BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-181D18
Chromosome7 (Build37)
Map Location 6,915,334 - 7,108,726
singlet/doubletdoublet
Overlap geneUsp29, Aurkc, LOC628030, LOC100041822, 5730403M16Rik, 2810409K11Rik, Vmn2r-ps35
Upstream geneLOC100041666, V1rd6, EG384525, EG269859, Nlrp4c, Zfp787, Zfp444, Galp, Zfp371, EG627821, Zfp667, Zfp583, LOC100042467, LOC100042459, Zfp78, Zfp28, LOC100042450, Olfr1344, GA_x5J8B7W3DQU-679632-679375, Olfr1336, Olfr1346, Olfr5, Olfr1347, Olfr1348, Olfr1349, LOC665328, Olfr1350, Zim2, Zim1, Peg3, LOC627961
Downstream geneZfp418, BC023179, 6430701C03Rik, Clcn4-2, V2r15, LOC100041866, LOC100042577, Vmn2r31, Vmn2r-ps36, V2r5, LOC100041883, EG628117, Vmn2r33, LOC665470, EG665474, EG628368, LOC100042636, LOC665485, EG625353, Vmn2r-ps40, Vmn2r36, LOC638170, LOC100042662, LOC100041942, LOC100042673, LOC100041949
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-181D18.bB6Ng01-181D18.g
ACCGA007451GA007452
length1,161863
definitionB6Ng01-181D18.b B6Ng01-181D18.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(6,915,334 - 6,916,491)(7,107,864 - 7,108,726)
sequence
gaattctgttctcaagtacacattgaggagactccccagggtcctcattg
ttcatctgaaacgctaccaagttaccactgacttgttgccagtgaagagt
gagcagccagttgagatttctaagtatttaaatatatcttcccactgcca
tgaaaacaggaagctaccatttcccttggctaatacatccccagatgtct
ctcaagggatgatgcctgggatcttcaaccagtcaatgttatctaagaag
gtgatttcagaatcctgtgaccccatggttctacaggttggatccagtgt
ggatgctgaaatacaaagcttccagataatgtatgaggatgaagatgcaa
gtgaggagcagcagcagagaggcctggaaagtggctccatgctggagcca
gaactagtgaagacagaaaaccggatactcagacaaaagacatcactagc
aactgactcaatgatgggtgacggatacagcttccttcctatgctctgtg
agcctctgagcatccaagatccaggtcttgcagagatgggtcttcaagag
gttccagagaatccagaatttaagaactatgagaaaattaacatatatgg
aaagtcagatggccgcactaacactgagttgtcaaaactctaccagaatc
atggaagtcgaatcaagggtttgttcctaccggcatcccttgcaagtgtt
agttctcaggaagacccagagaaggacctgagtaggtctccagaattgca
ggaagatgacccacattcctttgcatttggttctgatgattccaaagatg
gggagatgggagatgatcttcagaattacaggctcgtcagtgtggtcagc
cactttgggagctccccaaattcagccattacgtaagtgatgtgtatgac
tttcaaaagcaagcctggctcctttacagtgatgtccaagtgttcgagag
ttcagatccctccattcaggagaaccaggctaacagcgggatacatcttc
tttttacatgcataatgagattttttgagaactgttgaaaaaggcatctg
agtgcagttccttagcacatctaaggaggaaaagaggaacttgattactt
cctcacattggctttaacgggccttacattcattcctggcagattctaaa
ttcctgcctaa
gaattccataaaatattttattacattaattgcttatgtgtgtgggatag
gtaacacatgtacaggtgcacatatgagcaaatgatacccctatctgtac
atttacatgcgcttgtgagacacctggcatgggtgctggaatctgaaccc
aggttctttggtagaacaaagtattctgtttatagctaatccaaggtatg
cttttaggcaacttatcaaataatagctctacacaaatgcattgttgtag
atatgaattctgaaaaccaaggaagaacatcaacattctctgaaatgaca
ttaaaattaagtgcaaatacatttatagttgatattgcagccatgatggg
aattgaaacttaggaataaggtactattgcttaacacaaaccatctgggt
tacccctcttgctcgaggattcctctgttatattgctcattctatttgtc
catactgatttcatctctgacaacattcacagacactgaatcgaatagga
atggagatgaggcaaggataagtgtgctcagctttccaaatgaagaagga
atcaaggtaaaggacttcttagtacaaagtatctacagaggcttcttttc
catcagtgctaatcttagtgcatctctcaaataataatcagaacttttgt
ttatgtattgacatattaggatacatctgagggcttatttatttaatgtt
ttctgctttttaaaaattttaaaatattaatatattattacctctcattc
tctaccctctaatgacttatgacaggaatcacttaaattcaataatgcaa
ttgttacatttacacaaacattatagatatatatatgtgtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_6915334_6916491
seq2: B6Ng01-181D18.b_45_1205

seq1  GAATTCTGTTCTCAAGTACACATTGAGGAGACTCCCCAGGGTCCTCATTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGTTCTCAAGTACACATTGAGGAGACTCCCCAGGGTCCTCATTG  50

seq1  TTCATCTGAAACGCTACCAAGTTACCACTGACTTGTTGCCAGTGAAGAGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATCTGAAACGCTACCAAGTTACCACTGACTTGTTGCCAGTGAAGAGT  100

seq1  GAGCAGCCAGTTGAGATTTCTAAGTATTTAAATATATCTTCCCACTGCCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAGCCAGTTGAGATTTCTAAGTATTTAAATATATCTTCCCACTGCCA  150

seq1  TGAAAACAGGAAGCTACCATTTCCCTTGGCTAATACATCCCCAGATGTCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAAACAGGAAGCTACCATTTCCCTTGGCTAATACATCCCCAGATGTCT  200

seq1  CTCAAGGGATGATGCCTGGGATCTTCAACCAGTCAATGTTATCTAAGAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAAGGGATGATGCCTGGGATCTTCAACCAGTCAATGTTATCTAAGAAG  250

seq1  GTGATTTCAGAATCCTGTGACCCCATGGTTCTACAGGTTGGATCCAGTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATTTCAGAATCCTGTGACCCCATGGTTCTACAGGTTGGATCCAGTGT  300

seq1  GGATGCTGAAATACAAAGCTTCCAGATAATGTATGAGGATGAAGATGCAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGCTGAAATACAAAGCTTCCAGATAATGTATGAGGATGAAGATGCAA  350

seq1  GTGAGGAGCAGCAGCAGAGAGGCCTGGAAAGTGGCTCCATGCTGGAGCCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGGAGCAGCAGCAGAGAGGCCTGGAAAGTGGCTCCATGCTGGAGCCA  400

seq1  GAACTAGTGAAGACAGAAAACCGGATACTCAGACAAAAGACATCACTAGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTAGTGAAGACAGAAAACCGGATACTCAGACAAAAGACATCACTAGC  450

seq1  AACTGACTCAATGATGGGTGACGGATACAGCTTCCTTCCTATGCTCTGTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGACTCAATGATGGGTGACGGATACAGCTTCCTTCCTATGCTCTGTG  500

seq1  AGCCTCTGAGCATCCAAGATCCAGGTCTTGCAGAGATGGGTCTTCAAGAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTCTGAGCATCCAAGATCCAGGTCTTGCAGAGATGGGTCTTCAAGAG  550

seq1  GTTCCAGAGAATCCAGAATTTAAGAACTATGAGAAAATTAACATATATGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCCAGAGAATCCAGAATTTAAGAACTATGAGAAAATTAACATATATGG  600

seq1  AAAGTCAGATGGCCGCACTAACACTGAGTTGTCAAAACTCTACCAGAATC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTCAGATGGCCGCACTAACACTGAGTTGTCAAAACTCTACCAGAATC  650

seq1  ATGGAAGTCGAATCAAGGGTTTGTTCCTACCGGCATCCCTTGCAAGTGTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGAAGTCGAATCAAGGGTTTGTTCCTACCGGCATCCCTTGCAAGTGTT  700

seq1  AGTTCTCAGGAAGACCCAGAGAAGGACCTGAGTAGGTCTCCAGAATTGCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCTCAGGAAGACCCAGAGAAGGACCTGAGTAGGTCTCCAGAATTGCA  750

seq1  GGAAGATGACCCACATTCCTTTGCATTTGGTTCTGATGATTCCAAAGATG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGATGACCCACATTCCTTTGCATTTGGTTCTGATGATTCCAAAGATG  800

seq1  GGGAGATGGGAGATGATCTTCAGAATTACAGGCTCGTCAGTGTGGTCAGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGATGGGAGATGATCTTCAGAATTACAGGCTCGTCAGTGTGGTCAGC  850

seq1  CACTTTGGGAGCTCCCCAAATTCAGGCCATTACGTAAGTGATGTGTATGA  900
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTTGGGAGCTCCCCAAATTCA-GCCATTACGTAAGTGATGTGTATGA  899

seq1  CTTTCAAAAGCAAGCCTGGCTCCTTTACAGTGATGTCCAAGTGTTCGAGA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCAAAAGCAAGCCTGGCTCCTTTACAGTGATGTCCAAGTGTTCGAGA  949

seq1  GTTCAGATCCCTCCATTCAGGAGAA-CAGGCTAAACAGC-GGATACATCT  998
      ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||
seq2  GTTCAGATCCCTCCATTCAGGAGAACCAGGCT-AACAGCGGGATACATCT  998

seq1  TC-TTTTACATGCATAATGAGATTTTTGAGGAACTGTTGAAAAAGGCATC  1047
      || ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTTTACATGCATAATGAGATTTTTTGAGAACTGTTGAAAAAGGCATC  1048

seq1  TGAGTGCAAGGTCCTTAGCACATCTAAGGAGGAAAAGAGGGACATAGATT  1097
      ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||
seq2  TGAGTGC-AGTTCCTTAGCACATCTAAGGAGGAAAAGAGGAAC-TTGATT  1096

seq1  ACTTCTCAACATTG--CTTAAC-GGCCTTACATACA-TCCTGGAAGAATT  1143
      |||||   ||||||   ||||| |||||||||| || |||||| || |||
seq2  ACTTCCTCACATTGGCTTTAACGGGCCTTACATTCATTCCTGGCAG-ATT  1145

seq1  CTAAA-TCCTGCCTAA  1158
      ||||| ||||||||||
seq2  CTAAATTCCTGCCTAA  1161

seq1: chr7_7107864_7108726
seq2: B6Ng01-181D18.g_66_928 (reverse)

seq1  CACACACACACACACACACACACACACATATATATATCTATAATGTTTGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACACACACACACACACACACACATATATATATCTATAATGTTTGT  50

seq1  GTAAATGTAACAATTGCATTATTGAATTTAAGTGATTCCTGTCATAAGTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAATGTAACAATTGCATTATTGAATTTAAGTGATTCCTGTCATAAGTC  100

seq1  ATTAGAGGGTAGAGAATGAGAGGTAATAATATATTAATATTTTAAAATTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGAGGGTAGAGAATGAGAGGTAATAATATATTAATATTTTAAAATTT  150

seq1  TTAAAAAGCAGAAAACATTAAATAAATAAGCCCTCAGATGTATCCTAATA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAAAGCAGAAAACATTAAATAAATAAGCCCTCAGATGTATCCTAATA  200

seq1  TGTCAATACATAAACAAAAGTTCTGATTATTATTTGAGAGATGCACTAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCAATACATAAACAAAAGTTCTGATTATTATTTGAGAGATGCACTAAG  250

seq1  ATTAGCACTGATGGAAAAGAAGCCTCTGTAGATACTTTGTACTAAGAAGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGCACTGATGGAAAAGAAGCCTCTGTAGATACTTTGTACTAAGAAGT  300

seq1  CCTTTACCTTGATTCCTTCTTCATTTGGAAAGCTGAGCACACTTATCCTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTACCTTGATTCCTTCTTCATTTGGAAAGCTGAGCACACTTATCCTT  350

seq1  GCCTCATCTCCATTCCTATTCGATTCAGTGTCTGTGAATGTTGTCAGAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCATCTCCATTCCTATTCGATTCAGTGTCTGTGAATGTTGTCAGAGA  400

seq1  TGAAATCAGTATGGACAAATAGAATGAGCAATATAACAGAGGAATCCTCG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAATCAGTATGGACAAATAGAATGAGCAATATAACAGAGGAATCCTCG  450

seq1  AGCAAGAGGGGTAACCCAGATGGTTTGTGTTAAGCAATAGTACCTTATTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAAGAGGGGTAACCCAGATGGTTTGTGTTAAGCAATAGTACCTTATTC  500

seq1  CTAAGTTTCAATTCCCATCATGGCTGCAATATCAACTATAAATGTATTTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGTTTCAATTCCCATCATGGCTGCAATATCAACTATAAATGTATTTG  550

seq1  CACTTAATTTTAATGTCATTTCAGAGAATGTTGATGTTCTTCCTTGGTTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTAATTTTAATGTCATTTCAGAGAATGTTGATGTTCTTCCTTGGTTT  600

seq1  TCAGAATTCATATCTACAACAATGCATTTGTGTAGAGCTATTATTTGATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAATTCATATCTACAACAATGCATTTGTGTAGAGCTATTATTTGATA  650

seq1  AGTTGCCTAAAAGCATACCTTGGATTAGCTATAAACAGAATACTTTGTTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGCCTAAAAGCATACCTTGGATTAGCTATAAACAGAATACTTTGTTC  700

seq1  TACCAAAGAACCTGGGTTCAGATTCCAGCACCCATGCCAGGTGTCTCACA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCAAAGAACCTGGGTTCAGATTCCAGCACCCATGCCAGGTGTCTCACA  750

seq1  AGCGCATGTAAATGTACAGATAGGGGTATCATTTGCTCATATGTGCACCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCGCATGTAAATGTACAGATAGGGGTATCATTTGCTCATATGTGCACCT  800

seq1  GTACATGTGTTACCTATCCCACACACATAAGCAATTAATGTAATAAAATA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACATGTGTTACCTATCCCACACACATAAGCAATTAATGTAATAAAATA  850

seq1  TTTTATGGAATTC  863
      |||||||||||||
seq2  TTTTATGGAATTC  863