BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-144O24
Chromosome7 (Build37)
Map Location 145,186,408 - 145,389,378
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC435235
Upstream geneMgmt, EG621804, Ebf3, 9430038I01Rik, Txnl2
Downstream geneTcerg1l, LOC100043290, Mapk1ip1, Ppp2r2d, Bnip3, EG668784, LOC669185, 6330417G02Rik, Dpysl4, Stk32c, LOC100038956
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-144O24.bB6Ng01-144O24.g
ACCDH942482DH942483
length1,107967
definitionDH942482|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-144O24, 5' end.DH942483|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-144O24, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(145,186,408 - 145,187,521)(145,388,395 - 145,389,378)
sequence
gaattcaggcagggccttgtgagtgctcaccctgtgctctgctgccgaac
catccctccagttctagtggtctttagagaagatgaatctgcttagaagc
tcccctgagctgctcttggaactctcaggagccagaggtagatgggctga
ctagacatactgaaaccactctgaaagtgggttcagagcatggcttcagg
gcctcattcccgtgaatcctctataagccacggtggaagggaacacatag
tttgatttcactcctatgagcattccatagatcaagctggaagatgacgt
atagtgtgtattcaaggccccagcctgtgagctctccaggcttgagctac
atgcaatgcgcaggctactgagcaacacagccactagggcttctgcaaaa
gatatcctccaaagttatttccaacagccccctgggtcccctaggacaga
acagggggtgttttatccagaattgtgcctagggaggaagagagttcttg
tttgtcagtacacatctagggcacttgaaaagataacgtgtttcattatg
aataaatcaacaagaaaccctacaaacattttatttccagaccatcagtt
cttggagagcgaactgttggccttcccttagtaaccttagaggaatgagt
tgagtatggttttgattctctaaccctgatggtccgagagcttgctcaat
acgagaaactcaacattttagctgtgttgtctaagactccattctggaga
cttcttcttactgaaatgcttgagagtacggatggttctgtcacttctat
tcatacagttgtgaacccaggtgactctagccatgcaaggaagcacatat
acatggataaacatactcatatacagattcctacaaggctcatgtataca
tacacacatgcacataaacatgaatattcatacagtaatgcacacagatg
catacatgtaccccattgattcagttagtacacacacatacatgtacaca
gatgcatcaaaacactgaaatgtatgggaagctaacaaactcacatctgt
acacatgtatgtaagcagtgcttcgaatcgccccttacgaacatggatta
tggcatg
gaattccttaaggtatcttgaaccatgcatgaggtttggagcaaaaagag
tatcctggaactggaggagacatgatggtctgctagtccctggcccattc
cttttctttgacatacttggttctattttgaaggtagcatcagttagggc
aacctgagcaaagtctatccatcaggtctgggagtttagaatatgtcact
actaagccatgttttgctttgacaatgataacctagtaggtcctctgtag
acagctctaggtttaaagtgtcattccagaacttctatagaagatttgtg
acatcggctgccatttcagcactcacttgtgggagtcaccacagcctgac
ctggtcagatagccttgattccatctctagatgaccctactcatctggtc
ctgcctgtagagacccaatccagggctttgctctgccttttttagtaatc
tagacagtgttagccagaaatgtatggacatgtggagctgggcaatgcag
gacaccgggaggtccagagaggcaagtgtgtggatgtgtatctgggatat
aggatcttgcctcagtgcaaacctgtgcctatgtcagtgtgctttgaact
ctcctgttctaaaggcgccacagggaagggttatgtgtgtgaatgacgtg
agttaacacactgaacactgatgaagaggcaagtaagaagtatgagtgtt
tacatgttgacatggatggagcaagtttgtcacatgtggtctacccagag
ctgagtccaggtttgcctcacaataacagctgtttcccagtgtgaaagaa
ggcacattttcagttatcccaacactctttctaatttttcccactctgga
aatgcaggtgttgataattaaggtctcagaaacttgaatatgcatatctt
ttggaatattatctaatctactaaaaagcatttttaatgagcactaaacc
aaaaaatctggggctgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_145186408_145187521
seq2: B6Ng01-144O24.b_48_1154

seq1  GAATTCAGGCAGGGCCTTGTGAGTGCTCACCCTGTGCTCTGCTGCCGAAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGGCAGGGCCTTGTGAGTGCTCACCCTGTGCTCTGCTGCCGAAC  50

seq1  CATCCCTCCAGTTCTAGTGGTCTTTAGAGAAGATGAATCTGCTTAGAAGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCCTCCAGTTCTAGTGGTCTTTAGAGAAGATGAATCTGCTTAGAAGC  100

seq1  TCCCCTGAGCTGCTCTTGGAACTCTCAGGAGCCAGAGGTAGATGGGCTGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCTGAGCTGCTCTTGGAACTCTCAGGAGCCAGAGGTAGATGGGCTGA  150

seq1  CTAGACATACTGAAACCACTCTGAAAGTGGGTTCAGAGCATGGCTTCAGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGACATACTGAAACCACTCTGAAAGTGGGTTCAGAGCATGGCTTCAGG  200

seq1  GCCTCATTCCCGTGAATCCTCTATAAGCCACGGTGGAAGGGAACACATAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCATTCCCGTGAATCCTCTATAAGCCACGGTGGAAGGGAACACATAG  250

seq1  TTTGATTTCACTCCTATGAGCATTCCATAGATCAAGCTGGAAGATGACGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGATTTCACTCCTATGAGCATTCCATAGATCAAGCTGGAAGATGACGT  300

seq1  ATAGTGTGTATTCAAGGCCCCAGCCTGTGAGCTCTCCAGGCTTGAGCTAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTGTGTATTCAAGGCCCCAGCCTGTGAGCTCTCCAGGCTTGAGCTAC  350

seq1  ATGCAATGCGCAGGCTACTGAGCAACACAGCCACTAGGGCTTCTGCAAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAATGCGCAGGCTACTGAGCAACACAGCCACTAGGGCTTCTGCAAAA  400

seq1  GATATCCTCCAAAGTTATTTCCAACAGCCCCCTGGGTCCCCTAGGACAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATCCTCCAAAGTTATTTCCAACAGCCCCCTGGGTCCCCTAGGACAGA  450

seq1  ACAGGGGGTGTTTTATCCAGAATTGTGCCTAGGGAGGAAGAGAGTTCTTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGGGGTGTTTTATCCAGAATTGTGCCTAGGGAGGAAGAGAGTTCTTG  500

seq1  TTTGTCAGTACACATCTAGGGCACTTGAAAAGATAACGTGTTTCATTATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTCAGTACACATCTAGGGCACTTGAAAAGATAACGTGTTTCATTATG  550

seq1  AATAAATCAACAAGAAACCCTACAAACATTTTATTTCCAGACCATCAGTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAATCAACAAGAAACCCTACAAACATTTTATTTCCAGACCATCAGTT  600

seq1  CTTGGAGAGCGAACTGTTGGCCTTCCCTTAGTAACCTTAGAGGAATGAGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGAGAGCGAACTGTTGGCCTTCCCTTAGTAACCTTAGAGGAATGAGT  650

seq1  TGAGTATGGTTTTGATTCTCTAACCCTGATGGTCCGAGAGCTTGCTCAAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTATGGTTTTGATTCTCTAACCCTGATGGTCCGAGAGCTTGCTCAAT  700

seq1  ACGAGAAACTCAACATTTTAGCTGTGTTGTCTAAGACTCCATTCTGGAGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGAGAAACTCAACATTTTAGCTGTGTTGTCTAAGACTCCATTCTGGAGA  750

seq1  CTTCTTCTTACTGAAATGCTTGAGAGTACGGATGGTTCTGTCACTTCTAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTTCTTACTGAAATGCTTGAGAGTACGGATGGTTCTGTCACTTCTAT  800

seq1  TCATACAGTTGTGAACCCAGGTGACTCTAGCCATGCAAGGAAGCACATAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATACAGTTGTGAACCCAGGTGACTCTAGCCATGCAAGGAAGCACATAT  850

seq1  ACATGGATAAACATACTCATATACAGATTCCTACAAGGCTCATGTATACA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGGATAAACATACTCATATACAGATTCCTACAAGGCTCATGTATACA  900

seq1  TACACACATGCACATAAACATGAATATTCATACAGTAATGCACACAGATG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACACATGCACATAAACATGAATATTCATACAGTAATGCACACAGATG  950

seq1  CATACATGTACCCCATTGATTCAGTTAGTACACACACATACATGTACACA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACATGTACCCCATTGATTCAGTTAGTACACACACATACATGTACACA  1000

seq1  GATGCATTCATAAACACTGAAAATGTATGGGAAGCTTACAAACTCACATC  1050
      |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  GATGCA-TCA-AAACACTG-AAATGTATGGGAAGCTAACAAACTCACATC  1047

seq1  TGTACACATGTATGTAAGCAAGTGCTTTCAGATACGCACCCATACGAACA  1100
      ||||||||||||||||||| |||||||   ||  ||| ||| ||||||||
seq2  TGTACACATGTATGTAAGC-AGTGCTT--CGAATCGC-CCCTTACGAACA  1093

seq1  TGGATATAT-GCATG  1114
      ||||| ||| |||||
seq2  TGGAT-TATGGCATG  1107

seq1: chr7_145388395_145389378
seq2: B6Ng01-144O24.g_71_1037 (reverse)

seq1  ACAGCCCCCAAGATGTTTTTGGTTTATGTGCTCATTTTTAAAAATGCTTT  50
      ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||   |||||||||||||
seq2  ACAGCCCC--AGAT-TTTTTGGTTTA-GTGCTCA---TTAAAAATGCTTT  43

seq1  TTATAGTAGAATAAGATAAATATTTCAAAAAGATATTGCATAATTCAAGT  100
      |  |||||| || |||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||
seq2  T--TAGTAG-ATTAGAT-AATA-TTCCAAAAGATA-TGCAT-ATTCAAGT  86

seq1  TTCTGAGACCTTAATTATCAAACACCTGCATTTTCCAGAGTGGGAAAAAT  150
      ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  TTCTGAGACCTTAATTATC-AACACCTGCA-TTTCCAGAGTGGGAAAAAT  134

seq1  TAGAAAGAGTGTTGGGATAACTGAAAATGTGCCTTCTTTCACACTGGGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAAGAGTGTTGGGATAACTGAAAATGTGCCTTCTTTCACACTGGGAA  184

seq1  ACAGCTGTTATTTGTGAGGCAAACCTGGACTCAGCTCTGGGTAGACCACA  250
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCTGTTA-TTGTGAGGCAAACCTGGACTCAGCTCTGGGTAGACCACA  233

seq1  TGTGACAAACTTGCTCCATCCATGTCAACATGTAAACACTCATACTTCTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGACAAACTTGCTCCATCCATGTCAACATGTAAACACTCATACTTCTT  283

seq1  ACTTGCCTCTTCATCAGTGTTCAGTGTGTTAACTCACGTCATTCACACAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGCCTCTTCATCAGTGTTCAGTGTGTTAACTCACGTCATTCACACAC  333

seq1  ATAACCCTTCCCTGTGGCGCCTTTAGAACAGGAGAGTTCAAAGCACACTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACCCTTCCCTGTGGCGCCTTTAGAACAGGAGAGTTCAAAGCACACTG  383

seq1  ACATAGGCACAGGTTTGCACTGAGGCAAGATCCTATATCCCAGATACACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATAGGCACAGGTTTGCACTGAGGCAAGATCCTATATCCCAGATACACA  433

seq1  TCCACACACTTGCCTCTCTGGACCTCCCGGTGTCCTGCATTGCCCAGCTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACACACTTGCCTCTCTGGACCTCCCGGTGTCCTGCATTGCCCAGCTC  483

seq1  CACATGTCCATACATTTCTGGCTAACACTGTCTAGATTACTAAAAAAGGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATGTCCATACATTTCTGGCTAACACTGTCTAGATTACTAAAAAAGGC  533

seq1  AGAGCAAAGCCCTGGATTGGGTCTCTACAGGCAGGACCAGATGAGTAGGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCAAAGCCCTGGATTGGGTCTCTACAGGCAGGACCAGATGAGTAGGG  583

seq1  TCATCTAGAGATGGAATCAAGGCTATCTGACCAGGTCAGGCTGTGGTGAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCTAGAGATGGAATCAAGGCTATCTGACCAGGTCAGGCTGTGGTGAC  633

seq1  TCCCACAAGTGAGTGCTGAAATGGCAGCCGATGTCACAAATCTTCTATAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCACAAGTGAGTGCTGAAATGGCAGCCGATGTCACAAATCTTCTATAG  683

seq1  AAGTTCTGGAATGACACTTTAAACCTAGAGCTGTCTACAGAGGACCTACT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTCTGGAATGACACTTTAAACCTAGAGCTGTCTACAGAGGACCTACT  733

seq1  AGGTTATCATTGTCAAAGCAAAACATGGCTTAGTAGTGACATATTCTAAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTATCATTGTCAAAGCAAAACATGGCTTAGTAGTGACATATTCTAAA  783

seq1  CTCCCAGACCTGATGGATAGACTTTGCTCAGGTTGCCCTAACTGATGCTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCAGACCTGATGGATAGACTTTGCTCAGGTTGCCCTAACTGATGCTA  833

seq1  CCTTCAAAATAGAACCAAGTATGTCAAAGAAAAGGAATGGGCCAGGGACT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCAAAATAGAACCAAGTATGTCAAAGAAAAGGAATGGGCCAGGGACT  883

seq1  AGCAGACCATCATGTCTCCTCCAGTTCCAGGATACTCTTTTTGCTCCAAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGACCATCATGTCTCCTCCAGTTCCAGGATACTCTTTTTGCTCCAAA  933

seq1  CCTCATGCATGGTTCAAGATACCTTAAGGAATTC  984
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCATGCATGGTTCAAGATACCTTAAGGAATTC  967