BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-163K18
Chromosome7 (Build37)
Map Location 58,081,224 - 58,197,944
singlet/doubletdoublet
Overlap geneNell1, EG668766
Upstream genePrmt3, Slc6a5, 4933405O20Rik
Downstream geneEG668767, EG668768, EG638046, EG668770, EG668774, LOC668776, LOC434186, LOC546971, LOC668779, Tmem16e, Slc17a6, EG620599, LOC654473, LOC100040608, Gas2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-163K18.bB6Ng01-163K18.g
ACCDH956200DH956201
length1,1461,061
definitionDH956200|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-163K18, 5' end.DH956201|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-163K18, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(58,196,807 - 58,197,944)(58,081,224 - 58,082,287)
sequence
gaattcctagaagttttatgatggaagtgaaagatcctaacatgaaaggt
gcaatgcttacaaaaactgggcaatatgtaatcccgactataaatgcaga
ggcctatgcaattgggaagaaagagaaaccacccttcttaccagaggaac
catcatcatcatcatcttcagaagaagttgatcctgtcccagacgagttc
ttgtgcctcatctgcaaggacaccatgactgatgctgctatcatcccctg
ctgtggaaacagttactgtgatgaatgtataaggacagcacttctggagt
cagatgaacatacatgtccaacatgtcatcaaaatgatgtttctcctgat
gctttagttgccaacaaggttttacgacaggctgttaataactttaaaaa
tcaaactgactacacaaagagactgggaaaacaggtcactccgtccccac
ccccactacctccaccaagtgcactcattcagcagaacctgcagcctcct
atgaaatctctcacatctagacagcaggatcctctgaagattccaatgac
atcgtcctcagcctcagctcacccaactccctctgtaacctcattagctt
caaattcatcttcctcggctccttctgtgcctggaaacccatctcctgcc
ccagctcccgtacccgagaccactgcaagagtatctgtatcagacctttc
agaaaaatcagatggatcctttcgggaatcagaaaaccaattattaccag
ctgccgcccttacatcagaacattcaaagggagcctcttcaattgctgtt
actgctcctatggaagaaaagcgtggcccaggtggcggtccttgaaactc
caccttcgttgggacagtcactactccatgaacagtctattccccacaac
tggtccagtaagaataaatgcttgctcatccagtggtggtcaaccaggtt
gggaacattcctacatgattgggaagctagtttcttccaacacagcaaat
tagaagttgaagaaagaagctgttaccgaggaataaaacgtgggcgataa
ctacaagtggaaccatcaagaggagtcaagtccaatcacgaccagcaact
ccagtcatgtggcctattccaccaccttctttggccaccgtgctcc
gaattcatctgttcttaaatattttcagcaaacacacaataatatctaga
attactaatttagaagcactgagtctgagatcagctgtttatccaataga
ctgtgttgtcagttcagattttagttattcagatggtcagtcagaatgta
caattataattggctccaggactatgggtgtttattcataatttatgaga
aaaggtactggtgagtgaagctttcaacacattttggattctggattgtt
atatttagatctttctgtgacttttattttagatgatatatcagctgtaa
ttgatatgttgacatatgttgacacgagtatgtttgaggtatttattgaa
aggttagtgtaacagacactaatgtcccggtgggcttgtgtttttctctg
aggcagatattgatgaatgtgcagagggattcgttgagtgccacaaccac
tcccgctgcgttaaccttccagggtggtaccactgtgagtgcagaagcgg
tttccatgacgatgggacctattcactgtccggggagtcctgcattggta
agcagctctcagaaacaccctgcacctggggttgaattgctttgcaactc
catgtgaccactcactggctaaattaatctgttttccaatgttcttcccc
tacagtttagatactaggccaaagattttagagggtggcctggtgagaat
tttataccaaagtagagtattcagaggaacaaagtctggctccatgtgct
aagggtggttagttctttctcggtaaaagcatggcaaaaagatgaagttt
tcggcagttggagaagcagctaacaagtgaaaatagttctcgatttagat
tagaaagtgtagcctcaattcaaacccttaggcatgtctacttgtctgat
ccctcatctgggcatgtataaaaggaataatactacatgtgtcttttcag
gacaagactggatgtctgtttgaaattgtgaatttgaactgatgcatgaa
tccaatatgtttggtgttaaccttttgtcgttgccgctctctggatcaac
tttctaacttt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_58196807_58197944
seq2: B6Ng01-163K18.b_43_1188 (reverse)

seq1  GGAG-ACGGTGGCAAAAG-AGGTGGTGGAATAGGCACAAAGACTGGAGTT  48
      |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||   | ||||||||||
seq2  GGAGCACGGTGGCCAAAGAAGGTGGTGGAATAGGCCACATGACTGGAGTT  50

seq1  GCTGGTCGTGATGGGCCTTGACTCCTCTGTGATGGTT-CAC-TGTAG-TC  95
      |||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||| ||||| | 
seq2  GCTGGTCGTGATTGGACTTGACTCCTCT-TGATGGTTCCACTTGTAGTTA  99

seq1  TCGCCCACGTTTTATTCCTCGGTAACAGCTTCTTTCTTC-ACTTCTAATT  144
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  TCGCCCACGTTTTATTCCTCGGTAACAGCTTCTTTCTTCAACTTCTAATT  149

seq1  TGCTGTGTTGG-AGAAACTAGCTTCCCAATCTTGTTGGAATGTTCCCAAC  193
      ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||
seq2  TGCTGTGTTGGAAGAAACTAGCTTCCCAATCATGTAGGAATGTTCCCAAC  199

seq1  CTGGTTGACCACCACTTGGATGAGC-AGCATTTATTCTTACTGGACCAGT  242
      ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTTGACCACCAC-TGGATGAGCAAGCATTTATTCTTACTGGACCAGT  248

seq1  TGTGGGG-ATAGACTGTTCATGGAGTAGTGACTGTCCCAACGAAGGTGGA  291
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGGGAATAGACTGTTCATGGAGTAGTGACTGTCCCAACGAAGGTGGA  298

seq1  GTTTCAAGGACCGCCACCT-GGCCACGCTTTTCTTCCATAGGAGCAGTAA  340
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCAAGGACCGCCACCTGGGCCACGCTTTTCTTCCATAGGAGCAGTAA  348

seq1  CAGCAATTGAAGAGGCTCCCTTTGAATGTTCTGATGTAAGGGCGGCAGCT  390
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAATTGAAGAGGCTCCCTTTGAATGTTCTGATGTAAGGGCGGCAGCT  398

seq1  GGTAATAATTGGTTTTCTGATTCCCGAAAGGATCCATCTGATTTTTCTGA  440
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAATAATTGGTTTTCTGATTCCCGAAAGGATCCATCTGATTTTTCTGA  448

seq1  AAGGTCTGATACAGATACTCTTGCAGTGGTCTCGGGTACGGGAGCTGGGG  490
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTCTGATACAGATACTCTTGCAGTGGTCTCGGGTACGGGAGCTGGGG  498

seq1  CAGGAGATGGGTTTCCAGGCACAGAAGGAGCCGAGGAAGATGAATTTGAA  540
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAGATGGGTTTCCAGGCACAGAAGGAGCCGAGGAAGATGAATTTGAA  548

seq1  GCTAATGAGGTTACAGAGGGAGTTGGGTGAGCTGAGGCTGAGGACGATGT  590
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAATGAGGTTACAGAGGGAGTTGGGTGAGCTGAGGCTGAGGACGATGT  598

seq1  CATTGGAATCTTCAGAGGATCCTGCTGTCTAGATGTGAGAGATTTCATAG  640
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGGAATCTTCAGAGGATCCTGCTGTCTAGATGTGAGAGATTTCATAG  648

seq1  GAGGCTGCAGGTTCTGCTGAATGAGTGCACTTGGTGGAGGTAGTGGGGGT  690
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGCTGCAGGTTCTGCTGAATGAGTGCACTTGGTGGAGGTAGTGGGGGT  698

seq1  GGGGACGGAGTGACCTGTTTTCCCAGTCTCTTTGTGTAGTCAGTTTGATT  740
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGACGGAGTGACCTGTTTTCCCAGTCTCTTTGTGTAGTCAGTTTGATT  748

seq1  TTTAAAGTTATTAACAGCCTGTCGTAAAACCTTGTTGGCAACTAAAGCAT  790
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAAGTTATTAACAGCCTGTCGTAAAACCTTGTTGGCAACTAAAGCAT  798

seq1  CAGGAGAAACATCATTTTGATGACATGTTGGACATGTATGTTCATCTGAC  840
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAGAAACATCATTTTGATGACATGTTGGACATGTATGTTCATCTGAC  848

seq1  TCCAGAAGTGCTGTCCTTATACATTCATCACAGTAACTGTTTCCACAGCA  890
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGAAGTGCTGTCCTTATACATTCATCACAGTAACTGTTTCCACAGCA  898

seq1  GGGGATGATAGCAGCATCAGTCATGGTGTCCTTGCAGATGAGGCACAAGA  940
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGATGATAGCAGCATCAGTCATGGTGTCCTTGCAGATGAGGCACAAGA  948

seq1  ACTCGTCTGGGACAGGATCAACTTCTTCTGAAGATGATGATGATGATGGT  990
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCGTCTGGGACAGGATCAACTTCTTCTGAAGATGATGATGATGATGGT  998

seq1  TCCTCTGGTAAGAAGGGTGGTTTCTCTTTCTTCCCAATTGCATAGGCCTC  1040
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCTGGTAAGAAGGGTGGTTTCTCTTTCTTCCCAATTGCATAGGCCTC  1048

seq1  TGCATTTATAGTCGGGATTACATATTGCCCAGTTTTTGTAAGCATTGCAC  1090
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATTTATAGTCGGGATTACATATTGCCCAGTTTTTGTAAGCATTGCAC  1098

seq1  CTTTCATGTTAGGATCTTTCACTTCCATCATAAAACTTCTAGGAATTC  1138
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCATGTTAGGATCTTTCACTTCCATCATAAAACTTCTAGGAATTC  1146

seq1: chr7_58081224_58082287
seq2: B6Ng01-163K18.g_70_1130

seq1  GAATTCATCTGTTCTTAAATATTTTCAGCAAACACACAATAATATCTAGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATCTGTTCTTAAATATTTTCAGCAAACACACAATAATATCTAGA  50

seq1  ATTACTAATTTAGAAGCACTGAGTCTGAGATCAGCTGTTTATCCAATAGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTACTAATTTAGAAGCACTGAGTCTGAGATCAGCTGTTTATCCAATAGA  100

seq1  CTGTGTTGTCAGTTCAGATTTTAGTTATTCAGATGGTCAGTCAGAATGTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGTTGTCAGTTCAGATTTTAGTTATTCAGATGGTCAGTCAGAATGTA  150

seq1  CAATTATAATTGGCTCCAGGACTATGGGTGTTTATTCATAATTTATGAGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTATAATTGGCTCCAGGACTATGGGTGTTTATTCATAATTTATGAGA  200

seq1  AAAGGTACTGGTGAGTGAAGCTTTCAACACATTTTGGATTCTGGATTGTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGTACTGGTGAGTGAAGCTTTCAACACATTTTGGATTCTGGATTGTT  250

seq1  ATATTTAGATCTTTCTGTGACTTTTATTTTAGATGATATATCAGCTGTAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTTAGATCTTTCTGTGACTTTTATTTTAGATGATATATCAGCTGTAA  300

seq1  TTGATATGTTGACATATGTTGACACGAGTATGTTTGAGGTATTTATTGAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATATGTTGACATATGTTGACACGAGTATGTTTGAGGTATTTATTGAA  350

seq1  AGGTTAGTGTAACAGACACTAATGTCCCGGTGGGCTTGTGTTTTTCTCTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTAGTGTAACAGACACTAATGTCCCGGTGGGCTTGTGTTTTTCTCTG  400

seq1  AGGCAGATATTGATGAATGTGCAGAGGGATTCGTTGAGTGCCACAACCAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAGATATTGATGAATGTGCAGAGGGATTCGTTGAGTGCCACAACCAC  450

seq1  TCCCGCTGCGTTAACCTTCCAGGGTGGTACCACTGTGAGTGCAGAAGCGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCGCTGCGTTAACCTTCCAGGGTGGTACCACTGTGAGTGCAGAAGCGG  500

seq1  TTTCCATGACGATGGGACCTATTCACTGTCCGGGGAGTCCTGCATTGGTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCATGACGATGGGACCTATTCACTGTCCGGGGAGTCCTGCATTGGTA  550

seq1  AGCAGCTCTCAGAAACACCCTGCACCTGGGGTTGAATTGCTTTGCAACTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGCTCTCAGAAACACCCTGCACCTGGGGTTGAATTGCTTTGCAACTC  600

seq1  CATGTGACCACTCACTGGCTAAATTAATCTGTTTTCCAATGTTCTTCCCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTGACCACTCACTGGCTAAATTAATCTGTTTTCCAATGTTCTTCCCC  650

seq1  TACAGTTTAGATACTAGGCCAAAGATTTTAGAGGGTGGCCTGGTGAGAAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGTTTAGATACTAGGCCAAAGATTTTAGAGGGTGGCCTGGTGAGAAT  700

seq1  TTTATACCAAAGTAGAGTATTCAGAGGAACAAAGTCTGGCTCCATGTGCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATACCAAAGTAGAGTATTCAGAGGAACAAAGTCTGGCTCCATGTGCT  750

seq1  AAGGGTGGTTAGTTCTTTCTCGGTAAAAGCATGGCAAAAAGATGAAGTTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGTGGTTAGTTCTTTCTCGGTAAAAGCATGGCAAAAAGATGAAGTTT  800

seq1  TCGGCAGTTGGAGAAGCAGCTAACAAGTGAAAATAGTTCTCGATTTAGAA  850
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  TCGGCAGTTGGAGAAGCAGCTAACAAGTGAAAATAGTTCTCGATTTAG-A  849

seq1  TTAGAAAGTGTAGCCTCAATTCAAACCCTTAGGCATGTCTAC-TGTCTGA  899
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  TTAGAAAGTGTAGCCTCAATTCAAACCCTTAGGCATGTCTACTTGTCTGA  899

seq1  TCCCTCATCTGGGTATGTATAAAAGGAATAATACTACATGTGTCTTTTCA  949
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTCATCTGGGCATGTATAAAAGGAATAATACTACATGTGTCTTTTCA  949

seq1  GGACAAGACTGGATGTCTGTTTGAAATTGTGAATTTTGAACTGATGCATG  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  GGACAAGACTGGATGTCTGTTTGAAATTGTGAA-TTTGAACTGATGCATG  998

seq1  CATTCAATATGTTTTGTGTTAACCTTTTGTCTGTTGCTGCTCTTTGTGAT  1049
       || |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| || |||
seq2  AATCCAATATGTTTGGTGTTAACCTTTTGTC-GTTGCCGCTCTCTG-GAT  1046

seq1  CAACTTTCTAACTTT  1064
      |||||||||||||||
seq2  CAACTTTCTAACTTT  1061