BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-172A06
Chromosome7 (Build37)
Map Location 119,939,334 - 120,053,491
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTead1
Upstream geneLOC668399, LOC100042678, Usp47, Dkk3, Mical2, Micalcl, Parva, LOC627808
Downstream gene4632411J06Rik, LOC434227, Arntl, A630005I04Rik, Btbd10, Pth, LOC100042736, Mlstd2, EG434228, Spon1
LinkOpen Mouse BAC browser

no map image available.



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-172A06.bB6Ng01-172A06.g
ACCGA000745GA000746
length1,0531,097
definitionB6Ng01-172A06.b B6Ng01-172A06.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(120,052,437 - 120,053,491)(119,939,334 - 119,940,437)
sequence
gaattcctcccaacaggaactgagagcctttgccttggagcaaaccctga
gaacatgaatctgggctagattatggatagccactggtatactgagtgcc
cttctgtaattcaggtatcaatgtcccagtggaaaccaggtggtatttct
aatgtgctgctgggcagccccttgatgcttgaaagaaactatggtcaagg
ccatattcctgggatggattaataacttaagtggaaactagaatgtccac
ttcctatgtgctgaagacctagacattgcattaaaaccacagagagtggg
gaccaatactgttgaaacacggtggtggcttgcagtcaaggcttggcaat
agaggatacctaccgatagggaattgtgtggacatattagagctctggtg
gcagcactcagctgtcagatacaaaggagaaatgacaacgggggcaagtt
acggaaccaaggagtgcagccacagtgagctagggagacactaagtagac
agggcaagcgaggggtgagggagaatgctgggcattggaggaactgcttg
gcggcttttgaaatcagtgttgagtgagtgaggaggtatagctgccgcac
tcaatcaaggccaccattcctggggtcagagggattatccagttcatttg
aagggcctgagtttgaccacaagaaccgtcactatgaaatgagataggcg
tgtcaggctacgcgtgtcatcctagccctggaggggtggagacaggagga
cctctgggaagctttaggaccaggaggattatttcaaaggcagcgactgt
tcctaaaggatgatacccgaggtcctccagtctgtggacacccacccaga
cacgccccacctcccacattaaaagacctcccttacataacttcagactt
gagcttgtcctgtgatgggaaggaaaactgggttggctggagggaactac
agttataaccacttaccagggtatcactacacaccataggaagagaacta
ccctttagggtactgaataatagggacttttttttaatggcttaatagtg
ggg

gaattccttcctggcatggccttggctcaggaggacgcagaaaggctgac
ctttttttccagttacctactaattgctattctttaggttttggttagct
cctaactgaaatcttcagtgtttcagaacatggtgggttctcaggaatct
ttgcagagcttctgttgaggtgcgacagactggggaacaccccatcttac
gctctctagtggtaagttacttaaggggtagatgccatgcttgtgtttga
caaattcttaatgtctgttccacatggggctgggtggcaggcagacggtt
ggccttgtcacccccagttttcatctcatggtctttctggtcacagtctc
attgtgccaccattaaatcctcgaaggattttaccgaagcatcctgagaa
tgtctgtcttaaacacggcttggtttttcaggatacccaagtcaagatca
tctgtccctcacccagcgatccccttctcttctgcacactctttttccca
ggaccttaaggttactccactaacagttaaaatccccccaccttctctga
gtaattgaaagcacttgtctatgtattctgggcatgtgaggacctaaccc
gggagctcaggaagagaccatttgggcaatgtttaagaatctcattgggg
cagtttagaagaggaaacaatgcccttctgcatatgaggctctgagcaca
gaagggagaatgcacaccttgtggctattggctcaccacatctgtgcaca
tctccccagtctgcaaagggtggtgagtacaggtcacagtgactctaggg
cagccggccacagaccgcagcagcatcagaaccagaaaggagaagatgca
gacctggcagtgtccctttccctgtggtcccacctttccctatttccttg
atgccttctgtggctgcctgggccagtatgtatggccacaggcctgtcgg
attggttatacctgtgactgatgattgtttcccaaatctgtgtgagttta
tgcatacacagctgaagagaagctcatgtgttcactgtgctgatcagcac
tggggctgcccactgctggatccaaaggattctaggaaataggttcc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_120052437_120053491
seq2: B6Ng01-172A06.b_48_1100 (reverse)

seq1  CCCCACTA-TAAGCCATTAAAAAAAAAGTCCCTA-TATTCAGTAACCCTA  48
      |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| 
seq2  CCCCACTATTAAGCCATT-AAAAAAAAGTCCCTATTATTCAGT-ACCCT-  47

seq1  AAAGGGTAGTTTCTCTTTCTTTGGTGTGTAGTTGATACCCTGGTAAGTGG  98
      ||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  AAAGGGTAG-TTCTCTTCCTATGGTGTGTAG-TGATACCCTGGTAAGTGG  95

seq1  TTATAACTGTAGTTCCCTCCAGCC-ACCCAGTTTTCCTTCCCATCAACAG  147
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||
seq2  TTATAACTGTAGTTCCCTCCAGCCAACCCAGTTTTCCTTCCCATC-ACAG  144

seq1  GACAAGCTCAAGTCTGAAGTTATGTAAGGGAGGTCTTTTAATGTGGGAGG  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAAGCTCAAGTCTGAAGTTATGTAAGGGAGGTCTTTTAATGTGGGAGG  194

seq1  TGGGGCGTGTCTGGGTGGGTGTCCACAGACTGGAGGACCTCGGGTATCAT  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGCGTGTCTGGGTGGGTGTCCACAGACTGGAGGACCTCGGGTATCAT  244

seq1  CC-TTAGGAACAGTCGCTGCCTTTGAAATAATCCTCCTGGTCCTAAAGCT  296
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTAGGAACAGTCGCTGCCTTTGAAATAATCCTCCTGGTCCTAAAGCT  294

seq1  TCCCAGAGGTCCTCCTGTCTCCACCCCTCCAGGGCTAGGATGACACGCGT  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCAGAGGTCCTCCTGTCTCCACCCCTCCAGGGCTAGGATGACACGCGT  344

seq1  AGCCTGACACGCCTATCTCATTTCATAGTGACGGTTCTTGTGGTCAAACT  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTGACACGCCTATCTCATTTCATAGTGACGGTTCTTGTGGTCAAACT  394

seq1  CAGGCCCTTCAAATGAACTGGATAATCCCTCTGACCCCAGGAATGGTGGC  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCCCTTCAAATGAACTGGATAATCCCTCTGACCCCAGGAATGGTGGC  444

seq1  CTTGATTGAGTGCGGCAGCTATACCTCCTCACTCACTCAACACTGATTTC  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGATTGAGTGCGGCAGCTATACCTCCTCACTCACTCAACACTGATTTC  494

seq1  AAAAGCCGCCAAGCAGTTCCTCCAATGCCCAGCATTCTCCCTCACCCCTC  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGCCGCCAAGCAGTTCCTCCAATGCCCAGCATTCTCCCTCACCCCTC  544

seq1  GCTTGCCCTGTCTACTTAGTGTCTCCCTAGCTCACTGTGGCTGCACTCCT  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGCCCTGTCTACTTAGTGTCTCCCTAGCTCACTGTGGCTGCACTCCT  594

seq1  TGGTTCCGTAACTTGCCCCCGTTGTCATTTCTCCTTTGTATCTGACAGCT  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTCCGTAACTTGCCCCCGTTGTCATTTCTCCTTTGTATCTGACAGCT  644

seq1  GAGTGCTGCCACCAGAGCTCTAATATGTCCACACAATTCCCTATCGGTAG  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGCTGCCACCAGAGCTCTAATATGTCCACACAATTCCCTATCGGTAG  694

seq1  GTATCCTCTATTGCCAAGCCTTGACTGCAAGCCACCACCGTGTTTCAACA  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATCCTCTATTGCCAAGCCTTGACTGCAAGCCACCACCGTGTTTCAACA  744

seq1  GTATTGGTCCCCACTCTCTGTGGTTTTAATGCAATGTCTAGGTCTTCAGC  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTGGTCCCCACTCTCTGTGGTTTTAATGCAATGTCTAGGTCTTCAGC  794

seq1  ACATAGGAAGTGGACATTCTAGTTTCCACTTAAGTTATTAATCCATCCCA  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATAGGAAGTGGACATTCTAGTTTCCACTTAAGTTATTAATCCATCCCA  844

seq1  GGAATATGGCCTTGACCATAGTTTCTTTCAAGCATCAAGGGGCTGCCCAG  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATATGGCCTTGACCATAGTTTCTTTCAAGCATCAAGGGGCTGCCCAG  894

seq1  CAGCACATTAGAAATACCACCTGGTTTCCACTGGGACATTGATACCTGAA  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCACATTAGAAATACCACCTGGTTTCCACTGGGACATTGATACCTGAA  944

seq1  TTACAGAAGGGCACTCAGTATACCAGTGGCTATCCATAATCTAGCCCAGA  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAGAAGGGCACTCAGTATACCAGTGGCTATCCATAATCTAGCCCAGA  994

seq1  TTCATGTTCTCAGGGTTTGCTCCAAGGCAAAGGCTCTCAGTTCCTGTTGG  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATGTTCTCAGGGTTTGCTCCAAGGCAAAGGCTCTCAGTTCCTGTTGG  1044

seq1  GAGGAATTC  1055
      |||||||||
seq2  GAGGAATTC  1053


seq1: chr7_119939334_119940437
seq2: B6Ng01-172A06.g_65_1161

seq1  GAATTCCTTCCTGGCATGGCCTTGGCTCAGGAGGACGCAGAAAGGCTGAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTCCTGGCATGGCCTTGGCTCAGGAGGACGCAGAAAGGCTGAC  50

seq1  CTTTTTTTCCAGTTACCTACTAATTGCTATTCTTTAGGTTTTGGTTAGCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTTTTCCAGTTACCTACTAATTGCTATTCTTTAGGTTTTGGTTAGCT  100

seq1  CCTAACTGAAATCTTCAGTGTTTCAGAACATGGTGGGTTCTCAGGAATCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAACTGAAATCTTCAGTGTTTCAGAACATGGTGGGTTCTCAGGAATCT  150

seq1  TTGCAGAGCTTCTGTTGAGGTGCGACAGACTGGGGAACACCCCATCTTAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCAGAGCTTCTGTTGAGGTGCGACAGACTGGGGAACACCCCATCTTAC  200

seq1  GCTCTCTAGTGGTAAGTTACTTAAGGGGTAGATGCCATGCTTGTGTTTGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTCTAGTGGTAAGTTACTTAAGGGGTAGATGCCATGCTTGTGTTTGA  250

seq1  CAAATTCTTAATGTCTGTTCCACATGGGGCTGGGTGGCAGGCAGACGGTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATTCTTAATGTCTGTTCCACATGGGGCTGGGTGGCAGGCAGACGGTT  300

seq1  GGCCTTGTCACCCCCAGTTTTCATCTCATGGTCTTTCTGGTCACAGTCTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCTTGTCACCCCCAGTTTTCATCTCATGGTCTTTCTGGTCACAGTCTC  350

seq1  ATTGTGCCACCATTAAATCCTCGAAGGATTTTACCGAAGCATCCTGAGAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTGCCACCATTAAATCCTCGAAGGATTTTACCGAAGCATCCTGAGAA  400

seq1  TGTCTGTCTTAAACACGGCTTGGTTTTTCAGGATACCCAAGTCAAGATCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTGTCTTAAACACGGCTTGGTTTTTCAGGATACCCAAGTCAAGATCA  450

seq1  TCTGTCCCTCACCCAGCGATCCCCTTCTCTTCTGCACACTCTTTTTCCCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTCCCTCACCCAGCGATCCCCTTCTCTTCTGCACACTCTTTTTCCCA  500

seq1  GGACCTTAAGGTTACTCCACTAACAGTTAAAATCCCCCCACCTTCTCTGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACCTTAAGGTTACTCCACTAACAGTTAAAATCCCCCCACCTTCTCTGA  550

seq1  GTAATTGAAAGCACTTGTCTATGTATTCTGGGCATGTGAGGACCTAACCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATTGAAAGCACTTGTCTATGTATTCTGGGCATGTGAGGACCTAACCC  600

seq1  GGGAGCTCAGGAAGAGACCATTTGGGCAATGTTTAAGAATCTCATTGGGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGCTCAGGAAGAGACCATTTGGGCAATGTTTAAGAATCTCATTGGGG  650

seq1  CAGTTTAGAAGAGGAAACAATGCCCTTCTGCATATGAGGCTCTGAGCACA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTTAGAAGAGGAAACAATGCCCTTCTGCATATGAGGCTCTGAGCACA  700

seq1  GAAGGGAGAATGCACACCTTGTGGCTATTGGCTCACCACATCTGTGCACA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGGAGAATGCACACCTTGTGGCTATTGGCTCACCACATCTGTGCACA  750

seq1  TCTCCCCAGTCTGCAAAGGGTGGTGAGTACAGGTCACAGTGACTCTAGGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCCCAGTCTGCAAAGGGTGGTGAGTACAGGTCACAGTGACTCTAGGG  800

seq1  CAGCCGGCCACAGACCGCAGCAGCATCAGAACCAGAAAGGAGAAGATGCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCGGCCACAGACCGCAGCAGCATCAGAACCAGAAAGGAGAAGATGCA  850

seq1  GACCTGGCAGTGTCCC-TTCCCTGTGGTCCCACC-TTCCCTATTTCCTTG  898
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  GACCTGGCAGTGTCCCTTTCCCTGTGGTCCCACCTTTCCCTATTTCCTTG  900

seq1  ATGCCTTCTGTGGCTGCCT-GGCCAGTATGTATGGCCACAGGCCTGTCGG  947
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCTTCTGTGGCTGCCTGGGCCAGTATGTATGGCCACAGGCCTGTCGG  950

seq1  ATTGGTTATACCTGTGACTGATGAATTGTTTCCCCAAATCTGTGTGAAGT  997
      ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||
seq2  ATTGGTTATACCTGTGACTGATG-ATTGTTT-CCCAAATCTGTGTG-AGT  997

seq1  TTATGCATACACCAAGCTGAAAGAGAAGCTCATGTGTTCACTGGTGGCTG  1047
      ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||   ||| 
seq2  TTATGCATACAC--AGCTG-AAGAGAAGCTCATGTGTTCACTG--TGCT-  1041

seq1  GATCAGCACCTGGGGCTGCGCACTGCTTGGAT-CACAGTA-TCTAGGAAA  1095
      |||||||| |||||||||| |||||| ||||| || || | |||||||||
seq2  GATCAGCA-CTGGGGCTGCCCACTGC-TGGATCCAAAGGATTCTAGGAAA  1089

seq1  TAGGGTTCC  1104
      || ||||||
seq2  TA-GGTTCC  1097


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |