BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-150O05
Chromosome7 (Build37)
Map Location 91,082,521 - 91,217,742
singlet/doubletdoublet
Overlap gene9930013L23Rik
Upstream geneLOC619909, A530021J07Rik, EG666160, Tmc3, Stard5, Il16, Phgdh-ps1, LOC666170, 1700026D08Rik, Mesdc1, Mesdc2
Downstream gene2210412D01Rik, Arnt2, LOC100039239, Fah, Zfand6, 2610206C17Rik, EG620480, Olfr291, LOC666276, Olfr290, ENSMUSG00000070600, F830104D24Rik, LOC620641
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-150O05.bB6Ng01-150O05.g
ACCDH946851DH946852
length1,0161,136
definitionDH946851|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-150O05, 5' end.DH946852|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-150O05, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(91,082,521 - 91,083,539)(91,216,622 - 91,217,742)
sequence
gaattccacagtcatgagcagcccatgcccacatgtggctggcagtgtaa
agacagtggcagggctgctgcctagaggagagtgggcagtgtgtactgag
gggcaagagggaaaagccctttgcaaaagaccgtatattttgaaattgaa
agaacctagtggggaaccccccactcaattcccatttggtgcgcacccaa
gaatcacgaacagcttctccccatttcaggtgatatgctcccttccgaaa
gctacttgggaatactggacaccccaggctagccactgaggcaatgtggt
gtggcagtgggttgctgagcttggggctcacagacctggctgtgttattg
agtaccattttcctcagatgtaggtacaaaatgctgggctagatggtcct
caagggcccccaaggtcctttccatctctgacaccccaggttcactgtgg
cgagagcatgttcagatttcctggagtcttctgctcagctccaagctgaa
gtgcactggagacccattgtacagcctcaggtctgtgaacttcacttcac
cctctcgcagagtcagagggggctggctggacaccaatctgaacgaggtt
ctgtgcatcgtaactcagtccatttctctccgcagaccctgcttctctat
cacaagtgggtcagcaagaggtgacctagcatgactcagatgctgcaagt
ggtggcaggaaagccttcacctctgagccatgccagaggccacctcttct
ctcttcatcatctctgtccttgattcctgccaggaccatcaccttccaga
agaagccttccccatgtttctgggtgtggtgaggttcccctcctccaatc
cacctctgctctctcaacctggtatcaaagtgtgctgagacctggctgcc
tgtcaccagctgaccccaggtctgagctctcatcgctccattctctgtat
ccagggcactcagtggagatgtcactacaatgattacttctactgatggg
cttcaggcaagagcaa
gaattcaggcagacacttgatctgaccatctgggccaacttcagtgattg
cctctgagtgggccaagcctggatatgtctgggagtgagggctggggcca
gcctgcagtgactctgctctgagggttagccaagtgaggattaggctgtg
gcgtgctggggcgctggctgcctagtgtcagagtcatggagtccttctgc
agagttggcccgagagctgttccctaggtgtctcatcaaccttcatccac
ggccacacacagtcctttcactttgtctcaggcttcagaagcctcactac
tttgcatcaatgactgtctcttaggagacagggctttatgttggatttaa
ttcacagatggtagaagaggcagctggaatcaccactgttctctgaatgc
ctctgctctttccagccacatgagatgtggtatgtggtatagagagacat
tgtctcaaaaaaccactgcgcctctccaaaatcaatcaatcagtcagtcc
tgggaaacaggctttcatttcatctcgctttggaacatctttctcatttt
cccatcttgttgggccttcatcctcattctgtcatgggaatgtttcttga
ggggtctgcactaaccatagttttttttttttttaatcagagccagagag
gaaactttgcatgatagttgacatccccaccatggcctctcatgtttgaa
ctatttcactccttagcatgaggcaaatgcattgactttgcctctttttg
atactgttaattatctgtgataaattgaggctattcagtcagaggtctgg
ggatcaacagggaagcatctcatgactgggtagcttccttctctccagag
tctggctcaagtatgtccccctttcaattttaaatttttagtgacgccct
ttgggagcataattttctctttccccattcctccatgccatattatgttc
cgttttctctaaccagccactcaacaacccatttttttcttcctgtcttc
tctgggcatcatctctcctcttgcaagagccttctcacattttcttcctt
aaaacatgctctattgctggtgtaacgagcattcccaggccagtggttta
acaactcataatgtcttcacgcctggagggaccagc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_91082521_91083539
seq2: B6Ng01-150O05.b_47_1062

seq1  GAATTCCACAGTCATGAGCAGCCCATGCCCACATGTGGCTGGCAGTGTAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCACAGTCATGAGCAGCCCATGCCCACATGTGGCTGGCAGTGTAA  50

seq1  AGACAGTGGCAGGGCTGCTGCCTAGAGGAGAGTGGGCAGTGTGTACTGAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAGTGGCAGGGCTGCTGCCTAGAGGAGAGTGGGCAGTGTGTACTGAG  100

seq1  GGGCAAGAGGGAAAAGCCCTTTGCAAAAGACCGTATATTTTGAAATTGAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCAAGAGGGAAAAGCCCTTTGCAAAAGACCGTATATTTTGAAATTGAA  150

seq1  AGAACCTAGTGGGGAACCCCCCACTCAATTCCCATTTGGTGCGCACCCAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACCTAGTGGGGAACCCCCCACTCAATTCCCATTTGGTGCGCACCCAA  200

seq1  GAATCACGAACAGCTTCTCCCCATTTCAGGTGATATGCTCCCTTCCGAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATCACGAACAGCTTCTCCCCATTTCAGGTGATATGCTCCCTTCCGAAA  250

seq1  GCTACTTGGGAATACTGGACACCCCAGGCTAGCCACTGAGGCAATGTGGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTACTTGGGAATACTGGACACCCCAGGCTAGCCACTGAGGCAATGTGGT  300

seq1  GTGGCAGTGGGTTGCTGAGCTTGGGGCTCACAGACCTGGCTGTGTTATTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCAGTGGGTTGCTGAGCTTGGGGCTCACAGACCTGGCTGTGTTATTG  350

seq1  AGTACCATTTTCCTCAGATGTAGGTACAAAATGCTGGGCTAGATGGTCCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACCATTTTCCTCAGATGTAGGTACAAAATGCTGGGCTAGATGGTCCT  400

seq1  CAAGGGCCCCCAAGGTCCTTTCCATCTCTGACACCCCAGGTTCACTGTGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGGCCCCCAAGGTCCTTTCCATCTCTGACACCCCAGGTTCACTGTGG  450

seq1  CGAGAGCATGTTCAGATTTCCTGGAGTCTTCTGCTCAGCTCCAAGCTGAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAGAGCATGTTCAGATTTCCTGGAGTCTTCTGCTCAGCTCCAAGCTGAA  500

seq1  GTGCACTGGAGACCCATTGTACAGCCTCAGGTCTGTGAACTTCACTTCAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCACTGGAGACCCATTGTACAGCCTCAGGTCTGTGAACTTCACTTCAC  550

seq1  CCTCTCGCAGAGTCAGAGGGGGCTGGCTGGACACCAATCTGAACGAGGTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTCGCAGAGTCAGAGGGGGCTGGCTGGACACCAATCTGAACGAGGTT  600

seq1  CTGTGCATCGTAACTCAGTCCATTTCTCTCCGCAGACCCTGCTTCTCTAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGCATCGTAACTCAGTCCATTTCTCTCCGCAGACCCTGCTTCTCTAT  650

seq1  CACAAGTGGGTCAGCAAGAGGTGACCTAGCATGACTCAGATGCTGCAAGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAAGTGGGTCAGCAAGAGGTGACCTAGCATGACTCAGATGCTGCAAGT  700

seq1  GGTGGCAGGAAAGCCTTCACCTCTGAGCCATGCCAGAGGCCACCTCTTCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGCAGGAAAGCCTTCACCTCTGAGCCATGCCAGAGGCCACCTCTTCT  750

seq1  CTCTTCATCATCTCTGTCCTTGATTCCTGCCAGGACCATCACCTTCCAGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTCATCATCTCTGTCCTTGATTCCTGCCAGGACCATCACCTTCCAGA  800

seq1  AGAAGCCTTCCCCATGTTTCTGGGTGTGGTGAGGTTCCCCTCCTCCAATC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGCCTTCCCCATGTTTCTGGGTGTGGTGAGGTTCCCCTCCTCCAATC  850

seq1  CACCTCTGCTCTCTCAACCTGGTATCAAAGTGTGCTGAGACCTGGCTGCC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTCTGCTCTCTCAACCTGGTATCAAAGTGTGCTGAGACCTGGCTGCC  900

seq1  TGTCACCAGCTGACCCCCAGGTCTGAGCTCTCATCGCTCCATTCTCTGTA  950
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCACCAGCTGA-CCCCAGGTCTGAGCTCTCATCGCTCCATTCTCTGTA  949

seq1  TCCAGGGCACTCAGTGGAGATGTCAACTACAATGATTACTTCTACTGATG  1000
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGGGCACTCAGTGGAGATGTC-ACTACAATGATTACTTCTACTGATG  998

seq1  GGCTCCAGGCACAGAGCAA  1019
      |||| |||||| |||||||
seq2  GGCTTCAGGCA-AGAGCAA  1016

seq1: chr7_91216622_91217742
seq2: B6Ng01-150O05.g_68_1203 (reverse)

seq1  GCTGGTCC--ACAGGC-TGAAGACA-TATG-GTTGTTTAAACCACTGGCC  45
      ||||||||   ||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||
seq2  GCTGGTCCCTCCAGGCGTGAAGACATTATGAGTTG-TTAAACCACTGGCC  49

seq1  TGGGGCATGCTTTGTTACA-CAGCAAT--AGCATGTATTGA-GAAGAAAT  91
      | ||| |||| | |||||| |||||||  ||||||| || | ||||||| 
seq2  T-GGGAATGC-TCGTTACACCAGCAATAGAGCATGTTTTAAGGAAGAAAA  97

seq1  GTTGAGAAGGC-CTTGC-AGAGGAGAGGATGATGCCCAGAGAAGACCAGG  139
        ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||
seq2  TGTGAGAAGGCTCTTGCAAGAGGAGA-GATGATGCCCAGAGAAGA-CAGG  145

seq1  AAGAAAAAAATGGGTTGTTGAGTGGCTGGTTAGAGAAAACGGAACAT-AT  188
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  AAGAAAAAAATGGGTTGTTGAGTGGCTGGTTAGAGAAAACGGAACATAAT  195

seq1  ATAGCATGGAGGAATGGGG-AAGAGAAAA-TATGCT-CCAAAGGGCGTCA  235
      || |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||
seq2  ATGGCATGGAGGAATGGGGAAAGAGAAAATTATGCTCCCAAAGGGCGTCA  245

seq1  CTAAAA--TATAAATTGAAAGGGGGACATACTTGAGCCAGACTCTGGAGA  283
      ||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAAAATTTAAAATTGAAAGGGGGACATACTTGAGCCAGACTCTGGAGA  295

seq1  GAAGGAAGCTACCCAGTCATGAGATGCTTCCCTGTTGATCCCCAGACCTC  333
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGAAGCTACCCAGTCATGAGATGCTTCCCTGTTGATCCCCAGACCTC  345

seq1  TGACTGAATAGCCTCAATTTATCACAGATAATTAACAGTATC-AAAAGAG  382
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  TGACTGAATAGCCTCAATTTATCACAGATAATTAACAGTATCAAAAAGAG  395

seq1  GCAAAGTCAATGCATTTGCCTCATGCTAAGGAGTGAAATAGTTCAAACAT  432
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAAGTCAATGCATTTGCCTCATGCTAAGGAGTGAAATAGTTCAAACAT  445

seq1  GAGAGGCCATGGTGGGGATGTCAACTATCATGC-AAGTTTCCTCTCTGGC  481
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  GAGAGGCCATGGTGGGGATGTCAACTATCATGCAAAGTTTCCTCTCTGGC  495

seq1  TCTGATTAAAAAAAAAAAAAACTATGGTTAGTGCAGACCCCTCAAG-AAC  530
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TCTGATTAAAAAAAAAAAAAACTATGGTTAGTGCAGACCCCTCAAGAAAC  545

seq1  ATTCCCATGACAGAATGAGGATGAAGGCCCAACAAGATGGGAAAATGAGA  580
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCCATGACAGAATGAGGATGAAGGCCCAACAAGATGGGAAAATGAGA  595

seq1  AAGATGTTCCAAAGCGAGATGAAATGAAAGCCTGTTTCCCAGGACTGACT  630
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATGTTCCAAAGCGAGATGAAATGAAAGCCTGTTTCCCAGGACTGACT  645

seq1  GATTGATTGATTTTGGAGAGGCGCAGTGGTTTTTTGAGACAATGTCTCTC  680
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTGATTGATTTTGGAGAGGCGCAGTGGTTTTTTGAGACAATGTCTCTC  695

seq1  TATACCACATACCACATCTCATGTGGCTGGAAAGAGCAGAGGCATTCAGA  730
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACCACATACCACATCTCATGTGGCTGGAAAGAGCAGAGGCATTCAGA  745

seq1  GAACAGTGGTGATTCCAGCTGCCTCTTCTACCATCTGTGAATTAAATCCA  780
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACAGTGGTGATTCCAGCTGCCTCTTCTACCATCTGTGAATTAAATCCA  795

seq1  ACATAAAGCCCTGTCTCCTAAGAGACAGTCATTGATGCAAAGTAGTGAGG  830
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATAAAGCCCTGTCTCCTAAGAGACAGTCATTGATGCAAAGTAGTGAGG  845

seq1  CTTCTGAAGCCTGAGACAAAGTGAAAGGACTGTGTGTGGCCGTGGATGAA  880
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTGAAGCCTGAGACAAAGTGAAAGGACTGTGTGTGGCCGTGGATGAA  895

seq1  GGTTGATGAGACACCTAGGGAACAGCTCTCGGGCCAACTCTGCAGAAGGA  930
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTGATGAGACACCTAGGGAACAGCTCTCGGGCCAACTCTGCAGAAGGA  945

seq1  CTCCATGACTCTGACACTAGGCAGCCAGCGCCCCAGCACGCCACAGCCTA  980
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCATGACTCTGACACTAGGCAGCCAGCGCCCCAGCACGCCACAGCCTA  995

seq1  ATCCTCACTTGGCTAACCCTCAGAGCAGAGTCACTGCAGGCTGGCCCCAG  1030
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTCACTTGGCTAACCCTCAGAGCAGAGTCACTGCAGGCTGGCCCCAG  1045

seq1  CCCTCACTCCCAGACATATCCAGGCTTGGCCCACTCAGAGGCAATCACTG  1080
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCACTCCCAGACATATCCAGGCTTGGCCCACTCAGAGGCAATCACTG  1095

seq1  AAGTTGGCCCAGATGGTCAGATCAAGTGTCTGCCTGAATTC  1121
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTGGCCCAGATGGTCAGATCAAGTGTCTGCCTGAATTC  1136