BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-173D14
Chromosome7 (Build37)
Map Location 145,939,574 - 146,115,569
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMapk1ip1, Ppp2r2d, Bnip3, EG668784
Upstream geneLOC435235, Tcerg1l, LOC100043290
Downstream geneLOC669185, 6330417G02Rik, Dpysl4, Stk32c, LOC100038956, Lrrc27, Pwwp2, Inpp5a, Nkx6-2, E030019B06Rik, 9330101J02Rik, LOC100043472, EG434253, EG664869, Gpr123, LOC244229, Kndc1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-173D14.bB6Ng01-173D14.g
ACCGA001629GA001630
length1,1171,149
definitionB6Ng01-173D14.b B6Ng01-173D14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(146,114,478 - 146,115,569)(145,939,574 - 145,940,702)
sequence
gaattctcacccagatgtgtctaatgatcagacaataatctatgcctaaa
cctgaaggtcagccattactcttagccttctcttttccccttgagacaga
gtctcattaggcagtcctggctggcctggaacttgctatgtagagcaagt
tggccttgaactcacaggcatcaccctgtctctgctcctctggagtgctg
ggattaaagacatggaccaccatacctggctaccctctgtatttttaagt
atatgcaaccaaaatttactgctgtttgtttgtttgtttatttatttatt
tatttatttttgccaatgatccagtctacccgcagtgtttggcctaggca
cacctactcaaactgctgttacacctccagaatggtacaccctacttctg
taaagtgtcaccttcagagacttgatggcttttctgatgtgtggactctt
gatggcttgggtaattccatggctatttttaaagggaataaataagagga
gctgacctcttgatttgcataattgtgtgttgtttctggggcaagagggc
agtgaaccattttctttccaggatcacacaaggtgcttatagaaagacga
gctgggtgggtcattaccagggactgtgcatgaagtgtttcatccttggt
tggaaggagccctgcccccgcaggggatgagaacagacaagtgaatacct
gtgaaaccctcaagtccctgggtggcacattgtccagctgggctctgtgt
agctctgttctggtgagcatctttactcatggaggctgcccattgcaccc
ctcaggggtttttgactatgatttagtgggtttactcagatgaaaggctg
ggttttgttttgggttgcttgggtgtttctcacaatcagatctttctgac
tccaagagactaagaaggctatttaagacagcttcagctgccagagaaga
agacctggtagccaattggggtttgacaacaggaagtggagcacctgccc
tggttgccctccagaatcattaacaacttggacagttatagacttctaaa
agacttctgaaatcctagaggatcttggggattcgtcatttggacgcatt
cgccaaaagggggtact
gaattccaggagagagaggtcctggctctttggaaagctgagagcttcag
gagtcagggattgtatcacagcttggaggaccaaggttccagttccttgg
ccagcatgaggactgggataataaggaagacttaagacaacataaggtat
taaagaacccaacaaggactcttcctgggtgacagctacctagtattcta
ggctgcactgtcacaaggcccctgagcagagcaaagcaatgaccctttgc
tagctggccacatctttctcgccagggtctgcagctgaagggatagaacc
cacccacctcacccagaatctcactctggcctatagcacaagaccactga
cctcccagagttgcttcctatagctccaagaccagtgaagatcttgttca
gtggacggcatgtgacagtggagttgctgaaacagtggaggtcctgtgac
agtggaggtcctgcaacagtggaagtcccagggtaactggtgctctgccc
gggtcattgactggcccagagcaaaattcaacaaagagagcatatgccca
acctaaaaactttctggaggtgacacctcagtgattttcctcaggacaaa
cctagtttagaattgctgttgaggtatcttcattcagccacttggattgt
tacaaggcaaaatagaaaggaactcgcagcagggtttgcaggaggctaaa
aatagccagagcacccaccagcacaagcttccaggcagcagctgcagagt
gccatggataacctcacctgtttttactttattgacttgtctctaagacc
atcatggacagccagccagcaacatctgcccttagcgagcagaggaggac
tgtcctaaaacccaggaggtaattgaaaagcagaccagctccctctttct
ctgcctcctaatcttgcagatgggctttggtgtatgagcttggagttctt
ccaacctgaaaccccagtactcagcctgtcttctctcgtgtcccaagaag
gtgaccacatggccatgagggtcctccaggcagaagtcctttggctccag
ggtgctctgcaactagcgagacttccctgactgggggatcctagcacctg
gtgtgcaggcaaggaatgggacctcacttgaaggattgtctttggcttc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_146114478_146115569
seq2: B6Ng01-173D14.b_41_1157 (reverse)

seq1  AGTACCCCCTTTTGGCGAATGCGTTCAAATGACGAATCCC--AGATCTTC  48
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||
seq2  AGTACCCCCTTTTGGCGAATGCGTCCAAATGACGAATCCCCAAGATCCTC  50

seq1  TAG--ATTCAGAAGTCTTTTAG-AGTCTA-AACTGT-CAGGTTG-TAATG  92
      |||   |||||||||||||||| |||||| |||||| || |||| |||||
seq2  TAGGATTTCAGAAGTCTTTTAGAAGTCTATAACTGTCCAAGTTGTTAATG  100

seq1  ATTCTGGAGGCCA--CA-GGCA-GTGCTCCAC-TCCTGTTGTCAAACCC-  136
      |||||||||| ||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||| 
seq2  ATTCTGGAGGGCAACCAGGGCAGGTGCTCCACTTCCTGTTGTCAAACCCC  150

seq1  -ATTGGCT-CCAGGTCTTCTTCTCT-GCAGCTGAAGCTGTCTT-AATAG-  181
       ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| 
seq2  AATTGGCTACCAGGTCTTCTTCTCTGGCAGCTGAAGCTGTCTTAAATAGC  200

seq1  CTTCTTAGTCTC-TGGAGTCAG-AAGATCTGA-TGTGAGAAACACCCAAG  228
      |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||
seq2  CTTCTTAGTCTCTTGGAGTCAGAAAGATCTGATTGTGAGAAACACCCAAG  250

seq1  CAACCCAAA--CAAACCCAGCCTTTCATCTGAGTAAACCCACTAAATCAT  276
      |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACCCAAAACAAAACCCAGCCTTTCATCTGAGTAAACCCACTAAATCAT  300

seq1  AGTCAAAAACCCCTGAGGGGTGCAATGGGCAGCCTCCATGAGT-AAGATG  325
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  AGTCAAAAACCCCTGAGGGGTGCAATGGGCAGCCTCCATGAGTAAAGATG  350

seq1  CTCACCAGAACAGAGCTACACAGAGCCCAGCTGGACAATGTGCCACCCAG  375
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACCAGAACAGAGCTACACAGAGCCCAGCTGGACAATGTGCCACCCAG  400

seq1  GGACTTGAGGGTTTCACAGGTATTCACTTGTCTGTTCTCATCCCCTGCGG  425
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTTGAGGGTTTCACAGGTATTCACTTGTCTGTTCTCATCCCCTGCGG  450

seq1  GGGCAGGGCTCCTTCCAACCAAGGATGAAACACTTCATGCACAGTCCCTG  475
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCAGGGCTCCTTCCAACCAAGGATGAAACACTTCATGCACAGTCCCTG  500

seq1  GTAATGACCCACCCAGCTCGTCTTTCTATAAGCACCTTGTGTGATCCTGG  525
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATGACCCACCCAGCTCGTCTTTCTATAAGCACCTTGTGTGATCCTGG  550

seq1  AAAGAAAATGGTTCACTGCCCTCTTGCCCCAGAAACAACACACAATTATG  575
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAAAATGGTTCACTGCCCTCTTGCCCCAGAAACAACACACAATTATG  600

seq1  CAAATCAAGAGGTCAGCTCCTCTTATTTATTCCCTTTAAAAATAGCCATG  625
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATCAAGAGGTCAGCTCCTCTTATTTATTCCCTTTAAAAATAGCCATG  650

seq1  GAATTACCCAAGCCATCAAGAGTCCACACATCAGAAAAGCCATCAAGTCT  675
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTACCCAAGCCATCAAGAGTCCACACATCAGAAAAGCCATCAAGTCT  700

seq1  CTGAAGGTGACACTTTACAGAAGTAGGGTGTACCATTCTGGAGGTGTAAC  725
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAGGTGACACTTTACAGAAGTAGGGTGTACCATTCTGGAGGTGTAAC  750

seq1  AGCAGTTTGAGTAGGTGTGCCTAGGCCAAACACTGCGGGTAGACTGGATC  775
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGTTTGAGTAGGTGTGCCTAGGCCAAACACTGCGGGTAGACTGGATC  800

seq1  ATTGGCAAAAATAAATAAATAAATAAATAAACAAACAAACAAACAGCAGT  825
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGGCAAAAATAAATAAATAAATAAATAAACAAACAAACAAACAGCAGT  850

seq1  AAATTTTGGTTGCATATACTTAAAAATACAGAGGGTAGCCAGGTATGGTG  875
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTTTGGTTGCATATACTTAAAAATACAGAGGGTAGCCAGGTATGGTG  900

seq1  GTCCATGTCTTTAATCCCAGCACTCCAGAGGAGCAGAGACAGGGTGATGC  925
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCATGTCTTTAATCCCAGCACTCCAGAGGAGCAGAGACAGGGTGATGC  950

seq1  CTGTGAGTTCAAGGCCAACTTGCTCTACATAGCAAGTTCCAGGCCAGCCA  975
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGAGTTCAAGGCCAACTTGCTCTACATAGCAAGTTCCAGGCCAGCCA  1000

seq1  GGACTGCCTAATGAGACTCTGTCTCAAGGGGAAAAGAGAAGGCTAAGAGT  1025
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTGCCTAATGAGACTCTGTCTCAAGGGGAAAAGAGAAGGCTAAGAGT  1050

seq1  AATGGCTGACCTTCAGGTTTAGGCATAGATTATTGTCTGATCATTAGACA  1075
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGCTGACCTTCAGGTTTAGGCATAGATTATTGTCTGATCATTAGACA  1100

seq1  CATCTGGGTGAGAATTC  1092
      |||||||||||||||||
seq2  CATCTGGGTGAGAATTC  1117

seq1: chr7_145939574_145940702
seq2: B6Ng01-173D14.g_70_1218

seq1  GAATTCCAGGAGAGAGAGGTCCTGGCTCTTTGGAAAGCTGAGAGCTTCAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGGAGAGAGAGGTCCTGGCTCTTTGGAAAGCTGAGAGCTTCAG  50

seq1  GAGTCAGGGATTGTATCACAGCTTGGAGGACCAAGGTTCCAGTTCCTTGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCAGGGATTGTATCACAGCTTGGAGGACCAAGGTTCCAGTTCCTTGG  100

seq1  CCAGCATGAGGACTGGGATAATAAGGAAGACTTAAGACAACATAAGGTAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCATGAGGACTGGGATAATAAGGAAGACTTAAGACAACATAAGGTAT  150

seq1  TAAAGAACCCAACAAGGACTCTTCCTGGGTGACAGCTACCTAGTATTCTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGAACCCAACAAGGACTCTTCCTGGGTGACAGCTACCTAGTATTCTA  200

seq1  GGCTGCACTGTCACAAGGCCCCTGAGCAGAGCAAAGCAATGACCCTTTGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGCACTGTCACAAGGCCCCTGAGCAGAGCAAAGCAATGACCCTTTGC  250

seq1  TAGCTGGCCACATCTTTCTCGCCAGGGTCTGCAGCTGAAGGGATAGAACC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTGGCCACATCTTTCTCGCCAGGGTCTGCAGCTGAAGGGATAGAACC  300

seq1  CACCCACCTCACCCAGAATCTCACTCTGGCCTATAGCACAAGACCACTGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCACCTCACCCAGAATCTCACTCTGGCCTATAGCACAAGACCACTGA  350

seq1  CCTCCCAGAGTTGCTTCCTATAGCTCCAAGACCAGTGAAGATCTTGTTCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCCAGAGTTGCTTCCTATAGCTCCAAGACCAGTGAAGATCTTGTTCA  400

seq1  GTGGACGGCATGTGACAGTGGAGTTGCTGAAACAGTGGAGGTCCTGTGAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGACGGCATGTGACAGTGGAGTTGCTGAAACAGTGGAGGTCCTGTGAC  450

seq1  AGTGGAGGTCCTGCAACAGTGGAAGTCCCAGGGTAACTGGTGCTCTGCCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGAGGTCCTGCAACAGTGGAAGTCCCAGGGTAACTGGTGCTCTGCCC  500

seq1  GGGTCATTGACTGGCCCAGAGCAAAATTCAACAAAGAGAGCATATGCCCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTCATTGACTGGCCCAGAGCAAAATTCAACAAAGAGAGCATATGCCCA  550

seq1  ACCTAAAAACTTTCTGGAGGTGACACCTCAGTGATTTTCCTCAGGACAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTAAAAACTTTCTGGAGGTGACACCTCAGTGATTTTCCTCAGGACAAA  600

seq1  CCTAGTTTAGAATTGCTGTTGAGGTATCTTCATTCAGCCACTTGGATTGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAGTTTAGAATTGCTGTTGAGGTATCTTCATTCAGCCACTTGGATTGT  650

seq1  TACAAGGCAAAATAGAAAGGAACTCGCAGCAGGGTTTGCAGGAGGCTAAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAAGGCAAAATAGAAAGGAACTCGCAGCAGGGTTTGCAGGAGGCTAAA  700

seq1  AATAGCCAGAGCACCCACCAGCACAAGCTTCCAGGCAGCAGCTGCAGAGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGCCAGAGCACCCACCAGCACAAGCTTCCAGGCAGCAGCTGCAGAGT  750

seq1  GCCATGGATAACCTCACCTGTTTTTAC-TTATTGACTTGTCTCTAAGACC  799
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATGGATAACCTCACCTGTTTTTACTTTATTGACTTGTCTCTAAGACC  800

seq1  ATCATGGACAGCCAGCCAGCAACATCTGCCCTTAGCGAGCAGA-GAGGAC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  ATCATGGACAGCCAGCCAGCAACATCTGCCCTTAGCGAGCAGAGGAGGAC  850

seq1  TGTCCTAAAACCCAGGAGGTAAT--GAAAGCAGACCAGCT-CCTC-TTCT  894
      |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||| ||||
seq2  TGTCCTAAAACCCAGGAGGTAATTGAAAAGCAGACCAGCTCCCTCTTTCT  900

seq1  CTGCCT-CTAATC-TGCAGAT-GGCCTGGGTGTATGAGC-TGGAG-TCTT  939
      |||||| |||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||| ||||
seq2  CTGCCTCCTAATCTTGCAGATGGGCTTTGGTGTATGAGCTTGGAGTTCTT  950

seq1  CCTACCTG-AACCCCAGTACTCAGCCTGTCTTCTCTCGTGTCCCAAGAGG  988
      || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  CCAACCTGAAACCCCAGTACTCAGCCTGTCTTCTCTCGTGTCCCAAGAAG  1000

seq1  GTGA-CACATGGCCATGAGGGTCCT-CAGGCAGGAAGTCTTTGGGCTCCA  1036
      |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||
seq2  GTGACCACATGGCCATGAGGGTCCTCCAGGCA-GAAGTCCTTTGGCTCCA  1049

seq1  GGGTG--CTGCAACAAGCGAG-CTTCCCTGACTGGGGATCCCTAAGCACC  1083
      |||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||   ||| ||||||
seq2  GGGTGCTCTGCAACTAGCGAGACTTCCCTGACTGGGGGATCCT-AGCACC  1098

seq1  TGGTGTGCAGGC-AGGAATGGGACCTCACTTG-AGGA-TGTC--TGGCTT  1128
      |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||
seq2  TGGTGTGCAGGCAAGGAATGGGACCTCACTTGAAGGATTGTCTTTGGCTT  1148

seq1  C  1129
      |
seq2  C  1149