BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-157H11
Chromosome7 (Build37)
Map Location 151,778,827 - 151,988,094
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTmem16a, LOC669079, LOC677315
Upstream geneCars, Tnfrsf26, Tnfrsf22, Tnfrsf23, Osbpl5, Mrgprg, Mrgpre, Nadsyn1, Dhcr7, Gm498, Shank2, Cttn, Ppfia1, Fadd
Downstream geneFgf3, Fgf4, Fgf15, Oraov1, Ccnd1, 1810010D01Rik, LOC100040049, Tpcn2, Mrgprf, Mrgprd
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-157H11.bB6Ng01-157H11.g
ACCDH951693DH951694
length823409
definitionDH951693|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-157H11, 5' end.DH951694|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-157H11, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(151,778,827 - 151,779,649)(151,987,680 - 151,988,094)
sequence
gaattctctccatgttggacagggtggtcagagcccaggggcttgacata
aaacagacatcagggactttgagcaattttagaagtgttgagactctggg
gactttttgagacagactagctgctgcagtgcgtgctatgaatggatttg
agcctttagggccagggtgggatgtcctgatttaaagtgatgtttggtgt
taacaatggatgatacatttttttcttttacatttaattatgtgtgcatg
cgtgtctatgaaggtgcatgtggtgttctcacaggttaggagggaatggc
agatcaccctgcagctgatgatacaggaggttgtaagctgccatatgtgg
gttatgggatctgaactctggtccttgggaagaacagccagtgctcttag
tcactttgcccacacggctggtcttgattgtctacttgacaagatttata
atcaccgtggagggctggggagatgactcagtgataaagacactgttatc
aaacctgactgactacctgagtttaattctcatggtatcgagagagaact
gactcctgaaagttgccttttgccctccatgtgcaccatggtacatgtgc
acccacccatccacctacccacccacccaccaacccacccaccaaccaac
caaccaatcaaccaaccaccaaccaaccaaccaaccaaccaaccaaataa
ccaaaagcagacaaatataatagaatgatcatggacctctgggcaggtgt
gaagatgtttccagagaggtttaactaaagtgggaagacctatactgaat
atggcatgggggtggggggtggg
tagcactgtccgggagggagcaactgtgagagattcttagggaagaggca
aaggggctgggagcacagagggaatctgagaaaggcagcttggttggaaa
tgaatgacatttccacccacgatggcttatgagaccagaggtcagacttg
cttcaggctcctcggagaccagtttctctgggggcagctcctttggggct
tttacagtcgcagaggagtttgaacctctgtgctaagaacagaaaggtat
tgggcataaaagaccagaggggaaaccaaataatatgggacaggaggaag
tctggggaagctactctagggagattccaggtccttaaggtctgaatgag
cccagagtagaccacaaagctgcctatagatgctctcaaggatccggggg
gggggggtt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_151778827_151779649
seq2: B6Ng01-157H11.b_48_870

seq1  GAATTCTCTCCATGTTGGACAGGGTGGTCAGAGCCCAGGGGCTTGACATA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTCCATGTTGGACAGGGTGGTCAGAGCCCAGGGGCTTGACATA  50

seq1  AAACAGACATCAGGGACTTTGAGCAATTTTAGAAGTGTTGAGACTCTGGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAGACATCAGGGACTTTGAGCAATTTTAGAAGTGTTGAGACTCTGGG  100

seq1  GACTTTTTGAGACAGACTAGCTGCTGCAGTGCGTGCTATGAATGGATTTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTTTTGAGACAGACTAGCTGCTGCAGTGCGTGCTATGAATGGATTTG  150

seq1  AGCCTTTAGGGCCAGGGTGGGATGTCCTGATTTAAAGTGATGTTTGGTGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTTTAGGGCCAGGGTGGGATGTCCTGATTTAAAGTGATGTTTGGTGT  200

seq1  TAACAATGGATGATACATTTTTTTCTTTTACATTTAATTATGTGTGCATG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACAATGGATGATACATTTTTTTCTTTTACATTTAATTATGTGTGCATG  250

seq1  CGTGTCTATGAAGGTGCATGTGGTGTTCTCACAGGTTAGGAGGGAATGGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGTCTATGAAGGTGCATGTGGTGTTCTCACAGGTTAGGAGGGAATGGC  300

seq1  AGATCACCCTGCAGCTGATGATACAGGAGGTTGTAAGCTGCCATATGTGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATCACCCTGCAGCTGATGATACAGGAGGTTGTAAGCTGCCATATGTGG  350

seq1  GTTATGGGATCTGAACTCTGGTCCTTGGGAAGAACAGCCAGTGCTCTTAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTATGGGATCTGAACTCTGGTCCTTGGGAAGAACAGCCAGTGCTCTTAG  400

seq1  TCACTTTGCCCACACGGCTGGTCTTGATTGTCTACTTGACAAGATTTATA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTTTGCCCACACGGCTGGTCTTGATTGTCTACTTGACAAGATTTATA  450

seq1  ATCACCGTGGAGGGCTGGGGAGATGACTCAGTGATAAAGACACTGTTATC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACCGTGGAGGGCTGGGGAGATGACTCAGTGATAAAGACACTGTTATC  500

seq1  AAACCTGACTGACTACCTGAGTTTAATTCTCATGGTATCGAGAGAGAACT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCTGACTGACTACCTGAGTTTAATTCTCATGGTATCGAGAGAGAACT  550

seq1  GACTCCTGAAAGTTGCCTTTTGCCCTCCATGTGCACCATGGTACATGTGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTCCTGAAAGTTGCCTTTTGCCCTCCATGTGCACCATGGTACATGTGC  600

seq1  ACCCACCCATCCACCTACCCACCCACCCACCAACCCACCCACCAACCAAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCACCCATCCACCTACCCACCCACCCACCAACCCACCCACCAACCAAC  650

seq1  CAACCAATCAACCAACCACCAACCAACCAACCAACCAACCAACCAAATAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACCAATCAACCAACCACCAACCAACCAACCAACCAACCAACCAAATAA  700

seq1  CCAAAAGCAGACAAATATAATAGAATGATCATGGACCTCTGGGCAGGTGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAAAGCAGACAAATATAATAGAATGATCATGGACCTCTGGGCAGGTGT  750

seq1  GAAGATGTTTCCAGAGAGGTTTAACTAAGGTGGGAAGACCTATACTGAAT  800
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  GAAGATGTTTCCAGAGAGGTTTAACTAAAGTGGGAAGACCTATACTGAAT  800

seq1  ATGGGCATGGGGGT-GGGGGTGGG  823
      || ||||||||||| |||||||||
seq2  AT-GGCATGGGGGTGGGGGGTGGG  823

seq1: chr7_151987680_151988094
seq2: B6Ng01-157H11.g_68_482 (reverse)

seq1  AACCCCCCCCCCCCGGATCCTTGAGAGCATCTATAGGCAGCTTTGTGGTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCCCCCCCCCCGGATCCTTGAGAGCATCTATAGGCAGCTTTGTGGTC  50

seq1  TACTCTGGGCTCATTCAGACCTTAAGGACCTGGAATCTCCCTAGAGTAGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCTGGGCTCATTCAGACCTTAAGGACCTGGAATCTCCCTAGAGTAGC  100

seq1  TTCCCCAGACTTCCTCCTGTCCCATATTATTTGGTTTCCCCTCTGGTCTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCCAGACTTCCTCCTGTCCCATATTATTTGGTTTCCCCTCTGGTCTT  150

seq1  TTATGCCCAATACCTTTCTGTTCTTAGCACAGAGGTTCAAACTCCTCTGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGCCCAATACCTTTCTGTTCTTAGCACAGAGGTTCAAACTCCTCTGC  200

seq1  GACTGTAAAAGCCCCAAAGGAGCTGCCCCCAGAGAAACTGGTCTCCGAGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGTAAAAGCCCCAAAGGAGCTGCCCCCAGAGAAACTGGTCTCCGAGG  250

seq1  AGCCTGAAGCAAGTCTGACCTCTGGTCTCATAAGCCATCGTGGGTGGAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTGAAGCAAGTCTGACCTCTGGTCTCATAAGCCATCGTGGGTGGAAA  300

seq1  TGTCATTCATTTCCAACCAAGCTGCCTTTCTCAGATTCCCTCTGTGCTCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCATTCATTTCCAACCAAGCTGCCTTTCTCAGATTCCCTCTGTGCTCC  350

seq1  CAGCCCCTTTGCCTCTTCCCTAAGAATCTCTCACAGTTGCTCCCTCCCGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCCCTTTGCCTCTTCCCTAAGAATCTCTCACAGTTGCTCCCTCCCGG  400

seq1  ACAGTGCTAGAATTC  415
      |||||||||||||||
seq2  ACAGTGCTAGAATTC  415