BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-143H10
Chromosome7 (Build37)
Map Location 88,538,038 - 88,665,901
singlet/doubletdoublet
Overlap geneCpeb1, LOC623355, Ap3b2, BC048679
Upstream geneFurin, LOC384647, Blm, Crtc3, Iqgap1, LOC100042402, Zscan2, Wdr73, Nmb, Sec11a, Zfp592, Alpk3, Slc28a1, EG623286, LOC100043130, Pde8a, EG636544, Rps17
Downstream geneFsd2, Whdc1, Homer2, 2610204K14Rik, 3110040N11Rik, Btbd1, Tm6sf1, LOC100043161, Hdgfrp3, Bnc1, Sh3gl3, Adamtsl3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-143H10.bB6Ng01-143H10.g
ACCDH941391DH941392
length1,076982
definitionDH941391|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-143H10, 5' end.DH941392|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-143H10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(88,538,038 - 88,539,122)(88,664,915 - 88,665,901)
sequence
gaattcaatcagttttaaaagtacatgaggccagggtaggacatccgatg
tcctggaatttgagttacagatgtttataagctaccacatgggtgctggg
aaccaaacttgggttctctgaaacagcactaaatattcttaaccactaga
ctgtctctctagtcccaagaactaactcttgctctttccccttttcctaa
aatttccagttactctttaaaaagtcagcttgatcactatgatactccca
aaggtctcattgccatatgcatgcattatatttgaagataagtttaattc
ctcaaggaaatcaaaagcaaatcttgttgattattcaagaccagcttaac
acaatcgatggattctgaaagggaagttaaatatagaatctaatatcctg
tctagtactgtccccaagttatacataaaaatcaatatagctgaagtggt
aagtcaggattaacagtgcttgccttatatgaatggacctccaaacagac
aaacaaacatacatatatggaccagggcaagtaacttggtggtaaaatgc
tcatctagtgtgcacaggccctgtgttcaacccctaacactcagtgacat
aaagactaagctggtcaatttctagaggattatcaaagatgtgtattgaa
agctcaaaggggggctgaagagattgatcagtggttaagagcactggctg
ctcttccagaggtcttgagttcaatccccagcaaccacatattggctcag
aactatctgtaatggatccgatgttttcttctggtgtgtctgaagagaat
gacagtgtactcacatacataaaataaatcttaaaaaaaagaaagttcaa
aaaagatatttattctaagatggtgtcttagtcagggtttctattcctgc
acaaacatcatgaccaagaagcaaattgggggaggaaagggttatttggc
tacaacttcatacttgctggtcatcaccaggagtcaggactagaactcaa
gcaggtcagagcaggagcgatgcagaggccatggaaggatgctactactg
ctgcttcccttgcttgctcagcctgc
gaattcactaatggtgagggagacaggggggagaggaaagagaaagagag
aaagagcaagcagagagagagtgagaggccaaactgtctagatatataag
gaagagcttcagggggaggggcagcccagcccctgggctagaaagttcag
ggcagagggcagggtatgccagacctacgctgcaaccggtagggactgag
ggatgctgggagaacctggaggctaggtctacttatgcacctcagctgct
tgtcctgggtctgaatcccaagaatgtgatcatttgagttttttcctctt
tcttagccctggttgtcctggaattccctgtgtaaatcagacgggcctgg
acctcatagagatcttcctgcatccgtctcctgagtgctggggtcaaaga
tgtgtttcaccacacccagctcatataacatgtttagtttttgtaatggt
tttgcttcctcttttgttgtttctctaatgtcttttttgtttacttctat
ttaaaaatttttattacatttatttatgtatttgttgggaagggggctca
agtgtctggaagtcagaggacaatttacaggagtcagttctcttgttcca
ccatggcagtcctggggaccaagttcctgttgtcaggcttggccacatgt
acctttaaccaccaaagtcatctcacaaggactatgcttgtctgcttggt
tgattggttgggtgacttatttgagacagggttcactgtgattctcactc
agtctggccttaacccttctggttcttctgtgctaggattattgatctat
ggcttccacactcagctatacttcttagtaagagtctaagatggtaccct
ttcttctgggaatctgttacataccctgctgttttagttgccaattttgc
ttccaaacacaaccccatttatgttcctatttaatgcatggtggtgtcgg
tcccatgcccttaggttgaataagattttgtt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_88538038_88539122
seq2: B6Ng01-143H10.b_49_1124

seq1  GAATTCAATCAGTTTTAAAAGTACATGAGGCCAGGGTAGGACATCCGATG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAATCAGTTTTAAAAGTACATGAGGCCAGGGTAGGACATCCGATG  50

seq1  TCCTGGAATTTGAGTTACAGATGTTTATAAGCTACCACATGGGTGCTGGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGGAATTTGAGTTACAGATGTTTATAAGCTACCACATGGGTGCTGGG  100

seq1  AACCAAACTTGGGTTCTCTGAAACAGCACTAAATATTCTTAACCACTAGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCAAACTTGGGTTCTCTGAAACAGCACTAAATATTCTTAACCACTAGA  150

seq1  CTGTCTCTCTAGTCCCAAGAACTAACTCTTGCTCTTTCCCCTTTTCCTAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCTCTCTAGTCCCAAGAACTAACTCTTGCTCTTTCCCCTTTTCCTAA  200

seq1  AATTTCCAGTTACTCTTTAAAAAGTCAGCTTGATCACTATGATACTCCCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTCCAGTTACTCTTTAAAAAGTCAGCTTGATCACTATGATACTCCCA  250

seq1  AAGGTCTCATTGCCATATGCATGCATTATATTTGAAGATAAGTTTAATTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTCTCATTGCCATATGCATGCATTATATTTGAAGATAAGTTTAATTC  300

seq1  CTCAAGGAAATCAAAAGCAAATCTTGTTGATTATTCAAGACCAGCTTAAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAAGGAAATCAAAAGCAAATCTTGTTGATTATTCAAGACCAGCTTAAC  350

seq1  ACAATCGATGGATTCTGAAAGGGAAGTTAAATATAGAATCTAATATCCTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATCGATGGATTCTGAAAGGGAAGTTAAATATAGAATCTAATATCCTG  400

seq1  TCTAGTACTGTCCCCAAGTTATACATAAAAATCAATATAGCTGAAGTGGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGTACTGTCCCCAAGTTATACATAAAAATCAATATAGCTGAAGTGGT  450

seq1  AAGTCAGGATTAACAGTGCTTGCCTTATATGAATGGACCTCCAAACAGAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCAGGATTAACAGTGCTTGCCTTATATGAATGGACCTCCAAACAGAC  500

seq1  AAACAAACATACATATATGGACCAGGGCAAGTAACTTGGTGGTAAAATGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAAACATACATATATGGACCAGGGCAAGTAACTTGGTGGTAAAATGC  550

seq1  TCATCTAGTGTGCACAGGCCCTGTGTTCAACCCCTAACACTCAGTGACAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCTAGTGTGCACAGGCCCTGTGTTCAACCCCTAACACTCAGTGACAT  600

seq1  AAAGACTAAGCTGGTCAATTTCTAGAGGATTATCAAAGATGTGTATTGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGACTAAGCTGGTCAATTTCTAGAGGATTATCAAAGATGTGTATTGAA  650

seq1  AGCTCAAAGGGGGGCTGAAGAGATTGATCAGTGGTTAAGAGCACTGGCTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCAAAGGGGGGCTGAAGAGATTGATCAGTGGTTAAGAGCACTGGCTG  700

seq1  CTCTTCCAGAGGTCTTGAGTTCAATCCCCAGCAACCACATATTGGCTCAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTCCAGAGGTCTTGAGTTCAATCCCCAGCAACCACATATTGGCTCAG  750

seq1  AACTATCTGTAATGGATCCGATGTTTTCTTCTGGTGTGTCTGAAGAGAAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTATCTGTAATGGATCCGATGTTTTCTTCTGGTGTGTCTGAAGAGAAT  800

seq1  GACAGTGTACTCACATACATAAAATAAATCTTAAAAAAAAAGAAAGTTC-  849
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| 
seq2  GACAGTGTACTCACATACATAAAATAAATCTT-AAAAAAAAGAAAGTTCA  849

seq1  AAAAAGATATTTATTCTAAGATGGTGTCTTAGTCAGGGTTTCTATTCCTG  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAGATATTTATTCTAAGATGGTGTCTTAGTCAGGGTTTCTATTCCTG  899

seq1  CACAAACATCATGACCAAGAAGCAAATT-GGGGAGGAAAGGGTTTATTTG  948
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||
seq2  CACAAACATCATGACCAAGAAGCAAATTGGGGGAGGAAAGGG-TTATTTG  948

seq1  GCTTACACTTCCATAC-TGCTGTTCATCACCAAGGAAGTCAGGACTAGAA  997
      || ||||  | ||||| ||||| |||||||||  | ||||||||||||||
seq2  GC-TACAACTTCATACTTGCTGGTCATCACCA--GGAGTCAGGACTAGAA  995

seq1  CTCAAGCAGGTCAGGAAGCAGGAGCCGATGCAGAGGCCATGGAGGGATGC  1047
      ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||
seq2  CTCAAGCAGGTCAG--AGCAGGAG-CGATGCAGAGGCCATGGAAGGATGC  1042

seq1  TACTTACTGGCTTGCTTCCCCTGGCTTGCTCAGCCTGC  1085
      ||| |||||   ||||| |||| |||||||||||||||
seq2  TAC-TACTG--CTGCTT-CCCTTGCTTGCTCAGCCTGC  1076

seq1: chr7_88664915_88665901
seq2: B6Ng01-143H10.g_69_1050 (reverse)

seq1  AACAAAATCTAATTACAACCTAAAGAGCAATGGAACAGACAACAACAATG  50
      |||||||||| ||| |||||| ||| || |||| || ||| || || |||
seq2  AACAAAATCTTATT-CAACCT-AAGGGC-ATGGGACCGAC-ACCACCATG  46

seq1  CATTAAAATAAGAACATAAATGAGGTTGTATTTGGAAGC-AAATTCGCAA  99
      |||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||
seq2  CATT-AAATAGGAACATAAATGGGGTTGTGTTTGGAAGCAAAATTGGCAA  95

seq1  CTAAAAACAGCAGGGTAATGTAACAGA-TCCCAGAAGAAAGGTAACCATC  148
      || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||
seq2  CT-AAAACAGCAGGGT-ATGTAACAGATTCCCAGAAGAAAGGGTACCATC  143

seq1  TTAGACTCTTACTAAGAAGTATTAGCTGAGTGTGG-AGGCATAGATCAGT  197
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |
seq2  TTAGACTCTTACTAAGAAGTA-TAGCTGAGTGTGGAAGCCATAGATCAAT  192

seq1  AATCCTAGCACAGAAGAACCAGAA-GGTTAAGGCCAGACTGAGTGAGAAT  246
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCCTAGCACAGAAGAACCAGAAGGGTTAAGGCCAGACTGAGTGAGAAT  242

seq1  CACAGTGAAACCCTGTCTCAAATAAGTCAACCAACCAATCAACCAAGCAG  296
      ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  CACAGTG-AACCCTGTCTCAAATAAGTCACCCAACCAATCAACCAAGCAG  291

seq1  ACAAGCATAGTCCTTGTGAGATGACTTTGGTGGTTAAAGGTACATGTGGC  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGCATAGTCCTTGTGAGATGACTTTGGTGGTTAAAGGTACATGTGGC  341

seq1  CAAGCCTGACAACAGGAACTTGGTCCCCAGGACTGCCATGGTGGAACAAG  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCCTGACAACAGGAACTTGGTCCCCAGGACTGCCATGGTGGAACAAG  391

seq1  AGAACTGACTCCTGTAAATTGTCCTCTGACTTCCAGACACTTGAGCCCCC  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACTGACTCCTGTAAATTGTCCTCTGACTTCCAGACACTTGAGCCCCC  441

seq1  TTCCCAACAAATACATAAATAAATGTAATAAAAATTTTTAAATAGAAGTA  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCAACAAATACATAAATAAATGTAATAAAAATTTTTAAATAGAAGTA  491

seq1  AACAAAAAAGACATTAGAGAAACAACAAAAGAGGAAGCAAAACCATTACA  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAAAAAGACATTAGAGAAACAACAAAAGAGGAAGCAAAACCATTACA  541

seq1  AAAACTAAACATGTTATATGAGCTGGGTGTGGTGAAACACATCTTTGACC  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACTAAACATGTTATATGAGCTGGGTGTGGTGAAACACATCTTTGACC  591

seq1  CCAGCACTCAGGAGACGGATGCAGGAAGATCTCTATGAGGTCCAGGCCCG  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCACTCAGGAGACGGATGCAGGAAGATCTCTATGAGGTCCAGGCCCG  641

seq1  TCTGATTTACACAGGGAATTCCAGGACAACCAGGGCTAAGAAAGAGGAAA  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGATTTACACAGGGAATTCCAGGACAACCAGGGCTAAGAAAGAGGAAA  691

seq1  AAACTCAAATGATCACATTCTTGGGATTCAGACCCAGGACAAGCAGCTGA  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTCAAATGATCACATTCTTGGGATTCAGACCCAGGACAAGCAGCTGA  741

seq1  GGTGCATAAGTAGACCTAGCCTCCAGGTTCTCCCAGCATCCCTCAGTCCC  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGCATAAGTAGACCTAGCCTCCAGGTTCTCCCAGCATCCCTCAGTCCC  791

seq1  TACCGGTTGCAGCGTAGGTCTGGCATACCCTGCCCTCTGCCCTGAACTTT  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCGGTTGCAGCGTAGGTCTGGCATACCCTGCCCTCTGCCCTGAACTTT  841

seq1  CTAGCCCAGGGGCTGGGCTGCCCCTCCCCCTGAAGCTCTTCCTTATATAT  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGCCCAGGGGCTGGGCTGCCCCTCCCCCTGAAGCTCTTCCTTATATAT  891

seq1  CTAGACAGTTTGGCCTCTCACTCTCTCTCTGCTTGCTCTTTCTCTCTTTC  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGACAGTTTGGCCTCTCACTCTCTCTCTGCTTGCTCTTTCTCTCTTTC  941

seq1  TCTTTCCTCTCCCCCCTGTCTCCCTCACCATTAGTGAATTC  987
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTCCTCTCCCCCCTGTCTCCCTCACCATTAGTGAATTC  982