BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-148E10
Chromosome7 (Build37)
Map Location 33,436,711 - 33,577,932
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC434161, EG270499, LOC100043845, LOC100043373
Upstream geneLOC100043337, LOC546949, LOC100043836, EG626305, EG668342, EG626330, LOC100043340, LOC100043343, EG626358, LOC668351, EG384593, LOC100043351, LOC100043352, LOC100043353, EG384594, LOC100043838, EG668361, LOC668362, EG624584, LOC100043355, LOC546951, EG626740, EG668371, EG668377, LOC100043842, LOC634929, EG668379, EG668381, LOC668386, LOC626373, EG384589, EG668393, EG330689, LOC100043362, LOC100043365, EG384591, LOC668398, EG384596, LOC100043370
Downstream geneLOC668410, EG624439, LOC100043376, LOC100043379, LOC100043383, EG668411, LOC100043850, LOC100043386, LOC668416, EG668526, LOC100043388, LOC270234, EG668419, EG668422, EG546954, LOC100043856, LOC100043857, EG545947, EG434676, EG668431, Abpd, EG545948, LOC435963, LOC435962, EG626970, LOC100043859, LOC627004, LOC100043398, LOC100043401, Scgb2b1, LOC668440, Abpz, LOC100043860
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-148E10.bB6Ng01-148E10.g
ACCDH944933DH944934
length1,163907
definitionDH944933|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-148E10, 5' end.DH944934|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-148E10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(33,436,711 - 33,437,886)(33,577,029 - 33,577,932)
sequence
gaattccagaggatctgtagatgtttctcctgggagcagactcctcttca
gtcctacactgtgagctatatgttctcaagaaagcagcagggtgagcttg
gggaacaggtcagtaagtgaagtagttgcttggcatacactcttgaatcc
atggtttccaaccctatgaacttataggacagctaggcataaagtgaccc
attgtaactctagcaccagagagcttactggccagtccatctagccatta
gcaagctccagtaagaggtcctgtctcaaaaaatataaggtggtctcagc
tataaaaaggacacagaattacttcccagtactcacatgatagctaacaa
ccatctgtaactccagttgcagaggatccagtgctttactgtgacctcca
cagggaaagcattcagtatttcataagacactcatgcaggcacaatctcc
atacacatacattcaacctaaataaaatgtcaagtaagcacacacatatg
catatatgtatcaatacacagatataatgtatatacacacatgtcatggt
ggagagcaactgaaggccctcactgtctttctctggccactttgttcata
cagatataaatgtcacgtgtcttatttaagattactgttacagtgataca
acacgatgatcaaatcagagtagcatcgggtcactaggaactagacactt
gcttaaccacatgatgcccttgtctccattcccatccctgtgcagaacag
agaagcccccagtgggcacattctacaggccatctcagccctcaggacat
gcaaggttataaaaacaagtagaccgagcagagagctcagaattagatct
cagtacttggcacctaattgaccaaacagtaacaggaggtaaatcctgtt
tggttcagataaccagtaaaattcaaaggcgttggactctttaagtcttc
tgcaaagttcatctgtcaccgtgtgctgtaaagattgtgacagtcaagtg
cattttacaacaaactactaaatgtgccttatccaaacacatatatcttt
acttttaaaattaaataccatcaaactacttagccaacactttgtaacta
acatgttggagagtagtttgaaacaagctgcattatatgacagaaatgtg
ttgtggttttaag
gaattcttcagaaccaaggaagctgggctttttgttaatgcaattttaaa
aggagctgtttcttgtatatcttggctatcttccaaataaatgagacaga
gtccattctatttatttaatcaagcattatagcagaaaaagtgggcagcc
attgatacactctattttttaggctaaactgcctacctttcaataatatt
ccccaagatacttacttattttggggggaggtgcagcaaacattattgat
ggtattcaagagagtagggagggctccctaggccccttctgttatgtggg
tttggggtgaaaattatgaggtagattctcagtgttgggggccaagttgg
gataggaactcctcagcatccacgggcttctctcttgctctcagtgtcct
tgcttgggtgggtggtccagggtttcttactgcttggaggccatgtaggc
catgaggtctaccaccctgttgctgtagccgtattcattgttataccagg
aaatgagcttgacaaagttgtcattgagagtagtgccagccctggcatca
aaggtggaagagtgggatttgttttttaaattgcaggagacaacctggtc
ctcagtttagcccaagatgcccttcagtggaccctcagatacctgcttca
ccacctttttgatgtcatcatacatggcaggtttctccaggcagcacatc
agatccacaacagacacattgggggtaggaacacagaaggccatgccagt
gagcttcctattcagctctgggataaccttgcccactgccttggggagca
ccagtggatgcagggattatgttctgggcagcccccacggccttctttca
acagaatttcagaggggcaatccataatcttctgagtggcagtgatggca
tggactt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_33436711_33437886
seq2: B6Ng01-148E10.b_47_1209

seq1  GAATTCCAGAGGATCTGTAGATGTTTCTCCTGGGAGCAGACTCCTCTTCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGAGGATCTGTAGATGTTTCTCCTGGGAGCAGACTCCTCTTCA  50

seq1  GTCCTACACTGTGAGCTATATGTTCTCAAGAAAGCAGCAGGGTGAGCTTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTACACTGTGAGCTATATGTTCTCAAGAAAGCAGCAGGGTGAGCTTG  100

seq1  GGGAACAGGTCAGTAAGTGAAGTAGTTGCTTGGCATACACTCTTGAATCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAACAGGTCAGTAAGTGAAGTAGTTGCTTGGCATACACTCTTGAATCC  150

seq1  ATGGTTTCCAACCCTATGAACTTATAGGACAGCTAGGCATAAAGTGACCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTTTCCAACCCTATGAACTTATAGGACAGCTAGGCATAAAGTGACCC  200

seq1  ATTGTAACTCTAGCACCAGAGAGCTTACTGGCCAGTCCATCTAGCCATTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTAACTCTAGCACCAGAGAGCTTACTGGCCAGTCCATCTAGCCATTA  250

seq1  GCAAGCTCCAGTAAGAGGTCCTGTCTCAAAAAATATAAGGTGGTCTCAGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGCTCCAGTAAGAGGTCCTGTCTCAAAAAATATAAGGTGGTCTCAGC  300

seq1  TATAAAAAGGACACAGAATTACTTCCCAGTACTCACATGATAGCTAACAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAAAAAGGACACAGAATTACTTCCCAGTACTCACATGATAGCTAACAA  350

seq1  CCATCTGTAACTCCAGTTGCAGAGGATCCAGTGCTTTACTGTGACCTCCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCTGTAACTCCAGTTGCAGAGGATCCAGTGCTTTACTGTGACCTCCA  400

seq1  CAGGGAAAGCATTCAGTATTTCATAAGACACTCATGCAGGCACAATCTCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGAAAGCATTCAGTATTTCATAAGACACTCATGCAGGCACAATCTCC  450

seq1  ATACACATACATTCAACCTAAATAAAATGTCAAGTAAGCACACACATATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACACATACATTCAACCTAAATAAAATGTCAAGTAAGCACACACATATG  500

seq1  CATATATGTATCAATACACAGATATAATGTATATACACACATGTCATGGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATATGTATCAATACACAGATATAATGTATATACACACATGTCATGGT  550

seq1  GGAGAGCAACTGAAGGCCCTCACTGTCTTTCTCTGGCCACTTTGTTCATA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGAGCAACTGAAGGCCCTCACTGTCTTTCTCTGGCCACTTTGTTCATA  600

seq1  CAGATATAAATGTCACGTGTCTTATTTAAGATTACTGTTACAGTGATACA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATATAAATGTCACGTGTCTTATTTAAGATTACTGTTACAGTGATACA  650

seq1  ACACGATGATCAAATCAGAGTAGCATCGGGTCACTAGGAACTAGACACTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACGATGATCAAATCAGAGTAGCATCGGGTCACTAGGAACTAGACACTT  700

seq1  GCTTAACCACATGATGCCCTTGTCTCCATTCCCATCCCTGTGCAGAACAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTAACCACATGATGCCCTTGTCTCCATTCCCATCCCTGTGCAGAACAG  750

seq1  AGAAGCCCCCAGTGGGCACATTCTACAGGCCATCTCAGCCCTCAGGACAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGCCCCCAGTGGGCACATTCTACAGGCCATCTCAGCCCTCAGGACAT  800

seq1  GCAAGGTTATAAAAACAAGTAGACCGAGCAGAGAGCTCAGAATTAGATCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGGTTATAAAAACAAGTAGACCGAGCAGAGAGCTCAGAATTAGATCT  850

seq1  CAGTACTTGGCACCTAATTGACCAAACAGTAACAGGAGGTAAATCCTGTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTACTTGGCACCTAATTGACCAAACAGTAACAGGAGGTAAATCCTGTT  900

seq1  TGGTTCAGATAACCAGTAAAATTCAAAGGCGTTGGACTCTTTAAGTCTTC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTCAGATAACCAGTAAAATTCAAAGGCGTTGGACTCTTTAAGTCTTC  950

seq1  TGCAAAGTTCATTCTGTCACCGTGTGCTGTATAGATTGTGACAGTCAAGT  1000
      ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TGCAAAGTTCA-TCTGTCACCGTGTGCTGTAAAGATTGTGACAGTCAAGT  999

seq1  GCATTTTACAACAAACTACTTAATTGTGCCTTATCAAAACACATATAATC  1050
      ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||
seq2  GCATTTTACAACAAACTAC-TAAATGTGCCTTATCCAAACACATAT-ATC  1047

seq1  TTTACTTTTAAAATTAAATACCAATCAAACTACTTAAGCACAAACACTTA  1100
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    | ||||||| 
seq2  TTTACTTTTAAAATTAAATACC-ATCAAACTACTTA---GCCAACACTT-  1092

seq1  TGTAACTAAGCATGTGGGAAGAGTAGTTTGAAACCAAGGCTGCATTATAT  1150
      ||||||||| ||||| || |||||||||||||||  | ||||||||||||
seq2  TGTAACTAA-CATGTTGG-AGAGTAGTTTGAAAC--AAGCTGCATTATAT  1138

seq1  GACAAGATAGTGTTGTGTGTTTTAAG  1176
      ||||  |  |||||||| ||||||||
seq2  GACAGAAATGTGTTGTG-GTTTTAAG  1163

seq1: chr7_33577029_33577932
seq2: B6Ng01-148E10.g_69_974 (reverse)

seq1  AGTCCATGCCATCACTGCCACTCAGAAGACTATGGATTGCCCCTCTGGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
seq2  AGTCCATGCCATCACTGCCACTCAGAAGATTATGGATTGCCCCTCTGAAA  50

seq1  ATCTGTGGAATGAAGGCCGT-GGGGCTGCCCAGAACATAATCCCTGCATC  99
       ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGTTGAAAGAAGGCCGTGGGGGCTGCCCAGAACATAATCCCTGCATC  100

seq1  CACTGGTGCT-CCCAAGGCAGTGGGCAAGGTTATCCCAGAGCTGAATAGG  148
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGGTGCTCCCCAAGGCAGTGGGCAAGGTTATCCCAGAGCTGAATAGG  150

seq1  AAGCTCACTGGCATGGCCTTCTGTGTTCCTACCCCCAATGTGTCTGTTGT  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTCACTGGCATGGCCTTCTGTGTTCCTACCCCCAATGTGTCTGTTGT  200

seq1  GGATCTGATGTGCTGCCTGGAGAAACCTGCCATGTATGATGACATCAAAA  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATCTGATGTGCTGCCTGGAGAAACCTGCCATGTATGATGACATCAAAA  250

seq1  AGGTGGTGAAGCAGGTATCTGAGGGTCCACTGAAGGGCATCTTGGGCTAA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGGTGAAGCAGGTATCTGAGGGTCCACTGAAGGGCATCTTGGGCTAA  300

seq1  ACTGAGGACCAGGTTGTCTCCTGCAATTTAAAAAACAAATCCCACTCTTC  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAGGACCAGGTTGTCTCCTGCAATTTAAAAAACAAATCCCACTCTTC  350

seq1  CACCTTTGATGCCAGGGCTGGCACTACTCTCAATGACAACTTTGTCAAGC  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTTTGATGCCAGGGCTGGCACTACTCTCAATGACAACTTTGTCAAGC  400

seq1  TCATTTCCTGGTATAACAATGAATACGGCTACAGCAACAGGGTGGTAGAC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTTCCTGGTATAACAATGAATACGGCTACAGCAACAGGGTGGTAGAC  450

seq1  CTCATGGCCTACATGGCCTCCAAGCAGTAAGAAACCCTGGACCACCCACC  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATGGCCTACATGGCCTCCAAGCAGTAAGAAACCCTGGACCACCCACC  500

seq1  CAAGCAAGGACACTGAGAGCAAGAGAGAAGCCCGTGGATGCTGAGGAGTT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCAAGGACACTGAGAGCAAGAGAGAAGCCCGTGGATGCTGAGGAGTT  550

seq1  CCTATCCCAACTTGGCCCCCAACACTGAGAATCTACCTCATAATTTTCAC  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTATCCCAACTTGGCCCCCAACACTGAGAATCTACCTCATAATTTTCAC  600

seq1  CCCAAACCCACATAACAGAAGGGGCCTAGGGAGCCCTCCCTACTCTCTTG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAAACCCACATAACAGAAGGGGCCTAGGGAGCCCTCCCTACTCTCTTG  650

seq1  AATACCATCAATAATGTTTGCTGCACCTCCCCCCAAAATAAGTAAGTATC  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACCATCAATAATGTTTGCTGCACCTCCCCCCAAAATAAGTAAGTATC  700

seq1  TTGGGGAATATTATTGAAAGGTAGGCAGTTTAGCCTAAAAAATAGAGTGT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGGAATATTATTGAAAGGTAGGCAGTTTAGCCTAAAAAATAGAGTGT  750

seq1  ATCAATGGCTGCCCACTTTTTCTGCTATAATGCTTGATTAAATAAATAGA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAATGGCTGCCCACTTTTTCTGCTATAATGCTTGATTAAATAAATAGA  800

seq1  ATGGACTCTGTCTCATTTATTTGGAAGATAGCCAAGATATACAAGAAACA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGACTCTGTCTCATTTATTTGGAAGATAGCCAAGATATACAAGAAACA  850

seq1  GCTCCTTTTAAAATTGCATTAACAAAAAGCCCAGCTTCCTTGGTTCTGAA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCTTTTAAAATTGCATTAACAAAAAGCCCAGCTTCCTTGGTTCTGAA  900

seq1  GAATTC  904
      ||||||
seq2  GAATTC  906