BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-153J20
Chromosome7 (Build37)
Map Location 102,806,784 - 102,950,010
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneEG666816, LOC100040132, LOC666823
Downstream geneFrda-ps, EG666836, Odz4, LOC670727, LOC666858
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-153J20.bB6Ng01-153J20.g
ACCDH948879DH948880
length1,088557
definitionDH948879|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-153J20, 5' end.DH948880|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-153J20, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(102,948,926 - 102,950,010)(102,806,784 - 102,807,346)
sequence
gaattcctactgattagagtttgaggagatagaacccagagagagaaagg
tcactgtgggcatgccctgaagggctgtatctcatacccgttccttcatg
tctctgtctttctataagcagagcatctttgtttcattacactttcttca
ccatgatataatgttcccccatccatgggttcagacaccagggagccaag
tgacaaatgaccagtgaagccataaaccaatataaaccttttctcttttg
ggttgtttaactagacattttgtcacagtgagataaagtgtgactaacat
aagtctcctttgccaacagaaagcatcacataggttaagaactcacacct
accttcattaaagtatctatcaattatttggcttctaaaatcaacaatat
caattctgttaaggaattggaagtggcttctcaacttgactcacatagga
aggacatccagaggacttttactgttcagtcaggtaacctcaggatttgg
agcaggatagagactaggaccatccatccattcttttttttttttttttt
gatttgtttatttattatatgtaagtacactgtagatgtcttcagacaca
ccagaagagggtgtcaggtctcattacggatggttgtgagccaccatgtg
gttgctgggatttgaactcaggacctttggaagagcagtcagtgctctta
cacgctgagccatctcgccagccccaggaccatccattcttaaggcttct
gagaaataccaatataaacgccagattacaaactactgttccagggagtg
tttcttaaattttattatgcagttagattacctgggcatcttccatgtgt
ggattttagtttagctcatcaccattggagtctgtgttttctgtatctct
atggtgctcaaaaatgaagctagactgcttattccatagatataccttgc
taaatatacttgtagaagctgagtccttgctttctcacctctctggaatg
tagaacctggtattatggagtgcctcatcctgaaggatgaggacttgttc
agtggtggtcacaggcacaggcaggatgaaatttatat
aaattttgaattttgtaaagagaaactgcatgcggtgacatgaatgtgtt
attgcttttcatgtctctcaaccatttcttgtccaaataacttcttaact
atcatacatatgcctgcacttactaagaaagaactagacacctgcatgct
gcttcctggtgcttagcactctggaagatgtggagagaatgaagggttgg
ggcagaagcagctttaacatcttgggagcctatcatctttgcccacatgc
acaggtacactgatagagaactggtgcctgggagatctgtaagtggccac
tctttgtgtttctcagtctccattaattattgcttgtcttcccatgcaac
aatggaaacaacaacatacctttatgatggaatataatccttactttcca
accaataggattacatgtctaaataaatactttggagggatggcttataa
ttcacaaactcaagataaaaatggggaaaaaatccttaatgggaaagagt
ttagaaacagaaccactgaaaagctttggctgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
tgtgtgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_102948926_102950010
seq2: B6Ng01-153J20.b_45_1132 (reverse)

seq1  ATATAAATGTCATCCTGCCTGTGCCTGTGACCACCACTGAACAGGT-CTC  49
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||
seq2  ATATAAATTTCATCCTGCCTGTGCCTGTGACCACCACTGAACAAGTCCTC  50

seq1  ATCTTTCAGGATGAGGCACT-CATAATACAGGGTCTTACATTCAGGAGAA  98
      ||| |||||||||||||||| ||||||||  |||  |||||||  ||| |
seq2  ATCCTTCAGGATGAGGCACTCCATAATACCAGGTTCTACATTCCAGAG-A  99

seq1  GTTGAGAAAGCAAGGACTCAGCTTCTACAAGTATATTTAGCAAGGTATAT  148
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGAGAAAGCAAGGACTCAGCTTCTACAAGTATATTTAGCAAGGTATAT  149

seq1  CTATGG-ATAAGCAGTCTAGCTTCATTTTTGAGCACCATAGAGATACAG-  196
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  CTATGGAATAAGCAGTCTAGCTTCATTTTTGAGCACCATAGAGATACAGA  199

seq1  AAACACAGACTCCATTGTTGATGAGCTAAACTAAAATCCACACATGGAAG  246
      |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACACAGACTCCAATGGTGATGAGCTAAACTAAAATCCACACATGGAAG  249

seq1  ATGCCCAGGTAATCTAACTGCATAATAAAATTTAAGAAACACTCCCTGGA  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCCAGGTAATCTAACTGCATAATAAAATTTAAGAAACACTCCCTGGA  299

seq1  ACAGTAGTTTGTAATCTGGCGTTTATATTGGTATTTCTCAGAAGCCTTAA  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTAGTTTGTAATCTGGCGTTTATATTGGTATTTCTCAGAAGCCTTAA  349

seq1  GAATGGATGGTCCTGGGGCTGGCGAGATGGCTCAGCGTGTAAGAGCACTG  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGGATGGTCCTGGGGCTGGCGAGATGGCTCAGCGTGTAAGAGCACTG  399

seq1  ACTGCTCTTCCAAAGGTCCTGAGTTCAAATCCCAGCAACCACATGGTGGC  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCTCTTCCAAAGGTCCTGAGTTCAAATCCCAGCAACCACATGGTGGC  449

seq1  TCACAACCATCCGTAATGAGACCTGACACCCTCTTCTGGTGTGTCTGAAG  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACAACCATCCGTAATGAGACCTGACACCCTCTTCTGGTGTGTCTGAAG  499

seq1  ACATCTACAGTGTACTTACATATAATAAATAAACAAATCAAAAAAAAAAA  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCTACAGTGTACTTACATATAATAAATAAACAAATCAAAAAAAAAAA  549

seq1  AAAAAAGAATGGATGGATGGTCCTAGTCTCTATCCTGCTCCAAATCCTGA  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAGAATGGATGGATGGTCCTAGTCTCTATCCTGCTCCAAATCCTGA  599

seq1  GGTTACCTGACTGAACAGTAAAAGTCCTCTGGATGTCCTTCCTATGTGAG  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTACCTGACTGAACAGTAAAAGTCCTCTGGATGTCCTTCCTATGTGAG  649

seq1  TCAAGTTGAGAAGCCACTTCCAATTCCTTAACAGAATTGATATTGTTGAT  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGTTGAGAAGCCACTTCCAATTCCTTAACAGAATTGATATTGTTGAT  699

seq1  TTTAGAAGCCAAATAATTGATAGATACTTTAATGAAGGTAGGTGTGAGTT  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGAAGCCAAATAATTGATAGATACTTTAATGAAGGTAGGTGTGAGTT  749

seq1  CTTAACCTATGTGATGCTTTCTGTTGGCAAAGGAGACTTATGTTAGTCAC  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAACCTATGTGATGCTTTCTGTTGGCAAAGGAGACTTATGTTAGTCAC  799

seq1  ACTTTATCTCACTGTGACAAAATGTCTAGTTAAACAACCCAAAAGAGAAA  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTATCTCACTGTGACAAAATGTCTAGTTAAACAACCCAAAAGAGAAA  849

seq1  AGGTTTATATTGGTTTATGGCTTCACTGGTCATTTGTCACTTGGCTCCCT  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTTATATTGGTTTATGGCTTCACTGGTCATTTGTCACTTGGCTCCCT  899

seq1  GGTGTCTGAACCCATGGATGGGGGAACATTATATCATGGTGAAGAAAGTG  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTCTGAACCCATGGATGGGGGAACATTATATCATGGTGAAGAAAGTG  949

seq1  TAATGAAACAAAGATGCTCTGCTTATAGAAAGACAGAGACATGAAGGAAC  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGAAACAAAGATGCTCTGCTTATAGAAAGACAGAGACATGAAGGAAC  999

seq1  GGGTATGAGATACAGCCCTTCAGGGCATGCCCACAGTGACCTTTCTCTCT  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTATGAGATACAGCCCTTCAGGGCATGCCCACAGTGACCTTTCTCTCT  1049

seq1  CTGGGTTCTATCTCCTCAAACTCTAATCAGTAGGAATTC  1085
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGTTCTATCTCCTCAAACTCTAATCAGTAGGAATTC  1088

seq1: chr7_102806784_102807346
seq2: B6Ng01-153J20.g_72_634

seq1  GAATTCAAATTTTGAATTTTGTAAAGAGAAACTGCATGCGGTGACATGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAATTTTGAATTTTGTAAAGAGAAACTGCATGCGGTGACATGAA  50

seq1  TGTGTTATTGCTTTTCATGTCTCTCAACCATTTCTTGTCCAAATAACTTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTTATTGCTTTTCATGTCTCTCAACCATTTCTTGTCCAAATAACTTC  100

seq1  TTAACTATCATACATATGCCTGCACTTACTAAGAAAGAACTAGACACCTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACTATCATACATATGCCTGCACTTACTAAGAAAGAACTAGACACCTG  150

seq1  CATGCTGCTTCCTGGTGCTTAGCACTCTGGAAGATGTGGAGAGAATGAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCTGCTTCCTGGTGCTTAGCACTCTGGAAGATGTGGAGAGAATGAAG  200

seq1  GGTTGGGGCAGAAGCAGCTTTAACATCTTGGGAGCCTATCATCTTTGCCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTGGGGCAGAAGCAGCTTTAACATCTTGGGAGCCTATCATCTTTGCCC  250

seq1  ACATGCACAGGTACACTGATAGAGAACTGGTGCCTGGGAGATCTGTAAGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGCACAGGTACACTGATAGAGAACTGGTGCCTGGGAGATCTGTAAGT  300

seq1  GGCCACTCTTTGTGTTTCTCAGTCTCCATTAATTATTGCTTGTCTTCCCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCACTCTTTGTGTTTCTCAGTCTCCATTAATTATTGCTTGTCTTCCCA  350

seq1  TGCAACAATGGAAACAACAACATACCTTTATGATGGAATATAATCCTTAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAACAATGGAAACAACAACATACCTTTATGATGGAATATAATCCTTAC  400

seq1  TTTCCAACCAATAGGATTACATGTCTAAATAAATACTTTGGAGGGATGGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCAACCAATAGGATTACATGTCTAAATAAATACTTTGGAGGGATGGC  450

seq1  TTATAATTCACAAACTCAAGATAAAAATGGGGAAAAAATCCTTAATGGGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATAATTCACAAACTCAAGATAAAAATGGGGAAAAAATCCTTAATGGGA  500

seq1  AAGAGTTTAGAAACAGAACCACTGAAAAGCTTTGGCTGTGTGTGTGTGTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGTTTAGAAACAGAACCACTGAAAAGCTTTGGCTGTGTGTGTGTGTG  550

seq1  TGTGTGTGTGTGT  563
      |||||||||||||
seq2  TGTGTGTGTGTGT  563