BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-163M14
Chromosome7 (Build37)
Map Location 74,811,516 - 74,971,342
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTtc23, Dmn, LOC665319
Upstream geneAsb7, Lins2, Lass3, Adamts17, Lysmd4, Mef2a, EG665304, Lrrc28
Downstream geneLOC100041771, Igf1r, C330024D12Rik, EG434197, LOC100041800, EG384639, Arrdc4
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-163M14.bB6Ng01-163M14.g
ACCDH956284DH956285
length1,164969
definitionDH956284|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-163M14, 5' end.DH956285|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-163M14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(74,970,171 - 74,971,342)(74,811,516 - 74,812,482)
sequence
gaattctgctgtgagcaggtcaaggagagggctgtgtgggctgggtgtcc
actctttagtgagtggaatatgaggctaatcggaaaagctcacaggtttc
tgtaggggcgttaaacactttgtcgactcgtgggatctgactcacaaaca
catcatgccagcatcagagttacattagagccagtcgtagctttggaagc
tgaggtgggaaagaggggtgttatctttctctggctactggtggggtatg
gtaagcaagccctgcattctccagcccatgagactcaacatgaagtcatt
gcctgcatttgtactgtgactgtgactccggataaaactacggagaggtt
ttctcatgccaagtggacatattgcacaatagggttcattatgttaagtc
agtgcctacctgtgtctggattcagtagctagcgccagtgctgtggtaaa
gtggctgactgtgcattttcctgacaaggggggatctgtgaatctgaaag
atggcggcataagaagctctaagcagacccggaatagtgtgagtgtcaag
acggtgaggagtcattatctcagctcagtgtccctgggccttcttagtca
tgcattgactcttagttcaaagacccagtaaaacttttattactgctttc
tcttttccctgtgtcttgatgagcctggccttaaccaagggaggctcctg
cttagtgacaatagtgacagcagccaacccagactgcagacattgtcctc
aacagctttccacaggctggctcctggggtgcacacagaagttggatggg
attagtactcccattttatagatgacgaaaccgagggtaagcagcttgct
agggcatgggtaagcccaccagtctggctccagagtctttaaaagctttg
aaacagacctcagcacatagaattggatttattacattctcatgcatgac
acacttttctcatgcatgggctgtttttacttggttatttaagagtcacc
gattcattacatacacactgacattgcacacctgcaatgcctgctgcacc
acaaccaaactcatgcacacatatgcacacaccttgggtttggtcccttg
agtaggccaaaagttaacatgacatgggaaacagacaggaagaagggtgc
ccgttccaaatgca
gaattcagtttaggactccagcctgtgggatggagacacccacacctaag
ttaaatctcactggaaacaccggcaatcagaccttcccagcggtgtgcct
cctaggtgattctagacccattgaaagggacaaaagggacaatgctcatt
atcacagctacagaggactgctgagctgagagctaactttccccaggagc
cgatcactgcaggagccgatcactgcaggctagctagaagacctcagagg
tggtccgtgtctgttctacctgcctagttttccttcatcccactacattc
cccaccactaaagtgtatgtacctcttaaatgagttgctgtttgcttctc
gcaaccagatgaccactctactgccccagcaggtggttgtttgagtctct
ggcacttcccgagcgctcagcacatagcaagcgctcaggaaatacttact
gggtagatctacacacaagcagccctcgtgactctggagttccaagctgt
ctacctgataaactcattttctttttctaacagtacaaacaggccatcca
ggagcttgtgcgctgtgtggcactaacaagaatttgctatggcgactggc
actggaaactagcggaggcgtatgttaatctggctcaggggttacctgca
gctgaaaggtgagcttcccgggcaccagccaatgggcttctgttctccct
gtccccagacttattcacaccagagggatcagggttttgtggctcttaag
aagtgattgcctttaggaagaatcataaaggtatgtacatataggttccg
acagggaagaataggaagagtgtggtgtgggtttttttgtggccttattg
gagtccttagtggataatctgttggatcaaagatggcaggaaagagccca
gacatggaatggaggctagagtgggagtggattccatagtttttcttgag
aggggaatgggggtgggaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_74970171_74971342
seq2: B6Ng01-163M14.b_43_1206 (reverse)

seq1  TGCACTTTGGACGGGCACCC-TCTTTCTGTCTCGTTTCCCACTGTCCTGT  49
      |||| || | |||||||||| |||| |||||| |||||||| |||| |||
seq2  TGCATTTGGAACGGGCACCCTTCTTCCTGTCT-GTTTCCCA-TGTCATGT  48

seq1  TAACTTCTGGCCTGCTTCCAAGGGAGCCAAACCAAGGTGTGTGCATATGT  99
      |||||| |||||| ||  ||||||| | || |||||||||||||||||||
seq2  TAACTTTTGGCCTACT--CAAGGGACCAAACCCAAGGTGTGTGCATATGT  96

seq1  GTGCATGAGTTGTGTTTGTGTGTGC-GCACGCATCTGCACGTGTGC-ATG  147
      ||||||||||| || ||||| |||| ||| |||| |||| |||||| |||
seq2  GTGCATGAGTT-TGGTTGTG-GTGCAGCAGGCAT-TGCAGGTGTGCAATG  143

seq1  TCAGTGTTGTATGTAATG-ATCGGTGACTCTTTAATTATCCAAGTAAAAG  196
      |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||| 
seq2  TCAGTG-TGTATGTAATGAATCGGTGACTC-TTAAATAACCAAGTAAAA-  190

seq1  ACAGCCCATGCATGAG-AAAGTGTGTCATGCATGAGAATTGTAATTAATC  245
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||
seq2  ACAGCCCATGCATGAGAAAAGTGTGTCATGCATGAGAA-TGTAATAAATC  239

seq1  CAATTCTATGTGCCTGAGGTCTGTTTTCAAAAGCTTTTAAAGACTCTGGA  295
      |||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||
seq2  CAATTCTATGTG-CTGAGGTCTGTTT--CAAAGCTTTTAAAGACTCTGGA  286

seq1  GCCAGACTGGTGGGCTTACCCATGCCCTAGCAAGCTGCTTACCCTCGGTT  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGACTGGTGGGCTTACCCATGCCCTAGCAAGCTGCTTACCCTCGGTT  336

seq1  TCGTCATCTATAAAATGGGAGTACTAATCCCATCCAACTTCTGTGTGCAC  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGTCATCTATAAAATGGGAGTACTAATCCCATCCAACTTCTGTGTGCAC  386

seq1  CCCAGGAGCCAGCCTGTGGAAAGCTGTTGAGGACAATGTCTGCAGTCTGG  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGGAGCCAGCCTGTGGAAAGCTGTTGAGGACAATGTCTGCAGTCTGG  436

seq1  GTTGGCTGCTGTCACTATTGTCACTAAGCAGGAGCCTCCCTTGGTTAAGG  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGGCTGCTGTCACTATTGTCACTAAGCAGGAGCCTCCCTTGGTTAAGG  486

seq1  CCAGGCTCATCAAGACACAGGG-AAAGAGAAAGCAGTAATAAAAGTTTTA  544
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGCTCATCAAGACACAGGGAAAAGAGAAAGCAGTAATAAAAGTTTTA  536

seq1  CTGGGTCTTTGAACTAAGAGTCAATGCATGACTAAGAAGGCCCAGGGACA  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGTCTTTGAACTAAGAGTCAATGCATGACTAAGAAGGCCCAGGGACA  586

seq1  CTGAGCTGAGATAATGACTCCTCACCGTCTTGACACTCACACTATTCCGG  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGCTGAGATAATGACTCCTCACCGTCTTGACACTCACACTATTCCGG  636

seq1  GTCTGCTTAGAGCTTCTTATGCCGCCATCTTTCAGATTCACAGATCCCCC  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGCTTAGAGCTTCTTATGCCGCCATCTTTCAGATTCACAGATCCCCC  686

seq1  CTTGTCAGGAAAATGCACAGTCAGCCACTTTACCACAGCACTGGCGCTAG  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTCAGGAAAATGCACAGTCAGCCACTTTACCACAGCACTGGCGCTAG  736

seq1  CTACTGAATCCAGACACAGGTAGGCACTGACTTAACATAATGAACCCTAT  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACTGAATCCAGACACAGGTAGGCACTGACTTAACATAATGAACCCTAT  786

seq1  TGTGCAATATGTCCACTTGGCATGAGAAAACCTCTCCGTAGTTTTATCCG  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCAATATGTCCACTTGGCATGAGAAAACCTCTCCGTAGTTTTATCCG  836

seq1  GAGTCACAGTCACAGTACAAATGCAGGCAATGACTTCATGTTGAGTCTCA  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCACAGTCACAGTACAAATGCAGGCAATGACTTCATGTTGAGTCTCA  886

seq1  TGGGCTGGAGAATGCAGGGCTTGCTTACCATACCCCACCAGTAGCCAGAG  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCTGGAGAATGCAGGGCTTGCTTACCATACCCCACCAGTAGCCAGAG  936

seq1  AAAGATAACACCCCTCTTTCCCACCTCAGCTTCCAAAGCTACGACTGGCT  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGATAACACCCCTCTTTCCCACCTCAGCTTCCAAAGCTACGACTGGCT  986

seq1  CTAATGTAACTCTGATGCTGGCATGATGTGTTTGTGAGTCAGATCCCACG  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAATGTAACTCTGATGCTGGCATGATGTGTTTGTGAGTCAGATCCCACG  1036

seq1  AGTCGACAAAGTGTTTAACGCCCCTACAGAAACCTGTGAGCTTTTCCGAT  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCGACAAAGTGTTTAACGCCCCTACAGAAACCTGTGAGCTTTTCCGAT  1086

seq1  TAGCCTCATATTCCACTCACTAAAGAGTGGACACCCAGCCCACACAGCCC  1144
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCCTCATATTCCACTCACTAAAGAGTGGACACCCAGCCCACACAGCCC  1136

seq1  TCTCCTTGACCTGCTCACAGCAGAATTC  1172
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCTTGACCTGCTCACAGCAGAATTC  1164

seq1: chr7_74811516_74812482
seq2: B6Ng01-163M14.g_70_1038

seq1  GAATTCAGTCTAGGACTCCAGCCTGTGGGATGGAGACACCCACACCTAAG  50
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTTTAGGACTCCAGCCTGTGGGATGGAGACACCCACACCTAAG  50

seq1  TTAAATCTCACTGGAAACACCGGCAATCAGACCTTCCCAGCGGTGTGCCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAATCTCACTGGAAACACCGGCAATCAGACCTTCCCAGCGGTGTGCCT  100

seq1  CCTAGGTGATTCTAGACCCATTGAAAGGGACAAAAGGGACAATGCTCATT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAGGTGATTCTAGACCCATTGAAAGGGACAAAAGGGACAATGCTCATT  150

seq1  ATCACAGCTACAGAGGACTGCTGAGCTGAGAGCTAACTTTCCCCAGGAGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACAGCTACAGAGGACTGCTGAGCTGAGAGCTAACTTTCCCCAGGAGC  200

seq1  CGATCACTGCAGGAGCCGATCACTGCAGGCTAGCTAGAAGACCTCAGAGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGATCACTGCAGGAGCCGATCACTGCAGGCTAGCTAGAAGACCTCAGAGG  250

seq1  TGGTCCGTGTCTGTTCTACCTGCCTAGTTTTCCTTCATCCCACTACATTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCCGTGTCTGTTCTACCTGCCTAGTTTTCCTTCATCCCACTACATTC  300

seq1  CCCACCACTAAAGTGTATGTACCTCTTAAATGAGTTGCTGTTTGCTTCTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACCACTAAAGTGTATGTACCTCTTAAATGAGTTGCTGTTTGCTTCTC  350

seq1  GCAACCAGATGACCACTCTACTGCCCCAGCAGGTGGTTGTTTGAGTCTCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAACCAGATGACCACTCTACTGCCCCAGCAGGTGGTTGTTTGAGTCTCT  400

seq1  GGCACTTCCCGAGCGCTCAGCACATAGCAAGCGCTCAGGAAATACTTACT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCACTTCCCGAGCGCTCAGCACATAGCAAGCGCTCAGGAAATACTTACT  450

seq1  GGGTAGATCTACACACAAGCAGCCCTCGTGACTCTGGAGTTCCAAGCTGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTAGATCTACACACAAGCAGCCCTCGTGACTCTGGAGTTCCAAGCTGT  500

seq1  CTACCTGATAAACTCATTTTCTTTTTCTAACAGTACAAACAGGCCATCCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACCTGATAAACTCATTTTCTTTTTCTAACAGTACAAACAGGCCATCCA  550

seq1  GGAGCTTGTGCGCTGTGTGGCACTAACAAGAATTTGCTATGGCGACTGGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCTTGTGCGCTGTGTGGCACTAACAAGAATTTGCTATGGCGACTGGC  600

seq1  ACTGGAAACTAGCGGAGGCGTATGTTAATCTGGCTCA-GGGTTACCTGCA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  ACTGGAAACTAGCGGAGGCGTATGTTAATCTGGCTCAGGGGTTACCTGCA  650

seq1  GCTGAAAGGTGAGCTTCCCGGGCACCAGCCAATGGGCTTCTGTTCTCCCT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGAAAGGTGAGCTTCCCGGGCACCAGCCAATGGGCTTCTGTTCTCCCT  700

seq1  GTCCCCAGACTTATTCACACCAGAGGGATCAGGGTTTTGTGGCTCTTAAG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCCCAGACTTATTCACACCAGAGGGATCAGGGTTTTGTGGCTCTTAAG  750

seq1  AAGTGATTGCCTTTAGGAAGAATCATAAAGGTATGTACATATAGGTACCG  799
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  AAGTGATTGCCTTTAGGAAGAATCATAAAGGTATGTACATATAGGTTCCG  800

seq1  ACA-GGAAGAA-AGGAAGAGTGTGGTGTGGGTTTTTTTGTGGCCTTATTG  847
      ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGGAAGAATAGGAAGAGTGTGGTGTGGGTTTTTTTGTGGCCTTATTG  850

seq1  GAGTCCTTAGTGGATAATCTGTTGGATCAAAAGATGGCAGGAAAGAAGCC  897
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||
seq2  GAGTCCTTAGTGGATAATCTGTTGGATC-AAAGATGGCAGGAAAG-AGCC  898

seq1  AAGACATGGAATGGAGGCTTAGAGTGGGAGTGGATTCCATAG-TTTTCTT  946
       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  CAGACATGGAATGGAGGC-TAGAGTGGGAGTGGATTCCATAGTTTTTCTT  947

seq1  GAGAGGGGAAT-GGGGTGGGAA  967
      ||||||||||| ||||||||||
seq2  GAGAGGGGAATGGGGGTGGGAA  969