BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-158B10
Chromosome7 (Build37)
Map Location 99,190,750 - 99,299,942
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDlg2
Upstream genenone
Downstream geneCcdc90b, Ankrd42, Pcf11, LOC676240, LOC100040007, 4632427E13Rik, Rab30, 4632434I11Rik, Prcp, A830059I20Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-158B10.bB6Ng01-158B10.g
ACCDH952143DH952144
length1,1541,210
definitionDH952143|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-158B10, 5' end.DH952144|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-158B10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(99,190,750 - 99,191,922)(99,298,722 - 99,299,942)
sequence
gaattcaccaacattctgcaaagtaccaagtacttaccaatagatgaata
caaatttagtccaaatgctctgaaaatgaagaataataaggagaacagag
ttgggtaacatcaatatgtttgaagaacacattgaactcataatctcaag
cacataaatatacaattgtttacataaatacatctggattctgaaataat
ctagcatcaattgatcatttaaaagggaatgtcttggtgcccagcactcc
atagtctatgctgtattctatgccatgtatgcccagcaggctgccatatc
gagataacacagcatgtaattcttacctctaagcacataggttttttttt
ttatattgaactgttttaaatagaacaataagtcttaaatgggtttgcca
ttaaggcattaaattcccttagagtagagaatcaactgaaattggaaatc
aaattattttaaaccatctttctaatgcttttgtaaaattaaaatagctg
cataaaatagttattaaatgaaatgtggtttaaaataccaaacagctata
taagttttacctaagtttctatttacatgacataaagtaagcagagatgt
ttctcttttccagctaacttgatccaaggagacagaaaagctgtctacta
tagaacctctgctgttttcgatagtatccaaatcattcatgactataccc
aatacagcaagacataacaatatccccattacctaccgggctccatgctt
ccagttcagtttaaaagacccaacccacacattaatctcctctttctctt
gaaactctaacaaaggaaagtaacagaattttaaaggtgatgatgcctga
gtgataaagcaagtggaataggtcagctgtcttcaaaatgtcacaaaaag
ccacgtgggaagttctggtggatgaagcagagagatcagtttggatccta
tggaaccagcactatgcactatatgatcctagggccaatcgtcacaactt
aaataaccattatgtcccagtaccccagtgatgagtgaaacttcagaaag
acaaaccacatctacagctcttcatttatctgatactggcatcactggtg
acatgctttgcagaaaactatcatggattctttcctttccaattcatgga
tggg
gaattctctctctctcttttttaaagatttacctattttatgggtatgag
tatttgcctgcatgtatgcgaatcccacacttgaagtgatagagaaggtt
cagaaagtgcattagatttctcataactggagttacagatggttgtgagc
agctatgtatgtgctagaaaatgaatctaagtcatctgaaaaggtgcttt
cgagcactgagacatttctccaggcccaagacagtatactttaaaaaaca
cattcattcattttcactgattgaagttccaattgctttatctattaatc
gatagctatgagttatgtattgggcatttaatacattccagacacaagag
aagcagaaagattctgacctaaagggggaaatgtcataaatcatcgtgat
gcaaaataaaagtcttgagcaactgtatagaaaaagcagaagcaagttca
gaagagaaaacgttagcaacttgaagctcagtagaggaagcagctctgag
gtgtcctggaacctgactggaaagggagaggtgaggggagaacaacagag
gctgtgttcacaatgaagggcatgcaggagcccaggattgcaaatggaat
gggcaagtgcccacagtgaacagcagttagcacaggggtgggggctctaa
aagcacttcccaaagcttgcttgaccaccctgggctttcttttaattaac
actgctgtgaccttgtgggggaggttagccaatatgtttgctgtcccact
gttcctaatgatttttggttgtgggacttcaatttagtgtgagttctctc
cgttcaatatattcactcatgctactgtctgtcaccctcgctgcttctat
gagatttcacttattctctagagcagttcctgttggtacaaaatcatgga
atggtggatggaccctttgtgttctgtcctcagagtggtttaaaccgatg
gcattctctgcagtaaacattatgccagtagctaatgtggatcacattgg
tggactaccattggtgctggctttctagagagaacatgaacacccgagac
ccaaatttggagttacagctcagtcagctttgttccagatggtgacacaa
aggcaattagagggaggtctggaagcttctttagatgtttttattaatat
acatagacttggcatatgtctagcgagcttctgtgagtgtgacgaagcat
atcttaactt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_99190750_99191922
seq2: B6Ng01-158B10.b_46_1199

seq1  GAATTCACCAACATTCTGCAAAGTACCAAGTACTTACCAATAGATGAATA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACCAACATTCTGCAAAGTACCAAGTACTTACCAATAGATGAATA  50

seq1  CAAATTTAGTCCAAATGCTCTGAAAATGAAGAATAATAAGGAGAACAGAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATTTAGTCCAAATGCTCTGAAAATGAAGAATAATAAGGAGAACAGAG  100

seq1  TTGGGTAACATCAATATGTTTGAAGAACACATTGAACTCATAATCTCAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGTAACATCAATATGTTTGAAGAACACATTGAACTCATAATCTCAAG  150

seq1  CACATAAATATACAATTGTTTACATAAATACATCTGGATTCTGAAATAAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATAAATATACAATTGTTTACATAAATACATCTGGATTCTGAAATAAT  200

seq1  CTAGCATCAATTGATCATTTAAAAGGGAATGTCTTGGTGCCCAGCACTCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGCATCAATTGATCATTTAAAAGGGAATGTCTTGGTGCCCAGCACTCC  250

seq1  ATAGTCTATGCTGTATTCTATGCCATGTATGCCCAGCAGGCTGCCATATC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTCTATGCTGTATTCTATGCCATGTATGCCCAGCAGGCTGCCATATC  300

seq1  GAGATAACACAGCATGTAATTCTTACCTCTAAGCACATAGGTTTTTTTTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATAACACAGCATGTAATTCTTACCTCTAAGCACATAGGTTTTTTTTT  350

seq1  TTATATTGAACTGTTTTAAATAGAACAATAAGTCTTAAATGGGTTTGCCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATATTGAACTGTTTTAAATAGAACAATAAGTCTTAAATGGGTTTGCCA  400

seq1  TTAAGGCATTAAATTCCCTTAGAGTAGAGAATCAACTGAAATTGGAAATC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGGCATTAAATTCCCTTAGAGTAGAGAATCAACTGAAATTGGAAATC  450

seq1  AAATTATTTTAAACCATCTTTCTAATGCTTTTGTAAAATTAAAATAGCTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTATTTTAAACCATCTTTCTAATGCTTTTGTAAAATTAAAATAGCTG  500

seq1  CATAAAATAGTTATTAAATGAAATGTGGTTTAAAATACCAAACAGCTATA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAAAATAGTTATTAAATGAAATGTGGTTTAAAATACCAAACAGCTATA  550

seq1  TAAGTTTTACCTAAGTTTCTATTTACATGACATAAAGTAAGCAGAGATGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTTTTACCTAAGTTTCTATTTACATGACATAAAGTAAGCAGAGATGT  600

seq1  TTCTCTTTTCCAGCTAACTTGATCCAAGGAGACAGAAAAGCTGTCTACTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCTTTTCCAGCTAACTTGATCCAAGGAGACAGAAAAGCTGTCTACTA  650

seq1  TAGAACCTCTGCTGTTTTCGATAGTATCCAAATCATTCATGACTATACCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAACCTCTGCTGTTTTCGATAGTATCCAAATCATTCATGACTATACCC  700

seq1  AATACAGCAAGACATAACAATATCCCCATTACCTACCGGGCTCCATGCTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACAGCAAGACATAACAATATCCCCATTACCTACCGGGCTCCATGCTT  750

seq1  CCAGTTCAGTTTAAAAGACCCAACCCACACATTAATCTCCTCTTTCTCTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTTCAGTTTAAAAGACCCAACCCACACATTAATCTCCTCTTTCTCTT  800

seq1  GAAACTCTAACAAAGGAAAGTAACAGAATTTT-AAGGTGATGATGCCTGA  849
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  GAAACTCTAACAAAGGAAAGTAACAGAATTTTAAAGGTGATGATGCCTGA  850

seq1  GTGATAAAGCAAGTGGAATAGGTCAGCTGTCTTCAAAATGTCACAAAAAG  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATAAAGCAAGTGGAATAGGTCAGCTGTCTTCAAAATGTCACAAAAAG  900

seq1  CCACGTGGGAAGTTCTGGTGGATGAAGCAGAAGAGATCAGGTTTGGATCC  949
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||
seq2  CCACGTGGGAAGTTCTGGTGGATGAAGCAG-AGAGATCA-GTTTGGATCC  948

seq1  TATGGAACCAGCACTATGCACTATATGATCCCAGGGCCAATCGTCACAAC  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TATGGAACCAGCACTATGCACTATATGATCCTAGGGCCAATCGTCACAAC  998

seq1  TTAAATAACCATTATGTCCCAGTACCCCCAGTGGATGAGTGAAACTTCAG  1049
      |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||
seq2  TTAAATAACCATTATGTCCCAGTA-CCCCAGT-GATGAGTGAAACTTCAG  1046

seq1  AAAGAACCAAACCCACATCTACAGCCTCTTTCAATTTATCTGATTACTTG  1099
      |||||  |||| |||||||||||| |||||   |||||||||| ||| ||
seq2  AAAGA--CAAA-CCACATCTACAG-CTCTT--CATTTATCTGA-TAC-TG  1088

seq1  GCATTCACTGTGGACATGGCTTTGCAGAAAAACTATCATGGATTTCTTTT  1149
      ||| ||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| 
seq2  GCA-TCACTGGTGACAT-GCTTTGCAG-AAAACTATCATGGA-TTCTTT-  1133

seq1  CCCCTTTACAATTTCATGGATGGG  1173
        ||||| ||| ||||||||||||
seq2  --CCTTTCCAA-TTCATGGATGGG  1154

seq1: chr7_99298722_99299942
seq2: B6Ng01-158B10.g_68_1277 (reverse)

seq1  AAGTTAAGATATGGTCTCTGTCAAACATCA-GGAAGCTCGCTAGACATTA  49
      |||||||||||||  ||  |||| || |||  ||||||||||||||||  
seq2  AAGTTAAGATATG--CTTCGTCACAC-TCACAGAAGCTCGCTAGACATAT  47

seq1  TCCATG-CTATGATAATTTATTAAAACATCTTAAGAAGCTTCAAGACTTC  98
       ||| | |||||   ||| || ||||||||| |||||||||| |||| ||
seq2  GCCAAGTCTATGTATATTAATAAAAACATCTAAAGAAGCTTCCAGACCTC  97

seq1  CTTTCTAATTTCCTATTTGTGTCACTATCTGGGACAAAGCTGGACTGAGC  148
      |  ||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||
seq2  C-CTCTAATTGCC--TTTGTGTCACCATCTGGAACAAAGCT-GACTGAGC  143

seq1  TGGTAACTCCAAATTTGGGTTCTGGGTGTTCATGGTCTTCTCTAGAAAAG  198
      | ||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||||||  
seq2  T-GTAACTCCAAATTTGGGTCTCGGGTGTTCATGTTC-TCTCTAGAAA--  189

seq1  GCCAGCA-CAATGGTTGGTCCA-CAATGGTTGATCCACATTAGCTACTGG  246
      ||||||| |||||| | ||||| |||||  ||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGCACCAATGG-TAGTCCACCAATG--TGATCCACATTAGCTACTGG  236

seq1  CATAATGTTTACTGCAGAGAATGCCATCGGTTTAAAACCACTCTGAGGAC  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  CATAATGTTTACTGCAGAGAATGCCATCGGTTT-AAACCACTCTGAGGAC  285

seq1  AGAACACAAAGGGTCCATCCACCATTCCATGATTTTGTACCAACAGGAAC  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACACAAAGGGTCCATCCACCATTCCATGATTTTGTACCAACAGGAAC  335

seq1  TGCTCTAGAGAATAAGTGAGATCTCATAGAAGCAGCGAGGGTGACAGACA  396
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCTAGAGAATAAGTGAAATCTCATAGAAGCAGCGAGGGTGACAGACA  385

seq1  GTAGCATGAGTGAATATATTGAACGGAGAGAACTCACACTAAATTGAAGT  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCATGAGTGAATATATTGAACGGAGAGAACTCACACTAAATTGAAGT  435

seq1  CCCACAACCAAAAATCATTAGGAACAGTGGGACAGCAAACATATTGGCTA  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACAACCAAAAATCATTAGGAACAGTGGGACAGCAAACATATTGGCTA  485

seq1  ACCTCCCCCACAAGGTCACAGCAGTGTTAATTAAAAGAAAGCCCAGGGTG  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCCCCCACAAGGTCACAGCAGTGTTAATTAAAAGAAAGCCCAGGGTG  535

seq1  GTCAAGCAAGCTTTGGGAAGTGCTTTTAGAGCCCCCACCCCTGTGCTAAC  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAAGCAAGCTTTGGGAAGTGCTTTTAGAGCCCCCACCCCTGTGCTAAC  585

seq1  TGCTGTTCACTGTGGGCACTTGCCCATTCCATTTGCAATCCTGGGCTCCT  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGTTCACTGTGGGCACTTGCCCATTCCATTTGCAATCCTGGGCTCCT  635

seq1  GCATGCCCTTCATTGTGAACACAGCCTCTGTTGTTCTCCCCTCACCTCTC  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGCCCTTCATTGTGAACACAGCCTCTGTTGTTCTCCCCTCACCTCTC  685

seq1  CCTTTCCAGTCAGGTTCCAGGACACCTCAGAGCTGCTTCCTCTACTGAGC  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTCCAGTCAGGTTCCAGGACACCTCAGAGCTGCTTCCTCTACTGAGC  735

seq1  TTCAAGTTGCTAACGTTTTCTCTTCTGAACTTGCTTCTGCTTTTTCTATA  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAGTTGCTAACGTTTTCTCTTCTGAACTTGCTTCTGCTTTTTCTATA  785

seq1  CAGTTGCTCAAGACTTTTATTTTGCATCACGATGATTTATGACATTTCCC  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTGCTCAAGACTTTTATTTTGCATCACGATGATTTATGACATTTCCC  835

seq1  CCTTTAGGTCAGAATCTTTCTGCTTCTCTTGTGTCTGGAATGTATTAAAT  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTAGGTCAGAATCTTTCTGCTTCTCTTGTGTCTGGAATGTATTAAAT  885

seq1  GCCCAATACATAACTCATAGCTATCGATTAATAGATAAAGCAATTGGAAC  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCAATACATAACTCATAGCTATCGATTAATAGATAAAGCAATTGGAAC  935

seq1  TTCAATCAGTGAAAATGAATGAATGTGTTTTTTAAAGTATACTGTCTTGG  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAATCAGTGAAAATGAATGAATGTGTTTTTTAAAGTATACTGTCTTGG  985

seq1  GCCTGGAGAAATGTCTCAGTGCTCGAAAGCACCTTTTCAGATGACTTAGA  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGGAGAAATGTCTCAGTGCTCGAAAGCACCTTTTCAGATGACTTAGA  1035

seq1  TTCATTTTCTAGCACATACATAGCTGCTCACAACCATCTGTAACTCCAGT  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATTTTCTAGCACATACATAGCTGCTCACAACCATCTGTAACTCCAGT  1085

seq1  TATGAGAAATCTAATGCACTTTCTGAACCTTCTCTATCACTTCAAGTGTG  1146
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGAGAAATCTAATGCACTTTCTGAACCTTCTCTATCACTTCAAGTGTG  1135

seq1  GGATTCGCATACATGCAGGCAAATACTCATACCCATAAAATAGGTAAATC  1196
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTCGCATACATGCAGGCAAATACTCATACCCATAAAATAGGTAAATC  1185

seq1  TTTAAAAAAGAGAGAGAGAGAATTC  1221
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAAAAAGAGAGAGAGAGAATTC  1210