BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-142E04
Chromosome7 (Build37)
Map Location 141,077,399 - 141,224,382
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAdam12
Upstream geneZranb1, Ctbp2, LOC668747, 4930404H21Rik, LOC100043237, 2700050L05Rik, Mmp21, Uros, Bccip, Dhx32, LOC100043695, Fank1
Downstream geneA130023I24Rik, 4933400E14Rik, LOC100043248, LOC100043699, LOC668750, Dock1, B830028B13Rik, EG668693
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-142E04.bB6Ng01-142E04.g
ACCDH940500DH940501
length1,1221,131
definitionDH940500|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-142E04, 5' end.DH940501|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-142E04, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(141,223,249 - 141,224,382)(141,077,399 - 141,078,545)
sequence
gaattctttcctttttgttttttcttgctgagctgggggttgaacctagg
gcccatgcatgttccacagccactgagatacatcctgaaaactctcctgt
tttactttttattttagacagcatcttcctaggttgcccaggctgccctt
gaatttactctataatcaagtatggctggccttaaattcttgatactcct
gcttcagcctcccaagtagctgcactaccatccctaactggttctcttta
gtttagagagagaaagaaagagagagagagagagagagagagagagagag
agaaagtagtggacacatgagtatgtatgtgagtgtgcaggtatgtgtgc
ccatggaagccaagggtcaagctctgccacaatctacctcacttttagga
tatgttccctgtttttgctagactggctagctacaaaatcctaggattcc
tacacacacacacacacacacacaagcatacctttacatgggtgctggac
tcaggtctccatgggtgtgtgccaagtactccaaacccagccatctccca
actggcattcttttctttgaagcaatctgcagctgtgtgtgcttgaggtc
ttagctgagctaactcaaggcatggtctgttttttgatgaacctcccagt
tctctgacccaagacctgggaccatggtgacctaacccattgtgaaagcc
atctgtcgttataggggacaggacaggcattactgatgctaagttgctta
gtgcttacgcaacacaccaaatgtcagttttcatgacacagttttgtcca
ctgaccttgcagacaccaggagagactatttcgcccacctctgatgttcc
tagacctgtcgggcttcatcacccgacacttggccccgtggaattccata
atcaaagggtagagaggctccctatccctctaccacatagagcaggtggc
tggtgctgggctgattttgccaagcaccatgaaaatggtgctctctgtgt
tctgatgccacgagtggcctctctgtcaacctcacaggccctatgatcca
tcccatgaaatcctagctctttcacctcactcccctcaatgagataacta
aggttaggctcggactccatgt
gaattcctttagtaacactgtctgtcctgtaagggaatttcaggattaaa
tatgttcttattcagaaatgaatgcatggctctgtaaaagcaagcagcca
gcactgcacagctggtaaggcaccatcggcatccttagtggacactgggg
agatggcagaagatcatggctccaacttcctctaaaccacactctctctg
caccccccccaaaccaaagctcttctgttgtctttgtgtgtttctagcct
ccccatcactcccacctggaggaggagctcatacgcttcagctgaggctt
tgtgtgtctcacaagacaacgcccacacaactctataagtctttacagtt
gtggatgtttggccttaatacaactactgaatgacatatcagttacagaa
attttgtatgcatctcagtggcagcaatattgtctctgtgccacaaaaag
aggcatgtcataagagttattcttttatgcatctgtgacgtggatttatt
tacccagtcatgaagaccatgcttcccaatgctggatacagttttggatt
ctagaaagcaaaccaaattccttatctgtattttcccttctgcttcaagg
cacaggccagccattaatgttagttacccttccaaagaagccttgatctt
aaagcagtcagacgaggtagaggactgctgtcatttaccttctgtcgtga
aagctagtcatcctacgccccatctggaggcagggaaggcctctggcatt
acattattattttttaaatatatatctttcatgccattgggttgaggcac
cttgaagatttgcttctgaaggtagcttcccagtcacatactgaaagagc
agagggaaagagttgcctggctgaggtgcctttcgtgagcaactcagtat
tcggaaacggattgccttgctgtcttagtcatgataggtatgttcagatg
tgaggagaccgagtctctctatgctgagaattagatgcttgagagaacac
acagtaactttgggtgctttgtccaatggctactaataagataacaagac
tcagcctgttcatggaagagcattccacgtgtatagctttgcaagcatat
ggaattctgccttatttaataagtcgagcct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_141223249_141224382
seq2: B6Ng01-142E04.b_42_1163 (reverse)

seq1  ACATGGAGTTCTGAGCTTAACC-TAGTTATCTCATTGAAGGGGAGTGAGA  49
      |||||||| || |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| 
seq2  ACATGGAG-TCCGAGCCTAACCTTAGTTATCTCATTG-AGGGGAGTGAG-  47

seq1  GTG-AAGAGCTAGGAATTACATGGGATGGGATCATAGGG-CTGTGGAGGT  97
      ||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||
seq2  GTGAAAGAGCTAGG-ATTTCATGGGAT-GGATCATAGGGCCTGT-GAGGT  94

seq1  TGGACAGAGAGGGCCACTCGTGGCATCCAGAAACACAGAAGAGCACCATT  147
      | |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |
seq2  T-GACAGAGA-GGCCACTCGTGGCAT-CAG-AACACAG-AGAGCACCA-T  138

seq1  TTTCATGGTGCTTGGCAAAATCAGCCCAGCCACCAGCCACCCTGCTCTAT  197
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||
seq2  TTTCATGGTGCTTGGCAAAATCAGCCCAG-CACCAGCCA-CCTGCTCTAT  186

seq1  GTTGGTAGAGGGATAGGGAGCCTCTCTACCCTTTGATTATGGAATTCCAC  247
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  G-TGGTAGAGGGATAGGGAGCCTCTCTACCCTTTGATTATGGAATTCCAC  235

seq1  GGGGCCAAGTGTCGGGTGATGAAGCCCGACAGGTCTAGGAACATCAGAGG  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGCCAAGTGTCGGGTGATGAAGCCCGACAGGTCTAGGAACATCAGAGG  285

seq1  TGGGCGAAATAGTCTCTCCTGGTGTCTGCAAGGTCAGTGGACAAAACTGT  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCGAAATAGTCTCTCCTGGTGTCTGCAAGGTCAGTGGACAAAACTGT  335

seq1  GTCATGAAAACTGACATTTGGTGTGTTGCGTAAGCACTAAGCAACTTAGC  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATGAAAACTGACATTTGGTGTGTTGCGTAAGCACTAAGCAACTTAGC  385

seq1  ATCAGTAATGCCTGTCCTGTCCCCTATAACGACAGATGGCTTTCACAATG  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGTAATGCCTGTCCTGTCCCCTATAACGACAGATGGCTTTCACAATG  435

seq1  GGTTAGGTCACCATGGTCCCAGGTCTTGGGTCAGAGAACTGGGAGGTTCA  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTAGGTCACCATGGTCCCAGGTCTTGGGTCAGAGAACTGGGAGGTTCA  485

seq1  TCAAAAAACAGACCATGCCTTGAGTTAGCTCAGCTAAGACCTCAAGCACA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAAAACAGACCATGCCTTGAGTTAGCTCAGCTAAGACCTCAAGCACA  535

seq1  CACAGCTGCAGATTGCTTCAAAGAAAAGAATGCCAGTTGGGAGATGGCTG  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGCTGCAGATTGCTTCAAAGAAAAGAATGCCAGTTGGGAGATGGCTG  585

seq1  GGTTTGGAGTACTTGGCACACACCCATGGAGACCTGAGTCCAGCACCCAT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTGGAGTACTTGGCACACACCCATGGAGACCTGAGTCCAGCACCCAT  635

seq1  GTAAAGGTATGCTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGGAATCCTAGGAT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAAGGTATGCTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGGAATCCTAGGAT  685

seq1  TTTGTAGCTAGCCAGTCTAGCAAAAACAGGGAACATATCCTAAAAGTGAG  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTAGCTAGCCAGTCTAGCAAAAACAGGGAACATATCCTAAAAGTGAG  735

seq1  GTAGATTGTGGCAGAGCTTGACCCTTGGCTTCCATGGGCACACATACCTG  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGATTGTGGCAGAGCTTGACCCTTGGCTTCCATGGGCACACATACCTG  785

seq1  CACACTCACATACATACTCATGTGTCCACTACTTTCTCTCTCTCTCTCTC  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACTCACATACATACTCATGTGTCCACTACTTTCTCTCTCTCTCTCTC  835

seq1  TCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTTCTCTCTCTAAACTAAAGAGAACCAG  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTTCTCTCTCTAAACTAAAGAGAACCAG  885

seq1  TTAGGGATGGTAGTGCAGCTACTTGGGAGGCTGAAGCAGGAGTATCAAGA  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGGATGGTAGTGCAGCTACTTGGGAGGCTGAAGCAGGAGTATCAAGA  935

seq1  ATTTAAGGCCAGCCATACTTGATTATAGAGTAAATTCAAGGGCAGCCTGG  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAAGGCCAGCCATACTTGATTATAGAGTAAATTCAAGGGCAGCCTGG  985

seq1  GCAACCTAGGAAGATGCTGTCTAAAATAAAAAGTAAAACAGGAGAGTTTT  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAACCTAGGAAGATGCTGTCTAAAATAAAAAGTAAAACAGGAGAGTTTT  1035

seq1  CAGGATGTATCTCAGTGGCTGTGGAACATGCATGGGCCCTAGGTTCAACC  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGATGTATCTCAGTGGCTGTGGAACATGCATGGGCCCTAGGTTCAACC  1085

seq1  CCCAGCTCAGCAAGAAAAAACAAAAAGGAAAGAATTC  1134
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGCTCAGCAAGAAAAAACAAAAAGGAAAGAATTC  1122

seq1: chr7_141077399_141078545
seq2: B6Ng01-142E04.g_68_1198

seq1  GAATTCCTTTAGTAACACTGTCTGTCCTGTAAGGGAATTTCAGGATTAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTTAGTAACACTGTCTGTCCTGTAAGGGAATTTCAGGATTAAA  50

seq1  TATGTTCTTATTCAGAAATGAATGCATGGCTCTGTAAAAGCAAGCAGCCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTTCTTATTCAGAAATGAATGCATGGCTCTGTAAAAGCAAGCAGCCA  100

seq1  GCACTGCACAGCTGGTAAGGCACCATCGGCATCCTTAGTGGACACTGGGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTGCACAGCTGGTAAGGCACCATCGGCATCCTTAGTGGACACTGGGG  150

seq1  AGATGGCAGAAGATCATGGCTCCAACTTCCTCTAAACCACACTCTCTCTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGGCAGAAGATCATGGCTCCAACTTCCTCTAAACCACACTCTCTCTG  200

seq1  CACCCCCCCCAAACCAAAGCTCTTCTGTTGTCTTTGTGTGTTTCTAGCCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCCCCCCAAACCAAAGCTCTTCTGTTGTCTTTGTGTGTTTCTAGCCT  250

seq1  CCCCATCACTCCCACCTGGAGGAGGAGCTCATACGCTTCAGCTGAGGCTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCATCACTCCCACCTGGAGGAGGAGCTCATACGCTTCAGCTGAGGCTT  300

seq1  TGTGTGTCTCACAAGACAACGCCCACACAACTCTATAAGTCTTTACAGTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTCTCACAAGACAACGCCCACACAACTCTATAAGTCTTTACAGTT  350

seq1  GTGGATGTTTGGCCTTAATACAACTACTGAATGACATATCAGTTACAGAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGATGTTTGGCCTTAATACAACTACTGAATGACATATCAGTTACAGAA  400

seq1  ATTTTGTATGCATCTCAGTGGCAGCAATATTGTCTCTGTGCCACAAAAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTGTATGCATCTCAGTGGCAGCAATATTGTCTCTGTGCCACAAAAAG  450

seq1  AGGCATGTCATAAGAGTTATTCTTTTATGCATCTGTGACGTGGATTTATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCATGTCATAAGAGTTATTCTTTTATGCATCTGTGACGTGGATTTATT  500

seq1  TACCCAGTCATGAAGACCATGCTTCCCAATGCTGGATACAGTTTTGGATT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCCAGTCATGAAGACCATGCTTCCCAATGCTGGATACAGTTTTGGATT  550

seq1  CTAGAAAGCAAACCAAATTCCTTATCTGTATTTTCCCTTCTGCTTCAAGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGAAAGCAAACCAAATTCCTTATCTGTATTTTCCCTTCTGCTTCAAGG  600

seq1  CACAGGCCAGCCATTAATGTTAGTTACCCTTCCAAAGAAGCCTTGATCTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGGCCAGCCATTAATGTTAGTTACCCTTCCAAAGAAGCCTTGATCTT  650

seq1  AAAGCAGTCAGACGAGGTAGAGGACTGCTGTCATTTACCTTCTGTCGTGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCAGTCAGACGAGGTAGAGGACTGCTGTCATTTACCTTCTGTCGTGA  700

seq1  AAGCTAGTCATCCTACGCCCCATCTGGAGGCAGGGAAGGCCTCTGGCATT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTAGTCATCCTACGCCCCATCTGGAGGCAGGGAAGGCCTCTGGCATT  750

seq1  ACATTATTATTTTTTAAATATATATCTTTCATGCCATTGGGTTGAGGCAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTATTATTTTTTAAATATATATCTTTCATGCCATTGGGTTGAGGCAC  800

seq1  CTTGAAGATTTGCTTCTGAAGGTAGCTTCCCAGTCACATACTGAAAGAGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGAAGATTTGCTTCTGAAGGTAGCTTCCCAGTCACATACTGAAAGAGC  850

seq1  AGAGGGAAAGAGTTGCCTGGCTGAGGTTGCCTTTCGTGAGCAACTCAGTA  900
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGGAAAGAGTTGCCTGGCTGAGG-TGCCTTTCGTGAGCAACTCAGTA  899

seq1  TTCGGAAACGGATTGCCTTGCTGTCTTAGTCATTGATAGGTATGTTCAGA  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| 
seq2  TTCGGAAACGGATTGCCTTGCTGTCTTAGTCA-TGATAGGTATGTTCAG-  947

seq1  ATGTGAGGAAGACCGAGTCTCTCTATGCTGAAGAAATTAGGATGCCTTGA  1000
      |||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||| |||| |||| 
seq2  ATGTGAGG-AGACCGAGTCTCTCTATGCTGA--GAATTA-GATG-CTTG-  991

seq1  AGAGAACACACAGGTAACTTTGGGTGCTTTGTCCAATGGCTACTAATAAG  1050
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAACACACA-GTAACTTTGGGTGCTTTGTCCAATGGCTACTAATAAG  1040

seq1  GATACCAGACTCAGGCTGTGCCATGAGAAGAGCATTCCACGTGGTTATAG  1100
         || |||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||  |||||
seq2  ATAACAAGACTCAGCCTGT-TCATG-GAAGAGCATTCCACGTG--TATAG  1086

seq1  CTTTTGCAAGCATATGG-ATTCTGCCTAATTTTTAATAAGTCGAGCCT  1147
      | ||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||
seq2  C-TTTGCAAGCATATGGAATTCTGCCT--TATTTAATAAGTCGAGCCT  1131