgtgctgttggcaagaagtaagaaacaaacaaacaaaac
aaaaacaaacaaaaattccttcatgataattatattgttatactactgac
gttttcagtgtgaattcctcatgggaatctcatggctatccattattttc
atgttagcaattctccctcagaaaccattttataacttagacctttattt
aggaataaaaaactattctacctccactaacatcaaaaaaaactttgaga
gctaatatattgtctttttgcagagcataaaagattgtgagtgatatatg
atacattcattaacattaactaaggactctataaatctgtttaaaaaaat
tgtcagtgcatgcttttggaatggatgtcatttaactggtaacaagaagt
agatgtttagcaaagatgtgtggggaacacacatttatttttattccagt
ctttactcatcagacaaatgtacatcaaaatgacactgacattccacctt
atactaatcagaatagctaagattaaaaacccaagtgacagcacatttcg
gcaaggatgtggataaaggaacactttcttctgtgcttgtgggattacaa
actggtacaacccctctagaatcagtctggctgttcctcaaaacattgca
aatagttctaccagctcttccgctcttggggatatacccaaaagactgcc
caccataccacaaagacatgtgctccaacatgttcatagcagccttattt
ataacagccagaaactgaaatcacccggatgtccttcactgaagactgga
tacagaaatgtggttcattagacaatgaataatattgatctattaaaatg
agacatctggaattttgcaggcaatagatgaagt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_61134584_61135689
seq2: B6Ng01-140E24.b_45_1147

seq1  GAATTCTCTGACTTAACCCTGCTGGGACTGAGACTACCTGGTTTACAGAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTGACTTAACCCTGCTGGGACTGAGACTACCTGGTTTACAGAT  50

seq1  GGGAGCAGTATTCTCCATAAAGGTCAGAGACAAGCAGGTGCTGCTGTATT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGCAGTATTCTCCATAAAGGTCAGAGACAAGCAGGTGCTGCTGTATT  100

seq1  GTATGGCACAAATGTCATCTGGGCTGAAACTCTACACCCTGACATGTCTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATGGCACAAATGTCATCTGGGCTGAAACTCTACACCCTGACATGTCTG  150

seq1  CACAGAAAGAGGAGCTAATTACCCTTACCAGAGCCTTGGAACTTGAGGCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGAAAGAGGAGCTAATTACCCTTACCAGAGCCTTGGAACTTGAGGCA  200

seq1  GGCAAGAAAATTAACATCTACAGGGATAGCAGGTATGCTTTTGCCACAGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAAGAAAATTAACATCTACAGGGATAGCAGGTATGCTTTTGCCACAGA  250

seq1  TCACATCTACGGGGATAAATACCAAGAGAAAGTACTGCTCACATCAGAGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACATCTACGGGGATAAATACCAAGAGAAAGTACTGCTCACATCAGAGG  300

seq1  AAAAATAAAAATTAAAAAAAAACAAAACAAAACAGGACTTCTTGGATCAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAATAAAAATTAAAAAAAAACAAAACAAAACAGGACTTCTTGGATCAG  350

seq1  ATGAAGCCAGTAATTATGAGTATTATTCATTGCCCAAGACATCAGAAGGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAGCCAGTAATTATGAGTATTATTCATTGCCCAAGACATCAGAAGGG  400

seq1  AAGAGACTCAGTGACGGGGGCAATCATCAGGCATATCAAGCAGCTTGAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGACTCAGTGACGGGGGCAATCATCAGGCATATCAAGCAGCTTGAGA  450

seq1  TGTGGCTATGCAGGAACCTATCCCAGTTATTGGCCTACAAGAGTCACCCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGCTATGCAGGAACCTATCCCAGTTATTGGCCTACAAGAGTCACCCA  500

seq1  CTGGGGAATGGGATTGGACTAAGAGCTCGTCTCACTTAAAATATACAGAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGGAATGGGATTGGACTAAGAGCTCGTCTCACTTAAAATATACAGAA  550

seq1  GAAAGAACTTAGATTGCTAGCCAACCTTCCAACTATTACCTAGAGAAGGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGAACTTAGATTGCTAGCCAACCTTCCAACTATTACCTAGAGAAGGG  600

seq1  GATGGGGGAAATGCCACACAAAAGAATGAAAAACTATACTCTCCAGAAAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGGGGAAATGCCACACAAAAGAATGAAAAACTATACTCTCCAGAAAG  650

seq1  CAAGCAATAGACCTACTAGGCAAATGCACAGATGGACTCCTTTAGGGGAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCAATAGACCTACTAGGCAAATGCACAGATGGACTCCTTTAGGGGAT  700

seq1  AAAAAGCTTGTCTAAGCAGTTAAGGGATCTAAAGTATATATAATAGACCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAGCTTGTCTAAGCAGTTAAGGGATCTAAAGTATATATAATAGACCT  750

seq1  CAGGTTTTCGGCCAGAGAGATAGTAGTACAGGGTAAGGAATTCCAGCAAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTTTTCGGCCAGAGAGATAGTAGTACAGGGTAAGGAATTCCAGCAAG  800

seq1  TGAATGCTTATGAGACCAAGAGTAAACAGGGCAAAACACCTAGGGGAGAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATGCTTATGAGACCAAGAGTAAACAGGGCAAAACACCTAGGGGAGAA  850

seq1  CAGCCTGGAGTTTATTGGCAGGTCAATTTTATGGATGTTAAGCCAGAAAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCTGGAGTTTATTGGCAGGTCAATTTTATGGATGTTAAGCCAGAAAA  900

seq1  AAATATGTTTAGAAATACCTTCTACTGTCTGTGGATGATTTCTCTCAATG  950
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATATGTTTAGAAATA-CTTCTACTGTCTGTGGATGATTTCTCTCAATG  949

seq1  TGTTGAGGCTTTCCCACAAAGCAGGAAACAGCTACCATTATAGCCGAGAT  1000
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  TGTTGAGGCTTTCCCACAAAGCAGGAAACAGCTACCATTATAGCGGAGAT  999

seq1  ATTAGAAGAAATCTTGGAGGTTTGGAGTGCCCAAGCTAATTGGATTGGAT  1050
      | |||||||||||| ||||  || ||||||| | ||||| ||||| ||||
seq2  A-TAGAAGAAATCTGGGAG--TTTGAGTGCCTAGGCTAA-TGGATGGGAT  1045

seq1  AACAGTCCTGCTTTTGTTTCTAAGATAAGTC-AGGGATTGG-CAGAGATA  1098
      ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||
seq2  AACAGTCCTGCCTTTGTTTCTAAGATAAGTCAAGGAATTGGACGGAGATA  1095

seq1  TTGGGGAT  1106
      ||||||||
seq2  TTGGGGAT  1103

seq1: chr7_61245418_61246508
seq2: B6Ng01-140E24.g_66_1149 (reverse)

seq1  ACTTCCATCTATTTGCCTGCAAAATTCATGATGTCCTCATTTTTAATAGA  50
      |||| |||||| |||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||
seq2  ACTT-CATCTA-TTGCCTGCAAAATTCCAGATGT-CTCA-TTTTAATAGA  46

seq1  TCAATATTATTCCATTGTCTAAATGAACCACATTTCTGTATCCAGTCTTC  100
      ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATATTATT-CATTGTCT-AATGAACCACATTTCTGTATCCAGTCTTC  94

seq1  AGTTGAGGGACATCCGGGTGATTTTCAGTTTCTGGCTGTTATAAATAAGG  150
      || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AG-TGAAGGACATCCGGGTGA-TTTCAGTTTCTGGCTGTTATAAATAAGG  142

seq1  CTGCTATGAACATGTTGGAGCACATGTCTTTGTGGTATGGTGGGCAGTCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTATGAACATGTTGGAGCACATGTCTTTGTGGTATGGTGGGCAGTCT  192

seq1  TTTGGGTATATCCCCAAGAGCGGAAGAGCTGGTAGAACTATTTGCAATGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGGTATATCCCCAAGAGCGGAAGAGCTGGTAGAACTATTTGCAATGT  242

seq1  TTTGAGGAACAGCCAGACTGATTCTAGAGGGGTTGTACCAGTTTGTAATC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAGGAACAGCCAGACTGATTCTAGAGGGGTTGTACCAGTTTGTAATC  292

seq1  CCACAAGCACAGAAG-AAGTGTTCCTTTATCCACATCCTTGCCGAAATGT  349
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACAAGCACAGAAGAAAGTGTTCCTTTATCCACATCCTTGCCGAAATGT  342

seq1  GCTGTCACTTGGGTTTTTAATCTTAGCTATTCTGATTAGTATAAGGTGGA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTCACTTGGGTTTTTAATCTTAGCTATTCTGATTAGTATAAGGTGGA  392

seq1  ATGTCAGTGTCATTTTGATGTACATTTGTCTGATGAGTAAAGACTGGAAT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCAGTGTCATTTTGATGTACATTTGTCTGATGAGTAAAGACTGGAAT  442

seq1  AAAAATAAATGTGTGTTCCCCACACATCTTTGCTAAACATCTACTTCTTG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAATAAATGTGTGTTCCCCACACATCTTTGCTAAACATCTACTTCTTG  492

seq1  TTACCAGTTAAATGACATCCATTCCAAAAGCATGCACTGACAATTTTTTT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACCAGTTAAATGACATCCATTCCAAAAGCATGCACTGACAATTTTTTT  542

seq1  AAACAGATTTATAGAGTCCTTAGTTAATGTTAATGAATGTATCATATATC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAGATTTATAGAGTCCTTAGTTAATGTTAATGAATGTATCATATATC  592

seq1  ACTCACAATCTTTTATGCTCTGCAAAAAGACAATATATTAGCTCTCAAAG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCACAATCTTTTATGCTCTGCAAAAAGACAATATATTAGCTCTCAAAG  642

seq1  TTTTTTTTGATGTTAGTGGAGGTAGAATAGTTTTTTATTCCTAAATAAAG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTTTGATGTTAGTGGAGGTAGAATAGTTTTTTATTCCTAAATAAAG  692

seq1  GTCTAAGTTATAAAATGGTTTCTGAGGGAGAATTGCTAACATGAAAATAA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTAAGTTATAAAATGGTTTCTGAGGGAGAATTGCTAACATGAAAATAA  742

seq1  TGGATAGCCATGAGATTCCCATGAGGAATTCACACTGAAAACGTCAGTAG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATAGCCATGAGATTCCCATGAGGAATTCACACTGAAAACGTCAGTAG  792

seq1  TATAACAATATAATTATCATGAAGGAATTTTTGTTTGTTTTTGTTTTGTT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAACAATATAATTATCATGAAGGAATTTTTGTTTGTTTTTGTTTTGTT  842

seq1  TGTTTGTTTCTTACTTCTTGCCAACAGCACACTTATACAAATACATAAAC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTGTTTCTTACTTCTTGCCAACAGCACACTTATACAAATACATAAAC  892

seq1  CTGTACCTTTAAAGATGAGCACACACTACATATGTTTCTGTGTCTCCTGG  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTACCTTTAAAGATGAGCACACACTACATATGTTTCTGTGTCTCCTGG  942

seq1  GTTATCTTATACATGTAAAATTAAGTTATTAAAACTCAAACAAAGGAAAT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTATCTTATACATGTAAAATTAAGTTATTAAAACTCAAACAAAGGAAAT  992

seq1  CTTTCAAGCATACATAGTGTAATTGGTTGGCTAATTTATTAGATGTCAAT  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCAAGCATACATAGTGTAATTGGTTGGCTAATTTATTAGATGTCAAT  1042

seq1  AATGTATATAATTTTACAGAGGCAGAAATTAGGACTGAATTC  1091
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTATATAATTTTACAGAGGCAGAAATTAGGACTGAATTC  1084