BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-159P15
Chromosome7 (Build37)
Map Location 103,926,805 - 104,106,257
singlet/doubletdoublet
Overlap geneOdz4, Nars2
Upstream geneFrda-ps, EG666836, LOC670727, LOC666858
Downstream geneGab2, LOC100040457, Usp35, EG622320, Alg8, Ndufc2, Thrsp, Kctd14, Ints4, 1810020D17Rik, Rsf1, LOC622994, LOC100040211, Clns1a, Aqp11, LOC100040594, Pak1, Gdpd4
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-159P15.bB6Ng01-159P15.g
ACCDH953484DH953485
length1,0781,107
definitionDH953484|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-159P15, 5' end.DH953485|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-159P15, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(104,105,176 - 104,106,257)(103,926,805 - 103,927,903)
sequence
gaattcactcttttgactggcatggaactcaaagagagccacatacatct
gcctccccagtgctgggataaaggaatatcaccaccacctcgcacatgta
gatttttgttgctgtttttgaagaggaggtcccatgtagtgaaaattttg
gtttctttaaaaaacagaaatagaagtgcagtttttttttttattcccag
atatggggatgtggggctgcttcagattgtccatagcagctatgagttgc
ctcctgctttagcagggttaaacagagccatgcaactgttaccctcacag
atatcatcagaggaacacaaacctctttttaaaggtggtcacagtggctc
agtatgctggtgagagtaagaagggccctcagaagcatttaaatgtgtgg
tcctcagttggtggaactgtttgaagattaggaggtatggctttgtgtca
ctgaaggattaggaggtgggctttgagggtacaaaagcccaagccattcc
cagttagtgcactcattctttctacctcatacttgtggaacaaggtgaag
ctctcaatgactgctccagcagagtgcatgcctgctgccatgctccccaa
catgatggtatggactcttaacatgaaactattgcgcaccccccaaaatg
ctcattcttctatacgttgctttggttaaggtatcacaacaatagaaacg
taattaagacagatttttgtctttctgcccaattgagacccatcagtctt
tgtaatatgcaatatgtaatatgtattatgtaatatgtaatatgtagtat
gttattcctaacagtcctttggaatagcaaagtgctcttattctagcaga
aattgtgttctgctccttagaggttatactttaacacaaaatgttattag
ttctgacatctgataatgagaccataaaagttccagtattctggacaggt
gagatggctcaatggttaagagcactggctgcttttccagaaggtctgag
ttcaattccagcacacatgtagtctaataacatctgtaatgggatcttgt
tcctcttctggtgtgttctgaaacagct
gaattcaaggaggaaagattcgtgtcggatcacagtttttcagaaagttc
tttccaggattgcttagggcatgccatcttttgtagagcaagagccagga
gggaggaggcggggatactcacagggtgtgtccacagtggcagtgttgat
tacttgcctggttgttgtgacaaaatacatagtcaggaagcctgaagaag
aagtgaggacaggctataaacccccaggcccacccacaatgacacactac
ttccattaaggctctacctcttagaggccccacaacctgctcaaatagca
caactagctaggggcacaggatgctaacacctgtgcctttggcagacaca
ttcaaaccatagcagtgacctgctgcctccagctgtgttccagctctcca
ggcttccagaacatcccaaagtatcatcaccagataagggcaaagcgtgt
agcataagagcctgtgaggaacattcaatgtgaaatgatagcaagtgtcg
tttatcaacactgacagtagcgcctatgattccagatgtgttttactgag
acttatctagtgcaaggccacaagggggcctgagagagctacaagaatag
gggtcatggggaagcacctgccctgccaggctgtccttttagctctgtcc
tttcctcagaatgaaagatgagctcagtatgggattttaaggtcctctga
aatctgccccccaattcttttctggcttagtgcttatactggacagcaat
taccatggtttatgctgtagcaagtgtgtctgtttagtggatacaatccc
agggactcaacatagggcctgggcctactacacctgcttgggtaaagaca
gatggacagaagggatagataatgaatggacagacaggcagatggatgga
ttggatagaaatgattggacagacagacggatgaatggatagatggatgg
gcaggcagacagccacatgatagggcatccggttctacaagatatacatt
accaaccttctcctcttatagcaccgcctgtttagacccggaaaaagagg
attaatggagaaacaacacttggactaccttgtacagtatggttaccagt
aggcttt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_104105176_104106257
seq2: B6Ng01-159P15.b_47_1124 (reverse)

seq1  AGCTGTTTTCAG-ACACACCAGAAGAGGGCATCAGATCCCATTACAGATG  49
      ||||| |||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||||||| 
seq2  AGCTG-TTTCAGAACACACCAGAAGA-GGAACAAGATCCCATTACAGAT-  47

seq1  GTTATGAG-CTACCATGTGGTTGCTGGGATTTGAACTCAGGACCTCTGGA  98
      ||||| || ||| ||||||  |||| ||| ||||||||||  | ||||||
seq2  GTTATTAGACTA-CATGTG--TGCT-GGAATTGAACTCAGACCTTCTGGA  93

seq1  AGAGCAGCCAGTGCTCTTAACCATTGAGCCATCTCACCTGTCCAGAATAA  148
      | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  AAAGCAGCCAGTGCTCTTAACCATTGAGCCATCTCACCTGTCCAGAAT-A  142

seq1  CTGGAACTTTTATGGTCTCATTATCAGATGTCAGAACTAATAACATTTTG  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAACTTTTATGGTCTCATTATCAGATGTCAGAACTAATAACATTTTG  192

seq1  TGTTAAAGTATAACCTCTAAGGAGCAGAACACAA-TTCTGCTAGAATAAG  247
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  TGTTAAAGTATAACCTCTAAGGAGCAGAACACAATTTCTGCTAGAATAAG  242

seq1  AGCACTTTGCTATTCC-AAGGACTGTTAGGAATAACATACTACATATTAC  296
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACTTTGCTATTCCAAAGGACTGTTAGGAATAACATACTACATATTAC  292

seq1  ATATTACATAATACATATTACATATTGCATATTACAAAGACTGATGGGTC  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTACATAATACATATTACATATTGCATATTACAAAGACTGATGGGTC  342

seq1  TCAATTGGGCAGAAAGACAAAAATCTGTCTTAATTACGTTTCTATTGTTG  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATTGGGCAGAAAGACAAAAATCTGTCTTAATTACGTTTCTATTGTTG  392

seq1  TGATACCTTAACCAAAGCAACGTATAGAAGAATGAGCATTTTGGGGGGTG  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATACCTTAACCAAAGCAACGTATAGAAGAATGAGCATTTTGGGGGGTG  442

seq1  CGCAATAGTTTCATGTTAAGAGTCCATACCATCATGTTGGGGAGCATGGC  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCAATAGTTTCATGTTAAGAGTCCATACCATCATGTTGGGGAGCATGGC  492

seq1  AGCAGGCATGCACTCTGCTGGAGCAGTCATTGAGAGCTTCACCTTGTTCC  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGGCATGCACTCTGCTGGAGCAGTCATTGAGAGCTTCACCTTGTTCC  542

seq1  ACAAGTATGAGGTAGAAAGAATGAGTGCACTAACTGGGAATGGCTTGGGC  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGTATGAGGTAGAAAGAATGAGTGCACTAACTGGGAATGGCTTGGGC  592

seq1  TTTTGTACCCTCAAAGCCCACCTCCTAATCCTTCAGTGACACAAAGCCAT  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGTACCCTCAAAGCCCACCTCCTAATCCTTCAGTGACACAAAGCCAT  642

seq1  ACCTCCTAATCTTCAAACAGTTCCACCAACTGAGGACCACACATTTAAAT  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCCTAATCTTCAAACAGTTCCACCAACTGAGGACCACACATTTAAAT  692

seq1  GCTTCTGAGGGCCCTTCTTACTCTCACCAGCATACTGAGCCACTGTGACC  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCTGAGGGCCCTTCTTACTCTCACCAGCATACTGAGCCACTGTGACC  742

seq1  ACCTTTAAAAAGAGGTTTGTGTTCCTCTGATGATATCTGTGAGGGTAACA  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTTAAAAAGAGGTTTGTGTTCCTCTGATGATATCTGTGAGGGTAACA  792

seq1  GTTGCATGGCTCTGTTTAACCCTGCTAAAGCAGGAGGCAACTCATAGCTG  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGCATGGCTCTGTTTAACCCTGCTAAAGCAGGAGGCAACTCATAGCTG  842

seq1  CTATGGACAATCTGAAGCAGCCCCACATCCCCATATCTGGGAATAAAAAA  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGGACAATCTGAAGCAGCCCCACATCCCCATATCTGGGAATAAAAAA  892

seq1  AAAAACTGCACTTCTATTTCTGTTTTTTAAAGAAACCAAAATTTTCACTA  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAACTGCACTTCTATTTCTGTTTTTTAAAGAAACCAAAATTTTCACTA  942

seq1  CATGGGACCTCCTCTTCAAAAACAGCAACAAAAATCTACATGTGCGAGGT  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGGACCTCCTCTTCAAAAACAGCAACAAAAATCTACATGTGCGAGGT  992

seq1  GGTGGTGATATTCCTTTATCCCAGCACTGGGGAGGCAGATGTATGTGGCT  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGTGATATTCCTTTATCCCAGCACTGGGGAGGCAGATGTATGTGGCT  1042

seq1  CTCTTTGAGTTCCATGCCAGTCAAAAGAGTGAATTC  1082
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTTGAGTTCCATGCCAGTCAAAAGAGTGAATTC  1078

seq1: chr7_103926805_103927903
seq2: B6Ng01-159P15.g_70_1176

seq1  GAATTCAAGGAGGAAAGATTCGTGTCGGATCACAGTTTTTCAGAAAGTTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGGAGGAAAGATTCGTGTCGGATCACAGTTTTTCAGAAAGTTC  50

seq1  TTTCCAGGATTGCTTAGGGCATGCCATCTTTTGTAGAGCAAGAGCCAGGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCAGGATTGCTTAGGGCATGCCATCTTTTGTAGAGCAAGAGCCAGGA  100

seq1  GGGAGGAGGCGGGGATACTCACAGGGTGTGTCCACAGTGGCAGTGTTGAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGGAGGCGGGGATACTCACAGGGTGTGTCCACAGTGGCAGTGTTGAT  150

seq1  TACTTGCCTGGTTGTTGTGACAAAATACATAGTCAGGGAGCCTGAAGAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  TACTTGCCTGGTTGTTGTGACAAAATACATAGTCAGGAAGCCTGAAGAAG  200

seq1  AAGTGAGGACAGGCTATAAACCCCCAGGCCCACCCACAATGACACACTAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGAGGACAGGCTATAAACCCCCAGGCCCACCCACAATGACACACTAC  250

seq1  TTCCATTAAGGCTCTACCTCTTAGAGGCCCCACAACCTGCTCAAATAGCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCATTAAGGCTCTACCTCTTAGAGGCCCCACAACCTGCTCAAATAGCA  300

seq1  CAACTAGCTAGGGGCACAGGATGCTAACACCTGTGCCTTTGGCAGACACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTAGCTAGGGGCACAGGATGCTAACACCTGTGCCTTTGGCAGACACA  350

seq1  TTCAAACCATAGCAGTGACCTGCTGCCTCCAGCTGTGTTCCAGCTCTCCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAACCATAGCAGTGACCTGCTGCCTCCAGCTGTGTTCCAGCTCTCCA  400

seq1  GGCTTCCAGAACATCCCAAAGTATCATCACCAGATAAGGGCAAAGCGTGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTCCAGAACATCCCAAAGTATCATCACCAGATAAGGGCAAAGCGTGT  450

seq1  AGCATAAGAGCCTGTGAGGAACATTCAATGTGAAATGATAGCAAGTGTCG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATAAGAGCCTGTGAGGAACATTCAATGTGAAATGATAGCAAGTGTCG  500

seq1  TTTATCAACACTGACAGTAGCGCCTATGATTCCAGATGTGTTTTACTGAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATCAACACTGACAGTAGCGCCTATGATTCCAGATGTGTTTTACTGAG  550

seq1  ACTTATCTAGTGCAAGGCCACAAGGGGGCCTGAGAGAGCTACAAGAATAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTATCTAGTGCAAGGCCACAAGGGGGCCTGAGAGAGCTACAAGAATAG  600

seq1  GGGTCATGGGGAAGCACCTGCCCTGCCAGGCTGTCCTTTTAGCTCTGTCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTCATGGGGAAGCACCTGCCCTGCCAGGCTGTCCTTTTAGCTCTGTCC  650

seq1  TTTCCTCAGAATGAAAGATGAGCTCAGTAT-GGATTTTAAGGTCCTCTGA  699
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  TTTCCTCAGAATGAAAGATGAGCTCAGTATGGGATTTTAAGGTCCTCTGA  700

seq1  AATCTGCCCCCCAATTCTTTTCTGGCTTAGTGCTTATACTGGACAGCAAT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTGCCCCCCAATTCTTTTCTGGCTTAGTGCTTATACTGGACAGCAAT  750

seq1  TACCATGG-TTATGCTGTAGCAAGTGTGTCTG-TTAGTGGATACAATCCC  797
      |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TACCATGGTTTATGCTGTAGCAAGTGTGTCTGTTTAGTGGATACAATCCC  800

seq1  A-GGACTCAACATA-GGCCT-GGCCTACTACACCTGCTT-GGTAAAGACA  843
      | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  AGGGACTCAACATAGGGCCTGGGCCTACTACACCTGCTTGGGTAAAGACA  850

seq1  GATGGACAGAA-GGATAGATAATGAATGGACAGACAGGCAGATGGATGGA  892
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGACAGAAGGGATAGATAATGAATGGACAGACAGGCAGATGGATGGA  900

seq1  -TGGATAGATAATGAATGGACAGACAGACGGATGAATGGATAGATGGATG  941
       |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGATAGA-AATGATTGGACAGACAGACGGATGAATGGATAGATGGATG  949

seq1  GGCAGGCAGACAGCCACATGATAGGGCATCCGGTTCTACAAAGAATAATA  991
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||
seq2  GGCAGGCAGACAGCCACATGATAGGGCATCCGGTTCTAC-AAGA--TATA  996

seq1  CATTACCAACCTTCT-CTCTATAAGCACCGCCCTGTTTAGACCC-GCAAA  1039
      ||||||||||||||| ||||   ||||||| ||||||||||||| | |||
seq2  CATTACCAACCTTCTCCTCTTATAGCACCG-CCTGTTTAGACCCGGAAAA  1045

seq1  AGAGGATTAAATGAGAA--CACACTTGGACTACCTTGTACAGTATTGTTA  1087
      ||||||||||  |||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  AGAGGATTAATGGAGAAACAACACTTGGACTACCTTGTACAGTATGGTTA  1095

seq1  CCAGTAGGCTTT  1099
      ||||||||||||
seq2  CCAGTAGGCTTT  1107