BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-149P13
Chromosome7 (Build37)
Map Location 120,987,712 - 121,105,663
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSpon1
Upstream geneTead1, 4632411J06Rik, LOC434227, Arntl, A630005I04Rik, Btbd10, Pth, LOC100042736, Mlstd2, EG434228
Downstream geneRras2, LOC668451, Copb1, Psma1, 4933406I18Rik, Pde3b, Cyp2r1, Calca, LOC100043295, Calcb, Insc, EG627967
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-149P13.bB6Ng01-149P13.g
ACCDH946168DH946169
length1,0581,090
definitionDH946168|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-149P13, 5' end.DH946169|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-149P13, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(120,987,712 - 120,988,770)(121,104,558 - 121,105,663)
sequence
tactcatccctaacaggagggattaagagtggagcttctcctgagggcaa
ggtggcccatatgaggaatccaactttacaaaacaataatggcaagagcc
aagcaagcgctatcctggcttacaaacacttatttcctctgtaaagcatc
cttgtggtgtagatgctaaggagaaagctcaggcccagggaggctagata
acttctcacggtcacagagtagccaaccatggttagaagcattgaggcct
tagatctctgatttggacattagacttcaaggcctcagacaggaactatg
ggtcaggctgagattccacatctcagcttgacatcgccggtaggcaggcc
ttggagtggcatgtgtaactttctccgttgttgattgctttacatctatt
gccttatcaacagacacttcatatcttattgtcacaggaacctctgacat
ggtcacataagctccttcccctctgattctctttcaccttgatgtaagag
gtatttaacaaacccaacatggctccccatcaccctaagatccagttcag
agtcttgatcctgccgtgtaagtctccccatgcccttcagcaggatgtcc
catcagcctctgcttagccactcagtgaaccctgctctgcagcctttttc
ctctgctcataacattattgagcatttcctgcacgcagtcactggggaca
tgggagggcgtctttgacccagaagtaatctacaactaatatatgccagg
tgcacagcccttcatctgcagtcctgagatcccaaagactaaaattcaaa
aaaaaaaaaaatcttttttttttactcgtttgaagcccagaccttctctg
gattaagatgattattgtctttagtgtgaatataagattttgattatgag
atataagcccagaccctgtaggtatggatttaaactgtattatctttctg
gaccctaaaattgttcctcagctccaaaatatatggcctaagggtgcatg
tggcctttttcatatattcagagtggggacctggaagctttgtccctacc
cacccccc
ggattaagatagcatcaagtgacattcctggatgctttcccctgtctaac
tgcccatgtttccagagagacagctgctggtttttgaaaggatgtcattt
cataaatttcagtcctctcttgtggaagttcacaaagcatttaaggcctc
aagactcggtgtctaagtgggcttcaaaaatcagcttaaacatcaaactg
ttccttcccattatgttcacttgatcagacaaattctagacatctgagaa
gatgtgctctctgacttagaaggatttaatggattgaggtggcaatagca
aggaaggggctggaagtaggatggcagcagggatgggaggtggggccaga
gctgagaagatgccaggaagcctctggaggcagagagctgagccaaggac
acccaggcttggagagatactcagcctctgcagagggcttaggcagcagg
gtagaaagctaggtctgtggcagtgggcttaggcacaaggccaacgggaa
ttgcccagatggcaggactctgagtggatatgatctctagcaggagagag
cacgtgggaaaccatgcagaagaaaggggctggagacttgacagagaaga
caatgtttgctccttgattcaccttccatgtcagctctgtttgacgtagg
ggctaaagcattttttagatccttaacaagattgcagagggactctatag
tcatctcatggacgtgcaggctgcctctaatttctattaggaccatccac
acagcaaaccttcctgtgcattggactcttcctgtattgaggacgatttc
ctaagaatagattctgagaagtggaacaactgggtcaaaggaaaggaaca
tattttatgtgtcttatatacagtggagagcattggagagccaaattgct
ttccaaaggttggttgaacccatcgctttcatttcaacaagatttatggg
tgattatgcagcttttaatgagatgttggctcaaaatgatagtacaaatc
tgaacattatcgtgctaatcatagctttctaccgtgctcttattaatctc
acaacaagccagtgtgacagaaattgttctgcttgtttca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_120987712_120988770
seq2: B6Ng01-149P13.b_59_1116

seq1  TACTCATCCCTAACAGGAGGGATTAAGAGTGGAGCTTCTCCTGAGGGCAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCATCCCTAACAGGAGGGATTAAGAGTGGAGCTTCTCCTGAGGGCAA  50

seq1  GGTGGCCCATATGAGGAATCCAACTTTACAAAACAATAATGGCAAGAGCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGCCCATATGAGGAATCCAACTTTACAAAACAATAATGGCAAGAGCC  100

seq1  AAGCAAGCGCTATCCTGGCTTACAAACACTTATTTCCTCTGTAAAGCATC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAAGCGCTATCCTGGCTTACAAACACTTATTTCCTCTGTAAAGCATC  150

seq1  CTTGTGGTGTAGATGCTAAGGAGAAAGCTCAGGCCCAGGGAGGCTAGATA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTGGTGTAGATGCTAAGGAGAAAGCTCAGGCCCAGGGAGGCTAGATA  200

seq1  ACTTCTCACGGTCACAGAGTAGCCAACCATGGTTAGAAGCATTGAGGCCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCTCACGGTCACAGAGTAGCCAACCATGGTTAGAAGCATTGAGGCCT  250

seq1  TAGATCTCTGATTTGGACATTAGACTTCAAGGCCTCAGACAGGAACTATG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATCTCTGATTTGGACATTAGACTTCAAGGCCTCAGACAGGAACTATG  300

seq1  GGTCAGGCTGAGATTCCACATCTCAGCTTGACATCGCCGGTAGGCAGGCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCAGGCTGAGATTCCACATCTCAGCTTGACATCGCCGGTAGGCAGGCC  350

seq1  TTGGAGTGGCATGTGTAACTTTCTCCGTTGTTGATTGCTTTACATCTATT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGAGTGGCATGTGTAACTTTCTCCGTTGTTGATTGCTTTACATCTATT  400

seq1  GCCTTATCAACAGACACTTCATATCTTATTGTCACAGGAACCTCTGACAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTATCAACAGACACTTCATATCTTATTGTCACAGGAACCTCTGACAT  450

seq1  GGTCACATAAGCTCCTTCCCCTCTGATTCTCTTTCACCTTGATGTAAGAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCACATAAGCTCCTTCCCCTCTGATTCTCTTTCACCTTGATGTAAGAG  500

seq1  GTATTTAACAAACCCAACATGGCTCCCCATCACCCTAAGATCCAGTTCAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTTAACAAACCCAACATGGCTCCCCATCACCCTAAGATCCAGTTCAG  550

seq1  AGTCTTGATCCTGCCGTGTAAGTCTCCCCATGCCCTTCAGCAGGATGTCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTTGATCCTGCCGTGTAAGTCTCCCCATGCCCTTCAGCAGGATGTCC  600

seq1  CATCAGCCTCTGCTTAGCCACTCAGTGAACCCTGCTCTGCAGCCTTTTTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCAGCCTCTGCTTAGCCACTCAGTGAACCCTGCTCTGCAGCCTTTTTC  650

seq1  CTCTGCTCATAACATTATTGAGCATTTCCTGCACGCAGTCACTGGGGACA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGCTCATAACATTATTGAGCATTTCCTGCACGCAGTCACTGGGGACA  700

seq1  TGGGAGGGCGTCTTTGACCCAGAAGTAATCTACAACTAATATATGCCAGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAGGGCGTCTTTGACCCAGAAGTAATCTACAACTAATATATGCCAGG  750

seq1  TGCACAGCCCTTCATCTGCAGTCCTGAGATCCCAAAGACTAAAATTCAAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCACAGCCCTTCATCTGCAGTCCTGAGATCCCAAAGACTAAAATTCAAA  800

seq1  AAAAAAAAAAATCTTTTTTTTTAACTCGTTTGAAGCCCAGACCTTCTCTG  850
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAAAAATCTTTTTTTTTTACTCGTTTGAAGCCCAGACCTTCTCTG  850

seq1  GACTAAGATGATTATTGTCTTTAGTGTGAATATAAGATTTTGATTATGAG  900
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTAAGATGATTATTGTCTTTAGTGTGAATATAAGATTTTGATTATGAG  900

seq1  ATAT-AGCCCAGACCCTGTAGGTATGGAATATACACTGTATTATCTTTCT  949
      |||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||
seq2  ATATAAGCCCAGACCCTGTAGGTATGG-ATTTAAACTGTATTATCTTTCT  949

seq1  GGAACCCAAAAATGTT-CTCAGCTCCAAAATATATGGCCTAAGGGTGCAT  998
      ||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACCCTAAAATTGTTCCTCAGCTCCAAAATATATGGCCTAAGGGTGCAT  999

seq1  GTGGCCTTTTTCATATAATTCAGAGTGGGACCCTGGAAGCTTTGTCCCTA  1048
      |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||
seq2  GTGGCCTTTTTCATAT-ATTCAGAGTGGGGACCTGGAAGCTTTGTCCCTA  1048

seq1  CCCCACCCCCC  1059
       ||||||||||
seq2  -CCCACCCCCC  1058

seq1: chr7_121104558_121105663
seq2: B6Ng01-149P13.g_83_1172 (reverse)

seq1  TGAAACCAGCAGAACAATGTCTGTCACACTGCCTTGTTGTGAGGATTAAA  50
      |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||
seq2  TGAAACAAGCAGAACAATTTCTGTCACACTGGCTTGTTGTGA-GATT-AA  48

seq1  TAAGAGCACGGGTAGAAAAGCTATGATTAGCACAGAATAAATGTCAGATT  100
      ||||||||| ||||| |||||||||||||||||   ||||   ||||| |
seq2  TAAGAGCAC-GGTAG-AAAGCTATGATTAGCAC--GATAATGTTCAGA-T  93

seq1  TTGTACTATCATTTCTGAGCCAAACATCTCATTAAAGGCCTGCATAATCA  150
      |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||
seq2  TTGTACTATCATTT-TGAGCC-AACATCTCATTAAAAG-CTGCATAATCA  140

seq1  CCCATAAAATCTTGTTTGAAATGAAAGCGATTGGGTTCAACCAACCTTTT  200
      ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||
seq2  CCCAT-AAATCTTG-TTGAAATGAAAGCGA-TGGGTTCAACCAACC-TTT  186

seq1  GGAAAGCAATTTGGCTCTCCAAATGCTCTCCACTGTATATTAAGACACAT  250
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  GGAAAGCAATTTGGCTCTCC-AATGCTCTCCACTGTATA-TAAGACACAT  234

seq1  AAAATATGTTCCTTTCCTTTGACCCAGTTGTTCCACTTCTCAGAATCTAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATATGTTCCTTTCCTTTGACCCAGTTGTTCCACTTCTCAGAATCTAT  284

seq1  TCTTAGGAAATCGTCCTCAATACAGGAAGAGTCCAATGCACAGGAAGGTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTAGGAAATCGTCCTCAATACAGGAAGAGTCCAATGCACAGGAAGGTT  334

seq1  TGCTGTGTGGATGGTCCTAATAGAAATTAGAGGCAGCCTGCACGTCCATG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGTGTGGATGGTCCTAATAGAAATTAGAGGCAGCCTGCACGTCCATG  384

seq1  AGATGACTATAGAGTCCCTCTGCAATCTTGTTAAGGATCTAAAAAATGCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGACTATAGAGTCCCTCTGCAATCTTGTTAAGGATCTAAAAAATGCT  434

seq1  TTAGCCCCTACGTCAAACAGAGCTGACATGGAAGGTGAATCAAGGAGCAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGCCCCTACGTCAAACAGAGCTGACATGGAAGGTGAATCAAGGAGCAA  484

seq1  ACATTGTCTTCTCTGTCAAGTCTCCAGCCCCTTTCTTCTGCATGGTTTCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTGTCTTCTCTGTCAAGTCTCCAGCCCCTTTCTTCTGCATGGTTTCC  534

seq1  CACGTGCTCTCTCCTGCTAGAGATCATATCCACTCAGAGTCCTGCCATCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACGTGCTCTCTCCTGCTAGAGATCATATCCACTCAGAGTCCTGCCATCT  584

seq1  GGGCAATTCCCGTTGGCCTTGTGCCTAAGCCCACTGCCACAGACCTAGCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCAATTCCCGTTGGCCTTGTGCCTAAGCCCACTGCCACAGACCTAGCT  634

seq1  TTCTACCCTGCTGCCTAAGCCCTCTGCAGAGGCTGAGTATCTCTCCAAGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTACCCTGCTGCCTAAGCCCTCTGCAGAGGCTGAGTATCTCTCCAAGC  684

seq1  CTGGGTGTCCTTGGCTCAGCTCTCTGCCTCCAGAGGCTTCCTGGCATCTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGTGTCCTTGGCTCAGCTCTCTGCCTCCAGAGGCTTCCTGGCATCTT  734

seq1  CTCAGCTCTGGCCCCACCTCCCATCCCTGCTGCCATCCTACTTCCAGCCC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGCTCTGGCCCCACCTCCCATCCCTGCTGCCATCCTACTTCCAGCCC  784

seq1  CTTCCTTGCTATTGCCACCTCAATCCATTAAATCCTTCTAAGTCAGAGAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCTTGCTATTGCCACCTCAATCCATTAAATCCTTCTAAGTCAGAGAG  834

seq1  CACATCTTCTCAGATGTCTAGAATTTGTCTGATCAAGTGAACATAATGGG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATCTTCTCAGATGTCTAGAATTTGTCTGATCAAGTGAACATAATGGG  884

seq1  AAGGAACAGTTTGATGTTTAAGCTGATTTTTGAAGCCCACTTAGACACCG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAACAGTTTGATGTTTAAGCTGATTTTTGAAGCCCACTTAGACACCG  934

seq1  AGTCTTGAGGCCTTAAATGCTTTGTGAACTTCCACAAGAGAGGACTGAAA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTTGAGGCCTTAAATGCTTTGTGAACTTCCACAAGAGAGGACTGAAA  984

seq1  TTTATGAAATGACATCCTTTCAAAAACCAGCAGCTGTCTCTCTGGAAACA  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATGAAATGACATCCTTTCAAAAACCAGCAGCTGTCTCTCTGGAAACA  1034

seq1  TGGGCAGTTAGACAGGGGAAAGCATCCAGGAATGTCACTTGATGCTATCT  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCAGTTAGACAGGGGAAAGCATCCAGGAATGTCACTTGATGCTATCT  1084

seq1  TAATCC  1106
      ||||||
seq2  TAATCC  1090