BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-148O15
Chromosome7 (Build37)
Map Location 117,895,799 - 118,015,292
singlet/doubletdoublet
Overlap geneB430319F04Rik, Ampd3, Rnf141, Xlkd1, Mrvi1
Upstream gene4930431P19Rik, Nrip3, Scube2, Phxr5, Rab6ip1, Tmem41b, Ipo7, AA474408, Zfp143, Wee1, Swap70, EG668368, Sbf2, LOC668246, Adm
Downstream geneCtr9, Eif4g2, LOC100043221, LOC100042658, LOC384658, Galntl4, LOC668399
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-148O15.bB6Ng01-148O15.g
ACCDH945395DH945396
length8441,052
definitionDH945395|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-148O15, 5' end.DH945396|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-148O15, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(117,895,799 - 117,896,642)(118,014,231 - 118,015,292)
sequence
gaattcagagatccatctgcttctgcttcccaagtgctaagattaaaggt
gtgtgccaccatgccccaaagcattttttaaaaattcacttgtttttcct
tcttaaaaacacaacttaagatcctcacccatgccccttaccacctacag
cacagtagagcgaagtctagtctcaggggtgcaagtgagctagccctgag
ttcatgagtgagggagagccacctcctcatctgttgtgggggtagcatga
gcaaggaagagagctcaccttgacaggcgggtgagctagccccaaggtta
tgagagcaaaagagctgggccagccccctcactggctgcagcatttggga
aagtggtctttgcatcctatctggtcagcacagcagagctggcctggagg
cgaaggcactggtgaactggcctagaggacttgaaagtaggagagctgcc
ccagccccttgctggctttggcattgagtgaggcagctgggacagtgtgg
agagcttgccctggtggtgtgggagcgggccagctgacaaactcagctat
cttccagccccagatccacccaaccaacatcaatcctatctatgaactga
tggaatcctacagatccaaagcatcaggctctccgtggcacagggcaaca
acaaggtatccaagaggagttcctgtgagggcccagtgtagatagtgtag
cagaagccagaagcttcaaaacacactaatggctcattgcaatgaacact
tgcaagtaaagatgtgtggacaacagctttggggcagcctcagctcctcc
accctctcagaggaaaaggggaggggggaatgaaggggaaagga
gaattctcatttaaagggtattttgaataatatctgccatgtgttgctct
gtgtcattgaattgaagaaccactgctttagacagcataggaagtatccc
caggcagggaactatgggtctgggcattagatatgtgcccagtatactaa
cctctctatctatattttattgacagcaaacttgaagaactggtccactt
cctacaagtcatgtatcctaaattgtgtcaacactggcaagtgatctgga
tgatggccgcagtgatgctggtcttgagtgttgttctcgggctgtacagt
tcctataactcctgcacagaggaggccgatgggccccctgggagatccac
ctgctctgcagcccagcgggactcctggtggagctccggactccagcaag
agctgccagcagagcagtaggacatcggactccttagtcatgccctgctc
tagtgcattcatcccaacaccctgcccctaagtacagtgtgtcaggccca
aaccgggcacatgtggccacccatcccattggggaacaaggaggctctct
cctgtcattcatggaagctactcgcaacaacctgatgctttgaagggatc
aacaaaagatcaaattgtgctctgggaaagtgcctggttgataaagaatc
aaccttcattaaggactctagcacaagggaagggtcctgcccctggctca
gatggattaggagaactgaaatcccttcattcaggggaaagtgagaaacc
tactttccctttctcctccctgtgtttcatggtcagtaagaattgtactt
taggcgccagcactgaccataaggctcagtcttgggagtcacaacatatt
gtcccacttcccacttatgtatcacaaccgttctttcgccttccctctcc
cttcagattacctttttttttttttttttcagagagtgggaagctttctc
ataaaatgccacaggctaaaagtagccccatgctagaaggaacaggaaga
tgtgattatatataatgatctgttaacttagactataccatgttgtgcac
aa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_117895799_117896642
seq2: B6Ng01-148O15.b_47_890

seq1  GAATTCAGAGATCCATCTGCTTCTGCTTCCCAAGTGCTAAGATTAAAGGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGAGATCCATCTGCTTCTGCTTCCCAAGTGCTAAGATTAAAGGT  50

seq1  GTGTGCCACCATGCCCCAAAGCATTTTTTAAAAATTCACTTGTTTTTCCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGCCACCATGCCCCAAAGCATTTTTTAAAAATTCACTTGTTTTTCCT  100

seq1  TCTTAAAAACACAACTTAAGATCCTCACCCATGCCCCTTACCACCTACAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTAAAAACACAACTTAAGATCCTCACCCATGCCCCTTACCACCTACAG  150

seq1  CACAGTAGAGCGAAGTCTAGTCTCAGGGGTGCAAGTGAGCTAGCCCTGAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGTAGAGCGAAGTCTAGTCTCAGGGGTGCAAGTGAGCTAGCCCTGAG  200

seq1  TTCATGAGTGAGGGAGAGCCACCTCCTCATCTGTTGTGGGGGTAGCATGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATGAGTGAGGGAGAGCCACCTCCTCATCTGTTGTGGGGGTAGCATGA  250

seq1  GCAAGGAAGAGAGCTCACCTTGACAGGCGGGTGAGCTAGCCCCAAGGTTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGGAAGAGAGCTCACCTTGACAGGCGGGTGAGCTAGCCCCAAGGTTA  300

seq1  TGAGAGCAAAAGAGCTGGGCCAGCCCCCTCACTGGCTGCAGCATTTGGGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAGCAAAAGAGCTGGGCCAGCCCCCTCACTGGCTGCAGCATTTGGGA  350

seq1  AAGTGGTCTTTGCATCCTATCTGGTCAGCACAGCAGAGCTGGCCTGGAGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGGTCTTTGCATCCTATCTGGTCAGCACAGCAGAGCTGGCCTGGAGG  400

seq1  CGAAGGCACTGGTGAACTGGCCTAGAGGACTTGAAAGTAGGAGAGCTGCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAAGGCACTGGTGAACTGGCCTAGAGGACTTGAAAGTAGGAGAGCTGCC  450

seq1  CCAGCCCCTTGCTGGCTTTGGCATTGAGTGAGGCAGCTGGGACAGTGTGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCCCCTTGCTGGCTTTGGCATTGAGTGAGGCAGCTGGGACAGTGTGG  500

seq1  AGAGCTTGCCCTGGTGGTGTGGGAGCGGGCCAGCTGACAAACTCAGCTAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCTTGCCCTGGTGGTGTGGGAGCGGGCCAGCTGACAAACTCAGCTAT  550

seq1  CTTCCAGCCCCAGATCCACCCAACCAACATCAATCCTATCTATGAACTGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCAGCCCCAGATCCACCCAACCAACATCAATCCTATCTATGAACTGA  600

seq1  TGGAATCCTACAGATCCAAAGCATCAGGCTCTCCGTGGCACAGGGCAACA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAATCCTACAGATCCAAAGCATCAGGCTCTCCGTGGCACAGGGCAACA  650

seq1  ACAAGGTATCCAAGAGGAGTTCCTGTGAGGGCCCAGTGTAGATAGTGTAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGGTATCCAAGAGGAGTTCCTGTGAGGGCCCAGTGTAGATAGTGTAG  700

seq1  CAGAAGCCAGAAGCTTCAAAACACACTAATGGCTCATTGCAATGAACACT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAGCCAGAAGCTTCAAAACACACTAATGGCTCATTGCAATGAACACT  750

seq1  TGCAAGTAAAGATGTGTGGACAACAGCTTTGGGGCAGCCTCAGCTCCTCC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAAGTAAAGATGTGTGGACAACAGCTTTGGGGCAGCCTCAGCTCCTCC  800

seq1  ACCCTCTCAGAGGAAAAGGGGAGGGGGGAATGAAGGGGAAAGGA  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTCTCAGAGGAAAAGGGGAGGGGGGAATGAAGGGGAAAGGA  844

seq1: chr7_118014231_118015292
seq2: B6Ng01-148O15.g_68_1119 (reverse)

seq1  TTGTGCACAAACATGTGTATAGTCTATATGTATACAGATTCATTATATAT  50
      |||||||| |||||| ||||||||  || ||  ||||| |||||||||||
seq2  TTGTGCAC-AACATG-GTATAGTC--TAAGTTAACAGA-TCATTATATAT  45

seq1  TAATTCACATCTTCCTGTTTCCTTTCTAGCATGGGGCTACTTTTAGCCTG  100
        | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||
seq2  --AATCACATCTTCCTGTT--CCTTCTAGCATGGGGCTACTTTTAGCCTG  91

seq1  TGCATTTTTATGAGAAAGCTTTCCCACTCTCTG-AAAAAAAAAAAAAAAA  149
      ||   |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  TGGCATTTTATGAGAAAGC-TTCCCACTCTCTGAAAAAAAAAAAAAAAAA  140

seq1  GGTAATTCTGAAAGGGAGAGGGAAGGCGAAAGAACGGTTGTGATACATAA  199
      ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  GGTAA-TCTG-AAGGGAGAGGGAAGGCGAAAGAACGGTTGTGATACAT-A  187

seq1  AGTGGGAAGTGGGACAATATGTTGTGACT-CCAAGACTGAGCCTTATGGT  248
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGGAAGTGGGACAATATGTTGTGACTCCCAAGACTGAGCCTTATGGT  237

seq1  CAGTGCTGGCGCCT-AAGTACAATTCTTACTGACCATGAAACACAGGGAG  297
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGCTGGCGCCTAAAGTACAATTCTTACTGACCATGAAACACAGGGAG  287

seq1  GAGAAAGGGAAAGTAGGTTTCTCACTTTCCCCTGAATGAAGGGATTTCAG  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAAGGGAAAGTAGGTTTCTCACTTTCCCCTGAATGAAGGGATTTCAG  337

seq1  TTCTCCTAATCCATCTGAGCCAGGGGCAGGACCCTTCCCTTGTGCTAGAG  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCCTAATCCATCTGAGCCAGGGGCAGGACCCTTCCCTTGTGCTAGAG  387

seq1  TCCTTAATGAAGGTTGATTCTTTATCAACCAGGCACTTTCCCAGAGCACA  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTAATGAAGGTTGATTCTTTATCAACCAGGCACTTTCCCAGAGCACA  437

seq1  ATTTGATCTTTTGTTGATCCCTTCAAAGCATCAGGTTGTTGCGAGTAGCT  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGATCTTTTGTTGATCCCTTCAAAGCATCAGGTTGTTGCGAGTAGCT  487

seq1  TCCATGAATGACAGGAGAGAGCCTCCTTGTTCCCCAATGGGATGGGTGGC  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATGAATGACAGGAGAGAGCCTCCTTGTTCCCCAATGGGATGGGTGGC  537

seq1  CACATGTGCCCGGTTTGGGCCTGACACACTGTACTTAGGGGCAGGGTGTT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATGTGCCCGGTTTGGGCCTGACACACTGTACTTAGGGGCAGGGTGTT  587

seq1  GGGATGAATGCACTAGAGCAGGGCATGACTAAGGAGTCCGATGTCCTACT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATGAATGCACTAGAGCAGGGCATGACTAAGGAGTCCGATGTCCTACT  637

seq1  GCTCTGCTGGCAGCTCTTGCTGGAGTCCGGAGCTCCACCAGGAGTCCCGC  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTGCTGGCAGCTCTTGCTGGAGTCCGGAGCTCCACCAGGAGTCCCGC  687

seq1  TGGGCTGCAGAGCAGGTGGATCTCCCAGGGGGCCCATCGGCCTCCTCTGT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCTGCAGAGCAGGTGGATCTCCCAGGGGGCCCATCGGCCTCCTCTGT  737

seq1  GCAGGAGTTATAGGAACTGTACAGCCCGAGAACAACACTCAAGACCAGCA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGAGTTATAGGAACTGTACAGCCCGAGAACAACACTCAAGACCAGCA  787

seq1  TCACTGCGGCCATCATCCAGATCACTTGCCAGTGTTGACACAATTTAGGA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTGCGGCCATCATCCAGATCACTTGCCAGTGTTGACACAATTTAGGA  837

seq1  TACATGACTTGTAGGAAGTGGACCAGTTCTTCAAGTTTGCTGTCAATAAA  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATGACTTGTAGGAAGTGGACCAGTTCTTCAAGTTTGCTGTCAATAAA  887

seq1  ATATAGATAGAGAGGTTAGTATACTGGGCACATATCTAATGCCCAGACCC  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAGATAGAGAGGTTAGTATACTGGGCACATATCTAATGCCCAGACCC  937

seq1  ATAGTTCCCTGCCTGGGGATACTTCCTATGCTGTCTAAAGCAGTGGTTCT  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTTCCCTGCCTGGGGATACTTCCTATGCTGTCTAAAGCAGTGGTTCT  987

seq1  TCAATTCAATGACACAGAGCAACACATGGCAGATATTATTCAAAATACCC  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATTCAATGACACAGAGCAACACATGGCAGATATTATTCAAAATACCC  1037

seq1  TTTAAATGAGAATTC  1062
      |||||||||||||||
seq2  TTTAAATGAGAATTC  1052