BAC Information

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BAC

Clone NameB6Ng01-157P23
Chromosome7 (Build37)
Map Location 7,276,165 - 7,426,638
singlet/doubletdoublet
Overlap geneV2r15, LOC100041866, LOC100042577, Vmn2r31, Vmn2r-ps36, V2r5
Upstream geneZfp583, LOC100042467, LOC100042459, Zfp78, Zfp28, LOC100042450, Olfr1344, GA_x5J8B7W3DQU-679632-679375, Olfr1336, Olfr1346, Olfr5, Olfr1347, Olfr1348, Olfr1349, LOC665328, Olfr1350, Zim2, Zim1, Peg3, Usp29, LOC627961, Aurkc, LOC628030, LOC100041822, 5730403M16Rik, 2810409K11Rik, Vmn2r-ps35, Zfp418, BC023179, 6430701C03Rik, Clcn4-2
Downstream geneLOC100041883, EG628117, Vmn2r33, LOC665470, EG665474, EG628368, LOC100042636, LOC665485, EG625353, Vmn2r-ps40, Vmn2r36, LOC638170, LOC100042662, LOC100041942, LOC100042673, LOC100041949, LOC100042681, LOC100042688, LOC100042695, LOC100041956, LOC100041961
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-157P23.bB6Ng01-157P23.g
ACCDH952075DH952076
length7581,123
definitionDH952075|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-157P23, 5' end.DH952076|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-157P23, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(7,425,883 - 7,426,638)(7,276,165 - 7,277,286)
sequence
gaattcacagattagcaatgaaaatgtgtggttttatacaaagcatccaa
atatctattagcatgccccttccaatagtagataaaaagtctttcctcat
taattttctccatgattagaagatgagtttttatttatatttctcaatta
tatggaaatcatttggaggaattattttcattagcgtaatccagtgattc
tgccaagagtgtaggatctggagaacataatgggttttctgatagtaact
aaactagaaatagtgttggtattcatttctgtgtgtagaaatgtgtttat
atgtgtgaatgtatgcttctcactgagtatatgtatattttcttctcttt
ttgtttatctacatttatatttgtgttactttcaacatatatgtttatct
ctctgtatgaaagtggaagtgagcaacattttttttctatggaggaatgt
ctttctataagtgtttgtttatatatgtgtgtatgtttctttggggtttt
gtcagagtaggtttcattgtgtacgatgtatgtatttttaagtgtttata
agtacttatgcagatttttacctgctttactaagtatgtgtctgcctatt
tctttgtacttggcaaggtctttggcttcctttttgtctttaagtgtgag
tataaaaatctctgtgtgtcaatattgttcatggctagtcctttaatatt
ttatacatctcccctgtgttttgctctctctctctctctctctctctctc
tctctctc
gaattccaaacacagagaaaaatgcagatccaaacacaggtatgcaacac
acacacacacacacaaacacacacacacacacacacacacacacacacca
aacacacgcacacaaacacacgaatatacacacagacacctagagtggct
cacatcttttccatgttacacatataatacatctatacattcatttacaa
acaaatatacgtacatgttgacacacatatgtaaatattcattcacataa
gtgacaatcatatccactcaaataaaaacacagatatgaaatcacacaaa
ataatacactggcacacatacaacctcacacacagacatacagacataca
cacacacactcacacaaacacacacacacacacacacacacacacacaca
cacagagagagagagagagagagagagagagagagggagggaggctgaca
gcaaaacacggggagtggtataaatatataaggaacagccatgaataata
ttgacacacagagagttttatattcacacctaaagacaaaaaggaaggca
aaggccttgccaagtacaaagaaataggcagacacatacacagtaaagca
ggtacaaatccatataagtacttataaacacttacaaaatacatacattg
tgcacaatgaaacctactctgacaaaactccaaagaaacatacacacata
tataaacaaacacttatagaaagaaattcctacatagaaataattgttgc
tcaattccactttcatacagagagataaacatatatgttgaaagtaacac
aaatataaatgcagatatacagaaagagtagaaaatatatatatactcag
tgagaagcatacattcacacatataaacatatttctacagacagaaaatg
aataccaacaactattttcttgtttagttacttctcagaaaactcagaaa
tgttcttcaagaagtctactactctttgcaagaatcactggaatacacta
aatgaaaataatttccttcaattgattcatataattgacaaatataaata
aaaactcatttttaatcatgagaaattaaatgaagcaagcttttattcaa
tatagaaggggcatgctatagat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_7425883_7426638
seq2: B6Ng01-157P23.b_48_805 (reverse)

seq1  GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCAAAACACA-GGGAG  49
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCAAAACACAGGGGAG  50

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      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTATAAAATATTAAAGGACTAGCCATGAACAATATTGACACACAGAGA  100

seq1  TTTTTATACTCACACTTAAAGACAAAAAGGAAGCCAAAGACCTTGCCAAG  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTATACTCACACTTAAAGACAAAAAGGAAGCCAAAGACCTTGCCAAG  150

seq1  TACAAAGAAATAGGCAGACACATACTTAGTAAAGCAGGTAAAAATCTGCA  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAAAGAAATAGGCAGACACATACTTAGTAAAGCAGGTAAAAATCTGCA  200

seq1  TAAGTACTTATAAACACTTAAAAATACATACATCGTACACAATGAAACCT  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTACTTATAAACACTTAAAAATACATACATCGTACACAATGAAACCT  250

seq1  ACTCTGACAAAACCCCAAAGAAACATACACACATATATAAACAAACACTT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTGACAAAACCCCAAAGAAACATACACACATATATAAACAAACACTT  300

seq1  ATAGAAAGACATTCCTCCATAGAAAAAAAATGTTGCTCACTTCCACTTTC  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGAAAGACATTCCTCCATAGAAAAAAAATGTTGCTCACTTCCACTTTC  350

seq1  ATACAGAGAGATAAACATATATGTTGAAAGTAACACAAATATAAATGTAG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACAGAGAGATAAACATATATGTTGAAAGTAACACAAATATAAATGTAG  400

seq1  ATAAACAAAAAGAGAAGAAAATATACATATACTCAGTGAGAAGCATACAT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAACAAAAAGAGAAGAAAATATACATATACTCAGTGAGAAGCATACAT  450

seq1  TCACACATATAAACACATTTCTACACACAGAAATGAATACCAACACTATT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACACATATAAACACATTTCTACACACAGAAATGAATACCAACACTATT  500

seq1  TCTAGTTTAGTTACTATCAGAAAACCCATTATGTTCTCCAGATCCTACAC  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGTTTAGTTACTATCAGAAAACCCATTATGTTCTCCAGATCCTACAC  550

seq1  TCTTGGCAGAATCACTGGATTACGCTAATGAAAATAATTCCTCCAAATGA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGGCAGAATCACTGGATTACGCTAATGAAAATAATTCCTCCAAATGA  600

seq1  TTTCCATATAATTGAGAAATATAAATAAAAACTCATCTTCTAATCATGGA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCATATAATTGAGAAATATAAATAAAAACTCATCTTCTAATCATGGA  650

seq1  GAAAATTAATGAGGAAAGACTTTTTATCTACTATTGGAAGGGGCATGCTA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAATTAATGAGGAAAGACTTTTTATCTACTATTGGAAGGGGCATGCTA  700

seq1  ATAGATATTTGGATGCTTTGTATAAAACCACACATTTTCATTGCTAATCT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGATATTTGGATGCTTTGTATAAAACCACACATTTTCATTGCTAATCT  750

seq1  GTGAATTC  756
      ||||||||
seq2  GTGAATTC  758

seq1: chr7_7276165_7277286
seq2: B6Ng01-157P23.g_67_1189

seq1  GAATTCCAAACACAGAGAAAAATGCAGATCCAAACACAGGTATGCAACAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAAACACAGAGAAAAATGCAGATCCAAACACAGGTATGCAACAC  50

seq1  ACACACACACACACAAACACACACACACACACACACACACACACACACCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACACACAAACACACACACACACACACACACACACACACACCA  100

seq1  AACACACGCACACAAACACACGAATATACACACAGACACCTAGAGTGGCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACACGCACACAAACACACGAATATACACACAGACACCTAGAGTGGCT  150

seq1  CACATCTTTTCCATGTTACACATATAATACATCTATACATTCATTTACAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATCTTTTCCATGTTACACATATAATACATCTATACATTCATTTACAA  200

seq1  ACAAATATACGTACATGTTGACACACATATGTAAATATTCATTCACATAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAATATACGTACATGTTGACACACATATGTAAATATTCATTCACATAA  250

seq1  GTGACAATCATATCCACTCAAATAAAAACACAGATATGAAATCACACAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACAATCATATCCACTCAAATAAAAACACAGATATGAAATCACACAAA  300

seq1  ATAATACACTGGCACACATACAACCTCACACACAGACATACAGACATACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATACACTGGCACACATACAACCTCACACACAGACATACAGACATACA  350

seq1  CACACACACTCACACAAACACACACACACACACACACACACACACACACA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACACTCACACAAACACACACACACACACACACACACACACACACA  400

seq1  CACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGGGAGGCTGACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGGGAGGCTGACA  450

seq1  GCAAAACACGGGGAGTGGTATAAATATATAAGGAACAGCCATGAATAATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAAACACGGGGAGTGGTATAAATATATAAGGAACAGCCATGAATAATA  500

seq1  TTGACACACAGAGAGTTTTATATTCACACCTAAAGACAAAAAGGAAGGCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGACACACAGAGAGTTTTATATTCACACCTAAAGACAAAAAGGAAGGCA  550

seq1  AAGGCCTTGCCAAGTACAAAGAAATAGGCAGACACATACACAGTAAAGCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCCTTGCCAAGTACAAAGAAATAGGCAGACACATACACAGTAAAGCA  600

seq1  GGTACAAATCCATATAAGTACTTATAAACACTTACAAAATACATACATTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTACAAATCCATATAAGTACTTATAAACACTTACAAAATACATACATTG  650

seq1  TGCACAATGAAACCTACTCTGACAAAACCCCAAAGAAACATACACACATA  700
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TGCACAATGAAACCTACTCTGACAAAACTCCAAAGAAACATACACACATA  700

seq1  TATAAACAAACACTTATAGAAAGAAATTCCTACATAGAAATAATTGTTGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAAACAAACACTTATAGAAAGAAATTCCTACATAGAAATAATTGTTGC  750

seq1  TCAATTCCACTTTCATACAGAGAGATAAACATATATGTTGAAAGTAACAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATTCCACTTTCATACAGAGAGATAAACATATATGTTGAAAGTAACAC  800

seq1  AAATATAAATGCAGATACACAGAAAGAGTAGAAAATATACATATACTCAG  850
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  AAATATAAATGCAGATATACAGAAAGAGTAGAAAATATATATATACTCAG  850

seq1  TGAGAAGCATACATTCACACATATAAACATATTTCTACAGACAG-AAATG  899
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  TGAGAAGCATACATTCACACATATAAACATATTTCTACAGACAGAAAATG  900

seq1  AATACCAAC-ACTA-TTTCTTGTTTAGTTAC-TCTCAGAAAACCCAG-AA  945
      ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||
seq2  AATACCAACAACTATTTTCTTGTTTAGTTACTTCTCAGAAAACTCAGAAA  950

seq1  TGTTCTCCA--GAGCCTAC-ACTCTTTGC-AGAATCACTGGATTACACT-  990
      |||||| ||   || |||| ||||||||| |||||||||||| |||||| 
seq2  TGTTCTTCAAGAAGTCTACTACTCTTTGCAAGAATCACTGGAATACACTA  1000

seq1  AATGAAAATAA-TTCCTCCAAATGATTTCCATATAATTGACAAATATAAA  1039
      ||||||||||| ||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||
seq2  AATGAAAATAATTTCCTTCAATTGATT--CATATAATTGACAAATATAAA  1048

seq1  TAAAAACTCATCTTCTAATCATGGAGAAATTTAATGAGGAAAGACTTTTT  1089
      ||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||  
seq2  TAAAAACTCAT-TTTTAATCAT-GAGAAATTAAATGAAGCAAG-CTTT--  1093

seq1  ATATCCAATATTAGAAGGGGCATGCTAATAGAT  1122
       ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||
seq2  -TATTCAATA-TAGAAGGGGCATGCT-ATAGAT  1123