BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-151F13
Chromosome7 (Build37)
Map Location 152,160,587 - 152,272,233
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneShank2, Cttn, Ppfia1, Fadd, Tmem16a, LOC669079, LOC677315, Fgf3, Fgf4, Fgf15, Oraov1, Ccnd1
Downstream gene1810010D01Rik, LOC100040049, Tpcn2, Mrgprf, Mrgprd
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-151F13.bB6Ng01-151F13.g
ACCDH947187DH947188
length9751,131
definitionDH947187|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-151F13, 5' end.DH947188|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-151F13, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(152,160,587 - 152,161,561)(152,271,091 - 152,272,233)
sequence
gaattctttatttcttcaaataaagagtttactgggggatttagagttgg
tatgtactgtcaggtttcagcatcccttcctaacctgagagttcttagtg
atacagaaggtttgttgttgttgtcatcgtcgttgttttgttttgttttt
gagacagggtttctctgtatccctggctatcctagaacctgatatataga
ccctgttggcctctgtcttccagatactgggcttaactgtgtaccccccc
cccaccaggctgtgatatagagcatggaactttccagactccttaccttt
cccaacataaataactttgagttattaaatactctgtgagcccttcctgt
ttgccactgactggcccctggccaggacttactgacacttgtccatccac
ccaggcaaaggccggttatttctatttgtgcttgttgtctgtttatcact
gggaataaatgcctaacataatttaataaaagtcaggtgtgttaagtgca
tactgtcaccccagcacccaggaggtagaggcagaaggatcaggagttca
aggctagccttagctacatagtgagttcaagaccagcctatttgtgagac
cctatcttagtcattgttctattgcttcagagagccacctcttagcatta
attggggctggcttccagtttgagaaggttagcccattgtcatggtggga
agcatggcagcacacaggcagacatggtgctggcaaagtagctgagagtt
ttacaactagatcacaggcagcaggaaagagaatgctattggccctggct
tgggtttttgaaaccccaaagcccacctccagtgacacacttcctccaac
aaggccatgccactctaacaagggcacgcctcctaattcttcctcagtag
tgccgttccttgacaactaaatattgagtcaaatatatgattccatggga
gtccaccccgaccccatcttcagaa
gaattcctgtctcctccagcaccatgtctgtctgcacactgccatgcttc
ccactgtgatgataatggactgaacctctgaaattgttagccagccccaa
tgaaatgtttgcctttacttataagagttgtcttggtcatggtttctctt
cacagcaataaaaccctaactaagacagctcccttcccaggtgattctaa
gatgtggtaagttaatgggtaaaattaatcatcataccttctagctgaaa
aaacactgcccaaccttgctgactctcagtctgtctccccacaaaccagc
agtgtttttcttccttactctccaagtccgttgcttagcttggtgagcct
cataccaggtacaaaataaatgagaggagtaaaagccacacacccttttt
accactgtgccttttagcctggataggccagacaggaagactctggccca
aaaccctgccaggtctcctccaggtaggagcctcaggagataggtaggga
agagccagttgtctctgaaacctctgagcccaagcactgcagggaggcca
gggtgggttttcgtgtttgaaatcatgggctctaggataggctgacacaa
gtgctgcctggaggacacctcagtggtgggcatgcaatagccgctgagag
tcagctagtgcgttttatccccctcaccccctatgtgtgtaatatgtggt
attgtgcttcaggacaccatccaccttgtgatttgaaacaggtctctcat
tgcctggagttcacagtgatcccctgtctccacctctccagccctgggat
tacaagcacatgctaccacatggcttttcatataggctctgggagtgaag
cccaggtcctcatgcttgcagagtaagcacttaataattaaactatgcag
actcctcaatctttattatttgctatgaaactaagggttttttaatagat
atgtaaaagaaagacacatatttcaaactcagtctgaaagaaattacata
ttcaggaatcacatcaagctaagaaactaaatcagcaggataggactggc
ctattggttcagggtactccccaagagcgtggcctgaagaagataacaat
ctaagtgaaatacatctcctttcttcacccc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_152160587_152161561
seq2: B6Ng01-151F13.b_45_1019

seq1  GAATTCTTTATTTCTTCAAATAAAGAGTTTACTGGGGGATTTAGAGTTGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTATTTCTTCAAATAAAGAGTTTACTGGGGGATTTAGAGTTGG  50

seq1  TATGTACTGTCAGGTTTCAGCATCCCTTCCTAACCTGAGAGTTCTTAGTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTACTGTCAGGTTTCAGCATCCCTTCCTAACCTGAGAGTTCTTAGTG  100

seq1  ATACAGAAGGTTTGTTGTTGTTGTCATCGTCGTTGTTTTGTTTTGTTTTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACAGAAGGTTTGTTGTTGTTGTCATCGTCGTTGTTTTGTTTTGTTTTT  150

seq1  GAGACAGGGTTTCTCTGTATCCCTGGCTATCCTAGAACCTGATATATAGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACAGGGTTTCTCTGTATCCCTGGCTATCCTAGAACCTGATATATAGA  200

seq1  CCCTGTTGGCCTCTGTCTTCCAGATACTGGGCTTAACTGTGTACCCCCCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGTTGGCCTCTGTCTTCCAGATACTGGGCTTAACTGTGTACCCCCCC  250

seq1  CCCACCAGGCTGTGATATAGAGCATGGAACTTTCCAGACTCCTTACCTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACCAGGCTGTGATATAGAGCATGGAACTTTCCAGACTCCTTACCTTT  300

seq1  CCCAACATAAATAACTTTGAGTTATTAAATACTCTGTGAGCCCTTCCTGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAACATAAATAACTTTGAGTTATTAAATACTCTGTGAGCCCTTCCTGT  350

seq1  TTGCCACTGACTGGCCCCTGGCCAGGACTTACTGACACTTGTCCATCCAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCACTGACTGGCCCCTGGCCAGGACTTACTGACACTTGTCCATCCAC  400

seq1  CCAGGCAAAGGCCGGTTATTTCTATTTGTGCTTGTTGTCTGTTTATCACT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGCAAAGGCCGGTTATTTCTATTTGTGCTTGTTGTCTGTTTATCACT  450

seq1  GGGAATAAATGCCTAACATAATTTAATAAAAGTCAGGTGTGTTAAGTGCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAATAAATGCCTAACATAATTTAATAAAAGTCAGGTGTGTTAAGTGCA  500

seq1  TACTGTCACCCCAGCACCCAGGAGGTAGAGGCAGAAGGATCAGGAGTTCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGTCACCCCAGCACCCAGGAGGTAGAGGCAGAAGGATCAGGAGTTCA  550

seq1  AGGCTAGCCTTAGCTACATAGTGAGTTCAAGACCAGCCTATTTGTGAGAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTAGCCTTAGCTACATAGTGAGTTCAAGACCAGCCTATTTGTGAGAC  600

seq1  CCTATCTTAGTCATTGTTCTATTGCTTCAGAGAGCCACCTCTTAGCATTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTATCTTAGTCATTGTTCTATTGCTTCAGAGAGCCACCTCTTAGCATTA  650

seq1  ATTGGGGCTGGCTTCCAGTTTGAGAAGGTTAGCCCATTGTCATGGTGGGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGGGGCTGGCTTCCAGTTTGAGAAGGTTAGCCCATTGTCATGGTGGGA  700

seq1  AGCATGGCAGCACACAGGCAGACATGGTGCTGGCAAAGTAGCTGAGAGTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATGGCAGCACACAGGCAGACATGGTGCTGGCAAAGTAGCTGAGAGTT  750

seq1  TTACAACTAGATCCACAGGCAGCAGG-AAGAGAATGCTATTGGCCCTGGC  799
      |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAACTAGAT-CACAGGCAGCAGGAAAGAGAATGCTATTGGCCCTGGC  799

seq1  TTGGGTTTTTGAAACCCCAAAGCCCACCTCCAGTGACACACTTCCTCCAA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGTTTTTGAAACCCCAAAGCCCACCTCCAGTGACACACTTCCTCCAA  849

seq1  CAAGGCCATGCCACTCTAACAAGGGCACGCCTCCTAATTCTTCTCAAGTA  899
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||
seq2  CAAGGCCATGCCACTCTAACAAGGGCACGCCTCCTAATTCTTCCTCAGTA  899

seq1  GTGCCGTTCCTTGACAACTAAATATATGAGTCAAATATATGAGTCTATGG  949
      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||
seq2  GTGCCGTTCCTTGACAACTAAATAT-TGAGTCAAATATATGATTCCATGG  948

seq1  GAG-CCACCACAGACCCCATC-TCAGAA  975
      ||| ||||| | ||||||||| ||||||
seq2  GAGTCCACC-CCGACCCCATCTTCAGAA  975

seq1: chr7_152271091_152272233
seq2: B6Ng01-151F13.g_67_1197 (reverse)

seq1  GGGGTGGAAGAAGGGAGGAATGTATTACAACTTAGAATTGTTATCTTCTT  50
      ||||| |||||| ||||  ||||||| | |||||| ||||||||||||||
seq2  GGGGT-GAAGAAAGGAG--ATGTATTTC-ACTTAG-ATTGTTATCTTCTT  45

seq1  CAGACCACTGCTCTTGGGGAGGTACCCTTGACTCATA-GCCAGTCCTAAT  99
      ||| |||| ||||||||||| |||||||  ||  ||| ||||||||| ||
seq2  CAGGCCAC-GCTCTTGGGGA-GTACCCTGAACCAATAGGCCAGTCCT-AT  92

seq1  CCTGGCTGATGTAGTTTCTTAGCCTGATGTGATTCCTGGATATTGTAATT  149
      ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||
seq2  CCT-GCTGATTTAGTTTCTTAGCTTGATGTGATTCCTGAATA-TGTAATT  140

seq1  TTCCTTTCAGACTGGGTTTGAAATATGTGTCTTTCTTTTACATAATCTAT  199
      |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  T--CTTTCAGACTGAGTTTGAAATATGTGTCTTTCTTTTACAT-ATCTAT  187

seq1  TAAAAAAACCCTTAGTTTCATAGCAAATAATAAAGATTGA-GAGTCTGCA  248
      | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  T-AAAAAACCCTTAGTTTCATAGCAAATAATAAAGATTGAGGAGTCTGCA  236

seq1  TAG-TTAATTATTAAAGTGCTTACTCTGCAAGCATGAGGACCTGGGCTTC  297
      ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTTAATTATT-AAGTGCTTACTCTGCAAGCATGAGGACCTGGGCTTC  285

seq1  ACTCCCAGAGCCTATATGAAAAGCCATGTGGTAGCATGTGCTTGTAATCC  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCCAGAGCCTATATGAAAAGCCATGTGGTAGCATGTGCTTGTAATCC  335

seq1  CAGGGCTGGAGAGGTGGAGACAGGGGATCACTGTGAACTCCAGGCAATGA  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGCTGGAGAGGTGGAGACAGGGGATCACTGTGAACTCCAGGCAATGA  385

seq1  GAGACCTGTTTCAAATCACAAGGTGGATGGTGTCCTGAAGCACAATACCA  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACCTGTTTCAAATCACAAGGTGGATGGTGTCCTGAAGCACAATACCA  435

seq1  CATATTACACACATAGGGGGTGAGGGGGATAAAACGCACTAGCTGACTCT  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATTACACACATAGGGGGTGAGGGGGATAAAACGCACTAGCTGACTCT  485

seq1  CAGCGGCTATTGCATGCCCACCACTGAGGTGTCCTCCAGGCAGCACTTGT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCGGCTATTGCATGCCCACCACTGAGGTGTCCTCCAGGCAGCACTTGT  535

seq1  GTCAGCCTATCCTAGAGCCCATGATTTCAAACACGAAAACCCACCCTGGC  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGCCTATCCTAGAGCCCATGATTTCAAACACGAAAACCCACCCTGGC  585

seq1  CTCCCTGCAGTGCTTGGGCTCAGAGGTTTCAGAGACAACTGGCTCTTCCC  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCTGCAGTGCTTGGGCTCAGAGGTTTCAGAGACAACTGGCTCTTCCC  635

seq1  TACCTATCTCCTGAGGCTCCTACCTGGAGGAGACCTGGCAGGGTTTTGGG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTATCTCCTGAGGCTCCTACCTGGAGGAGACCTGGCAGGGTTTTGGG  685

seq1  CCAGAGTCTTCCTGTCTGGCCTATCCAGGCTAAAAGGCACAGTGGTAAAA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAGTCTTCCTGTCTGGCCTATCCAGGCTAAAAGGCACAGTGGTAAAA  735

seq1  AGGGTGTGTGGCTTTTACTCCTCTCATTTATTTTGTACCTGGTATGAGGC  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTGTGTGGCTTTTACTCCTCTCATTTATTTTGTACCTGGTATGAGGC  785

seq1  TCACCAAGCTAAGCAACGGACTTGGAGAGTAAGGAAGAAAAACACTGCTG  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCAAGCTAAGCAACGGACTTGGAGAGTAAGGAAGAAAAACACTGCTG  835

seq1  GTTTGTGGGGAGACAGACTGAGAGTCAGCAAGGTTGGGCAGTGTTTTTTC  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGTGGGGAGACAGACTGAGAGTCAGCAAGGTTGGGCAGTGTTTTTTC  885

seq1  AGCTAGAAGGTATGATGATTAATTTTACCCATTAACTTACCACATCTTAG  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTAGAAGGTATGATGATTAATTTTACCCATTAACTTACCACATCTTAG  935

seq1  AATCACCTGGGAAGGGAGCTGTCTTAGTTAGGGTTTTATTGCTGTGAAGA  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCACCTGGGAAGGGAGCTGTCTTAGTTAGGGTTTTATTGCTGTGAAGA  985

seq1  GAAACCATGACCAAGACAACTCTTATAAGTAAAGGCAAACATTTCATTGG  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACCATGACCAAGACAACTCTTATAAGTAAAGGCAAACATTTCATTGG  1035

seq1  GGCTGGCTAACAATTTCAGAGGTTCAGTCCATTATCATCACAGTGGGAAG  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGGCTAACAATTTCAGAGGTTCAGTCCATTATCATCACAGTGGGAAG  1085

seq1  CATGGCAGTGTGCAGACAGACATGGTGCTGGAGGAGACAGGAATTC  1143
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGCAGTGTGCAGACAGACATGGTGCTGGAGGAGACAGGAATTC  1131