BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-160I22
Chromosome7 (Build37)
Map Location 108,711,909 - 108,860,434
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG630138, Art2b, Clpb
Upstream geneMrpl48, LOC100041155, Rab6, LOC100041167, Plekhb1, B930006L02Rik, LOC100041204, Tnfrsf19l, Arhgef17, P2ry6, P2ry2, LOC100049539, EG435996, Fchsd2, EG622673, Atg16l2, Stard10, Centd2, Pde2a, Art2a
Downstream genePhox2a, Inppl1, Folr2, Folr1, 3200002M19Rik, F930017I19Rik, 2400001E08Rik, Lrrc51, LOC667222, Numa1, Il18bp, Rnf121, Trpc2, Art5, Art1, Chrna10, Nup98, Frag1, Rhog, Stim1, Rrm1, Olfr543, Olfr544, Olfr545, LOC667284, Olfr547, Olfr548-ps1, Olfr549, Trim21, LOC384699, Olfr550, Olfr551, Olfr552, Olfr553, Olfr554, LOC100040840, Olfr555, Olfr556, Trim68, Olfr557, Olfr558
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-160I22.bB6Ng01-160I22.g
ACCDH953899DH953900
length1,1111,062
definitionDH953899|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-160I22, 5' end.DH953900|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-160I22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(108,859,329 - 108,860,434)(108,711,909 - 108,712,986)
sequence
gaattcctcctacatcgcaggcataggggagggataaatatattacttct
agctctcttaatcacttttactttacaaattgagagagagaacatctgag
aagtctaggggactgctccaggtgtaaaagctactgaatggtcaacaaac
ccaccaggggctggggggaggggctggcacacgtgtggggttgggtcttg
aggggtaagactcaaactctttcctgggagcctctgtattcccgttagtc
tggattctctggggtcatgcattctctattgtgccaggggaggcttgaga
ccatggtgcttaacttatacactaagtggttagcttatttggaatagaat
tggtgagatcgcacctcgcttggcctaggggtgggaataactattatagt
atagagagcagttccattaccgccaaccgggactcctagccacctcctga
actccagggcacttgtccactggtttgtcattcgccagcttgcacagtct
tgtctcccatctgaaggcaagagatggggaggtcagctggagcaggccag
gacctgatgcccctgtggaaaggggtgcatgggtaggagggcttggctct
ggcaagtccagtctgacaaacctttaccccagaagaactccatgccagcc
cagttcttcaggtctcatctttattcagctgccactcggagctgagaaga
gaacctgacatatagcctgctctggccatgtttctaccgtgttttattgt
tttaattgtacatatgagaggcactcgaagtgctcgcatgcatttctgac
agcaccagacagtggatgtttatatcgttacttataagcagcctgcggca
tccacagctgggcgacttgtttactgttatcactaatttaatgtctcctc
cacctgaggattggagcccaccacccaccgtccagccacaagtggaagtc
tcctggaatggagcttgtgggctgaaggctatgaagggaatgttggtcaa
gacaggaatagctggcgagaggtgggttacaatcccacctgtgctatgtc
tgtcctatccgtatccccctccttggaatatatggtcttccccccctctc
ttaccgctgaa
gaattctcccgtgggttgaggaactccaactgagccagccctcggcaccc
atggtctctggggataatatgagtcatggacattgacagacctccctgaa
tcccgacatggccctcagtggctacattggcagggacttcaccatggcct
caaggtggctgggatgactacacacaacagactattcttctcctccctcg
aatctccagttccatctcccttcacaatgctcaaactgtgctgcttctct
ttctttccataattgtacttttagtggctcctgctgcaggctggccaagt
ggttagtgggcctctggtggtggcaaatgtgtccctaggtatctccagtc
tgcccctgtggcatagagctgggcgggtctctgaacatttccccctcctg
cactgtgtggtgagaaggcagactggcctctgtgtgtctatggcctgctg
gagcccttcagtagaacacaggtctctgggtctctctctctgccagtgac
ccacagcaatgacgatggactggtcttgggatgtcttactccaactagtc
tctgttgcatgaaggcaggcagggctctctgtgtgtcctgtgcctgccag
ctccttgcagttgagggcgggtctctatgagcatctttccccactaagtc
aacttggcatggcagtgggcaacaccacagatgtcttcctcttcctcctt
ttgttcagtgtggagacatgcagggctctatgtctatggtctgactgtgc
tgagcatggaaagctggtctgtgggtgtctttccatacctatgccatgtg
gcatggcggtgggcaaactctagatgtgctttacttttaccttcatgctt
ctgcacagccctggatgctgcaatggtctccttgtcactgacctcactga
ctcagcacacagtcagagtcccagctcaggcaagtcaggcagtacagttc
aaatagtgatttgtggataaatgttgcattctaggataacattcatacga
catcttgctttcttgtggactaggtatttttatagactggaagctttgtt
tgagagacttct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_108859329_108860434
seq2: B6Ng01-160I22.b_41_1151 (reverse)

seq1  TTCAGGGGTAAGAGAAGGGGGGAAGCAAATATATTCAAAGGA-GGGGATA  49
      ||||| ||||||||| |||||||||   |||||||| ||||| |||||||
seq2  TTCAGCGGTAAGAGAGGGGGGGAAGACCATATATTCCAAGGAGGGGGATA  50

seq1  CGGATAGGACAGACAT--GACAGGTGGGATTGT-AGCCACCTCT-GCCAG  95
      ||||||||||||||||   |||||||||||||| | |||||||| |||||
seq2  CGGATAGGACAGACATAGCACAGGTGGGATTGTAACCCACCTCTCGCCAG  100

seq1  CTATTTCCCTGTCTTGACC-ACATTCCCTTCATAGCC-TCAGCCCACCAG  143
      |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||
seq2  CTATT--CCTGTCTTGACCAACATTCCCTTCATAGCCTTCAGCCCACAAG  148

seq1  CT-CATTCCAGGAGACTTCCACTTGTGGCTGGACGGTGGGTGGTGGGCTC  192
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCATTCCAGGAGACTTCCACTTGTGGCTGGACGGTGGGTGGTGGGCTC  198

seq1  CAATCCTCAGGTGGAGGAGACATTAAATTAGTGATAACAGTAAACAAGTC  242
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATCCTCAGGTGGAGGAGACATTAAATTAGTGATAACAGTAAACAAGTC  248

seq1  GCCCAGCTGTGGATGCCGCAGGCTGCTTATAAGTAACGATTATAAACATC  292
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  GCCCAGCTGTGGATGCCGCAGGCTGCTTATAAGTAACGA-TATAAACATC  297

seq1  CACTGTCTGGTGCTGTCAGAAATGCATGCGAGCACTTCGAGTGCCTCTCA  342
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGTCTGGTGCTGTCAGAAATGCATGCGAGCACTTCGAGTGCCTCTCA  347

seq1  TATGTACAATTAAAACAATAAAACACGGTAGAAACATGGCCAGAGCAGGC  392
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTACAATTAAAACAATAAAACACGGTAGAAACATGGCCAGAGCAGGC  397

seq1  TATATGTCAGGTTCTCTTCTCAGCTCCGAGTGGCAGCTGAATAAAGATGA  442
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATGTCAGGTTCTCTTCTCAGCTCCGAGTGGCAGCTGAATAAAGATGA  447

seq1  GACCTGAAGAACTGGGCTGGCATGGAGTTCTTCTGGGGTAAAGGTTTGTC  492
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCTGAAGAACTGGGCTGGCATGGAGTTCTTCTGGGGTAAAGGTTTGTC  497

seq1  AGACTGGACTTGCCAGAGCCAAGCCCTCCTACCCATGCACCCCTTTCCAC  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTGGACTTGCCAGAGCCAAGCCCTCCTACCCATGCACCCCTTTCCAC  547

seq1  AGGGGCATCAGGTCCTGGCCTGCTCCAGCTGACCTCCCCATCTCTTGCCT  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGCATCAGGTCCTGGCCTGCTCCAGCTGACCTCCCCATCTCTTGCCT  597

seq1  TCAGATGGGAGACAAGACTGTGCAAGCTGGCGAATGACAAACCAGTGGAC  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGATGGGAGACAAGACTGTGCAAGCTGGCGAATGACAAACCAGTGGAC  647

seq1  AAGTGCCCTGGAGTTCAGGAGGTGGCTAGGAGTCCCGGTTGGCGGTAATG  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGCCCTGGAGTTCAGGAGGTGGCTAGGAGTCCCGGTTGGCGGTAATG  697

seq1  GAACTGCTCTCTATACTATAATAGTTATTCCCACCCCTAGGCCAAGCGAG  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTGCTCTCTATACTATAATAGTTATTCCCACCCCTAGGCCAAGCGAG  747

seq1  GTGCGATCTCACCAATTCTATTCCAAATAAGCTAACCACTTAGTGTATAA  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCGATCTCACCAATTCTATTCCAAATAAGCTAACCACTTAGTGTATAA  797

seq1  GTTAAGCACCATGGTCTCAAGCCTCCCCTGGCACAATAGAGAATGCATGA  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAAGCACCATGGTCTCAAGCCTCCCCTGGCACAATAGAGAATGCATGA  847

seq1  CCCCAGAGAATCCAGACTAACGGGAATACAGAGGCTCCCAGGAAAGAGTT  892
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCAGAGAATCCAGACTAACGGGAATACAGAGGCTCCCAGGAAAGAGTT  897

seq1  TGAGTCTTACCCCTCAAGACCCAACCCCACACGTGTGCCAGCCCCTCCCC  942
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTCTTACCCCTCAAGACCCAACCCCACACGTGTGCCAGCCCCTCCCC  947

seq1  CCAGCCCCTGGTGGGTTTGTTGACCATTCAGTAGCTTTTACACCTGGAGC  992
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCCCCTGGTGGGTTTGTTGACCATTCAGTAGCTTTTACACCTGGAGC  997

seq1  AGTCCCCTAGACTTCTCAGATGTTCTCTCTCTCAATTTGTAAAGTAAAAG  1042
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCCCCTAGACTTCTCAGATGTTCTCTCTCTCAATTTGTAAAGTAAAAG  1047

seq1  TGATTAAGAGAGCTAGAAGTAATATATTTATCCCTCCCCTATGCCTGCGA  1092
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTAAGAGAGCTAGAAGTAATATATTTATCCCTCCCCTATGCCTGCGA  1097

seq1  TGTAGGAGGAATTC  1106
      ||||||||||||||
seq2  TGTAGGAGGAATTC  1111

seq1: chr7_108711909_108712986
seq2: B6Ng01-160I22.g_69_1130

seq1  GAATTCTCCCGTGGGTTGAGGAACTCCAACTGAGCCAGCCCTCGGCACCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCCGTGGGTTGAGGAACTCCAACTGAGCCAGCCCTCGGCACCC  50

seq1  ATGGTCTCTGGGGATAATATGAGTCATGGACATTGACAGACCTCCCTGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTCTCTGGGGATAATATGAGTCATGGACATTGACAGACCTCCCTGAA  100

seq1  TCCCGACATGGCCCTCAGTGGCTACATTGGCAGGGACTTCACCATGGCCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCGACATGGCCCTCAGTGGCTACATTGGCAGGGACTTCACCATGGCCT  150

seq1  CAAGGTGGCTGGGATGACTACACACAACAGACTATTCTTCTCCTCCCTCG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGTGGCTGGGATGACTACACACAACAGACTATTCTTCTCCTCCCTCG  200

seq1  AATCTCCAGTTCCATCTCCCTTCACAATGCTCAAACTGTGCTGCTTCTCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTCCAGTTCCATCTCCCTTCACAATGCTCAAACTGTGCTGCTTCTCT  250

seq1  TTCTTTCCATAATTGTACTTTTAGTGGCTCCTGCTGCAGGCTGGCCAAGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTTCCATAATTGTACTTTTAGTGGCTCCTGCTGCAGGCTGGCCAAGT  300

seq1  GGTTAGTGGGCCTCTGGTGGTGGCAAATGTGTCCCTAGGTATCTCCAGTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTAGTGGGCCTCTGGTGGTGGCAAATGTGTCCCTAGGTATCTCCAGTC  350

seq1  TGCCCCTGTGGCATAGAGCTGGGCGGGTCTCTGAACATTTCCCCCTCCTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCCTGTGGCATAGAGCTGGGCGGGTCTCTGAACATTTCCCCCTCCTG  400

seq1  CACTGTGTGGTGAGAAGGCAGACTGGCCTCTGTGTGTCTATGGCCTGCTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGTGTGGTGAGAAGGCAGACTGGCCTCTGTGTGTCTATGGCCTGCTG  450

seq1  GAGCCCTTCAGTAGAACACAGGTCTCTGGGTCTCTCTCTCTGCCAGTGAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCCTTCAGTAGAACACAGGTCTCTGGGTCTCTCTCTCTGCCAGTGAC  500

seq1  CCACAGCAATGACGATGGACTGGTCTTGGGATGTCTTACTCCAACTAGTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACAGCAATGACGATGGACTGGTCTTGGGATGTCTTACTCCAACTAGTC  550

seq1  TCTGTTGCATGAAGGCAGGCAGGGCTCTCTGTGTGTCCTGTGCCTGCCAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTTGCATGAAGGCAGGCAGGGCTCTCTGTGTGTCCTGTGCCTGCCAG  600

seq1  CTCCTTGCAGTTGAGGGCGGGTCTCTATGAGCATCTTTCCCCACTAAGTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTTGCAGTTGAGGGCGGGTCTCTATGAGCATCTTTCCCCACTAAGTC  650

seq1  AACTTGGCATGGCAGTGGGCAACACCACAGATGTCTTCCTCTTCCTCCTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTGGCATGGCAGTGGGCAACACCACAGATGTCTTCCTCTTCCTCCTT  700

seq1  TTGTTCAGTGTGGAGACATGCAGGGCTCTATGTCTATGGTCTGACTGTGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTCAGTGTGGAGACATGCAGGGCTCTATGTCTATGGTCTGACTGTGC  750

seq1  TGAGCATGGAAGGCTGGTCTGTGGGTGTCTTTCCATACCTATGCCAGGTG  800
      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TGAGCATGGAAAGCTGGTCTGTGGGTGTCTTTCCATACCTATGCCATGTG  800

seq1  GCATGGCGGTGGGCAGAACTCTAGATGTGGCTTTACTTTTAACCTTCATT  850
      ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |
seq2  GCATGGCGGTGGGCA-AACTCTAGATGT-GCTTTACTTTT-ACCTTCA-T  846

seq1  GCTTCTGCACAGCCCTGGGATGCTGCAATGGTCTCCTTGTCACTGACCTC  900
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCTGCACAGCCCT-GGATGCTGCAATGGTCTCCTTGTCACTGACCTC  895

seq1  ACTGACTCAGCACAACAGTCAGAGGTCCCAGCCCAAGGCAAGTCAGGGCA  950
      ||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||
seq2  ACTGACTCAGCAC-ACAGTCAGA-GTCCCAGCTC-AGGCAAGTCA-GGCA  941

seq1  GTAACAGTTCAAAATAGGTGATTTGT-GATAAATGTTGCAATCTAAGGAA  999
      || ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |   
seq2  GT-ACAGTTC-AAATA-GTGATTTGTGGATAAATGTTGCATTCTAGG---  985

seq1  ATAAACCATTCATAACGACATCTTGCTTTCTTGT-GACTAGGTATTTCTA  1048
      ||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||
seq2  ATAA--CATTCAT-ACGACATCTTGCTTTCTTGTGGACTAGGTATTTTTA  1032

seq1  TAGACTGTAGCCTTTGTTTGAGAGACTCCT  1078
      ||||||| |  |||||||||||||||| ||
seq2  TAGACTGGAAGCTTTGTTTGAGAGACTTCT  1062