BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-162F23
Chromosome7 (Build37)
Map Location 70,484,780 - 70,642,896
singlet/doubletdoublet
Overlap geneOtud7a
Upstream geneNdn, Magel2, Mkrn3, Peg12, Atp5l-ps1, EG665038, LOC669222, LOC384631, LOC622243, EG622251, Chrna7
Downstream geneLOC545971, LOC100041386, LOC665083, Klf13, E030018B13Rik, Trpm1, BB128963, Mtmr15, LOC100041582, Mphosph10, Mcee
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-162F23.bB6Ng01-162F23.g
ACCDH955226DH955227
length1,1411,116
definitionDH955226|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-162F23, 5' end.DH955227|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-162F23, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(70,641,760 - 70,642,896)(70,484,780 - 70,485,894)
sequence
gaattcaataaatcactgtttaaattagactgggaagaggagcaactaca
ggatttcccacgtgacataccctgcatctgttcacttctccataaacact
ggatctgaggagtgcatgtgacaaaggggttgagggagtactttgagaaa
acaggactgaggaatactggaccccatgtaagtgatcagtactctgatgg
atccgtctcagcctcgggtatagaatgggcacagtgaataattgcagaga
agacagaacacagtatttctctcaagcttattagataaacagcccgattt
tatttgtaaagggatatattttaacatcattaaacataatggaaaatttc
cagtttgccactctgtacagctgtctagtttcaaaatgttttgataaaca
cgagtctcctggaagagccatacaaattctgttcctgcctttgccatgcc
acttagactgggagcacctcttgtttacatggacatgcccgaaaagacgt
tttcactgggaattctgggaaacagccagagagataaccacagtgctcag
ttctaagacgtgactgacttgataacaatgcagagaaaaagagacaaaaa
gcactcaggatcactggcctagtaactaacattccagtcgctgagaccca
tccctgtttaacaattaaatgctcagtcccacaagtcacacacgtcagtc
tgactcaccactctcagagtagcatcaactttacttcctggggttcaccc
taccacaagaagccccatgtgttgcacagctctgaccatgtgttgcacag
gcgggtactggaccacgggcactgatgatgactacaggggacttgctaca
accctatgcatgtaatactgttcaatgatccctgttcagtcttagcacaa
ctaacaggcagagaaggcttttaacgctattgaaagtcacgttctaaaca
tgatgtctaagttctctgttttatgtttgttgagtagtttttttttcact
gatgtgaatccatccatgtacacaatggcctaagtatgtgttcataattc
aaccatccaccttggttgaagccacagtgatctttcagctacaaaatcaa
attttctaacctctattcagatattcttgtcctccagtgga
gaattctggggacactttagaggttacataaatgctagagcccccctaga
agggcctggttggctgcctggtggttagatgcagtttgttgcagtttgtc
aagtagtcctctgcagagatttaaaaaaattagatatcctgatggtgaaa
atcaaacttgcccccaaggaactcaatgcccctaatcagcaggaagcagt
ctaatgatattcactgccacctttccccctgtatcccttttctctcctac
gtagtgtttggggctgaaaggaagagaaggggaacccacaaagtagcaaa
agaaagttacagtggactaggcccttctacatcagtcctcaatcaatctt
gcttttttgtgcagcaagtggtttaactgatgagttatctctccagccta
ttgcttcccccaaaggaaaactaaccatctactaaataagccaaactatc
aacagaaagaaaatggaaataaaatatgtgagcatcaatgaaggagaatg
tttttaaattgatgaaaataacacattttcccagatgattttcttcaatt
acctgtgacaattgaaaaagttataatacctccttatgtaattctaaatg
catggaaaataaaactctttgtgttacaagccttactatgttatagctca
ggctgacttcaaagtcctgggctcaggtgacccttctgctccagctgtca
gagcttcagccctgtgccatggtcgcaccttagagaaaataattaagata
actctataataaatgacagttgcttaacagaacaggcatctgtgatgtag
aaagagtatatgggaagctcctgcaattcttgaatttctctttgaataca
agattgctctaaaaaataaagtcgggctcagtgagtaaggctgctaatca
tgcacgcgaatctaagttcagatccccataccttcttgaaagtgatacat
ggtcatgcatgtgcctgtgaccttagctctggggtgaggcaaggtatttg
agactgctggacacccaagaagctgaggtttacttgagaaaacactgtcc
tcaggtacaagatggaaagtgatagcagaaagactgatgtttttctctct
gacccctataagtgct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_70641760_70642896
seq2: B6Ng01-162F23.b_47_1187 (reverse)

seq1  TCCACCTGGA-GAC-AGAATATCTGAATAGAG--TAGAAAATGTGATTTC  46
      |||| ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||| 
seq2  TCCA-CTGGAGGACAAGAATATCTGAATAGAGGTTAGAAAATTTGATTT-  48

seq1  TGTAGCTGGAAGATCACTGTGGCTTC-ACCAAGGTGGTGTGTTGAATTAT  95
      |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||
seq2  TGTAGCTGAAAGATCACTGTGGCTTCAACCAAGGTGGATGGTTGAATTAT  98

seq1  GAACACATACTTA-GCCATTGTGTACATGGATGGATTCACATCAGTGAAA  144
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  GAACACATACTTAGGCCATTGTGTACATGGATGGATTCACATCAGTG-AA  147

seq1  AAAAAAACTACTCAACAAACATAGAACAGAGAACTTAGACATCATGTTTA  194
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAACTACTCAACAAACATAAAACAGAGAACTTAGACATCATGTTTA  197

seq1  GAACGTGACTTTCAATAGCGTTAAAGGCCTTCTCTGCCTGTTAGTTGTGC  244
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACGTGACTTTCAATAGCGTTAAAAGCCTTCTCTGCCTGTTAGTTGTGC  247

seq1  TAAGACTGAACAGGGATCATTGAACAGTATTACATGCATAGGGTTGTAGC  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGACTGAACAGGGATCATTGAACAGTATTACATGCATAGGGTTGTAGC  297

seq1  AAGTCCCCTGTAGTCATCATCAGTGCCCGTGGTCCAGTACCCGCCTGTGC  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCCCCTGTAGTCATCATCAGTGCCCGTGGTCCAGTACCCGCCTGTGC  347

seq1  AACACATGGTCAGAGCTGTGCAACACATGGGGCTTCTTGTGGTAGGGTGA  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACATGGTCAGAGCTGTGCAACACATGGGGCTTCTTGTGGTAGGGTGA  397

seq1  A-CCCAGGAAGTAAAGTTGATGCTACTCTGAGAGTGGTGAGTCAGACTGA  443
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCCAGGAAGTAAAGTTGATGCTACTCTGAGAGTGGTGAGTCAGACTGA  447

seq1  CGTGTGTGACTTGTGGGACTGAGCATTTAATTGTTAAACAGGGATGGGTC  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGTGTGACTTGTGGGACTGAGCATTTAATTGTTAAACAGGGATGGGTC  497

seq1  TCAGCGACTGGAATGTTAGTTACTAGGCCAGTGATCCTGAGTGCTTTTTG  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCGACTGGAATGTTAGTTACTAGGCCAGTGATCCTGAGTGCTTTTTG  547

seq1  TCTCTTTTTCTCTGCATTGTTATCAAGTCAGTCACGTCTTAGAACTGAGC  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTTTTTCTCTGCATTGTTATCAAGTCAGTCACGTCTTAGAACTGAGC  597

seq1  ACTGTGGTTATCTCTCTGGCTGTTTCCCAGAATTCCCAGTGAAAACGTCT  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTGGTTATCTCTCTGGCTGTTTCCCAGAATTCCCAGTGAAAACGTCT  647

seq1  TTTCGGGCATGTCCATGTAAACAAGAGGTGCTCCCAGTCTAAGTGGCATG  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCGGGCATGTCCATGTAAACAAGAGGTGCTCCCAGTCTAAGTGGCATG  697

seq1  GCAAAGGCAGGAACAGAATTTGTATGGCTCTTCCAGGAGACTCGTGTTTA  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAAGGCAGGAACAGAATTTGTATGGCTCTTCCAGGAGACTCGTGTTTA  747

seq1  TCAAAACATTTTGAAACTAGACAGCTGTACAGAGTGGCAAACTGGAAATT  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAACATTTTGAAACTAGACAGCTGTACAGAGTGGCAAACTGGAAATT  797

seq1  TTCCATTATGTTTAATGATGTTAAAATATATCCCTTTACAAATAAAATCG  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCATTATGTTTAATGATGTTAAAATATATCCCTTTACAAATAAAATCG  847

seq1  GGCTGTTTATCTAATAAGCTTGAGAGAAATACTGTGTTCTGTCTTCTCTG  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGTTTATCTAATAAGCTTGAGAGAAATACTGTGTTCTGTCTTCTCTG  897

seq1  CAATTATTCACTGTGCCCATTCTATACCCGAGGCTGAGACGGATCCATCA  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTATTCACTGTGCCCATTCTATACCCGAGGCTGAGACGGATCCATCA  947

seq1  GAGTACTGATCACTTACATGGGGTCCAGTATTCCTCAGTCCTGTTTTCTC  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTACTGATCACTTACATGGGGTCCAGTATTCCTCAGTCCTGTTTTCTC  997

seq1  AAAGTACTCCCTCAACCCCTTTGTCACATGCACTCCTCAGATCCAGTGTT  1043
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTACTCCCTCAACCCCTTTGTCACATGCACTCCTCAGATCCAGTGTT  1047

seq1  TATGGAGAAGTGAACAGATGCAGGGTATGTCACGTGGGAAATCCTGTAGT  1093
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGAGAAGTGAACAGATGCAGGGTATGTCACGTGGGAAATCCTGTAGT  1097

seq1  TGCTCCTCTTCCCAGTCTAATTTAAACAGTGATTTATTGAATTC  1137
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCCTCTTCCCAGTCTAATTTAAACAGTGATTTATTGAATTC  1141

seq1: chr7_70484780_70485894
seq2: B6Ng01-162F23.g_68_1183

seq1  GAATTCTGGGGACACTTTAGAGGTTACATAAATGCTAGAGCCCCCCTAGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGGGGACACTTTAGAGGTTACATAAATGCTAGAGCCCCCCTAGA  50

seq1  AGGGCCTGGTTGGCTGCCTGGTGGTTAGATGCAGTTTGTTGCAGTTTGTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCCTGGTTGGCTGCCTGGTGGTTAGATGCAGTTTGTTGCAGTTTGTC  100

seq1  AAGTAGTCCTCTGCAGAGATTTAAAAAAATTAGATATCCTGATGGTGAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTAGTCCTCTGCAGAGATTTAAAAAAATTAGATATCCTGATGGTGAAA  150

seq1  ATCAAACTTGCCCCCAAGGAACTCAATGCCCCTAATCAGCAGGAAGCAGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAAACTTGCCCCCAAGGAACTCAATGCCCCTAATCAGCAGGAAGCAGT  200

seq1  CTAATGATATTCACTGCCACCTTTCCCCCTGTATCCCTTTTCTCTCCTAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAATGATATTCACTGCCACCTTTCCCCCTGTATCCCTTTTCTCTCCTAC  250

seq1  GTAGTGTTTGGGGCTGAAAGGAAGAGAAGGGGAACCCACAAAGTAGCAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGTGTTTGGGGCTGAAAGGAAGAGAAGGGGAACCCACAAAGTAGCAAA  300

seq1  AGAAAGTTACAGTGGACTAGGCCCTTCTACATCAGTCCTCAATCAATCTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGTTACAGTGGACTAGGCCCTTCTACATCAGTCCTCAATCAATCTT  350

seq1  GCTTTTTTGTGCAGCAAGTGGTTTAACTGATGAGTTATCTCTCCAGCCTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTTTTGTGCAGCAAGTGGTTTAACTGATGAGTTATCTCTCCAGCCTA  400

seq1  TTGCTTCCCCCAAAGGAAAACTAACCATCTACTAAATAAGCCAAACTATC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTTCCCCCAAAGGAAAACTAACCATCTACTAAATAAGCCAAACTATC  450

seq1  AACAGAAAGAAAATGGAAATAAAATATGTGAGCATCAATGAAGGAGAATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGAAAGAAAATGGAAATAAAATATGTGAGCATCAATGAAGGAGAATG  500

seq1  TTTTTAAATTGATGAAAATAACACATTTTCCCAGATGATTTTCTTCAATT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTAAATTGATGAAAATAACACATTTTCCCAGATGATTTTCTTCAATT  550

seq1  ACCTGTGACAATTGAAAAAGTTATAATACCTCCTTATGTAATTCTAAATG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGTGACAATTGAAAAAGTTATAATACCTCCTTATGTAATTCTAAATG  600

seq1  CATGGAAAATAAAACTCTTTGTGTTACAAGCCTTACTATGTTATAGCTCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGAAAATAAAACTCTTTGTGTTACAAGCCTTACTATGTTATAGCTCA  650

seq1  GGCTGACTTCAAAGTCCTGGGCTCAGGTGACCCTTCTGCTCCAGCTGTCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGACTTCAAAGTCCTGGGCTCAGGTGACCCTTCTGCTCCAGCTGTCA  700

seq1  GAGCTTCAGCCCTGTGCCATGGTCGCACCTTAGAGAAAATAATTAAGATA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTTCAGCCCTGTGCCATGGTCGCACCTTAGAGAAAATAATTAAGATA  750

seq1  ACTCTATAATAAATGACAGTTGCTTAACAGAACAGGCATCTGTGATGTAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTATAATAAATGACAGTTGCTTAACAGAACAGGCATCTGTGATGTAG  800

seq1  AAAGAGTATATGGGAAGCTCCTGCAATTCTTGAATTTCTCTTTGAATACA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAGTATATGGGAAGCTCCTGCAATTCTTGAATTTCTCTTTGAATACA  850

seq1  AGATTGCTCTAAAAAATAAAGTCGGGCTCAGTGAGTAAGGCTGCTAATCA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTGCTCTAAAAAATAAAGTCGGGCTCAGTGAGTAAGGCTGCTAATCA  900

seq1  TGCACGCGAATCTAAGTTCAGATCCCCAATACCTTCTTGAAAGTGATACA  950
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  TGCACGCGAATCTAAGTTCAGATCCCC-ATACCTTCTTGAAAGTGATACA  949

seq1  TGGTCATGCATGTGCCTGTGACCTTAGCTCTGGGGTGAGGC-AGGGAATT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||
seq2  TGGTCATGCATGTGCCTGTGACCTTAGCTCTGGGGTGAGGCAAGGTATTT  999

seq1  GAGACTGCTGGACACCCAAGAAAGCTTGAGGTTTAC-TGAG-AAACACTG  1047
      |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||
seq2  GAGACTGCTGGACACCCAAG-AAGC-TGAGGTTTACTTGAGAAAACACTG  1047

seq1  TCTCAAGGTACAAGATGGAAAGTGATAGGCAGAAGAGTTGATGTTTT--C  1095
      ||   |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||   
seq2  TCCTCAGGTACAAGATGGAAAGTGATA-GCAGAAAGACTGATGTTTTTCT  1096

seq1  CTCTGACCCCTATAAGTGCT  1115
      ||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGACCCCTATAAGTGCT  1116