BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-169B15
Chromosome7 (Build37)
Map Location 139,411,915 - 139,573,907
singlet/doubletdoublet
Overlap gene4631426J05Rik, LOC100043682
Upstream geneLOC546006, LOC100043173, Cuzd1, 1700007K09Rik, 1700063I17Rik, 2310057M21Rik, Pstk, Ikzf5, Acadsb, Hmx3, Hmx2, Bub3, LOC677073, LOC100043679, Gpr26, Cpxm2
Downstream geneLOC100043683, Oat, Nkx1-2, 2310007H09Rik, A930008G19Rik, 2010208K18Rik, C430003P19Rik, Zranb1, Ctbp2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-169B15.bB6Ng01-169B15.g
ACCDH960167DH960168
length1,1711,097
definitionDH960167|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-169B15, 5' end.DH960168|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-169B15, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(139,572,690 - 139,573,907)(139,411,915 - 139,413,018)
sequence
gaattctaggtttgcgtgcaggctgccatgtgtcttgatgtatgtagaac
agctcagtatgtacatcttagcatcctgttcgacaatgaatacattcaca
gattagaatcataaaactgcttgagtaagatgctgggtaagagtcaaagg
gggaaaaaatccctagggctgcaggtactgctactgtgtgaatttggtgc
accattcggatatctactatgatacagaaactgtaaaccaggccaagcta
ctttgtaaactcactacctaagtctgtaatgttttctccttcgctagctt
gtgagaagaggatggaaacaacccagaccaggagggagaactttcgaagt
gagtctagccatgtggcttttgaagacagagaagaagcagaggtgaaaat
gagagttgaggggatgttccccaggcagacttcactgaaatcatcttcat
tggctagaagaaaatttgagagtgccccctaaaccctttccccagggagg
accagaaataagcccattgatcaatgagtttcagacataagactctagaa
ggtaagttctctctctctcccatcctgttgctgcgagagcaccctgtggg
agcaccctgtgggggcaccctgtaggagaactcacacaaagggagcaccc
tgtgggagcaccctgtgggagcaccctgtgggagcaccctgtgggggcac
cctgtaggagaactcacacaaagggagcaccctgtgggagcaccctgtag
gagaacccttgaaatcacacaaagggagcaccctgtgggagcaccctatg
agatcacgctatgggagcacatcacaggatcacattagactgttgttcct
catcgctgtgctatgatggagccaaacgtctcctgttagttacacttgct
gttgtgtctgttgattttcattagatgaattttaattttatgacaggatt
gggaaatttcaaagcagtctctaaagcagctccagtgtgccatgcatttg
taaaactagcttccagatggtcactgcagtctaaagagagtgggaggtgg
gttctctggtctgaggaagagcttcattgatgcaggactcttggtcatac
tgcttgggaacacccaatgggcagcatagcaggctctggctctagatacg
aacgcttgaatgctgccaatc
gaattcctgtatctctccaataacatgcatgtctggctttggaactgcag
cctttgcgcttttattgctatttacacaagtccttttggtccatcaactt
ggaagagagctattgcaggccactttcccctaaacacacattcctgtgtg
cagactgaaatctgtgtctgttagagaggggctatgttagggcaatgcat
agactcaaaatacacagtagcacaaacacaagagagacagatctgtgtgt
ctagctgagaacacaacctgagagaggccacacccctaacaaaaactgac
tcttccccccagcggccatcaactgccaataactttgagttaggagttga
gccatgtgagacccttcgctgtctgagctggactgacctgaccttgtgca
ggtgttgttcaggcaaactcagttgctgtgagctcatgagcgcaatgacc
ctgctgtatggagaagatggcatttcccagcagtctccccaacctctggc
tcttacaagcttcctacctcctcgtctgcagtgctccttggcctatgtgg
gagctggcatgactggctcattttttaaaaagatttatttattcttattt
atatgagtacactgtagctgtcttcagacacataccagaagagtacatca
gaccccattacaaatggttctgagccatcatgtggttgctgggacttgaa
ctcagaacctctggaagaacagtcagtgctcttaaccactgagccatctc
tccagccctttgctgacctgttcttaatgatgaacatttgtctttgctaa
tcagattcagccctgaagactcaattccaggctcggcactgtagactcgg
attagctcttcccaactcagttgttctcacaaatcttcgagtcatggctt
ctgttaatggagttgatctgtgtgctacagctaaggtttgaatttctctg
agatgaaaggctgagtctctagagttcctgggcctctaacccttgctctg
atctcactgggctctgattgcctttgccctgaggtgggcatcttctcatc
agaattctgtgacagcttctataggctgatctagaatgtgtcaattt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_139572690_139573907
seq2: B6Ng01-169B15.b_48_1218 (reverse)

seq1  GATTGGCCACAGCATTCCACAGCCTGTTTCAGTCTTCCCTAGAGCCCCAG  50
      ||||||   ||||||||   ||| |       || |  ||||||  ||||
seq2  GATTGG---CAGCATTC--AAGCGT-------TCGTATCTAGAG--CCAG  36

seq1  AGCCTTACCTCATGCCTGCCACTGAGGTGGTCCCCAGGCAGTATGTGACC  100
      |||||   || ||| |||||  |  ||| || |||| ||||||||    |
seq2  AGCCT--GCT-ATG-CTGCCCATTGGGT-GTTCCCAAGCAGTATG---AC  78

seq1  CAAGAGTCCTGGCACTCCATTGAAGGCTCTTCCCTCAGACCAGAGAAACC  150
      |||||||||||   |  || |||| |||||| ||||||||||||| ||||
seq2  CAAGAGTCCTG---CATCAATGAA-GCTCTT-CCTCAGACCAGAG-AACC  122

seq1  CACCTCCCACTTCCTCTTTTAGACTTGCAGTGAACCATCTGGAAGCCTTA  200
      |||||||||||  ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||    
seq2  CACCTCCCACT--CTC-TTTAGAC-TGCAGTG-ACCATCTGGAAGC---T  164

seq1  AGTTTTTAACCAAATGCATGGCACACTTGGAGCCTGCCTTTTAGAGACTG  250
      ||||||    |||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||
seq2  AGTTTT---ACAAATGCATGGCACAC-TGGAG-CTGC--TTTAGAGACTG  207

seq1  CTTTGAAAATTTCCCAATCCTGTCATAAAAATTAAAAATTCATCTAATGA  300
      ||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||
seq2  CTTTG-AAATTTCCCAATCCTGTCATAAAA--TTAAAATTCATCTAATGA  254

seq1  AAATCAACAAGACACAACAGCAAGTGTAACTAACAGGAGACGTTTGGCTC  350
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCAAC-AGACACAACAGCAAGTGTAACTAACAGGAGACGTTTGGCTC  303

seq1  CATCATAGCACAGCGATGAGGAACAACAGTCTAATGTGATCCTGTGATGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCATAGCACAGCGATGAGGAACAACAGTCTAATGTGATCCTGTGATGT  353

seq1  GCTCCCATAGCGTGATCTCATAGGGTGCTCCCACAGGGTGCTCCCTTTGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCCATAGCGTGATCTCATAGGGTGCTCCCACAGGGTGCTCCCTTTGT  403

seq1  GTGATTTCAAGGGTTCTCCTACAGGGTGCTCCCACAGGGTGCTCCCTTTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATTTCAAGGGTTCTCCTACAGGGTGCTCCCACAGGGTGCTCCCTTTG  453

seq1  TGTGAGTTCTCCTACAGGGTGCCCCCACAGGGTGCTCCCACAGGGTGCTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAGTTCTCCTACAGGGTGCCCCCACAGGGTGCTCCCACAGGGTGCTC  503

seq1  CCACAGGGTGCTCCCACAGGGTGCTCCCTTTGTGTGAGTTCTCCTACAGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACAGGGTGCTCCCACAGGGTGCTCCCTTTGTGTGAGTTCTCCTACAGG  553

seq1  GTGCCCCCACAGGGTGCTCCCACAGGGTGCTCTCGCAGCAACAGGATGGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCCCCACAGGGTGCTCCCACAGGGTGCTCTCGCAGCAACAGGATGGG  603

seq1  AGAGAGAGAGAACTTACCTTCTAGAGTCTTATGTCTGAAACTCATTGATC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGAGAGAACTTACCTTCTAGAGTCTTATGTCTGAAACTCATTGATC  653

seq1  AATGGGCTTATTTCTGGTCCTCCCTGGGGAAAGGGTTTAGGGGGCACTCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGGCTTATTTCTGGTCCTCCCTGGGGAAAGGGTTTAGGGGGCACTCT  703

seq1  CAAATTTTCTTCTAGCCAATGAAGATGATTTCAGTGAAGTCTGCCTGGGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATTTTCTTCTAGCCAATGAAGATGATTTCAGTGAAGTCTGCCTGGGG  753

seq1  AACATCCCCTCAACTCTCATTTTCACCTCTGCTTCTTCTCTGTCTTCAAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATCCCCTCAACTCTCATTTTCACCTCTGCTTCTTCTCTGTCTTCAAA  803

seq1  AGCCACATGGCTAGACTCACTTCGAAAGTTCTCCCTCCTGGTCTGGGTTG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCACATGGCTAGACTCACTTCGAAAGTTCTCCCTCCTGGTCTGGGTTG  853

seq1  TTTCCATCCTCTTCTCACAAGCTAGCGAAGGAGAAAACATTACAGACTTA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCATCCTCTTCTCACAAGCTAGCGAAGGAGAAAACATTACAGACTTA  903

seq1  GGTAGTGAGTTTACAAAGTAGCTTGGCCTGGTTTACAGTTTCTGTATCAT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAGTGAGTTTACAAAGTAGCTTGGCCTGGTTTACAGTTTCTGTATCAT  953

seq1  AGTAGATATCCGAATGGTGCACCAAATTCACACAGTAGCAGTACCTGCAG  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAGATATCCGAATGGTGCACCAAATTCACACAGTAGCAGTACCTGCAG  1003

seq1  CCCTAGGGATTTTTTCCCCCTTTGACTCTTACCCAGCATCTTACTCAAGC  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTAGGGATTTTTTCCCCCTTTGACTCTTACCCAGCATCTTACTCAAGC  1053

seq1  AGTTTTATGATTCTAATCTGTGAATGTATTCATTGTCGAACAGGATGCTA  1150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTTATGATTCTAATCTGTGAATGTATTCATTGTCGAACAGGATGCTA  1103

seq1  AGATGTACATACTGAGCTGTTCTACATACATCAAGACACATGGCAGCCTG  1200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGTACATACTGAGCTGTTCTACATACATCAAGACACATGGCAGCCTG  1153

seq1  CACGCAAACCTAGAATTC  1218
      ||||||||||||||||||
seq2  CACGCAAACCTAGAATTC  1171

seq1: chr7_139411915_139413018
seq2: B6Ng01-169B15.g_67_1163

seq1  GAATTCCTGTATCTCTCCAATAACATGCATGTCTGGCTTTGGAACTGCAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTGTATCTCTCCAATAACATGCATGTCTGGCTTTGGAACTGCAG  50

seq1  CCTTTGCGCTTTTATTGCTATTTACACAAGTCCTTTTGGTCCATCAACTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTGCGCTTTTATTGCTATTTACACAAGTCCTTTTGGTCCATCAACTT  100

seq1  GGAAGAGAGCTATTGCAGGCCACTTTCCCCTAAACACACATTCCTGTGTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGAGAGCTATTGCAGGCCACTTTCCCCTAAACACACATTCCTGTGTG  150

seq1  CAGACTGAAATCTGTGTCTGTTAGAGAGGGGCTATGTTAGGGCAATGCAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACTGAAATCTGTGTCTGTTAGAGAGGGGCTATGTTAGGGCAATGCAT  200

seq1  AGACTCAAAATACACAGTAGCACAAACACAAGAGAGACAGATCTGTGTGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTCAAAATACACAGTAGCACAAACACAAGAGAGACAGATCTGTGTGT  250

seq1  CTAGCTGAGAACACAACCTGAGAGAGGCCACACCCCTAACAAAAACTGAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGCTGAGAACACAACCTGAGAGAGGCCACACCCCTAACAAAAACTGAC  300

seq1  TCTTCCCCCCAGCGGCCATCAACTGCCAATAACTTTGAGTTAGGAGTTGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCCCCCCAGCGGCCATCAACTGCCAATAACTTTGAGTTAGGAGTTGA  350

seq1  GCCATGTGAGACCCTTCGCTGTCTGAGCTGGACTGACCTGACCTTGTGCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATGTGAGACCCTTCGCTGTCTGAGCTGGACTGACCTGACCTTGTGCA  400

seq1  GGTGTTGTTCAGGCAAACTCAGTTGCTGTGAGCTCATGAGCGCAATGACC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTTGTTCAGGCAAACTCAGTTGCTGTGAGCTCATGAGCGCAATGACC  450

seq1  CTGCTGTATGGAGAAGATGGCATTTCCCAGCAGTCTCCCCAACCTCTGGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTGTATGGAGAAGATGGCATTTCCCAGCAGTCTCCCCAACCTCTGGC  500

seq1  TCTTACAAGCTTCCTACCTCCTCGTCTGCAGTGCTCCTTGGCCTATGTGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTACAAGCTTCCTACCTCCTCGTCTGCAGTGCTCCTTGGCCTATGTGG  550

seq1  GAGCTGGCATGACTGGCTCATTTTTTAAAAAGATTTATTTATTCTTATTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTGGCATGACTGGCTCATTTTTTAAAAAGATTTATTTATTCTTATTT  600

seq1  ATATGAGTACACTGTAGCTGTCTTCAGACACATACCAGAAGAGTACATCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGAGTACACTGTAGCTGTCTTCAGACACATACCAGAAGAGTACATCA  650

seq1  GACCCCATTACAAATGGTTCTGAGCCATCATGTGGTTGCTGGGACTTGAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCCCATTACAAATGGTTCTGAGCCATCATGTGGTTGCTGGGACTTGAA  700

seq1  CTCAGAACCTCTGGAAGAACAGTCAGTGCTCTTAACCACTGAGCCATCTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGAACCTCTGGAAGAACAGTCAGTGCTCTTAACCACTGAGCCATCTC  750

seq1  TCCAGCCCTTTGCTGACCTGTTCTTAATGATGAACATTTGTCTTTGCTAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGCCCTTTGCTGACCTGTTCTTAATGATGAACATTTGTCTTTGCTAA  800

seq1  TCAGATTCAGCCCTGAAGACTCAATTCCAGGCTCAGGCACTGTAGACTCG  850
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  TCAGATTCAGCCCTGAAGACTCAATTCCAGGCTC-GGCACTGTAGACTCG  849

seq1  GATTAGCTCTTCCCAACTCAGTTGTTCTCACAAATCTTCGAGTCATGGCT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTAGCTCTTCCCAACTCAGTTGTTCTCACAAATCTTCGAGTCATGGCT  899

seq1  TCTGTTAATGGAGTTGATCTGTGTGCTACAGCTAAGGTTTGAATTTCTCT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTTAATGGAGTTGATCTGTGTGCTACAGCTAAGGTTTGAATTTCTCT  949

seq1  GAGATGAAAGGCTGAGTCTCTAGAGTTCCTGGGGCCTCTAACCCTTGCTC  1000
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  GAGATGAAAGGCTGAGTCTCTAGAGTTCCT-GGGCCTCTAACCCTTGCTC  998

seq1  TGATCCTCACTGGGCTCTGATTGCCTTTGCCCCTGAGGTGGGCATCTTCT  1050
      |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  TGAT-CTCACTGGGCTCTGATTGCCTTTG-CCCTGAGGTGGGCATCTTCT  1046

seq1  CATCAGAA-TCTGTGACAAAGCTTTCTATAGCCTGATCTAAGAATGTGTC  1099
      |||||||| ||||||||  ||| |||||||| ||||||| ||||||||||
seq2  CATCAGAATTCTGTGAC--AGC-TTCTATAGGCTGATCT-AGAATGTGTC  1092

seq1  TATTT  1104
       ||||
seq2  AATTT  1097