BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-148M09
Chromosome7 (Build37)
Map Location 77,285,985 - 77,461,669
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC384741, EG665410
Downstream geneNr2f2, LOC100042833, B130024G19Rik, LOC100042838, LOC665486, LOC100041957
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-148M09.bB6Ng01-148M09.g
ACCDH945289DH945290
length1,0581,021
definitionDH945289|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-148M09, 5' end.DH945290|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-148M09, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(77,285,985 - 77,287,062)(77,460,641 - 77,461,669)
sequence
gaattcttcatttccaagtcagcagtgctctcacttggaatgcttctaat
atctcatcaagatgcactagtaggatcctgtagtacttttgagctcatct
agaaaatgcaggacagtctccttattttaattgtgtttgtcaagtctcat
gggacagctactgtaggaaatccataggctccaagaatagaaatattgat
ctttccagcaccattctgcttaccacttctagacttggctacaatactag
ggctcagcactgccctcaatgctcagaagtaacgtcataacaagacctga
gttacaggacagagtgatgatattaaagcatctccttgaattttggaaca
agaggagttggggattgaacaggacatagctgcttattcttcaacagttg
tggttgggaagtggatgaatgactggctggagaatgtgagctctgcttta
tagcaggcaaaaacttggatctttatgtggggtttgatcttttctacctt
tatttatattagttattttccaaaatagttgctacttgttaacatattca
tttacttacaagtgatctaattaaatggcaatatataactgccaatgaaa
tcttaaatattagatgtccattaatacatttagaatgttcagtttgggga
gtaagttgatgatgagatcattatggcctggatattacatgctaccaaag
gaacagaaaatgatccaggacaaatttctcatccttctcctgaaaccaaa
aagcaaatggaagattttgttgacaagaccctaatatatctgtctcttgt
gaggctgtgtcagtgcctggcaaacactgaggttgatgctcacagtcaac
tattggatggaacataaggcccccatgaagagttagagaaagtacccaag
agctaaagggtctgcaaccctatagaggacaacatatgaactaaccagta
ccctcaaggcttgtgtctctcgtgcattattagagaggatggtctagtag
gcatcatggaagagaagccctggtcttgcgaaaatattcccattcagggt
atgccagg
gaattcttcctatgttgccaatttagtgagcataaattactgcgaacctt
atatggaatagattatgttcttaagccttctcagatgtgtagccagtaga
ggttttaaacaaacaaacaaacaaacaaacaagcccccgaaatgcagcta
aattctggtggcatttggagtcctctctggatatgtttcctctccacccc
tgtgagggaattacagggctgcgttccaaccccaggctttcttagccaca
cgcagctcttcagaaacctgcatggggtttccttcttagattgaaataga
gtaaggaggaatatgacatgttggtgtggcaatggcagtgtggtgggacc
aatgaagaggaggctccaactccgaagaaaccgtgaactgacccctctgc
catggctgagaaccatgagccaccacccccttttttaaagctattgtagg
tgcaattctcaggttcgtccggatgcaaggggagtttaagtgatttgcag
ctttccacattgctgatgatgaagtggtacttcggctgttaaacttgatt
tcaattcggagatgagatgctgcatcctctaaagtgacagatggaattcc
tgcttcagaattcattacaggaggtgaaggacaatggtgaaaatttgagt
ctactagacagttcagcaggtcaaaatatagttgggccactaaaagttaa
ataaatcggggagttaaaattcactggaaagtgtatttttaatggaggtt
tccaggttcttcagtgatcttaggtttctcaggctggtgtgatggatcag
tgggtaaagtatttaccatcaagcttgggaagctcgacaagttgagttga
atcctggaccacatagtggaaggagagaacatttcatattaattgtctcc
tgatttactggatactgtggcatgagcatactgtcccccataaggaaact
atgtgagacgaagattctgtgacattttattttccttatattttgagcca
ctgaatgtacgcatccctact
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_77285985_77287062
seq2: B6Ng01-148M09.b_47_1104

seq1  GAATTCTTCATTTCCAAGTCAGCAGTGCTCTCACTTGGAATGCTTCTAAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTCATTTCCAAGTCAGCAGTGCTCTCACTTGGAATGCTTCTAAT  50

seq1  ATCTCATCAAGATGCACTAGTAGGATCCTGTAGTACTTTTGAGCTCATCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCATCAAGATGCACTAGTAGGATCCTGTAGTACTTTTGAGCTCATCT  100

seq1  AGAAAATGCAGGACAGTCTCCTTATTTTAATTGTGTTTGTCAAGTCTCAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAATGCAGGACAGTCTCCTTATTTTAATTGTGTTTGTCAAGTCTCAT  150

seq1  GGGACAGCTACTGTAGGAAATCCATAGGCTCCAAGAATAGAAATATTGAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGACAGCTACTGTAGGAAATCCATAGGCTCCAAGAATAGAAATATTGAT  200

seq1  CTTTCCAGCACCATTCTGCTTACCACTTCTAGACTTGGCTACAATACTAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCCAGCACCATTCTGCTTACCACTTCTAGACTTGGCTACAATACTAG  250

seq1  GGCTCAGCACTGCCCTCAATGCTCAGAAGTAACGTCATAACAAGACCTGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTCAGCACTGCCCTCAATGCTCAGAAGTAACGTCATAACAAGACCTGA  300

seq1  GTTACAGGACAGAGTGATGATATTAAAGCATCTCCTTGAATTTTGGAACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTACAGGACAGAGTGATGATATTAAAGCATCTCCTTGAATTTTGGAACA  350

seq1  AGAGGAGTTGGGGATTGAACAGGACATAGCTGCTTATTCTTCAACAGTTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGAGTTGGGGATTGAACAGGACATAGCTGCTTATTCTTCAACAGTTG  400

seq1  TGGTTGGGAAGTGGATGAATGACTGGCTGGAGAATGTGAGCTCTGCTTTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTGGGAAGTGGATGAATGACTGGCTGGAGAATGTGAGCTCTGCTTTA  450

seq1  TAGCAGGCAAAAACTTGGATCTTTATGTGGGGTTTGATCTTTTCTACCTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCAGGCAAAAACTTGGATCTTTATGTGGGGTTTGATCTTTTCTACCTT  500

seq1  TATTTATATTAGTTATTTTCCAAAATAGTTGCTACTTGTTAACATATTCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTATATTAGTTATTTTCCAAAATAGTTGCTACTTGTTAACATATTCA  550

seq1  TTTACTTACAAGTGATCTAATTAAATGGCAATATATAACTGCCAATGAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACTTACAAGTGATCTAATTAAATGGCAATATATAACTGCCAATGAAA  600

seq1  TCTTAAATATTAGATGTCCATTAATACATTTAGAATGTTCAGTTTGGGGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTAAATATTAGATGTCCATTAATACATTTAGAATGTTCAGTTTGGGGA  650

seq1  GTAAGTTGATGATGAGATCATTATGGCCTGGATATTACATGCTACCAAAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAGTTGATGATGAGATCATTATGGCCTGGATATTACATGCTACCAAAG  700

seq1  GAACAGAAAATGATCCAGGACAAATTTCTCATCCTTCTCCTGAAACCAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACAGAAAATGATCCAGGACAAATTTCTCATCCTTCTCCTGAAACCAAA  750

seq1  AAGCAAATGGAAGATTTTGTTGACAAGACCCTAATATATCTGTCTCTTGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAAATGGAAGATTTTGTTGACAAGACCCTAATATATCTGTCTCTTGT  800

seq1  GAGGCTGTGTCAGTGCCTGGCAAACACTGAGGTTGATGCTCACAGTCAAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGCTGTGTCAGTGCCTGGCAAACACTGAGGTTGATGCTCACAGTCAAC  850

seq1  TATTGGATGGAACATAGGGCCCCCAATGAAGGAGTTAGAGAAAGTACCCA  900
      |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||
seq2  TATTGGATGGAACATAAGGCCCCC-ATGAA-GAGTTAGAGAAAGTACCCA  898

seq1  AGGAGCTAAAGGGGTCTGCAACCCTATAAGAGGAACAACAATATGAACTA  950
      | |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||
seq2  A-GAGCTAAA-GGGTCTGCAACCCTAT-AGAGG-ACAAC-ATATGAACTA  943

seq1  ACCAGTACCCTCCAGAGCTTGTGTCTCTCGTTGCATATATAGCAGAGGAT  1000
      |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||   |||||||
seq2  ACCAGTACCCTCAAG-GCTTGTGTCTCTCG-TGCAT-TATTAGAGAGGAT  990

seq1  GGTCTAGTAGGCCATCAATGGGAGGAGAGGCCCTTGGTCTTGCGAAGATT  1050
      ||||||||||| |||||   ||| |||| |||| ||||||||||||    
seq2  GGTCTAGTAGG-CATCA--TGGAAGAGAAGCCC-TGGTCTTGCGAA---A  1033

seq1  ATATGCCCCAGTACAGGGGAATGCCAGG  1078
      |||| |||   | || ||| ||||||||
seq2  ATATTCCC--ATTCA-GGGTATGCCAGG  1058

seq1: chr7_77460641_77461669
seq2: B6Ng01-148M09.g_68_1088 (reverse)

seq1  AGTAGGGATGCGTACA-TCAGTGGCTCAAAAATATTAAGGAAAATTAAAA  49
      |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||
seq2  AGTAGGGATGCGTACATTCAGTGGCTC-AAAATA-TAAGGAAAA-TAAAA  47

seq1  TGTCACAGAATCTTCGTCTCACACTTTGTTTCCTTATGGGGGACAGTATG  99
      |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCACAGAATCTTCGTCTCACA--TAGTTTCCTTATGGGGGACAGTATG  95

seq1  CTCATGCCACAGTATCCAAGTAAATCAGGAGACAATTAATATGAATTGTT  149
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |
seq2  CTCATGCCACAGTATCC-AGTAAATCAGGAGACAATTAATATGAAATG-T  143

seq1  TCTCTCCTTCCACTATGTGGGTCCAGGATTCAACTCAACTTGTCGAGCTT  199
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCCTTCCACTATGT-GGTCCAGGATTCAACTCAACTTGTCGAGCTT  192

seq1  CCCAAGCTTGATGGTAAATACTTTACCCACTGATCCATCACACCAGCCCT  249
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  CCCAAGCTTGATGGTAAATACTTTACCCACTGATCCATCACACCAG-CCT  241

seq1  GAGAAACCTAAGATCACTGAAGAACCTGGAAACCTCCATTAAAAATACAC  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAACCTAAGATCACTGAAGAACCTGGAAACCTCCATTAAAAATACAC  291

seq1  TTTCCAGTGAATTTTAACTCCCCGATTTATTTAACTTTTAGTGGCCCAAC  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCAGTGAATTTTAACTCCCCGATTTATTTAACTTTTAGTGGCCCAAC  341

seq1  TATATTTTGACCTGCTGAACTGTCTAGTAGACTCAAATTTTCACCATTGT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATTTTGACCTGCTGAACTGTCTAGTAGACTCAAATTTTCACCATTGT  391

seq1  CCTTCACCTCCTGTAATGAATTCTGAAGCAGGAATTCCATCTGTCACTTT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCACCTCCTGTAATGAATTCTGAAGCAGGAATTCCATCTGTCACTTT  441

seq1  AGAGGATGCAGCATCTCATCTCCGAATTGAAATCAAGTTTAACAGCCGAA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGATGCAGCATCTCATCTCCGAATTGAAATCAAGTTTAACAGCCGAA  491

seq1  GTACCACTTCATCATCAGCAATGTGGAAAGCTGCAAATCACTTAAACTCC  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACCACTTCATCATCAGCAATGTGGAAAGCTGCAAATCACTTAAACTCC  541

seq1  CCTTGCATCCGGACGAACCTGAGAATTGCACCTACAATAGCTTTAAAAAA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGCATCCGGACGAACCTGAGAATTGCACCTACAATAGCTTTAAAAAA  591

seq1  GGGGGTGGTGGCTCATGGTTCTCAGCCATGGCAGAGGGGTCAGTTCACGG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGTGGTGGCTCATGGTTCTCAGCCATGGCAGAGGGGTCAGTTCACGG  641

seq1  TTTCTTCGGAGTTGGAGCCTCCTCTTCATTGGTCCCACCACACTGCCATT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTCGGAGTTGGAGCCTCCTCTTCATTGGTCCCACCACACTGCCATT  691

seq1  GCCACACCAACATGTCATATTCCTCCTTACTCTATTTCAATCTAAGAAGG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCACACCAACATGTCATATTCCTCCTTACTCTATTTCAATCTAAGAAGG  741

seq1  AAACCCCATGCAGGTTTCTGAAGAGCTGCGTGTGGCTAAGAAAGCCTGGG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCCCATGCAGGTTTCTGAAGAGCTGCGTGTGGCTAAGAAAGCCTGGG  791

seq1  GTTGGAACGCAGCCCTGTAATTCCCTCACAGGGGTGGAGAGGAAACATAT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGGAACGCAGCCCTGTAATTCCCTCACAGGGGTGGAGAGGAAACATAT  841

seq1  CCAGAGAGGACTCCAAATGCCACCAGAATTTAGCTGCATTTCGGGGGCTT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAGAGGACTCCAAATGCCACCAGAATTTAGCTGCATTTCGGGGGCTT  891

seq1  GTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTAAAACCTCTACTGGCTACACATCTGA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTAAAACCTCTACTGGCTACACATCTGA  941

seq1  GAAGGCTTAAGAACATAATCTATTCCATATAAGGTTCGCAGTAATTTATG  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGCTTAAGAACATAATCTATTCCATATAAGGTTCGCAGTAATTTATG  991

seq1  CTCACTAAATTGGCAACATAGGAAGAATTC  1029
      ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACTAAATTGGCAACATAGGAAGAATTC  1021