BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-147O17
Chromosome7 (Build37)
Map Location 91,320,684 - 91,477,775
singlet/doubletdoublet
Overlap geneArnt2
Upstream geneA530021J07Rik, EG666160, Tmc3, Stard5, Il16, Phgdh-ps1, LOC666170, 1700026D08Rik, Mesdc1, Mesdc2, 9930013L23Rik, 2210412D01Rik
Downstream geneLOC100039239, Fah, Zfand6, 2610206C17Rik, EG620480, Olfr291, LOC666276, Olfr290, ENSMUSG00000070600, F830104D24Rik, LOC620641, EG620672, Vmn2r-ps68, EG620697, Vmn2r-ps69
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-147O17.bB6Ng01-147O17.g
ACCDH944666DH944667
length811844
definitionDH944666|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-147O17, 5' end.DH944667|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-147O17, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(91,320,684 - 91,321,485)(91,476,932 - 91,477,775)
sequence
gaattcctttaagactaaggatgtaatggatttttgaactactacatggc
taccatgcacaaaaccctgggttctatcccctgaaccacacaaactggtc
atacatttgtaacctagcattcagaggttagaggcaggagagtcaaggtc
acccatggtcacatagcaagtctgaagacaacttgaactatatgagaccc
tgtttccaaaagaaaaaaaagggacagtgaggataagaataaaagaaaat
aaatatcccctcttaacctttggtaggccaatcagtgactaagaatttgg
gttcaaaccctaactctgtagttataagctgggagaacctgggcataggg
ctgccctgcctgctgtactgaggcctgtaaggatcagaaccaaaaacatg
tgcactggatcaagatcctggcattgagagatggattgccaaggtccact
actgtcttctttttaaacttgtgaggtgcaggcacagaccatagcaggtt
tatctgttttgagaaaatcctttgctcgtgtgctttgtgctttgtttgca
aatcatagttcctcctgtataatgactacagtggctagtaatgatttcca
gaaatgaacactttggagtaattactgtgctttgcagaggatatatcaat
tcaggtacttcacggatgctgactttagtttgtttgcccaaccatcttta
gaaagtatgcactattgatttttctttcaattgtagataaagaaactgtc
atagcaatgtcaactgacttcttcaggtataacaccagtaagtagaaaaa
gtctagagtca
gaattcaaatgcaggaaagagttatggggctctgctgagagttgaggggc
tcagctgctgaggtggtaaaggtggcatggtctgttcccttggtgctccc
agccccttggtagagatgtccccaaagtctagcctgtactttgcttatgg
gatgattgctctctgatgctctttgcagactgccactgctctcttttgcc
atctactgcctgcttcttgctaattaacacctcattagcgcctttcccag
atggagggtgagggacagagggcagacaatacaaaccaaactgcttggca
ggaaagctccttttgagtgtcagtgggacaggggccatcactggctgttt
gccagtcctgatcaacctcaccagagcttctttctttggttactccattg
ttacagactggagtctaagccagacctcagcaccatatcctgtgatcatc
aagagaaggatgagcagtgtggttctccaccaacctgttcctaatatgga
ccacagttctacctgtcaaccgtaatggtgcattgctcgctgagaggata
ggactatggctaccagtcatcccttctccccagcagccatttcttataga
ttggatatgaatgctcaagttacaaagttttgcttctaaaacatacctca
tacatatatgttaaagggcaaatcatgttaacttccccaggaagttcaga
gattttactctggtcttatgctctggcctttgcaaggcaaactcactatc
tattgtcaacaatgtgaaggtgtgaatggggcaataagaagcacatgcct
gggacaggggaagagggaggagaaagagaggtagggaagggggt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_91320684_91321485
seq2: B6Ng01-147O17.b_35_845

seq1  GAATTCCTTTAAGACTAAGGATGTAATGGA--GTTGAACTACTACATGGC  48
      ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTTAAGACTAAGGATGTAATGGATTTTTGAACTACTACATGGC  50

seq1  TACCATGCACAAAACCCTGGGTTCTATCCCCTGAACCACACAAACTGGTC  98
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCATGCACAAAACCCTGGGTTCTATCCCCTGAACCACACAAACTGGTC  100

seq1  ATACATTTGTAACCTAGCATTCAGAGGTTAGAGGCAGGAGAGTCAAGGTC  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATTTGTAACCTAGCATTCAGAGGTTAGAGGCAGGAGAGTCAAGGTC  150

seq1  ACCCATGGTCACATAGCAAGTCTGAAGACAACTTGAACTATATGAGACCC  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCATGGTCACATAGCAAGTCTGAAGACAACTTGAACTATATGAGACCC  200

seq1  TGTTTCCAAAAGAAAAAAAAGGGACAGTGAGGATAAGAATAAAAGAAAAT  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTCCAAAAGAAAAAAAAGGGACAGTGAGGATAAGAATAAAAGAAAAT  250

seq1  AAATATCCCCTCTTAACCTTTGGTAGGCCAATCAGTGACTAAGAATTTGG  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATATCCCCTCTTAACCTTTGGTAGGCCAATCAGTGACTAAGAATTTGG  300

seq1  GTTCAAACCCTAACTCTGTAGTTATAAGCTGGGAGAACCTGGGCATAGGG  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCAAACCCTAACTCTGTAGTTATAAGCTGGGAGAACCTGGGCATAGGG  350

seq1  CTGCCCTGCCTGCTGTACTGAGGCCTGTAAGGATCAGAACCAAAAACATG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCCTGCCTGCTGTACTGAGGCCTGTAAGGATCAGAACCAAAAACATG  400

seq1  TGCACTGGATCAAGATCCTGGCATTGAGAGATGGATTGCCAAGGTCCACT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCACTGGATCAAGATCCTGGCATTGAGAGATGGATTGCCAAGGTCCACT  450

seq1  ACTGTCTTCTTTTTAAACTTGTGAGGTGCAGGCACAGACCATAGCAGGTT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTCTTCTTTTTAAACTTGTGAGGTGCAGGCACAGACCATAGCAGGTT  500

seq1  TATCTGTTTTGAGAAAATCCTTTGCTCGTGTGCTTTGTGCTTTGTTTGCA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTGTTTTGAGAAAATCCTTTGCTCGTGTGCTTTGTGCTTTGTTTGCA  550

seq1  AATCATAGTTCCTCCTGTATAATGACTACAGTGGCTAGTAATGA-TTCCA  597
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  AATCATAGTTCCTCCTGTATAATGACTACAGTGGCTAGTAATGATTTCCA  600

seq1  GAAATGAACACTTTGGAGTAATTACTGTGC-TTGCAGAGGATATATCAAT  646
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  GAAATGAACACTTTGGAGTAATTACTGTGCTTTGCAGAGGATATATCAAT  650

seq1  TCAGGTACTTCACGGATGCTGAC-TTAGTTTGTTTGCCCAACCATCTTTA  695
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGTACTTCACGGATGCTGACTTTAGTTTGTTTGCCCAACCATCTTTA  700

seq1  GAAAGTATGCACTA-TGATTTT--CTTCAATTGTAGATAAAGAAACTGTC  742
      |||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGTATGCACTATTGATTTTTCTTTCAATTGTAGATAAAGAAACTGTC  750

seq1  ATAGCAATGTCAACTGACTTC-TCAGGTTATAACACCAGTAAGTAG-AAA  790
      ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||
seq2  ATAGCAATGTCAACTGACTTCTTCAGG-TATAACACCAGTAAGTAGAAAA  799

seq1  AGTCTAGAGTCA  802
      ||||||||||||
seq2  AGTCTAGAGTCA  811

seq1: chr7_91476932_91477775
seq2: B6Ng01-147O17.g_71_914 (reverse)

seq1  ACCCCCTTCCCTACCTCTCTTTCTCCTCCCTCTTCCCCTGTCCCAGGCAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCCCTTCCCTACCTCTCTTTCTCCTCCCTCTTCCCCTGTCCCAGGCAT  50

seq1  GTGCTTCTTATTGCCCCATTCACACCTTCACATTGTTGACAATAGATAGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTTCTTATTGCCCCATTCACACCTTCACATTGTTGACAATAGATAGT  100

seq1  GAGTTTGCCTTGCAAAGGCCAGAGCATAAGACCAGAGTAAAATCTCTGAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTTGCCTTGCAAAGGCCAGAGCATAAGACCAGAGTAAAATCTCTGAA  150

seq1  CTTCCTGGGGAAGTTAACATGATTTGCCCTTTAACATATATGTATGAGGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCTGGGGAAGTTAACATGATTTGCCCTTTAACATATATGTATGAGGT  200

seq1  ATGTTTTAGAAGCAAAACTTTGTAACTTGAGCATTCATATCCAATCTATA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTTTAGAAGCAAAACTTTGTAACTTGAGCATTCATATCCAATCTATA  250

seq1  AGAAATGGCTGCTGGGGAGAAGGGATGACTGGTAGCCATAGTCCTATCCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAATGGCTGCTGGGGAGAAGGGATGACTGGTAGCCATAGTCCTATCCT  300

seq1  CTCAGCGAGCAATGCACCATTACGGTTGACAGGTAGAACTGTGGTCCATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGCGAGCAATGCACCATTACGGTTGACAGGTAGAACTGTGGTCCATA  350

seq1  TTAGGAACAGGTTGGTGGAGAACCACACTGCTCATCCTTCTCTTGATGAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGAACAGGTTGGTGGAGAACCACACTGCTCATCCTTCTCTTGATGAT  400

seq1  CACAGGATATGGTGCTGAGGTCTGGCTTAGACTCCAGTCTGTAACAATGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGGATATGGTGCTGAGGTCTGGCTTAGACTCCAGTCTGTAACAATGG  450

seq1  AGTAACCAAAGAAAGAAGCTCTGGTGAGGTTGATCAGGACTGGCAAACAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAACCAAAGAAAGAAGCTCTGGTGAGGTTGATCAGGACTGGCAAACAG  500

seq1  CCAGTGATGGCCCCTGTCCCACTGACACTCAAAAGGAGCTTTCCTGCCAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTGATGGCCCCTGTCCCACTGACACTCAAAAGGAGCTTTCCTGCCAA  550

seq1  GCAGTTTGGTTTGTATTGTCTGCCCTCTGTCCCTCACCCTCCATCTGGGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGTTTGGTTTGTATTGTCTGCCCTCTGTCCCTCACCCTCCATCTGGGA  600

seq1  AAGGCGCTAATGAGGTGTTAATTAGCAAGAAGCAGGCAGTAGATGGCAAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCGCTAATGAGGTGTTAATTAGCAAGAAGCAGGCAGTAGATGGCAAA  650

seq1  AGAGAGCAGTGGCAGTCTGCAAAGAGCATCAGAGAGCAATCATCCCATAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGCAGTGGCAGTCTGCAAAGAGCATCAGAGAGCAATCATCCCATAA  700

seq1  GCAAAGTACAGGCTAGACTTTGGGGACATCTCTACCAAGGGGCTGGGAGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAAGTACAGGCTAGACTTTGGGGACATCTCTACCAAGGGGCTGGGAGC  750

seq1  ACCAAGGGAACAGACCATGCCACCTTTACCACCTCAGCAGCTGAGCCCCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAAGGGAACAGACCATGCCACCTTTACCACCTCAGCAGCTGAGCCCCT  800

seq1  CAACTCTCAGCAGAGCCCCATAACTCTTTCCTGCATTTGAATTC  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTCTCAGCAGAGCCCCATAACTCTTTCCTGCATTTGAATTC  844